These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_4062#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 753 fasta sequence [CCGGGCAAGATGAATCGCACTTTGTAACATTTCAGTTTGAGTAAACACCATGCTGTACACCATGTATTATTGAAACAATCGGAACCGAACCTTTTTTAATGAATCATAAAGCATAAATTAATTAATCATGGCTAATGACATGATACTTTTACGGGGTGGAATATATGGAGATAAGAAGGTATAACACAAACACACGTAATCTAAGCTAAATTTGTCTACACATG-T-TTCGACT-GATTGG-GCAGTCAGAAAGATGTAGTAACTTAGTATCGTAGTAAAACTCCCAAAAACAGCTGCACATTGTGTATCGTTTTTGTTGAATTCTAAGTACTGCTGTAATCTTATGCACAGCATTTATTTTCGTTCGTCGCAAATTCATATCCTTTGCAAAGGTTTGTTTCAAGTAATGTTTTGATTTGAGGATAAACAGTGAATTAACATTAAAACAGTTTTGATATAAATAATAGTCCATCACACACATGTATCGTGCAATGAGCCACTCGTTTATATATCTGCATGAACCAAACAACCCAAACAACAATAGGAAACATAATTACTATTCTGGGATATGGTAGGATCATAATCGAAGAAAACACCTTGAAATGGAAAACAGAAAAGAGGGAACTGCTAACTGCGCATCATTGTAGGGCCAAATTGATAAAACTCAGCTAGGAAGTAAAGAAAAGTCGTCACGTAGCGTAATGTAACATGGAAATGGGTGACATACATTGCGATATTTTGTTCTTGAAAATTGCT] [+] EMBL BM595242 [CCGGGCAAGATGAATCGCACTTTGTAACATTTCAGTTTGAGTAAACACCATGCTGTACACCATGTATTATTGAAACAATCGGAACCGAACCTTTTTTAATGAATCATAAAGCATAAATTAATTAATCATGGCTAATGACATGATACTTTTACGGGGTGGAATATATGGAGATAAGAAGGTATAACACAAACACACGTAATCTAAGCTAAATTTGTCTACACATG T TTCGACT GATTGG GCAGTCAGAAAGTTGTAGTAACTTAGTATCGTAGTAAAACTCCCAAAAACAGCTGCACATTGTGTGTCGTTTTTGTTGAATTCTAAGTACTGCTGTAATCTTATGCACAGCATTTATTTTCGTTCGTCGCAAATTCATATCCTTTGCAAAGGTTTGTTTCAAGTAATGTTTTGATTTGAGGATAAACAGTGAATTAACATTAAAACAGTTTTGATATAAATAATAGTCCATCACACACATGTATCGTGCAATGAGCCACTCGTTTATATATCTGCATGAACCAAACAACCCAAACAACAATAGGGAACATAATTACTATTCTGGGATATGGTAGGATCATAATCGAAGAAAACACCTTGAAATGGAAAACAGAACAGAGGGAACTGCTAACTGCGCATCATTGTAGGGCCAAATTGATAAAACTCAGCTAGGAAGTAAAGAAAAGTCGTCACGTAGCGTAATGTAACAT ] [+] EMBL BX622181 [ ACCTTTTTTGATGAATCATAAAGCATAAATTAATTAATCATGGCTAATGACATGATACTTTTACGGGGTGGAATATATGGAGATAAGAAGGTATAACACAAACACACGTAATCTAAGCTAAATTTGTCTACACATG T TTCGACT GATTGG GCAGTCAGAAAGATGTAGTAACTTAGTATCGTAGTAAAACTCCCAAAAACAGCTGCACATTGTGTATCGTTTTTGTTGAATTCTAAGTACTGCTGTAATCTTATGCACAGCATTTATTTTCGTTCGTCGCAAATTCATATCCTTTGCAAAGGTTTGTTTCAAGTAATGTTTTGATTTGAGGATAAACAGTGAATTAACATTAAAACAGTTTTGATATAAATAATAGTCCATCACACACATGTATCGTGCAATGAGCCACTCGTTTATATATCTGCATGAACCAAACAACCCAAACAACAATAGGAAACATAATTACTATTCTGGGATATGGTAGGATCATAATCGAAGAAAACACCTTGAAATGGAAAACAGAAAAGAGGGAACTGCTAACTGCGCATCATTGTAGGGCCAAATTGATAAAACTCAGCTAGGAAGTAAAGAAAAGTTGTCACGTAGCGTAATGTAACATGGAAATGGGTGACATACATTGCGATATTTTGTTCTTGAAAATTGCT] [+] EMBL BX624314 [ ACATGATATATGACTCGATTGGAGCAG AAAAAAGATGTAGTAACTTAGTATCGTAGTAAAACTCCCAAAAACAGCTGCACATTGTGTATCGTTTTTGTTGAATTCTAAGTACTGCTGTAATCTTATGCACAGCATTTATTTTCGTTCGTCGCAAATTCATATCCTTTGCAAAGGTTTGTTTCAAGTAATGTTTTGATTTGAGGATAAACAGTGAATTAACATTAAAACAGTTTTGATATAAATAATAGTCCATCACACACATGTATCGTGCAATGAGCCACTCGTTTATATATCTGCATGAACCAAACAACCCAAACAACAATAGGAAACATAATTACTATTCTGGGATATGGTANGATCATAATCGAAGANAACACCTTGAAATGGAAAACAGAAAAGANGGAACTGCTAACTGCGCATCATTGTAGGGCCAAATTGATAAAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||