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Anopheles gambiae
cluster # 4138 cluster # 4138       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4138#0 length = 979 sequences # 3  

consensusID : consensus_4138#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 979
fasta sequence
                              [TACTCTCTCTCTCTTTCTCTTTTCACTGTTTGGTAATTGCAATGTTTTCAAAGAATCACAACACACTTGTCGCTTCTCTATAGACCTGCAAAGCGTGCAATTAGCAATCTGTTTCCCTTGCGCAAATATTGAATATCTCTCCCTTACCTCCCCGTAACGCAGCTGAGCCGAGTGATATCAGTAGAGCAGGAGCGCAAGTAGTAACGTTTAAACAAACCACACAACAAGCTAATTAAAATAGTAAAACGAATATGCAATACAACACCACCCCGTCTGTGGTGTGTTTTGCTCAGGCGTGGGTTTTTGCTGGTGGAAGACAACAAAACCTAATAGTTCTCATCACAACACATACAGTTTTAAAAATCATCCCAAACAGCACTATGTCGTGATAGTNCGTGACACAGCAGAGTAGAGCATCTGTGGAGGGCATCATCTTAAANGGTTGCTGATCGTGCACTCCTAGTGTTTAATATTTAGCAGCTGTTACCANANTTTTGGGTTNCNGGGTNTAGAAAACGGCACACACACACACACGATCGCACACGATCACACACGATCACACTCGATATTGTAATAATCTAATTGTTAACAGTTGTNTTAGAAACGACCCACAANCACTCACAGCAGCATGGAAGGAGTGAACATACTATTGCAAGAGTACACTTTTTAGCACTCTACTACGATATATAATAACTAGAACACATCACACTTATGAATTGATCGTTTTGCCCCAGCACACGCGANGTTTGGGTGTATCTGTACTGTTTATTTATTTATTGCCGAGAGAAAGCGCAAATAATCGATAGAAGGNTGCGGTGCGCTTGCCACTGATGAGCCACTGATCGGNTGTGTCTGACGTGCTGGATTGTGCGTACGATCGATTTTCGTTTTGGTATGTCTTTTGCTGTGGGCTCCAGGGCTACCCCGAGTGCGCTGACTGGACATTGAGGGACTACTGGACACAACCAAAAGCAACCAA]

[+] EMBL BX619233             [TACTCTCTCTCTCTTTCTCTTTTCACTGTTTGGTAATTGCAATGTTTTCAAAGAATCACAACACACTTGTCGCTTCTCTATAGACCTGCAAAGCGTGCAATTAGCAATCTGTTTCCCTTGCGCAAATATTGAATATCTCTCCCTTACCTCCCCGTAACGCAGCTGAGCCGAGTGATATCAGTAGAGCAGGAGCGCAAGTAGTAACGTTTAAACAAACCACACAACAAGCTAATTAAAATAGTAAAACGAATATGCAATACAACACCACCCCGTCTGTGGTGTGTTTTGCTCAGGCGTGGGTTTTTGCTGGTGGAAGACAACAAAACCTAATAGTTCTCATCACAACACATACAGTTTTAAAAATCATCCCAAACAGCACTATGTCGTGATAGTNCGTGACACAGCAGAGTAGAGCATCTGTGGAGGGCATCATCTTAAANGGTTGCTGATCGTGCACTCCTAGTGTTTAATATTTAGCAGCTGTTACCANANTTTTGGGTTNCNGGGTNTAGAAAACGGCACACACACACACACGATCGCACACGATCACACACGATCACACTCGATATTGTAATAATCTAATTGTTAACAGTTGTNTTAGAAACGACCCACAANCACTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BX623596             [                   TTTTCACTGTTTGGTAATTGCAATGTTTTCAAAGAATCACAACACACTTGTCGCTTCTCTATAGACCTGCAAAGCGTGCAATTAGCAATCTGTTTCCCTTGCGCAAATATTGAATATCTCTCCCTTACCTCCCCGTAACGCAGCTGAGCCGAGTGATATCAGTAGAGCAGGAGCGCAAGTAGTAACGTTTAAACAAACCACACAACAAGCTAATTAAAATAGTAAAACGAATATGCAATACAACACCACCCCGTCTGTGGTGTGTTTTGCTCAGGCGTGGGTTTTTGCTGGTGGAAGACAACAAAACCTAATAGTTCTCATCACAACACATACAGTTTTAAAAATCATCCCAAACAGCACTATGTCGTGATAGTTCGTGACACAGCAGAGTAGAGCATCTGTGGAGGGCATCATCTTAAAGGGTTGCTGATCGTGCACTCCTAGTGTTTAATATTTAGCAGCTGTTACCAGAGTTTTGGGTT CCGGGTTTAGAAAACGGCACACACACACACACGATCGCACACGATCACACACGATCACACTCGATATTGTAATAATCTAATTGTTAACAGTTGTTTTAGAAACGACCCACAAACACTCACAGCAGCATGGAAGGAGTGAACATACTATTGCAAGAGTACACTTTTTAGCACTCTACTACGATATATAATAACTAGAACACATCACACTTATGAATTGATCGTTTTGCCCCAGCACACGCGANGTTTGGGTGTATCTGTACTGTTTATTTATTTATTGCCGAGAGAAAGCGCAAATAATCGATAGAAGGNTGCGGTGCGCTTGCCACTGATGAGCCACTGATCGGNTGTGTCTGA                                                                                                                           ]
[+] EMBL BX608159             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TACTGTTTATTTATTTATTGCCGAGAGAAAGCGCAAATAATCGATAGAAGGTTGCGGTGCGCTTGCCACTGATGAGCCACTGATCGGTTGTGTCTGACGTGCTGGATTGTGCGTACGATCGATTTTCGTTTTGGTATGTCTTTTGCTGTGGGCTCCAGGGCTACCCCGAGTGCGCTGACTGGACATTGAGGGACTACTGGACACAACCAAAAGCAACCAA]


>consensus_4138#0 TACTCTCTCTCTCTTTCTCTTTTCACTGTTTGGTAATTGCAATGTTTTCAAAGAATCACA ACACACTTGTCGCTTCTCTATAGACCTGCAAAGCGTGCAATTAGCAATCTGTTTCCCTTG CGCAAATATTGAATATCTCTCCCTTACCTCCCCGTAACGCAGCTGAGCCGAGTGATATCA GTAGAGCAGGAGCGCAAGTAGTAACGTTTAAACAAACCACACAACAAGCTAATTAAAATA GTAAAACGAATATGCAATACAACACCACCCCGTCTGTGGTGTGTTTTGCTCAGGCGTGGG TTTTTGCTGGTGGAAGACAACAAAACCTAATAGTTCTCATCACAACACATACAGTTTTAA AAATCATCCCAAACAGCACTATGTCGTGATAGTNCGTGACACAGCAGAGTAGAGCATCTG TGGAGGGCATCATCTTAAANGGTTGCTGATCGTGCACTCCTAGTGTTTAATATTTAGCAG CTGTTACCANANTTTTGGGTTNCNGGGTNTAGAAAACGGCACACACACACACACGATCGC ACACGATCACACACGATCACACTCGATATTGTAATAATCTAATTGTTAACAGTTGTNTTA GAAACGACCCACAANCACTCACAGCAGCATGGAAGGAGTGAACATACTATTGCAAGAGTA CACTTTTTAGCACTCTACTACGATATATAATAACTAGAACACATCACACTTATGAATTGA TCGTTTTGCCCCAGCACACGCGANGTTTGGGTGTATCTGTACTGTTTATTTATTTATTGC CGAGAGAAAGCGCAAATAATCGATAGAAGGNTGCGGTGCGCTTGCCACTGATGAGCCACT GATCGGNTGTGTCTGACGTGCTGGATTGTGCGTACGATCGATTTTCGTTTTGGTATGTCT TTTGCTGTGGGCTCCAGGGCTACCCCGAGTGCGCTGACTGGACATTGAGGGACTACTGGA CACAACCAAAAGCAACCAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)