Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Anopheles gambiae
cluster # 4158 cluster # 4158       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4158#0 length = 868 sequences # 3  
consensusID : consensus_4158#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 868
fasta sequence 
                              [CTGGGTTAGGTAATTGTATCTAAGTTTTAAGGAATAAGAGTAATGAGAAAATGAAATAACTTTAACAGTTTTAGTACAAACCATTTTAAAAACGTATTATTGTAGTTAATGTAATCGGCTGTTTGCTCAAAGCTTAAACAACTACCTGTTTACACTCTATGATAGAAGCCAGCACGCACCAAGGCCCTAGCATTCAAGACACGTTTCCCCTATTCGACAGAAAACGATTACTTAACAGGCACTAATGACGCCAACTATTTAGCATGCACTAGCTCACTTGCTGTTGTAATTAAAATCACGGTCAAATTAATTTGCGCTCATATTTTATTTCATTAATCTCCCGAGCAATGGGAATCCGTCGAAAGGGTATACAGCGAATTGTTACACTCTCCAAATGTGTTGCCTTAAATGGAAGGACGAGAAAATGGGTAGAAGAATTTTCAGTCCAACTCTACGCTGTACAATGAGAAGCGATTCAACCAGGAGGTTTGATGTAATTTGTTTTATGACAACACATGCGACATGCAATTCATCAAACTCAACTAGATCATAAATTTTAAAAGCCCAATCTCTCTGCTCATTCTATCATTGAAACGATAGGATAAAAGAGAAATGGTTACCACGGTGCGCATTAGCCCTACCTTCGTTGACTGATTACAAAGAATGACAGTTTAGTCTGCGAAATGGAAGGCACCGTTGCTATGGCCAGTTGAAATGACTCTCAATTGGTCGTGATGTTGAAACGTGTCCGTGAATTATGATCACAGCTGCCAGTTTGGAGTTGTTTTTGCAGGTTTTAAAGTGCATCCCATTGCAGTGGCATGTAGTCGTTTAATTTAAGAAGGGTAAGTGATGGAATTAATTTAAG]

[+] EMBL BX626759             [CTGGGTTAGGTAATTGTATCTAAGTTTTAAGGAATAAGAGTAATGAGAAAATGAAATAACTTTAACAGTTTTAGTACAAACCATTTTAAAAACGTATTATTGTAGTTAATGTAATCGGCTGTTTGCTCAAAGCTTAAACAACTACCTGTTTACACTCTATGATAGAAGCCAGCACGCACCAAGGCCCTAGCATTCAAGACACGTTTCCCCTATTCGACAGAAAACGATTACTTAACAGGCACTAATGACGCCAACTATTTAGCATGCACTAGCTCACTTGCTGTTGTAATTAAAATCACGGTCAAATTAATTTGCGCTCATATTTTATTTCATTAATCTCCCGAGCAATGGGAATCCGTCGAAAGGGTATACAGCGAATTGTTACACTCTCCAAATGTGTTGCCTTAAATGGAAGGACGAGAAAATGGGTAGAAGAATTTTCAGTCCAACTCTACGCTGTACAATGAGAAGCGATTCAACCAGGAGGTTTGATGTAATTTGTTTTATGACAACACATGCGACATGCAATTCATCAAACTCAACTAGATCATAAATTTTAAAAGCCCAATCTCTCTGCTCATTCTATCATTGAAACGATAGGATAAAAGAGAAATGGNTACCACGGTGCGCATTAGCCCTACCTTCGTTGACTGATTACAAAGAATGACAGTTTAGTCTGCGAAATGGAAGGCACCGTTGCTATGGNCAGTTG AATGACTCTC ATTGGTCGNGATGTTGAAACGTGTCCGTGAA TATGATCNCAGCTGCCAG                                                                                              ]
[+] EMBL BX624476             [                                                                                                                        GTTTGCTCAAAGCTTAAACAACTACCTGTTTACACTCTATGATAGAAGCCAGCACGCACCAAGGCCCTAGCATTCAAGACACGTTTCCCCTATTCGACAGAAAACGATTACTTAACAGGCACTAATGACGCCAACTATTTAGCATGCACTAGCTCACTTGCTGTTGTAATTAAAATCACGGTCAAATTAATTTGCGCTCATATTTTATTTCATTAATCTCCCGAGCAATGGGAATCCGTCGAAAGGGTATACAGCGAATTGTTACACTCTCCAAATGTGTTGCCTTAAATGGAAGGACGAGAAAATGGGTAGAAGAATTTTCAGTCCAACTCTACGCTGTACAATGAGAAGCGATTCAACCAGGAGGTTTGATGTAATTTGTTTTATGACAACACATGCGACATGCAATTCATCAAACTCAACTAGATCATAAATTTTAAAAGCCCAATCTCTCTGCTCATTCTATCATTGAAACGATAGGATAAAAGAGAAATGGTTACCACGGTGCGCATTAGCCCTACCTTCGTTGACTGATTACAAAGAATGACAGTTTAGTCTGCGAAATGGAANGCACCGTTGCTATGGCCAGTTGAAATGACTCTCAATTGGTCGTGATGTTGAAACGTGTCCGTGAATTATGATCA                                                                                                        ]
[+] EMBL BX623623             [                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACTTGCTGTTGTAATTAAAATCACGGTCAAATTAATTTGCGCTCATATTTTATTTCATTAATCTCCCGAGCAATGGGAATCCGTCGAAAGGGTATACAGCGAATTGTTACACTCTCCAAATGTGTTGCCTTAAATGGAAGGACGAGAAAATGGGTAGAAGAATTTTCAGTCCAACTCTACGCTGTACAATGAGAAGCGATTCAACCAGGAGGTTTGATGTAATTTGTTTTATGACAACACATGCGACATGCAATTCATCAAACTCAACTAGATCATAAATTTTAAAAGCCCAATCTCTCTGCTCATTCTATCATTGAAACGATAGGATAAAAGAGAAATGGTTACCACGGTGCGCATTAGCCCTACCTTCGTTGACTGATTACAAAGAATGACAGTTTAGTCTGCGAAATGGAAGGCACCGTTGCTATGGCCAGTTGAAATGACTCTCAATTGGTCGTGATGTTGAAACGTGTCCGTGAATTATGATCACAGCTGCCAGTTTGGAGTTGTTTTTGCAGGTTTTAAAGTGCATCCCATTGCAGTGGCATGTAGTCGTTTAATTTAAGAAGGGTAAGTGATGGAATTAATTTAAG]




>consensus_4158#0
CTGGGTTAGGTAATTGTATCTAAGTTTTAAGGAATAAGAGTAATGAGAAAATGAAATAAC
TTTAACAGTTTTAGTACAAACCATTTTAAAAACGTATTATTGTAGTTAATGTAATCGGCT
GTTTGCTCAAAGCTTAAACAACTACCTGTTTACACTCTATGATAGAAGCCAGCACGCACC
AAGGCCCTAGCATTCAAGACACGTTTCCCCTATTCGACAGAAAACGATTACTTAACAGGC
ACTAATGACGCCAACTATTTAGCATGCACTAGCTCACTTGCTGTTGTAATTAAAATCACG
GTCAAATTAATTTGCGCTCATATTTTATTTCATTAATCTCCCGAGCAATGGGAATCCGTC
GAAAGGGTATACAGCGAATTGTTACACTCTCCAAATGTGTTGCCTTAAATGGAAGGACGA
GAAAATGGGTAGAAGAATTTTCAGTCCAACTCTACGCTGTACAATGAGAAGCGATTCAAC
CAGGAGGTTTGATGTAATTTGTTTTATGACAACACATGCGACATGCAATTCATCAAACTC
AACTAGATCATAAATTTTAAAAGCCCAATCTCTCTGCTCATTCTATCATTGAAACGATAG
GATAAAAGAGAAATGGTTACCACGGTGCGCATTAGCCCTACCTTCGTTGACTGATTACAA
AGAATGACAGTTTAGTCTGCGAAATGGAAGGCACCGTTGCTATGGCCAGTTGAAATGACT
CTCAATTGGTCGTGATGTTGAAACGTGTCCGTGAATTATGATCACAGCTGCCAGTTTGGA
GTTGTTTTTGCAGGTTTTAAAGTGCATCCCATTGCAGTGGCATGTAGTCGTTTAATTTAA
GAAGGGTAAGTGATGGAATTAATTTAAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)