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Anopheles gambiae
cluster # 4167 cluster # 4167       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4167#0 length = 1357 sequences # 3  

consensusID : consensus_4167#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1357
fasta sequence
                              [GGCATGGAAGACAGCCTTCCAGCCGAGTACCACCTGGGGACCGGAGAACGAGCTCACCCGCGACCAGTACAACAAGATGGAGAGCAAGCGGAGCCACTTTACTGCAACCCCGGCCCGACATTGTACGCAATTGTGTGGCAAAATATTTGACTAATTTGTTGTGCCATCTAATAGATTTACGATGCATAACCCCTACCCATCCAACCGGCACTATGCGTAAAAGATTTGCGATAAAGACGCCGAGTCGTCGCCGTTGTACCCACTAATGTGATACACGAGTTATCGCCCGATAAAGCAAAAGGTGCTGGCACTTTTTTTTCTCTCTCTTCTATAACTAGGATAGCACGCACAGAACGGACCAATACGCAGTATTTGTGCGAAACAGTCACAACAACACTTCAGAGTGCGATCGTTTTGCGGAAGAGCAAATAATTCCGTGAATTGAATAGAAATCTTTAACAACGCTCCTCACCGTCATCATTGTCGGCCATCGAGGAGACGGAGGAAGATGGTGTGTTTGTTACTGTTTCGCGATTCGCGCTGTAAAGTGGTGCATCTAGTCTAGCAAGCAATAAAAGTTCGTCGTAGATACGTGTCGTGTCCGTACCCTTTGAGGTAAACGCGGGACAATGCAGTTACGGACCATTTTGGTGGTTGCATAGAGTGAACAACACAGCACTCACAGCACAGCCACCAACAGTCGCGTTATTTGATCTGGTTTTTGTTTCCCCGTGGGAAGTAAGGGACAAAAGGGACCGTCAGTTACCGGGCGTGCAGTGTGCAGTGTTGCTAACAGCGGGCCAGTTGCCAAAAGTGCGGTACTCCGTTGTGTGGTGTGGTGAGTAAATGTGTAGGTTACTGGCAGACCCCGTAAAACACCTCACAGCAAATATACTCAAGCGCAGAGATGATATGGACTGAGAGTTTGCCAAAAACAAAGGTGGTTTGGTTAGTCGTGACTCTATCCAGACATTTTCATGGTGGAAAGAGTTCAAAAACCGCTGTAGTGCTGTGTGCTAGGGAAAGTGGTCCAATGTTATCGAGCTACAAAGCTATGTAGATGTTGTTTATACGTTGTTCAGTGTAGTTCTATGTGCCAAAAACTAGATTTTTCTAGTCGGTCGTGAGAAAATTTTTAATTAGGTAATTGAGTACNATAATCATTGAATTGTTGAAGNTATGATTTACCTTAGTCCTTTAATTCCTTGTAAATGCAGTAATTTTTCAGTGTTTGTAAGGCACTGTCAGTAATGGAACGCATCAGAGTGTTANGNCTGGATCTGATTCTATCTGGGTCTATCTTTCAATTCTGGTTTACCAATAGCATGTACATGGAAGTATATGCNGTGATGTGTTA]

[+] EMBL BX622827             [GGCATGGAAGACAGCCTTCCAGCCGAGTACCACCTGGGGACCGGAGAACGAGCTCACCCGCGACCAGTACAACAAGATGGAGAGCAAGCGGAGCCACTTTACTGCAACCCCGGCCCGACATTGTACGCAATTGTGTGGCAAAATATTTGACTAATTTGTTGTGCCATCTAATAGATTTACGATGCATAACCCCTACCCATCCAACCGGCACTATGCGTAAAAGATTTGCGATAAAGACGCCGAGTCGTCGCCGTTGTACCCACTAATGTGATACACGAGTTATCGCCCGATAAAGCAAAAGGTGCTGGCACTTTTTTTTCTCTCTCTTCTATAACTAGGATAGCACGCACAGAACGGACCAATACGCAGTATTTGTGCGAAACAGTCACAACAACACTTCAGAGTGCGATCGTTTTGCGGAAGAGCAAATAATTCCGTGAATTGAATAGAAATCTTTAACAACGCTCCTCACCGTCATCATTGTCGGCCATCGAGGAGACGGAGGAAGATGGTGTGTTTGTTACTGTTTCGCGATTCGCGCTGTAAAGTGGTGCATCTAGTCTAGCAAGCAATAAAAGTTCGTCGTAGATACGTGTCGTGTCCGTACCCTTTGAGGTAAACGCGGGACAATGCAGTTACGGACCATTTTGGTGGTTGCATAGAGTGAACAACACAGCACTCACAGCACAGCCACCAACAGTCGCGTTATTTGATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BX616298             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GCGATTCGCGCTGTAAAGTGGTGCATCTAGTCTAGCAAGCAATAAAAGTTCGTCGTAGATACGTGTCGTGTCCGTACCCTTTGAGGTAAACGCGGGACAATGCAGTTACGGACCATTTTGGTGGTTGCATAGAGTGAACAACACAGCACTCACAGCACAGCCACCAACAGTCGCGTTATTTGATCTGGTTTTTGTTTCCCCGTGGGAAGTAAGGGACAAAAGGGACCGTCAGTTACCGGGCGTGCAGTGTGCAGTGTTGCTAACAGCGGGCCAGTTGCCAAAAGTGCGGTACTCCGTTGTGTGGTGTGGTGAGTAAATGTGTAGGTTACTGGCAGACCCCGTAAAACACCTCACAGCAAATATACTCAAGCGCAGAGATGATATGGACTGAGAGTTTGCCAAAAACAAAGGTGGTTTGGTTAGTCGTGACTCTATCCAGACATTTTCATGGTGGAAAGAGTTCAAAAACCGCTGTAGTGCTGTGTGCTAGGGAAAGTGGTCCAATGTTATCGAGCTACAAAGCTATGTAGATGTTGTTTATACGTTGTTCAGTGTAGT                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BX620035             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TACGGACCATTTTGGTGGTTGCATAGAGTGAACAACACAGCACTCACAGCACAGCCACCAACAGTCGCGTTATTTGATCTGGTTTTTGTTTCCCCGTGGGAAGTAAGGGACAAAAGGGACCGTCANTTACCGGGCGTGCAGTGTGCAGTGTTGCTAACAGCGGGCCAGTTGCCAAAAGTGCGGTACTCCGTTGTGTGGTGTGGTGAGTAAATGTGTAGGTTACTGGCAGACCCCGTAAAACACCTCACAGCAAATATACTCAAGCGCAGAGATGATATGGACTGAGAGTTTGCCAAAAACAAAGGTGGTTTGGTTAGTCGTGACTCTATCCAGACATTTTCATGGTGGAAAGAGTTCAAAAACCGCTGTAGTGCTGTGTGCTAGGGAAAGTGGTCCAATGTTATCGAGCTACAAAGCTATGTAGATGTTGTTTATACGTTGTTCAGTGTAGTTCTATGTGCCAAAAACTAGATTTTTCTAGTCGGTCGTGAGAAAATTTTTAATTAGGTAATTGAGTACNATAATCATTGAATTGTTGAAGNTATGATTTACCTTAGTCCTTTAATTCCTTGTAAATGCAGTAATTTTTCAGTGTTTGTAAGGCACTGTCAGTAATGGAACGCATCAGAGTGTTANGNCTGGATCTGATTCTATCTGGGTCTATCTTTCAATTCTGGTTTACCAATAGCATGTACATGGAAGTATATGCNGTGATGTGTTA]


>consensus_4167#0 GGCATGGAAGACAGCCTTCCAGCCGAGTACCACCTGGGGACCGGAGAACGAGCTCACCCG CGACCAGTACAACAAGATGGAGAGCAAGCGGAGCCACTTTACTGCAACCCCGGCCCGACA TTGTACGCAATTGTGTGGCAAAATATTTGACTAATTTGTTGTGCCATCTAATAGATTTAC GATGCATAACCCCTACCCATCCAACCGGCACTATGCGTAAAAGATTTGCGATAAAGACGC CGAGTCGTCGCCGTTGTACCCACTAATGTGATACACGAGTTATCGCCCGATAAAGCAAAA GGTGCTGGCACTTTTTTTTCTCTCTCTTCTATAACTAGGATAGCACGCACAGAACGGACC AATACGCAGTATTTGTGCGAAACAGTCACAACAACACTTCAGAGTGCGATCGTTTTGCGG AAGAGCAAATAATTCCGTGAATTGAATAGAAATCTTTAACAACGCTCCTCACCGTCATCA TTGTCGGCCATCGAGGAGACGGAGGAAGATGGTGTGTTTGTTACTGTTTCGCGATTCGCG CTGTAAAGTGGTGCATCTAGTCTAGCAAGCAATAAAAGTTCGTCGTAGATACGTGTCGTG TCCGTACCCTTTGAGGTAAACGCGGGACAATGCAGTTACGGACCATTTTGGTGGTTGCAT AGAGTGAACAACACAGCACTCACAGCACAGCCACCAACAGTCGCGTTATTTGATCTGGTT TTTGTTTCCCCGTGGGAAGTAAGGGACAAAAGGGACCGTCAGTTACCGGGCGTGCAGTGT GCAGTGTTGCTAACAGCGGGCCAGTTGCCAAAAGTGCGGTACTCCGTTGTGTGGTGTGGT GAGTAAATGTGTAGGTTACTGGCAGACCCCGTAAAACACCTCACAGCAAATATACTCAAG CGCAGAGATGATATGGACTGAGAGTTTGCCAAAAACAAAGGTGGTTTGGTTAGTCGTGAC TCTATCCAGACATTTTCATGGTGGAAAGAGTTCAAAAACCGCTGTAGTGCTGTGTGCTAG GGAAAGTGGTCCAATGTTATCGAGCTACAAAGCTATGTAGATGTTGTTTATACGTTGTTC AGTGTAGTTCTATGTGCCAAAAACTAGATTTTTCTAGTCGGTCGTGAGAAAATTTTTAAT TAGGTAATTGAGTACNATAATCATTGAATTGTTGAAGNTATGATTTACCTTAGTCCTTTA ATTCCTTGTAAATGCAGTAATTTTTCAGTGTTTGTAAGGCACTGTCAGTAATGGAACGCA TCAGAGTGTTANGNCTGGATCTGATTCTATCTGGGTCTATCTTTCAATTCTGGTTTACCA ATAGCATGTACATGGAAGTATATGCNGTGATGTGTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)