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Anopheles gambiae
cluster # 4324 cluster # 4324       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4324#0 length = 1440 sequences # 3  

consensusID : consensus_4324#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1440
fasta sequence
                              [CCGCTGTCTGGTCCCAGTGCCGGTAGTGTGGCCAGAGGTGGTGCCGTCATTTCGTCCGAACCAACCAGTCCCGTGAATGGAGCGGCGCCGGTGGCACAGTTTGCAGAATGTGTTGTCTGCATGGAGCAATTGGTACAAGTGATATTTTTACCATGTGGCCATATGTGCTGCTGCTCTGGATGTCACGTCGAAATTCACGATTGTCCAATGTGTCGTGCCTACATTGAGAGGAAAATTAAAGTAATACAGCCTTAATTGTGTGGGCCCGACATGCAGATTCACGCACCATTTTAACTACTACTGATTGTGATCGTATCACATACCACGGCAATAAATGTGCGGTTCATCGAGGAGAAATCGTATATCAAGCAGGACGTAGCAAGAGTTTGGATTGAATATTTAAACAAATGGGTAAACTAAACCACAACCATACAACATTAGTCAAATTAATACCCATTTTATATTATACCTCTAGTCAAAAGAATACGATTTTCATGATTGATTTGTGTTCTAACACACAAGTACGAAACAAACTTCGTATAGCTTTTCTCTTGACCTGCAAAACAAATCCCTCAATTATCAATACATGCGACAATTTTTTCAACAGTTATTAAACGACAACATCAAACAAAATTGATTATCAAAAAAACGGACACATTTATACTACCAAAAGTACACCCTAATACTCATCAGTCAAATGTTTCGTGATGCTTTCGGCTTTTATCTAAATGAAGATGAAAAAAAACACAAATGAAAACAAAAATAGGAAAATATTCCGTACCCAAATAATCATACCTAAACGAGTAGCGAGTAAGATAAGAAAAAAACACCAAACCGTTTTTGTCACATCTAAGATAAATCTATAAATCAATGATATCGTTCGAAACGAACATACAACATAGGCTAGAGTATTTTATTCGTTTTTAAAAATCATACCCTCGTTACGCTCTACAGGTCTAGTGCGACCGCATGTTTTAATTTTGTTGTTTTTATCTATTAACTTAAGAAATAATTAATTAAAAACTCCAATCAAAAGACATTCTTACATTAAAAAAAAACACACATACATATTTATACAAGCCGCAATAATATGATTCATTGTTGATGGTTCGGCTTCATACAGACACGTACAAACAAAAATATATGATTTTTGCGGTTGATTTTGTAACGCTTTCTCTAAACAATCGTTGCAAGAAGGAAGTTTGTTCCTTGTTTTAAAAATGTTATATAAATGTTCGCCATATCTAAATTAATTATTTCACCCCATAAATGCGTGTGCAATGAAAATTGAGATTTGTTTGGGAGAGTGCCTTTGATGCGTATAATAACTCTAAGGNATATATTGTAATCTAACGTGAGAAACCCTATATGCACACCCTTTTTCCATCGGGAAAGCGAGAAAAAAATGNCAGTTATGCTCAGTTCAGTTAAGATAAANGG]

[+] EMBL BX624777             [CCGCTGTCTGGTCCCAGTGCCGGTAGTGTGGCCAGAGGTGGTGCCGTCATTTCGTCCGAACCAACCAGTCCCGTGAATGGAGCGGCGCCGGTGGCACAGTTTGCAGAATGTGTTGTCTGCATGGAGCAATTGGTACAAGTGATATTTTTACCATGTGGCCATATGTGCTGCTGCTCTGGATGTCACGTCGAAATTCACGATTGTCCAATGTGTCGTGCCTACATTGAGAGGAAAATTAAAGTAATACAGCCTTAATTGTGTGGGCCCGACATGCAGATTCACGCACCATTTTAACTACTACTGATTGTGATCGTATCACATACCACGGCAATAAATGTGCGGTTCATCGAGGAGAAATCGTATATCAAGCAGGACGTAGCAAGAGTTTGGATTGAATATTTAAACAAATGGGTAAACTAAACCACAACCATACAACATTAGTCAAATTAATACCCATTTTATATTATACCTCTAGTCAAAAGAATACGATTTTCATGATTGATTTGTGTTCTAACACACAAGTACGAAACAAACTTCGTATAGCTTTTCTCTTGACCTGCAAAACAAATCCCTCAATTATCAATACATGCGACAATTTTTTCAACAGTTATTAAACGACAACATCAAACAAAATTGATTATCAAAAAAACGGACACATTTATACTACCAAAAGTACACCCTAATACTCATCAGTCAAATGTTTCGTGATGCTTTCNGCTTTTATCTAAATGAAGATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BX625991             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AATTTTTTCAACAGTTATTAAACGACAACATCAAACAAAATTGATTATCAAAAAAACGGACACATTTATACTACCAAAAGTACACCCTAATACTCATCAGTCAAATGTTTCGTGATGCTTTCGGCTTTTATCTAAATGAAGATGAAAAAAAACACAAATGAAAACAAAAATAGGAAAATATTCCGTACCCAAATAATCATACCTAAACGAGTAGCGAGTAAGATAAGAAAAAAACACCAAACCGTTTTTGTCACATCTAAGATAAATCTATAAATCAATGATATCGTTCGAAACGAACATACAACATAGGCTAGAGTATTTTATTCGTTTTTAAAAATCATACCCTCGTTACGCTCTACAGGTCTAGTGCGACCGCATGTTTTAATTTTGTTGTTTTTATCTATTAACTTAAGAAATAATTAATTAAAAACTCCAATCAAAAGACATTCTTACATTAAAAAAAAACACACATACATATTTATACAAGCCGCAATAATATGATTCATTGTTGATGGTTCGGCTTCATACAGACACGTACAAACAAAAATATATGATTTTTGCGGTTGATTTTGTAACGCTTTCTCTAAACAATCGTTGCAAGAAGGAAGTTTGTTCCTTGTTTTAAAAATGTTATATAAATGTTCGCCATATCTAAATTAATTATTTCACCCCATAAATGCGTGTGCAATGAAAATTGAGATTTGTTTGGGAGAGTGCCTTTGATGCGTATAATAACTCTAAGGNATATATTGTAATCTAACGTGAGAAACCCTATATGCACACCCTTTTTCCATCGGGAAAGCGAGAAAAAAATGNCAGTTATGCTCAGTTCAGTTAAGATAAANGG]
[+] EMBL BX617451             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CACATTTATACTACCAAAAGTACACCCTAATACTCATCAGTCAAATGTTTCGTGATGCTTTCGGCTTTTAGCTAAATGAAGAT  TAAAAAACACAAATGAAAACAAAAATAGGAAAATATTCCGTACCCAAATAATCATACCTAAACGAGTAGCGAGTAAGATAAGAAAAAAACACCAAACCGTTTTTGTCACATCTAAGATAAATCTATAAATCAATGATATCGTTCGAAACGAACATTCAACATAGGCTAGAGTATTTTATTCGGTTTTAAAAATCATACCCTCGTTACGCTCTACAGGTCTAGTGCAATCGTAAGTTTTAATTTTGTTGTTTTTATCTATTAACTTAAGAAATAATTAATTAAAAACTCCAATCAAAAGACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]


>consensus_4324#0 CCGCTGTCTGGTCCCAGTGCCGGTAGTGTGGCCAGAGGTGGTGCCGTCATTTCGTCCGAA CCAACCAGTCCCGTGAATGGAGCGGCGCCGGTGGCACAGTTTGCAGAATGTGTTGTCTGC ATGGAGCAATTGGTACAAGTGATATTTTTACCATGTGGCCATATGTGCTGCTGCTCTGGA TGTCACGTCGAAATTCACGATTGTCCAATGTGTCGTGCCTACATTGAGAGGAAAATTAAA GTAATACAGCCTTAATTGTGTGGGCCCGACATGCAGATTCACGCACCATTTTAACTACTA CTGATTGTGATCGTATCACATACCACGGCAATAAATGTGCGGTTCATCGAGGAGAAATCG TATATCAAGCAGGACGTAGCAAGAGTTTGGATTGAATATTTAAACAAATGGGTAAACTAA ACCACAACCATACAACATTAGTCAAATTAATACCCATTTTATATTATACCTCTAGTCAAA AGAATACGATTTTCATGATTGATTTGTGTTCTAACACACAAGTACGAAACAAACTTCGTA TAGCTTTTCTCTTGACCTGCAAAACAAATCCCTCAATTATCAATACATGCGACAATTTTT TCAACAGTTATTAAACGACAACATCAAACAAAATTGATTATCAAAAAAACGGACACATTT ATACTACCAAAAGTACACCCTAATACTCATCAGTCAAATGTTTCGTGATGCTTTCGGCTT TTATCTAAATGAAGATGAAAAAAAACACAAATGAAAACAAAAATAGGAAAATATTCCGTA CCCAAATAATCATACCTAAACGAGTAGCGAGTAAGATAAGAAAAAAACACCAAACCGTTT TTGTCACATCTAAGATAAATCTATAAATCAATGATATCGTTCGAAACGAACATACAACAT AGGCTAGAGTATTTTATTCGTTTTTAAAAATCATACCCTCGTTACGCTCTACAGGTCTAG TGCGACCGCATGTTTTAATTTTGTTGTTTTTATCTATTAACTTAAGAAATAATTAATTAA AAACTCCAATCAAAAGACATTCTTACATTAAAAAAAAACACACATACATATTTATACAAG CCGCAATAATATGATTCATTGTTGATGGTTCGGCTTCATACAGACACGTACAAACAAAAA TATATGATTTTTGCGGTTGATTTTGTAACGCTTTCTCTAAACAATCGTTGCAAGAAGGAA GTTTGTTCCTTGTTTTAAAAATGTTATATAAATGTTCGCCATATCTAAATTAATTATTTC ACCCCATAAATGCGTGTGCAATGAAAATTGAGATTTGTTTGGGAGAGTGCCTTTGATGCG TATAATAACTCTAAGGNATATATTGTAATCTAACGTGAGAAACCCTATATGCACACCCTT TTTCCATCGGGAAAGCGAGAAAAAAATGNCAGTTATGCTCAGTTCAGTTAAGATAAANGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)