Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Anopheles gambiae
cluster # 4927 cluster # 4927       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4927#0 length = 924 sequences # 4  

consensusID : consensus_4927#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 924
fasta sequence
                              [CCGCGGACGCGTGGGTTTTTTTATCGCTTTCTCATAAAAGATCCTTGATTTTGTCGTGACATCCTTTCCTTTTTTCCCGAATGTACCCCGTAGAAGAAAAAAAAAATCACTCCCCTTCTCCTAATTGGTTTGTGGGGATGGGGGCATCACCGACCCACCCCCCTCGCCCTAATACACCTTCCTTTTCCCCTTCCTCTCCCAACTATTAATTATCTAGATTCGGCTAGTTGTGTGGGTGTTCGCTGTGTGATTTCCGGTTAAATGATTGCACGAAATTGGATTGTGTGTGGAATTCAAATTGGAATTAATGGTAACCATTGCCATTAAAGGGTTTCTATCCAGTTGTTTGTATGAAATGAATGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGACTAGCTGCATGTGTAAGGATTGGATGAACCCCCGGGGAGATATGAACCCTTTGACCACTGCTCCCCCCTTCAAGTAGCCCCCCTACTTCATCAGCGCATGCACAACGGCCTTCGCGTTCAGCGCCTTCAGATCGGTGTACGTTTGCCCGGTGCCGACGAACACGATCGGCTGCCCGGTAATGTACGTCATGGAGATGGCCGCACCGACCTTGTCGTCGATCGTGTCAAACTTCGTCAGCACAATGCCGT-CGATGATGTGGGGCCGCTCGCTCGACGAGTAGTCGGCCAGCGCCTGGTTGAACTTGACCAGCTGATCGACCGCCTCATTCCCCACCAGCGCCTCGCCCACAAACAGCACCAGGTCGGGTTCGTTCACCTTGATCAGCTTCGCGAGCGCACGCATCAGCGGCTCATTGTCCTGCATCCGGCCGGCCGTGTCGATCAGCACCACATCGATCTTGCTATCGTTCGCGTACCGGATCGCTTCCATCGCAATGCCGGCCGCATCCTTCCCGTATCCCTTCTCGTACAGCTG]

[+] EMBL BM657332             [CCGCGGACGCGTGGGTTTTTTTATCGCTTTCTCATAAAAGATCCTTGATTTTGTCGTGACATCCTTTCCTTTTTTCCCGAATGTACCCCGTAGAAGAAAAAAAAAATCACTCCCCTTCTCCTAATTGGTTTGTGGGGATGGGGGCATCACCGACCCACCCCCCTCGCCCTAATACACCTTCCTTTCTCCCTTCCTCTCCCAACTATTAATTATCTAGATTCGGCTAGCTGTGTGGGTGTTCGCTGTGTGATTTCCGGTTAAATGATTGCACGAAATTGGATTGTGGGTGGAATTCAAATTGGAATTAATGGTAACCATTGCCATTAAAGGGTTTCTATCCAGTTGATTGTATGAAATGAATGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGACTAGCTGCATGTGTAAGGATTGGATGAACCCCCTGGGAGATATGAACCCTTTGACC   GCTCCCCCCTTCAAGTAGCCATCCTACTTCATCAGCGCATGCACGACGGCCTTCGCGTTCAGCGCCTTCAGATCGGTGTACGTTTGCCCGGTGCCGACGAACACGATCGGCTGCCCGGTAATGTACGTCATGGAGATGGCCGCACCGACCTTGTCGTCGATCGTGTCAAACTTCGTCAGCACAATGCCGTCCAATGATGTGGGGCCGCTCGCTCGACGAGTAGTCGGCCAGCGCCTGGTTGAACTTGACCA                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AGA282625            [                                                                                      CCCGTAGAAG  AAAAAAAATCACTCCCCTTCTCCTAATTGGTTTGTGGGGATGGGGGCATCACCGAC   CCCCCCTCGCCCTAATACACCTTCCTTTTCCCCTTCCTCTCCCAACTATTAATTATCTAGATTCGGCTAGTTGCGTGGGTGTTCGCTGTGTGATTTCCGGTTAAATGATTGCACGAAATTGGATTGTGTGTGGAATTCAAATTGGAATTAATGGTAACCATTGCCATTAAAGGGTTTCTATCCAGTTGTTTGTATGAAATGAATGG    GTGTGTGTGTGTATTTGTGTGACTAGCTGCATGTGTAAGGATTGGATGAACCCCCGGGGAGATATGAACCCTTTGACCACTGCTCCCCCCTTCAAGTAGCCCCCCTACTTCATCAGCGCATGCACAACGGCCTTCGCGTTCAGCGCCTTCAGATCGGTGTACGTTTGCCCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL BX627010             [                                                                                                                                                                                   TCCTTTTCCCCTTCCTCTCCCAACTATTAATTATCTAGATTCGGCTAGTTGTGTGGGTGTTCGCTGTGTGATTTCCGGTTAAACGATTGCACGAAGTTGGATTGTGTGTGGAATTCAAATTGGAATTAATGGTAACCATTGCCATTAAAGGGTTTCTATCCAGTTGTTTGTATGAAATGAATGGGTGTGTGTGTGTATG    TGTGTGACTAGCTGCATGTGTAAGGATTGGATGAACCCCCGGGGAGATATGAACCCTTTGACCACTGCTCCCTCCTTCAAGTAGCCCCCCTACTTCATCAGCGCATGCACAACGGCCTTCGCGTTTAGCGCCTTCAGATCGGTGTACGTTTGCCCGGTGCCGACGAACACGATCGGCTGCCCGGTAATGTACGTCATGGAGATGGCCGCACCGACCTTGTCGTCGATCGTGTCAAACTTCGTCAGCACAATGCCGT CGATGATGTGGGGCCGCTCGCTCGACGAGTAGTCGGCCAGCGCCTGGTTGAACTTGACCAGCTGATCGACCGCCTCATTCCCCACCAGCGCCTCGCCCACAAACAGCACCAGGTCGGGTTCGTTCACCTTGATCA                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL AGA280995            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GCCCGGTGCCGACGAACACGATCGGCTGCCCGGTAATGTACGTCATGGAGATGGCCGCACCGACCTTGTCGTCGATCGTGTCAAACTTCGTCAGCACAATGCCGT CGATGATGTGGGGCCGCTCGCTCGACGAGTAGTCGGCCAGCGCCTGGTTGAACTTGACCAGCTGATCGACCGCCTCATTCCCCACCAGCGCCTCGCCCACAAACAGCACCAGGTCGGGTTCGTTCACCTTGATCAGCTTCGCGAGCGCACGCATCAGCGGCTCATTGTCCTGCATCCGGCCGGCCGTGTCGATCAGCACCACATCGATCTTGCTATCGTTCGCGTACCGGATCGCTTCCATCGCAATGCCGGCCGCATCCTTCCCGTATCCCTTCTCGTACAGCTG]


>consensus_4927#0 CCGCGGACGCGTGGGTTTTTTTATCGCTTTCTCATAAAAGATCCTTGATTTTGTCGTGAC ATCCTTTCCTTTTTTCCCGAATGTACCCCGTAGAAGAAAAAAAAAATCACTCCCCTTCTC CTAATTGGTTTGTGGGGATGGGGGCATCACCGACCCACCCCCCTCGCCCTAATACACCTT CCTTTTCCCCTTCCTCTCCCAACTATTAATTATCTAGATTCGGCTAGTTGTGTGGGTGTT CGCTGTGTGATTTCCGGTTAAATGATTGCACGAAATTGGATTGTGTGTGGAATTCAAATT GGAATTAATGGTAACCATTGCCATTAAAGGGTTTCTATCCAGTTGTTTGTATGAAATGAA TGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGACTAGCTGCATGTGTAAGGATTGGATGAACCC CCGGGGAGATATGAACCCTTTGACCACTGCTCCCCCCTTCAAGTAGCCCCCCTACTTCAT CAGCGCATGCACAACGGCCTTCGCGTTCAGCGCCTTCAGATCGGTGTACGTTTGCCCGGT GCCGACGAACACGATCGGCTGCCCGGTAATGTACGTCATGGAGATGGCCGCACCGACCTT GTCGTCGATCGTGTCAAACTTCGTCAGCACAATGCCGTCGATGATGTGGGGCCGCTCGCT CGACGAGTAGTCGGCCAGCGCCTGGTTGAACTTGACCAGCTGATCGACCGCCTCATTCCC CACCAGCGCCTCGCCCACAAACAGCACCAGGTCGGGTTCGTTCACCTTGATCAGCTTCGC GAGCGCACGCATCAGCGGCTCATTGTCCTGCATCCGGCCGGCCGTGTCGATCAGCACCAC ATCGATCTTGCTATCGTTCGCGTACCGGATCGCTTCCATCGCAATGCCGGCCGCATCCTT CCCGTATCCCTTCTCGTACAGCTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)