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Anopheles gambiae
cluster # 5041 cluster # 5041       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5041#0 length = 907 sequences # 4  
consensusID : consensus_5041#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 907
fasta sequence 
                              [CACTTCCCGCCCGTTCAGGAACCGCGTCCGTGTTGTACCGGAGCGTCACTGCAGCAGATCGATCCGCTCGCTCGTGGTTAACTTCAGGGCCGATGACGGCAGCTGTAGCGCGCGCAGATTGTCCTCGATGTACGGCACGATGGCGAGCCGCAGATCGTATAGCCGGCAGCCGTTCCGCATGATCAGATTGTACAGCGCGAGGTGCACGAGGTTCACCGTGCCCAGCTCGAACCGCCGGACGAACTCGTGCCCGTGGTTGCAGATCGAGCAGATGAACA-GGTAGAACGTGTCGCCCAGCAGGATGGGAAACTGCAGGCTGCGTACGCACCGCCCGTGGAACCACTGTTCGCAGCGCCGGCACTGGATCATTTCGCGCGTCCACTCGCCGTCAGCACCGCAGTAGCAGTAGTGCCGTTCCGCGTTCACCCGATGCTCGCTATCCCAGTGGAGGGCGTGCAGACTGTACGGCAGCTGGCTGGCGCTGGTTAGCGGCGAAAACTCATCTGGAATGACGATCGAACGAAATTTAGGCGCCGGTTGCGCTGATGGTGCTTGGGATGCTGCTGATAGGCTGTTGGGTGCGTGTTCGTTCGTAAGCGAAACACACTCTTCTTCCGGCTCCTTCTCCTCCACGTGATCCACGAGCATCTCCTGTTGGTCCCGTTCGCCCGAGCATTTCCCATTCGCTGCTGGTCGCTCCGGCTCCTCCTGCTCTAAGTATTCCTCCAAAAACTCCTCCTGTGGCCTCTGGTCCACGTGCTCTAACTGCTTCTCCCGTTTCGTCCGCTCTACCTGCTCCACGTTTTCTTGCCGCTGCTGCTCCGCCTTGTCGTGCCGTTCCTCCCGGTCCACCTGTACCGCCTGATCAACCGAGCGCGGGCAGGGGGACGGTTGCCTGGGGTTGGCC]

[+] EMBL CNS08JJR             [CACTTCCCGCCCGTTCAGGAACCGCGTCCGTGTTGTACCGGAGCGTCACTGCAGCAGATCGATCCGCTCGCTCGTGGTTAACTTCAGGGCCGATGACGGCAGCTGTAGCGCGCGCAGATTGTCCTCGATGTACGGCACGATGGCGAGCCGCAGATCGTATAGCCGGCAGCCGTTCCGCATGATCAGATTGTACAGCGCGAGGTGCACGAGGTTCACCGTGCCCAGCTCGAACCGCCGGACGAACTCGTGCCCGTGGTTGCAGATCGAGCAGATGAACA GGTAGAACGTGTCGCCCAGCAGGATGGGAAACTGCAGGCTGCGTACGCACCGCCCGTGGAACCACTGTTCGCAGCGCCGGCACTGGATCATTTCGCGCGTCCACTCGCCGTCAGCACCGCAGTAGCAGTAGTGCCGTTCCGCGTTCACCCGATGCTCGCTATCCCAGTGGAGGGCGTGCAGACTGTACGGCAGCTGGCTGGCGCTGGTTAGCGGCGAAAACTCATCTGGAATGACGATAGAACGAAATTTAGGCGCCGGTTGCGCTGATGGTGCTTGGGATGCTGCTGATAGGCTGTTGGGTGCGTGTTCGTTCGTAAGCGAAACACACTCTTCTTCCGGCTCCTTCTCCTCCACGTGATCCACGAGCATCTCCTGTTGGTCCCGTTCGTTTG TCATTTCCCATTCGCTGCTGGTCGCTCCGGCTCCTCCTGCTCTAAGTATTCCTCCAAAAACTCCTCCTGTGGCCTCTGGTCCACGTGCTCTAACTGCTTCTCCCGTTTCGTCCGCTCTACCTGCTCCACGTTTTCTTGCCGCTGCTGCTCCGCCTTGTCGTGCCGTTCCTCCCGGTCCACCTGTACCGCCTGATCAACCGAGCGCGGGCAGGGGGACGGTTGCCTGGGGTTGGCC]
[+] EMBL CNS08FZ2             [      gCGCGCGTTCAGGAACCG GTCCGTGTTGTACCGGAGCGTCACTGCAGCAGATCGATCCGCTCGCTCGTGGTTAACTTCAGGGCCGATGACGGCAGCTGTAGCGCGCGCAGATTGTCCTCGATGTACGGCACGATGGCGAGCCGCAGATCGTATAGCCGGCAGCCGTTCCGCATGATCAGATTGTACAGCGCGAGGTGCACGAGGTTCACCGTGCCCAGCTCGAACCGCCGGACGAACTCGTGCCCGTGGTTGCAGATCGAGCAGATGACCAGGGTAGAACGTGTCGCCCAGCAGGATGGGAAACTGCAGGCTGCGTACGCACCGCCCGTGGAACCACTGTTCGCAGCGCCGGCACTGGATCATTTCGCGCGTCCACTCGCCGTCAGCACCGCAGTAGCAGTAGTGCCGTTCCGCGTTCACCCGATGCTCGCTATCCCAGTGGAGGGCGTGCAGACTGTACGGCAGCTGGCTGGCGCTGGTTAGCGGCGAAAACTCATCTGGAATGACGATCGAACGAAATTTAGGCGCCGGTTGCGCTGATGGTGCTTGGGATGCTGCTGATAGGCTGTTGGGTGCGTGTTCGTTCGTAAGCGAAACACACTCTTCTTCCGGCTCCTTCTCCTCCACGTGATCCACGAGCATCTCCTGTTGGTCCCGTTCGCCCGAGCATTTCCCATTCGCTGCTGGTCGCTCCGGCTCCTCCTGCTCTAAGTATTCCTCCAAAAACTCCTCCTGTGGCCTCTGGTCCACGTGCTCTAACTGCTTCTCCCGTTTCGTCCGCTCTACCTGCTCCACGTTTTCTTGCCGCTGCTGCTCCGCCTTGTCGTGCCGTTCCTCCCGGTCCACCTGTACCGCCTGATCAACCGAGCGCGGGCAGGGGGAC                  ]
[+] EMBL CNS08JCP             [                              TGTTGTACCGGAGCGTCACTGCAGCAGATCGATCCGCTCGCTCGTGGTTAACTTCAGGGCCGATGACGGCAGCTGTAGCGCGCGCAGATTGTCCTCGATGTACGGCACGATGGCGAGCCGCAGATCGTATAGCCGGCAGCCGTTCCGCATGATCAGATTGTACAGCGCGAGGTGCACGAGGTTCACCGTGCCCAGCTCGAACCGCCGGACGAACTCGTGCCCGTGGTTGCAGATCGAGCAGATGAACA GGTAGAACGTGTCGCCCAGCAGGATGGGAAACTGCAGGCTGCGTACGCACCGCCCGTGGAACCACTGTTCGCAGCGCCGGCACTGGATCATTTCGCGCGTCCACTCGCCGTCAGCACCGCAGTAGCAGTAGTGCCGTTCCGCGTTCACCCGATGCTCGCTATCCCAGTGGAGGGCGTGCAGACTGTACGGCAGCTGGCTGGCGCTGGTTAGCGGCGAAAACTCATCTGGAATGACGATCGAACGAAATTTAGGCGCCGGTTGCGCTGATGGTGCTTGGGATGCTGCTGATAGGCTGTTGGGTGCGTGTTCGTTCGTAAGCGAAACACACTCTTCTTCCGGCTCCTTCTCCTCCACGTGATCCACGAGCATCTCCTGTTGGTCCCGTTCGCCCGAGCATTTCCCATTCGCTGCTGGTCGCTCCGGCTCCTCCTGCTCTAAGTATTCCTCCAAAAACTCCTCCTGTGGCCTCTGGTCCACGTGCTCTAACTGCTTCTCCCGTTTCGTCCGCTCTACCTGCTCCACGTTTTCTTACCGCTGCTGCTCCGCCTTGTCGTGCCGTTCCTCCCGGTCCACCTGTACCGCCTGATCAACCGAGCGCGGGCAGGGGGACGGTTGCCTGGGGTTG   ]
[+] EMBL CNS08QVZ             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTAGCAGTAGTGCCGTTCCGCGTTCACCCGATGCTCGCTATCCCAGTGGAGGGCGTGCAGACTGTACGGCAGCTGGCTGGCGCTGGTTAGCGGCGAAAACTCATCTGGAATGACGATCGAACGAAATTTAGGCGCCGGTTGCGCTGATGGTGCTTGGGATGCTGCTGATAGGCTGTTGGGTGCGTGTTCGTTCGTAAGCGAAACACACTCTTCTTCCGGCTCCTTCTCCTCCACGTGATCCACGAGCATCTCCTGTTGGTCCCGTTCGCCCGAGCATTTCCCATTCGCTGCTGGTCGCTCCGGCTCCTCCTGCTCTAAGTATTCCTCCAAAAACTCCTCCTGTGGCCTCTGGTCCACGTGCTCTAACTGCTTCTCCCGTTTCGTCCGCTCTACCTGCTCCACGTTTTCTTGCCGCTGCTGCTCCGCCTTGTCGTGCCGTTCCTCCCGGTCCACCTGTACCGCCTGATCAACCGA                                  ]




>consensus_5041#0
CACTTCCCGCCCGTTCAGGAACCGCGTCCGTGTTGTACCGGAGCGTCACTGCAGCAGATC
GATCCGCTCGCTCGTGGTTAACTTCAGGGCCGATGACGGCAGCTGTAGCGCGCGCAGATT
GTCCTCGATGTACGGCACGATGGCGAGCCGCAGATCGTATAGCCGGCAGCCGTTCCGCAT
GATCAGATTGTACAGCGCGAGGTGCACGAGGTTCACCGTGCCCAGCTCGAACCGCCGGAC
GAACTCGTGCCCGTGGTTGCAGATCGAGCAGATGAACAGGTAGAACGTGTCGCCCAGCAG
GATGGGAAACTGCAGGCTGCGTACGCACCGCCCGTGGAACCACTGTTCGCAGCGCCGGCA
CTGGATCATTTCGCGCGTCCACTCGCCGTCAGCACCGCAGTAGCAGTAGTGCCGTTCCGC
GTTCACCCGATGCTCGCTATCCCAGTGGAGGGCGTGCAGACTGTACGGCAGCTGGCTGGC
GCTGGTTAGCGGCGAAAACTCATCTGGAATGACGATCGAACGAAATTTAGGCGCCGGTTG
CGCTGATGGTGCTTGGGATGCTGCTGATAGGCTGTTGGGTGCGTGTTCGTTCGTAAGCGA
AACACACTCTTCTTCCGGCTCCTTCTCCTCCACGTGATCCACGAGCATCTCCTGTTGGTC
CCGTTCGCCCGAGCATTTCCCATTCGCTGCTGGTCGCTCCGGCTCCTCCTGCTCTAAGTA
TTCCTCCAAAAACTCCTCCTGTGGCCTCTGGTCCACGTGCTCTAACTGCTTCTCCCGTTT
CGTCCGCTCTACCTGCTCCACGTTTTCTTGCCGCTGCTGCTCCGCCTTGTCGTGCCGTTC
CTCCCGGTCCACCTGTACCGCCTGATCAACCGAGCGCGGGCAGGGGGACGGTTGCCTGGG
GTTGGCC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)