Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Anopheles gambiae
cluster # 5396 cluster # 5396       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5396#0 length = 1252 sequences # 4  
consensusID : consensus_5396#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1252
fasta sequence 
                              [ATCGCCCCGAGGTTTNGGTTAGAATAAAATTGTACTATATAGAAAACACAACTATACCAACATATTGTANTTAGACTTGACATTCTTCGACTTGACAGCAAAGTTTATATTGTTGGCCTACATTCTACTATCAGTAATAATACGGAATGAAGGGGGGTGGGGTCTGAGTGGGTCAAGCTGATTAGGAAGTTACACGTGGCAAGGTTAGAACTTGTATTCATTGGGTTAAAACCAAACGATTCGAAGTATCGCTCTTGTCATCTCATTTGTTGTACAGTTGCATTAAAGCAACGTATTTTCTTTCCTTGAAATGCTTGGACAAGCTTGATGCCATCGTTTCAAGGTTTTTTTTAAATTTTGTTGCTCAAGATTTCAGTACAATTTCAACTCCAAGATGATGCTTTTCGTTTATTTAATGCTCAATGCTGATCAAAGAGTAGAAACATAGCGAAGATCATTTGCAGCTATTTCCTTACTCATCGCAGTTGTGGACAGGCGTGCCGAGCCCTGAACTCGTCGTAGCAGTTGCGCTCGATCACTGGACGTTGCGCTCACGCACACTACGACGCACAGGCTAGCGACACGCGCTTTGTGTTGTGAGTTGGTGCAGAGCGCACAAAAGGAATTAGTGTGAATCAGGCTGTGTAGGGCTGACGGTGCGTTTCGTGTGCGGGGCATAGTCCTAATTTTTTGTGTGTTTTTATATTGTTTATTAAAGTGGAACGCCATTTATACGAATTGTCGAATGACATGGATAGTGAGTCCAAGTACAGTAGAACATCGATTATACGAAGAGGATTAACCGGCGGGCCGCTTAACCGTGGGCATAAATTAGACAGCTGTTCAAGCGTGGCGAACATTTGCAGCGTCGGTGAAGTTGCTAAACAATATTTTGTGTGCAGCTTTTTAGTGTCTAGCGATAGGTTTGAGCTTCATTTGTGTGCATGAACAATTGTTAAACCTATAGTTATTGATTCAAATAATGTTTTGCTAATGATTAACCGATTAATCGGCTACCGGCCGGTCCCAAGCTACCCGGATAATCGACGTTTTACTGTTTGTTTATTTGCTAAAAATTTTGGGATTTTTTTTTTAAATTTAGGTAAATACCACTTTTTTCAAATATCTTTCTCTGCGAGCAATGTCATCGATTCTCAATAACAAGGATATATGGACAGCCGGATAGACGGTACTCGACGGTACAGCGTCCTACTTTTAATTTTTGTTTGTTAATAAACCGAGTGTATTCAAA]

[+] EMBL AL932767             [ATCGCCCCGAGGTTTNGGTTAGAATAAAATTGTACTATATAGAAAACACAACTATACCAACATATTGTANTTAGACTTGACATTCTTCGACTTGACAGCAAAGTTTATATTGTTGGCCTACATTCTACTATCAGTAATAATACGGAATGAAGGGGGGTGGGGTCTGAGTGGGTCAAGCTGATTAGGAAGTTACACGTGGCAAGGTTAGAACTTGTATTCATTGGGTTAAAACCAAACGATTCGAAGTATCGCTCTTGTCATCTCATTTGTTGTACAGTTGCATTAAAGCAACGTATTTTCTTTCCTTGAAATGCTTGGACAAGCTTGATGCCATCGTTTCAAGGTTTTTTTTAAATTTTGTTGCTCAAGATTTCAGTACAATTTCAACTCCAAGATGATGCTTTTCGTTTATTTAATGCTCAATGCTGATCAAAGAGTAGAAACATAGCGAAGATCATTTGCAGCTATTTCCTTACTCATCGCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BM584918             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccgCAACTCCAAGATGATGCTTTTCGTTTATTTAATGCTCAATGCTGATCAAAGAGTAGAAACATAGCGAAGATCATTTGCAGCTATTTCCTTACTCATCGCAGTTGTGGACAGGCGTGCCGAGCCCTGAACTCGTCGTAGCAGTTGCGCTCGATCACTGGACGTTGCGCTCACGCACACTACGACGCACAGGCTAGCGACACGCGCTTTGTGTTGTGAGTTGGTGCAGAGCGCACAAAAGGAATTAGTGTGAATCAGGCTGTGTAGGGCTGACGGTGCGTTTCGTGTGCGGGGCATAGTCCTAATTTTTTGTGTGTTTTTATATTGTTTATTAAAGTGGAACGCCATTTATACGAATTGTCGAATGACATGGATAGTGAGTCCAAGTACAGTAGAACATCGATTATACGAAGAGGATTAACCGGCGGGCCGCTTAACCGTGGGCATAAATTAGACAGCTGTTCAAGCGTGGCGAACATTTGCAGCGTCGGTGAAGTTGCTAAACAATATTTTGTGTGCAGCTTTTTAGTGTCTAGCGATAGGTTTGAGCTTCATTTGTGTGCATGAACCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BM607624             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGCCCTGAACTCCTCGTAGCAGTTGCGCTCGATCACTGGACGTTGCGCTCACGCACACTACGACGCACAGGCTAGCGACACGCGCTTTATGTTGAGAGTTTGTGCAGAGCGCACAAAAGGAATTAGTGTGAATCAGGCTGTGTAGGGCTGACGGTGCGTTTCGTGTGCGGGGCATAGTCCTAATTTTTTGTGTGTTTTTATATTTTTTATTAAAGTGGAACGCCATTTATACGAATTGTCGAATGACATGGATAGTGAGTCCAAGTACAGTAGAACATCGATTATACGAAGAGGATTAACCGGCGGGCCGCTTAACCGTGGGCATAAATTAGACAGCTGTTCAAGCGTGGCGAACATTTGCAGCGTTGGTCAAGTTGCTAAATAATATTTTGTGTGCAGCTTTTTAGTGTCTAGCGATAGGTTTGAGCTTCATTTGTGTGCATGAACAATTGTTAAACCTATAGTTATTGATTCAAATAATGTTTTGCTAATGATTAACCGATTAATCGGCTACCGGCCGGTCCCAAGCT                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BX621479             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CGTTTCGTGTGCGGGGCATAGTCCTAATTTTTTGTGTGTTTTTATATTGTTTATTAAAGTGGAACGCCATTTATACGAATTGTCGAATGACATGGATAGTGAGTCCAAGTACAGTAGAACATCGATTATACGAAGAGGATTAACCGGCGGGCCGCTTAACCGTGGGCATAAATTAGACAGCTGTTCAAGCGTGGCGAACATTTGCAGCGTCGGTGAAGTTGCTAAACAATATTTTGTGTGCAGCTTTTTAGTGTCTAGCGATAGGTTTGAGCTTCATTTGTGTGCATGAACAATTGTTAAACCTATAGTTATTGATTCAAATAATGTTTTACTAATGATTTACCGATTAAACGGCCACCGCCCGGTCCCAAGCTACCCGGATAATCGACGTTTTACTGTTTGTTTATTTGCTAAAAATTTTGGGATTTTTTTTTTAAATTTAGGTAAATACCACTTTTTTCAAATATCTTTCTCTGCGAGCAATGTCATCGATTCTCAATAACAAGGATATATGGACAGCCGGATAGACGGTACTCGACGGTACAGCGTCCTACTTTTAATTTTTGTTTGTTAATAAACCGAGTGTATTCAAA]




>consensus_5396#0
ATCGCCCCGAGGTTTNGGTTAGAATAAAATTGTACTATATAGAAAACACAACTATACCAA
CATATTGTANTTAGACTTGACATTCTTCGACTTGACAGCAAAGTTTATATTGTTGGCCTA
CATTCTACTATCAGTAATAATACGGAATGAAGGGGGGTGGGGTCTGAGTGGGTCAAGCTG
ATTAGGAAGTTACACGTGGCAAGGTTAGAACTTGTATTCATTGGGTTAAAACCAAACGAT
TCGAAGTATCGCTCTTGTCATCTCATTTGTTGTACAGTTGCATTAAAGCAACGTATTTTC
TTTCCTTGAAATGCTTGGACAAGCTTGATGCCATCGTTTCAAGGTTTTTTTTAAATTTTG
TTGCTCAAGATTTCAGTACAATTTCAACTCCAAGATGATGCTTTTCGTTTATTTAATGCT
CAATGCTGATCAAAGAGTAGAAACATAGCGAAGATCATTTGCAGCTATTTCCTTACTCAT
CGCAGTTGTGGACAGGCGTGCCGAGCCCTGAACTCGTCGTAGCAGTTGCGCTCGATCACT
GGACGTTGCGCTCACGCACACTACGACGCACAGGCTAGCGACACGCGCTTTGTGTTGTGA
GTTGGTGCAGAGCGCACAAAAGGAATTAGTGTGAATCAGGCTGTGTAGGGCTGACGGTGC
GTTTCGTGTGCGGGGCATAGTCCTAATTTTTTGTGTGTTTTTATATTGTTTATTAAAGTG
GAACGCCATTTATACGAATTGTCGAATGACATGGATAGTGAGTCCAAGTACAGTAGAACA
TCGATTATACGAAGAGGATTAACCGGCGGGCCGCTTAACCGTGGGCATAAATTAGACAGC
TGTTCAAGCGTGGCGAACATTTGCAGCGTCGGTGAAGTTGCTAAACAATATTTTGTGTGC
AGCTTTTTAGTGTCTAGCGATAGGTTTGAGCTTCATTTGTGTGCATGAACAATTGTTAAA
CCTATAGTTATTGATTCAAATAATGTTTTGCTAATGATTAACCGATTAATCGGCTACCGG
CCGGTCCCAAGCTACCCGGATAATCGACGTTTTACTGTTTGTTTATTTGCTAAAAATTTT
GGGATTTTTTTTTTAAATTTAGGTAAATACCACTTTTTTCAAATATCTTTCTCTGCGAGC
AATGTCATCGATTCTCAATAACAAGGATATATGGACAGCCGGATAGACGGTACTCGACGG
TACAGCGTCCTACTTTTAATTTTTGTTTGTTAATAAACCGAGTGTATTCAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)