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Anopheles gambiae
cluster # 5517 cluster # 5517       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5517#0 length = 1120 sequences # 4  

consensusID : consensus_5517#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1120
fasta sequence
                              [CCGCCCACGCGTCCGGTTTTAGTAACCGAACAGTTACATGCTAAATCATACACAATGCAAATCAGTGCTACCGTGTTCATATTGGTTCTAGTACTAGGGCATAGGGAAGAAGTTAGTGGTGCCACTATTGCTGATCGTTTATCTCCAATGGCACTCATTATCGGTGGCACTGATGTTGAGGATGGGAAGGCACCATATCTAGCTGGTTTGGTGTATAACAACTCTGCAACATATTGTGGTGGCTCGATTATAGCCGCTCGATGGATCTTGACAGCAGCTCACTGTGTAACAAACGTTAATGTCACAAATTTAACTGTAGTACGGGTGGGAACAAATGATAACTATAAAGGTGGATCAATGTACCAAATCGATCGTGTTATACCACATGAGCGATACATTGCTATAACATTCCGCAATGACGTTGCGCTGCTTCGTCTGAAGACCCCAATAAAATTTGAAGAACACGTTGAGAAGATAGAACTTAACGAGGAGCTCGTTCCGATTAATGCTACACTGACAATTGTTGGATGGGGATTCGTTGGATGGAACAAAGAAAACCCAAAACGAACTCAAGTGATTAAAGTTCAACATATTGGTCTAAACCGTTGTCGAAAGATGGCAAACGGTAGTGCTATTTACCCTGAACATCTGTGTACTTTTTCTAGAGCAGGGCATGGTCCGTGCAAGGGCGATTCTGGTAGTCCTGTGGTATGGAAAGGGAAACAGGTTGGCGTAGTCAGTTGGGCAATGGCAGGCGTGTGTGCAATTGGATTACCCGATGTACAAGCCAGCATTAGGTACTTCTATGGTTGGATTACGAAAACAATGGCAGCTAATAGTGATCATTGAAATCTACAAAACTGATATCAGATGTGAGGCAATGACAGTATCAAATGCGCTCTTGTAGAGGTAAATGATAATAACTTTGCAACCCCCTTTATTGGCTATAATATGGTAAAGTAAATCTATGATGCCATTAAGCAATGAAACCTTTGGGACCCAATTATTGATTCGAAAATAATATTCATATACGGTGGAGCGCCGTTTATACGGATACCTTTTATTCGGCCATGTGCATAAAAAACATACAATACATTGCAAATTTCAAACATTCTCATTG]

[+] EMBL BM656366             [CCGCCCACGCGTCCGGTTTTAGTAACCGAACAGTTACATGCTAAATCATACACAATGCAAATCAGTGCTACCGTGTTCATATTGGTTCTAGTACTAGGGCATAGGGAAGAAGTTAGTGGTGCCACTATTGCTGATCGTTTATCTCCAATGGCACTCATTATCGGTGGCACTGATGTTGAGGATGGGAAGGCACCATATCTAGCTGGTTTGGTGTATAACAACTCTGCAACATATTGTGGTGGCTCGATTATAGCCGCTCGATGGATCTTGACAGCAGCTCACTGTGTAACAAACGTTAATGTCACAAATTTAACTGTAGTACGGGTGGGAACAAATGATAACTATAAAGGTGGATCAATGTACCAAATCGATCGTGTTATACCACATGAGCGATACATTGCTATAACATTCCGCAATGACGTTGCGCTGCTTCGTCTGAAGACCCCAATAAAATTTGAAGAACACGTTGAGAAGATAGAACTTAACGAGGAGCTCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BX610267             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTGCTTCGTCTGAAGACCCCAATAAAATTTGAAGAACACGTTGAGAAGATAGAACTTAACGAGGAGCTCGTTCCGATTAATGCTACACTGACAATTGTTGGATGGGGATTCGTTGGATGGAACAAAGAAAACCCAAAACGAACTCAAGTGATTAAAGTTCAACATATTGGTCTAAACCGTTGTCGAAAGATGGCAAACGGTAGTGCTATTTACCCTGAACATCTGTGTACTTTTTCTAGAGCAGGGCATGGTCCGTGCAAGGGCGATTCTGGTAGTCCTGTGGTATGGAAAGGGAAACAGGTTGGCGTAGTCAGTTGGGCAATGGCAGGCGTGTGTGCAATTGGATTACCCGATGTACAAGCCAGCATTAGGTACTTCTATGGTTGGATTACGAAAACAATGTCAGCTAATAGTGATCATTGAAATCTACAAAACTGATATCAGATGTGAGGCAATGACAGTATCAAATGCGCTCTTGTAGAGGTAAATGATAATAACTTTGCAACCCCCTTTATTGGCTATAATATGGTAAAGTAAATCTATGATGCCATTAAGCAATGAAACCTTTGGGACCCAATTATTGATTCGAAAATAATATTCATATACGGTGGAGCGCCGTTTATACGGATACCTTTTATTCGGCCATGTGCATAAAAAACATACAATACATTGCAAATTTCAAACATTCTCATTG]
[+] EMBL BM579388             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ccgCCCAAAACGAACTCAAGTGATTAAAGTTCAACATATTGGTCTAAACCGTTGTCGAAAGATGGCAAACGGTAGTGCTATTTACCCTGAACATCTGTGTACTTTTTCTAGAGCAGGGCATGGTCCGTGCAAGGGCGATTCTGGTAGTCCTGTGGTATGGAAAGGGAAACAGGTTGGTGTAGTCAGTTGGGCAATGGCGGGCGTGTGTGCAATTGGATTACCTGATGTACAAGCCAGCATTAGGTACTTCTATGGTTGGATTAAGAAAACAATGGCAGCTAATAGTGATCATTGAAATCTACGAAACTGATATCAGATGTTAGGCAATGACAGTATCAAATGCGCTCTTGTAGAGGTAAATGATAATAACTTTGCAACCCCCTTTATTGGCTATAATATG                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BX618770             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGTTCAACATATTGGTCTAAACCGTTGTCGAAAGATGGCAAACGGTAGTGCTATTTACCCTGAACATCTGTGTACTTTTTCTAGAGCAGGGCATGGTCCGTGCAAGGGCGATTCTGGTAGTCCTGTGGTATGAAAAGGGAAACAGGTTGGCGTAGTCAGTTGGGCAATGGCAGGCGTGTGTGCAATTGGATTACCCGATGTACAAGCCAGCATTAGGTACTTCTATGGTTGGATTACGAAAACAATGGCAGCTAATAGTGATCATTGAAATCTACAAAACTGATATCAGATGTGAGGCAATGACAGTATCAAATGCGCTCTTGTAGAGGTAAATGATAATAACTTTGCAACCCCCTTTATTGGCTAT                                                                                                                                                                            ]


>consensus_5517#0 CCGCCCACGCGTCCGGTTTTAGTAACCGAACAGTTACATGCTAAATCATACACAATGCAA ATCAGTGCTACCGTGTTCATATTGGTTCTAGTACTAGGGCATAGGGAAGAAGTTAGTGGT GCCACTATTGCTGATCGTTTATCTCCAATGGCACTCATTATCGGTGGCACTGATGTTGAG GATGGGAAGGCACCATATCTAGCTGGTTTGGTGTATAACAACTCTGCAACATATTGTGGT GGCTCGATTATAGCCGCTCGATGGATCTTGACAGCAGCTCACTGTGTAACAAACGTTAAT GTCACAAATTTAACTGTAGTACGGGTGGGAACAAATGATAACTATAAAGGTGGATCAATG TACCAAATCGATCGTGTTATACCACATGAGCGATACATTGCTATAACATTCCGCAATGAC GTTGCGCTGCTTCGTCTGAAGACCCCAATAAAATTTGAAGAACACGTTGAGAAGATAGAA CTTAACGAGGAGCTCGTTCCGATTAATGCTACACTGACAATTGTTGGATGGGGATTCGTT GGATGGAACAAAGAAAACCCAAAACGAACTCAAGTGATTAAAGTTCAACATATTGGTCTA AACCGTTGTCGAAAGATGGCAAACGGTAGTGCTATTTACCCTGAACATCTGTGTACTTTT TCTAGAGCAGGGCATGGTCCGTGCAAGGGCGATTCTGGTAGTCCTGTGGTATGGAAAGGG AAACAGGTTGGCGTAGTCAGTTGGGCAATGGCAGGCGTGTGTGCAATTGGATTACCCGAT GTACAAGCCAGCATTAGGTACTTCTATGGTTGGATTACGAAAACAATGGCAGCTAATAGT GATCATTGAAATCTACAAAACTGATATCAGATGTGAGGCAATGACAGTATCAAATGCGCT CTTGTAGAGGTAAATGATAATAACTTTGCAACCCCCTTTATTGGCTATAATATGGTAAAG TAAATCTATGATGCCATTAAGCAATGAAACCTTTGGGACCCAATTATTGATTCGAAAATA ATATTCATATACGGTGGAGCGCCGTTTATACGGATACCTTTTATTCGGCCATGTGCATAA AAAACATACAATACATTGCAAATTTCAAACATTCTCATTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)