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Anopheles gambiae
cluster # 5855 cluster # 5855       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5855#0 length = 1996 sequences # 4  

consensusID : consensus_5855#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1996
fasta sequence
                              [CCGCTCTGCGAAACGAAATCTCCGACACGCGAAAAAAAAGGACGCGCAAAACCTGCGCAAAACAGGAAACCGATCGACATGACACACGCTTAGAAGGTTTATCCGCGTATTACCTTACAATTTTTCTATTTTTGTTTTTTTTTTTTGTTAACTTTCTCATTTCACTGCTCTTTATGTTCACTCGTCCACTGTTTTGGATGTAAATCATATCCTACCATATACGTACATTCGTTCGTTCGTGATTCGTTGGT-AAGTGTGAAATAACCGCGTATAGTTCGTTAGCCGTTAGTTAGCGTGTAAGCTGCGCAATGTTATAAGAATATAAGATCAATAATGAGGCAGGCTTCTCAAACGTTTACGTTATTAAGTAATAGCAGCAGTAGAGAGGACGCCACTAACTATAATTAATGTTGAATTGCACTATGTAATTGCACTGTCCTATGAGGAGAGAGCA--AGAGAGAGAGAGATGATAGCAAGCTGGTTATGTTGTAGCTTTTATTTAAATTTGTTATCGTAAAACGACGCAAGCTAATGGAAGCGAGAGAGAGA---AAAACC-GGATACAGCAGGACTCGTTATCGAAACTAACAGCATTATTTTGGCAATGGCAAAAGACTTAGAGAATGCATGC----GACACTCCGTATGCAATTGTGCAAGCTCCTCCAAAAACTCACACAAGTGCCATTCTATGCTGTGAGGTGGTGGTACATCTTACAGCGCATAAGGCATCCTCCTCCTCTCGGTATTATTGGCTGCTTTTACAATAACTCACAAGGATTTGCTCACTTCACCCATCCGCAC-CACGCTCTTCGTGAGTGTGGTGAAGTGAGTAAGCGTGTTGTGTTATCAAACCATAGAAAACAAACGCGTTGTATCCATTATATCACACTTGTTCGATTAGAAAATGCTATTCTATATGATGTGCCGCTGTAGTATGTTGCATTCTATATCGTTAGGCAAATTGTTTGATACTCTGTGCAGGCAGCGAACATGTATTATTCCCCCCTCTCTATACTAGATCCATACGTTTATCATTCGTTACAGCTGACAATGCCTCTAGCTATGTTGCCGGCATAGTTTTCTTAGGCAACAACAAGAAAACCAAGGACCCCAACATGTTTAAAGCTATTACCATTTCCGTTCGCGCTCGACAGACAAAACCTGCCAATGGTTTCTATTCAAAGAGGGCAGAAGGGAATCGTCCTTTTAGAAACTCCCTCCGATGTGTTATGCTTAATGCAATCATGCAGATTTTAATAATTGAATTTTGAGCTAAGAAATAGATAAAAGCTGAAAGATAGTTTATTTGCGAGCAAACAAACTTACACATACACACAATCATGTGCTAGGAAAATAGTGTTGTACGTTATTTTGTTTCTGCATAATGCTATGAAATCATTTAATGGAAATCTTTTCTAAAAAGGTGTGTTATTAATCAAAATTAGCTTTGGTGTGTGAAAAGATCCCCACAACAGGACGCCTCAAACAACCCAAAAACACACACCGTACCTGTGAGATTTGTGGCGTGAAACGAAAGAGAGTGGTTATGTAGTAGCTAAAAGTGAAAGTAAATGTGATTTGATAAAAAAAGAAAAGAAAATCGAACCAAAAAGATACAAGCAGATGGTAAATGTTATGCGCTACGCGCCCTTATCTGATGGAATGATAGTTTTAAAAAAACGCATAAATCGTTTAGATGGAATTTTAACGATTTTAAAACCTGTTTAACCCTATCCCAATTCGGTTGGTATGTTTACTTTTTCTATGCATGTTACGTTTTTCCTATTCTCTCTTGTTTAGAGTCCTGTTAAGGACATATTTTTTGTTGCTATAACAAGCTTATCGTGCGTACAAAGAATACATACAACAACAAAAAACACCTTCCCCTTTAGCGAGTGTAGCAAAAAGCGCTGGCAACAACGTTGTGCAGGAAGGATAACCTTTTCTAGTGATTGATAGAATCTTTTCTTTTGTCGATAGCATGAAATAATAAATGGGGT]

[+] EMBL BM657112             [CCGCTCTGCGAAACGAAATCTCCGACACGCGAAAAAAAAGGACGCGCAAAACCTGCGCAAAACAGGAAACCGATCGACATGACACACGCTTAGAAGGTTTATCCGCGTATTACCTTACAATTTTTCTATTTTTGTTTTTTTTTTTTGTTAACTTTCTCATTTCACTGCTCTTTATGTTCACTCGTCCACTGTTTTGGATGTAAATCATATCCTACCATATACGTACATTCGTTCGTTCGTGATTCGTTGGTAAAGTGTGAAATAACCGCGTATAGTTCGTTAGCCGTTAGTTAGCGTGTAAGCTGCGCAATGTTATAAGAATATAAGATCAATAATGAGGCAGGCTTCTCAAACGTTTACGTTATTAAGTAATAGCAGCAGTAGAGAGGACGCCACTAACTATAATTAATGTTGAATTGCACTATGTAATTGCACTGTCCTATGAGGAGAGAGCA  AGAGAGAGAGAGATGATAGCAAGCTGGTTATGTTGTAGCTTTTATTTAAATTTGTTATCGTAAAACGACGCAAGCTAATGGAAGCGAGAGAGAGAGAGAAAACCAGGATACAGCAGGACTCGTTATCGAAACTAACAGCATTATTTTGGCAATGGCAAAAGACTTAGAGAATGCATGCAATAGACACTCCGTATGCAATTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CNS08JTY             [                                                                                                                                                                                                                                                      TTGGT AAGTGTGAAATAACCGCGTATAGTTCGTTAGCCGTTAGTTAGCGTGTAAGTTGCGCAATGTTATAAGAAGATAAGATCAATAATGAGGCAGGCTTCTCAAACGTTTACGTTATTAAGTAATAGCGGCAGTGGAGAGAACGCCACTGACTATAATTAATGTTGAATTGCACTATGTATTTGCCCTGTCCTATGAGGAGAGAGCAAGAGAGAGAGAGAGATGATAGCAAGCTGGTTATGTTGTAGCTTTTATTTAAATTTGTTATCGTAAAACGACGCAAGCTAATGGAAGCGAGAGAGAGA   AAAACC GGATACAATAGGACTCGTCATCGAAACTAACAGCATTATTTTGGCAATGGCAAAAGACTTAGAGAATGCATGC    GACACTCCGTATGCAATTGAGCAAGCTCCTCCAAAAACTCACACAAGTGCCATTCTATGCTGTGAGGTGGTGGTACATCTTACAGCGCATAAGGCATCCTCCTCCTCTCGGTATTATTGGCTGCTTTTACAATAACTCACAAGGATTTGCTCACTTCACCCATCCGCAC CACGCTCTTCGTGAGTGTGGTGAAGTGAGTAAGCGTGTTGTGTTATCAAACCATAGAAAACAAACGCGTTGTATCCATTATATCACACTTGTTCGATTAGAAAATGCTATTCTATATGATGTGCCGCTGTAGTATGTTGCATTCTATATCGTTAGGCAAATTGTTTGATACTCTGTGCAGGCAGCGAACATGTATTATTCCCCCCTCTCTATACTAGATCCATACGTTTATCATTCGTTACAGCTGACAATGCCTCTAGCTATGTTGCCGGCATAGTTTTCTTAGGCAACAACAAGAAAACCAAGGACCCCAACATGTTTAAAGCTATTACCATTTCCGTTCGCGCTCGACAGACAAAACCTGCCAATGGTTTCTATTCAAAGAGGGCAGAAGGGAATCGTCCTTTTAGAAACTCCCTCCGATGTGTTATGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CNS08JTZ             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCACTAACGCTCTTCGTTAGTGTGGTGAAGTGAGTGAGCGTGTTGTGTTATCAAACCATAGAAAACAAACGCGTTGTATCCATTATATTAAACTTGTTCGATTAGAAAATGCTATTCTATATGATGTGCCGCTGTAGTATGTTGCATTCTATATCGTTAGGCAAATTGTTTGATACTCTGTGCAGGCAGCGAACATGTATTATTCCCCCCTCTCTATACTAGATCCATACGTTTATCATTCGTTACAGCTGACAATGCCTCTAGCTATGTTGCCGGCATAGTTTTTTTAGGCAACAACAAGAAAACCAAGGACCCCAACATGTTTAAAGCTATTACCATTTCCGTTCGCGCTCCACAGACAAAACCTGCCAATGGTTTCTATTCAAAGAGGGCAGAAGGGAATCGTCCTTTTAGAAACTCCCTCCGATGTGTTATGCTTAATGCAATCATGCAGATTTTAATAATTGAATTTTGAGCTAAGAAATAGATAAAAGCTGAAAGATAGTTTATTTGCGAGCAAACAAACTTACACATACACACAATCATGTGCTAGGAAAATAGTGTTGTACGTTATTTTGTTTCTGCATAATGCTATGAAATCATTTAATGGAAATCTTTTCTAAAAAGGTGTGTTATTAATCAAAATTAGCTTTGGTGTGTGAAAAGATCCCCACAACAGGACGCCTCAAACAACCCAAAAACACACACCGTACCTGTGAGATTTGTGGCGTGAAACGAAAGAGAGTGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BX616762             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTTATTAATCGAAATTAGCTTTGGTGTGTGAAAAGATCCCCACAACAGGACGCCTCAAACAACCCACACACACACACCGTACCTGTGAGATATGTGGCGTGAAACGAAAGAGAGTGGGTATGTAGTAGCTAAAAGTGAAAGTAAATGTGATTTGATAAAAAAAGAAAAGAAAATCGAACCAAAAAGATACAAGCAGATGGTAAATGTTATGCGCTACGCGCCCTTATCTGATGGAATGATAGTTTTAAAAAAACGCATAAATCGTTTAGATGGAATTTTAACGATTTTAAAACCTGTTTAACCCTATCCCAATTCGGTTGGTATGTTTACTTTTTCTATGCATGTTACGTTTTTCCTATTCTCTCTTGTTTAGAGTCCTGTTAAGGACATATTTTTTGTTGCTATAACAAGCTTATCGTGCGTACAAAGAATACATACAACAACAAAAAACACCTTCCCCTTTAGCGAGTGTAGCAAAAAGCGCTGGCAACAACGTTGTGCAGGAAGGATAACCTTTTCTAGTGATTGATAGAATCTTTTCTTTTGTCGATAGCATGAAATAATAAATGGGGT]


>consensus_5855#0 CCGCTCTGCGAAACGAAATCTCCGACACGCGAAAAAAAAGGACGCGCAAAACCTGCGCAA AACAGGAAACCGATCGACATGACACACGCTTAGAAGGTTTATCCGCGTATTACCTTACAA TTTTTCTATTTTTGTTTTTTTTTTTTGTTAACTTTCTCATTTCACTGCTCTTTATGTTCA CTCGTCCACTGTTTTGGATGTAAATCATATCCTACCATATACGTACATTCGTTCGTTCGT GATTCGTTGGTAAGTGTGAAATAACCGCGTATAGTTCGTTAGCCGTTAGTTAGCGTGTAA GCTGCGCAATGTTATAAGAATATAAGATCAATAATGAGGCAGGCTTCTCAAACGTTTACG TTATTAAGTAATAGCAGCAGTAGAGAGGACGCCACTAACTATAATTAATGTTGAATTGCA CTATGTAATTGCACTGTCCTATGAGGAGAGAGCAAGAGAGAGAGAGATGATAGCAAGCTG GTTATGTTGTAGCTTTTATTTAAATTTGTTATCGTAAAACGACGCAAGCTAATGGAAGCG AGAGAGAGAAAAACCGGATACAGCAGGACTCGTTATCGAAACTAACAGCATTATTTTGGC AATGGCAAAAGACTTAGAGAATGCATGCGACACTCCGTATGCAATTGTGCAAGCTCCTCC AAAAACTCACACAAGTGCCATTCTATGCTGTGAGGTGGTGGTACATCTTACAGCGCATAA GGCATCCTCCTCCTCTCGGTATTATTGGCTGCTTTTACAATAACTCACAAGGATTTGCTC ACTTCACCCATCCGCACCACGCTCTTCGTGAGTGTGGTGAAGTGAGTAAGCGTGTTGTGT TATCAAACCATAGAAAACAAACGCGTTGTATCCATTATATCACACTTGTTCGATTAGAAA ATGCTATTCTATATGATGTGCCGCTGTAGTATGTTGCATTCTATATCGTTAGGCAAATTG TTTGATACTCTGTGCAGGCAGCGAACATGTATTATTCCCCCCTCTCTATACTAGATCCAT ACGTTTATCATTCGTTACAGCTGACAATGCCTCTAGCTATGTTGCCGGCATAGTTTTCTT AGGCAACAACAAGAAAACCAAGGACCCCAACATGTTTAAAGCTATTACCATTTCCGTTCG CGCTCGACAGACAAAACCTGCCAATGGTTTCTATTCAAAGAGGGCAGAAGGGAATCGTCC TTTTAGAAACTCCCTCCGATGTGTTATGCTTAATGCAATCATGCAGATTTTAATAATTGA ATTTTGAGCTAAGAAATAGATAAAAGCTGAAAGATAGTTTATTTGCGAGCAAACAAACTT ACACATACACACAATCATGTGCTAGGAAAATAGTGTTGTACGTTATTTTGTTTCTGCATA ATGCTATGAAATCATTTAATGGAAATCTTTTCTAAAAAGGTGTGTTATTAATCAAAATTA GCTTTGGTGTGTGAAAAGATCCCCACAACAGGACGCCTCAAACAACCCAAAAACACACAC CGTACCTGTGAGATTTGTGGCGTGAAACGAAAGAGAGTGGTTATGTAGTAGCTAAAAGTG AAAGTAAATGTGATTTGATAAAAAAAGAAAAGAAAATCGAACCAAAAAGATACAAGCAGA TGGTAAATGTTATGCGCTACGCGCCCTTATCTGATGGAATGATAGTTTTAAAAAAACGCA TAAATCGTTTAGATGGAATTTTAACGATTTTAAAACCTGTTTAACCCTATCCCAATTCGG TTGGTATGTTTACTTTTTCTATGCATGTTACGTTTTTCCTATTCTCTCTTGTTTAGAGTC CTGTTAAGGACATATTTTTTGTTGCTATAACAAGCTTATCGTGCGTACAAAGAATACATA CAACAACAAAAAACACCTTCCCCTTTAGCGAGTGTAGCAAAAAGCGCTGGCAACAACGTT GTGCAGGAAGGATAACCTTTTCTAGTGATTGATAGAATCTTTTCTTTTGTCGATAGCATG AAATAATAAATGGGGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)