These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5975#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 861 fasta sequence [CCGCGGACGCGTGGGCGGACGCGTGGGCGGACGCGTGGGCTAAGGCATAGCATCGTTGAGTTTGAGTTTATAGGGTGTAAAATAATAAATAAAAGCAGAATAAAGAGTGAATTTGTCAGAACCGTCAGATTTTTTTCAAAATAAAAGTTAAACAGTTTATTAAAACAAAAGATGTTACGTTGGCGGCTTCATTTTTTATCATATTTTACATTATGTTACTGTGCTGGTTTGTTTCAGGATACCAATTGCTCTCCTGTGCTGGTATTGGTTGCCAACGGCAGTGATATCACGATTAATTTTCCCGGAGAAAACAACAACAATCGAGTATTCAGCATTGTCAGTAGCTCTGGTAACAATAATCCATCTATGTTCGATTGGATAGGAGGCAACGGCGCCAACAAAGCACCTACAATATTGCTGGGAAAATCGAATGAGCCTGCAATGCCACCCAGCTTGCCAAAAGATTACAGTGCTGAAGATGATGATACCTTACCTTCAAATCGCAAACCAGTATGGGGAAAACACGGATTAAACGAATTCGAGGTAACTGATGGAATTTTTCCTCTTGTATCGACTGCCTCCCCGACAACATTGCCGAACGTTACAACCATATCCGTGCCATACACGCATAAATTTATTGCAGCACCTGTTTGATACTATTATACTGACCTGCTTTCAAACATTATTAAGAAACTG-AATGCATTCGTAAATAGATGTGCACACGTAATTGTCTCTGCTTTCATGCACTTTTATTACTTGATTTTATTTTTTCTTACATAGGTTTTGATCATGTTCCTTATCTGGAATTTACTTAGCACATATAATTAGGAAGAAAGAGTTTAATAAATATATTCGATTTTG] [+] EMBL BM634167 [CCGCGGACGCGTGGGCGGACGCGTGGGCGGACGCGTGGGCTAAGGCATAGCATCGTTGAGTTTGAGTTTATAGGGTGTAAAATAATAAATAAAAGCAGAATAAAGAGTGAATTTGTCAGAACCGTCAGATTTTTTTCAAAATAAAAGTTAAACAGTTTATTAAAACAAAAGATGTTACGTTGGCGGCTTCATTTTTTATCATATTTTACATTATGTTACTGTGCTGGTTTGTTTCAGGATACCAATTGCTCTCCTGTGCTGGTATTGGTTGCCAACGGCAGTGATATCACGATTAATTTTCCCGGAGAAAACAACAACAATCGAGTATTCAGCATTGTCAGTAGCTCTGGTAACAATAATCCATCTATGTTCGATTGGATAGGAGGCAACGGCGCCAACAAAGCACCTACAATATTGCTGGGAAAATCGAATGAGCCTGCAATGCCACCCAGCTTGCCAAAAGATTACAGTGCTGAAGATGATGATACCTTACCTTCAAATCGCAAACCAGTATGGGGAAAACACGGATTAAACGAATTCGAGGTAACTGATGGAATTTTTCCTCTTGTATCGACTGCCTCCCCGACAACATTGCCGAACGTTACAACCATATCCGTGCCATACACGCATAAATTTATTGCAGCACCTGTTTGATACTATTATACTGACCTGCTTT ] [+] EMBL BM646490 [ ccGGCATAGCATCGTTGAGTTTGAGTTTATAGGGTGTAAAATAATAAATAAAAGCAGAATAAAGAGTGAATTTGTCAGAACCGTCAGATTTTTTTCAAAATAAAAGTTAAACAGTTTATTAAAACAAAAGATGTTACGTTGGCGGCTTCATTTTTTATCATATTTTACATTATGTTACTGTGCTGGTTTGTTTCAGGATACCAATTGCTCTCCTGTGCTGGTATTGGTTGCCAACGGCAGTGATATCACGATTAATTTTCCCGGAGAAAACAACAACAATCGAGTATTCAGCATTGTCAGTAGCTCTGGTAACAATAATCCATCTATGTTCGATTGGATAGGAGGCAACGGCGCCAACAAAGCACCTACAATATTGCTGGGAAAATCGAATGAGCCTGCAATGCCACCCAGCTTGCCAAAAGATTACAGTGCTGAAGATGATGATACCTTACCTTCAAATCGCAAACCAGTATGGGGAAAACACGGATTAAACGAATTCGAGGTAACTGATGGAATTTTTCCTCTTGTATCGACTGCCTCCCCGACAACATTGCCGAACGTTACAACCATATCCGTGCCATACACGCATAAATTTATTGCAGCACCTGTTTGATACTATTATACTGACCTGCTTTCAAACATTATTAAGAAACTGCAATGCATTCGTAAATAGATGTGCACACGTAATTGTCTCTGC ] [+] EMBL BM579962 [ ccGGTGTAAAATAATAAATAAAAGCAGAATAAAGAGTGAATTTGTCAGAACCGTCAGATTTTTTTCAAAATAAAAGTTAAACAGTTTATTAAAACAAAAGATGTTACGTTGGCGGCTTCATTTTTTATCATATTTTACATTATGTTACTGTGCTGGTTTGTTTCAGGATACCAATTGCTCTCCTGTGCTGGTATTGGTTGCCAACGGCAGTGATATCACGATTAATTTTCCCGGAGAAAACAACAACAATCGAGTATTCAGCATTGTCAGTAGCTCTGGTAACAATAATCCATCTATGTTCGATTGGATAGGAGGCAACGGCGCCAACAAAGCACCTACAATATTGCTGGGAAAATCGAATGAGCCTGCAATGCCACCCAGCTTGCCAAAAGATTACAGTGCTGAAGATGATGATACCTTACCTTCAAATCGCAAACCAGTATGGGGAAAACACGGATTAAACGAATTCGAGGTAACTGATGGAATTTTTCCTCTTGTATCGACTGCCTCCCCGACAACATTGCCGAACGTTACAACCATATCCGTGCCATACACGCATAAATTTATTGCAGCACCTGTTTGATACTATTATACTGACCTGCTTTCAAACATTATTAAGAAACTG AATGCATTCGTAAATAGATGTGCACACGTAATTGTCTC ] [+] EMBL BX606279 [ GTAAAATAATAAATAAAAGCAGAATAAAGATTGAATTTGTCAGAACCGTCAGATTTTTTTCAAAATAAAAGTTAAACAGTTTATTAAAACAAAAGATGTTACGTTGGCGGCTTCATTTTTTATCATATTTTACATTATGTTACTGTGCTGGTTTGTTTCAGGATACCAATTGCTCTCCTGTGCTGGTATTGGTTGCCAACGGCAGTGATATCACGATTAATTTTCCCGGAGAAAACAACAACAATCGAGTATTCAGCATTGTCAGTAGCTCTGGTAACAATAATCCATCTATGTTCGATTGGATAGGAGGCAACGGCGCCAACAAAGCACCTACAATATTGCTGGGAAAATCGAATGAGCCTGCAATGCCACCCAGCTTGCCAAAAGATTACAGTGCTGAAGATGATGATACCTTACCTTCAAATCGCAAACCAGTATGGGGAAAACACGGATTAAACGAATTCGAAGTAACTGATGGAATTTTTCCTTTTGTATCGACTGCCTCCCCGACAACATTGCCGAACGTTACAACCATATCCGTGCCATACACGCATAAAGTTATTGCAGCACCTGTTTGATACTATTATACAGACCTGCTTTCAAACATTATTAAGAAACTG AATGCATTCGTAAATAGATGTGCACACGTAATTGTCTCTGCTTTCATGCACTTTTATTACTTGATTTTATTTTTTCTTACATAGGTTTTGATCATGTTCCTTATCTGGAATTTACTTAGCACATATAATTAGGAAGAAAGAGTTTAATAAATATATTCGATTTTG] [+] EMBL BM648194 [ ccgGTCAGAACCGTCAGATTTTTTTCAAAATAAAAGTTAAACAGTTTATTAAAACAAAAGATGTTACGTTGGCGGCTTCATTTTTTATCATATTTTACATTATGTTACTGTGCTGGTTTGTTTCAGGATACCAATTGCTCTCCTGTGCTGGTATTGGTTGCCAACGGCAGTGATATCACGATTAATTTTCCCGGAGAAAACAACAAC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||