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Anopheles gambiae
cluster # 5975 cluster # 5975       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5975#0 length = 861 sequences # 5  

consensusID : consensus_5975#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 861
fasta sequence
                              [CCGCGGACGCGTGGGCGGACGCGTGGGCGGACGCGTGGGCTAAGGCATAGCATCGTTGAGTTTGAGTTTATAGGGTGTAAAATAATAAATAAAAGCAGAATAAAGAGTGAATTTGTCAGAACCGTCAGATTTTTTTCAAAATAAAAGTTAAACAGTTTATTAAAACAAAAGATGTTACGTTGGCGGCTTCATTTTTTATCATATTTTACATTATGTTACTGTGCTGGTTTGTTTCAGGATACCAATTGCTCTCCTGTGCTGGTATTGGTTGCCAACGGCAGTGATATCACGATTAATTTTCCCGGAGAAAACAACAACAATCGAGTATTCAGCATTGTCAGTAGCTCTGGTAACAATAATCCATCTATGTTCGATTGGATAGGAGGCAACGGCGCCAACAAAGCACCTACAATATTGCTGGGAAAATCGAATGAGCCTGCAATGCCACCCAGCTTGCCAAAAGATTACAGTGCTGAAGATGATGATACCTTACCTTCAAATCGCAAACCAGTATGGGGAAAACACGGATTAAACGAATTCGAGGTAACTGATGGAATTTTTCCTCTTGTATCGACTGCCTCCCCGACAACATTGCCGAACGTTACAACCATATCCGTGCCATACACGCATAAATTTATTGCAGCACCTGTTTGATACTATTATACTGACCTGCTTTCAAACATTATTAAGAAACTG-AATGCATTCGTAAATAGATGTGCACACGTAATTGTCTCTGCTTTCATGCACTTTTATTACTTGATTTTATTTTTTCTTACATAGGTTTTGATCATGTTCCTTATCTGGAATTTACTTAGCACATATAATTAGGAAGAAAGAGTTTAATAAATATATTCGATTTTG]

[+] EMBL BM634167             [CCGCGGACGCGTGGGCGGACGCGTGGGCGGACGCGTGGGCTAAGGCATAGCATCGTTGAGTTTGAGTTTATAGGGTGTAAAATAATAAATAAAAGCAGAATAAAGAGTGAATTTGTCAGAACCGTCAGATTTTTTTCAAAATAAAAGTTAAACAGTTTATTAAAACAAAAGATGTTACGTTGGCGGCTTCATTTTTTATCATATTTTACATTATGTTACTGTGCTGGTTTGTTTCAGGATACCAATTGCTCTCCTGTGCTGGTATTGGTTGCCAACGGCAGTGATATCACGATTAATTTTCCCGGAGAAAACAACAACAATCGAGTATTCAGCATTGTCAGTAGCTCTGGTAACAATAATCCATCTATGTTCGATTGGATAGGAGGCAACGGCGCCAACAAAGCACCTACAATATTGCTGGGAAAATCGAATGAGCCTGCAATGCCACCCAGCTTGCCAAAAGATTACAGTGCTGAAGATGATGATACCTTACCTTCAAATCGCAAACCAGTATGGGGAAAACACGGATTAAACGAATTCGAGGTAACTGATGGAATTTTTCCTCTTGTATCGACTGCCTCCCCGACAACATTGCCGAACGTTACAACCATATCCGTGCCATACACGCATAAATTTATTGCAGCACCTGTTTGATACTATTATACTGACCTGCTTT                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BM646490             [                                         ccGGCATAGCATCGTTGAGTTTGAGTTTATAGGGTGTAAAATAATAAATAAAAGCAGAATAAAGAGTGAATTTGTCAGAACCGTCAGATTTTTTTCAAAATAAAAGTTAAACAGTTTATTAAAACAAAAGATGTTACGTTGGCGGCTTCATTTTTTATCATATTTTACATTATGTTACTGTGCTGGTTTGTTTCAGGATACCAATTGCTCTCCTGTGCTGGTATTGGTTGCCAACGGCAGTGATATCACGATTAATTTTCCCGGAGAAAACAACAACAATCGAGTATTCAGCATTGTCAGTAGCTCTGGTAACAATAATCCATCTATGTTCGATTGGATAGGAGGCAACGGCGCCAACAAAGCACCTACAATATTGCTGGGAAAATCGAATGAGCCTGCAATGCCACCCAGCTTGCCAAAAGATTACAGTGCTGAAGATGATGATACCTTACCTTCAAATCGCAAACCAGTATGGGGAAAACACGGATTAAACGAATTCGAGGTAACTGATGGAATTTTTCCTCTTGTATCGACTGCCTCCCCGACAACATTGCCGAACGTTACAACCATATCCGTGCCATACACGCATAAATTTATTGCAGCACCTGTTTGATACTATTATACTGACCTGCTTTCAAACATTATTAAGAAACTGCAATGCATTCGTAAATAGATGTGCACACGTAATTGTCTCTGC                                                                                                                            ]
[+] EMBL BM579962             [                                                                       ccGGTGTAAAATAATAAATAAAAGCAGAATAAAGAGTGAATTTGTCAGAACCGTCAGATTTTTTTCAAAATAAAAGTTAAACAGTTTATTAAAACAAAAGATGTTACGTTGGCGGCTTCATTTTTTATCATATTTTACATTATGTTACTGTGCTGGTTTGTTTCAGGATACCAATTGCTCTCCTGTGCTGGTATTGGTTGCCAACGGCAGTGATATCACGATTAATTTTCCCGGAGAAAACAACAACAATCGAGTATTCAGCATTGTCAGTAGCTCTGGTAACAATAATCCATCTATGTTCGATTGGATAGGAGGCAACGGCGCCAACAAAGCACCTACAATATTGCTGGGAAAATCGAATGAGCCTGCAATGCCACCCAGCTTGCCAAAAGATTACAGTGCTGAAGATGATGATACCTTACCTTCAAATCGCAAACCAGTATGGGGAAAACACGGATTAAACGAATTCGAGGTAACTGATGGAATTTTTCCTCTTGTATCGACTGCCTCCCCGACAACATTGCCGAACGTTACAACCATATCCGTGCCATACACGCATAAATTTATTGCAGCACCTGTTTGATACTATTATACTGACCTGCTTTCAAACATTATTAAGAAACTG AATGCATTCGTAAATAGATGTGCACACGTAATTGTCTC                                                                                                                               ]
[+] EMBL BX606279             [                                                                            GTAAAATAATAAATAAAAGCAGAATAAAGATTGAATTTGTCAGAACCGTCAGATTTTTTTCAAAATAAAAGTTAAACAGTTTATTAAAACAAAAGATGTTACGTTGGCGGCTTCATTTTTTATCATATTTTACATTATGTTACTGTGCTGGTTTGTTTCAGGATACCAATTGCTCTCCTGTGCTGGTATTGGTTGCCAACGGCAGTGATATCACGATTAATTTTCCCGGAGAAAACAACAACAATCGAGTATTCAGCATTGTCAGTAGCTCTGGTAACAATAATCCATCTATGTTCGATTGGATAGGAGGCAACGGCGCCAACAAAGCACCTACAATATTGCTGGGAAAATCGAATGAGCCTGCAATGCCACCCAGCTTGCCAAAAGATTACAGTGCTGAAGATGATGATACCTTACCTTCAAATCGCAAACCAGTATGGGGAAAACACGGATTAAACGAATTCGAAGTAACTGATGGAATTTTTCCTTTTGTATCGACTGCCTCCCCGACAACATTGCCGAACGTTACAACCATATCCGTGCCATACACGCATAAAGTTATTGCAGCACCTGTTTGATACTATTATACAGACCTGCTTTCAAACATTATTAAGAAACTG AATGCATTCGTAAATAGATGTGCACACGTAATTGTCTCTGCTTTCATGCACTTTTATTACTTGATTTTATTTTTTCTTACATAGGTTTTGATCATGTTCCTTATCTGGAATTTACTTAGCACATATAATTAGGAAGAAAGAGTTTAATAAATATATTCGATTTTG]
[+] EMBL BM648194             [                                                                                                               ccgGTCAGAACCGTCAGATTTTTTTCAAAATAAAAGTTAAACAGTTTATTAAAACAAAAGATGTTACGTTGGCGGCTTCATTTTTTATCATATTTTACATTATGTTACTGTGCTGGTTTGTTTCAGGATACCAATTGCTCTCCTGTGCTGGTATTGGTTGCCAACGGCAGTGATATCACGATTAATTTTCCCGGAGAAAACAACAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]


>consensus_5975#0 CCGCGGACGCGTGGGCGGACGCGTGGGCGGACGCGTGGGCTAAGGCATAGCATCGTTGAG TTTGAGTTTATAGGGTGTAAAATAATAAATAAAAGCAGAATAAAGAGTGAATTTGTCAGA ACCGTCAGATTTTTTTCAAAATAAAAGTTAAACAGTTTATTAAAACAAAAGATGTTACGT TGGCGGCTTCATTTTTTATCATATTTTACATTATGTTACTGTGCTGGTTTGTTTCAGGAT ACCAATTGCTCTCCTGTGCTGGTATTGGTTGCCAACGGCAGTGATATCACGATTAATTTT CCCGGAGAAAACAACAACAATCGAGTATTCAGCATTGTCAGTAGCTCTGGTAACAATAAT CCATCTATGTTCGATTGGATAGGAGGCAACGGCGCCAACAAAGCACCTACAATATTGCTG GGAAAATCGAATGAGCCTGCAATGCCACCCAGCTTGCCAAAAGATTACAGTGCTGAAGAT GATGATACCTTACCTTCAAATCGCAAACCAGTATGGGGAAAACACGGATTAAACGAATTC GAGGTAACTGATGGAATTTTTCCTCTTGTATCGACTGCCTCCCCGACAACATTGCCGAAC GTTACAACCATATCCGTGCCATACACGCATAAATTTATTGCAGCACCTGTTTGATACTAT TATACTGACCTGCTTTCAAACATTATTAAGAAACTGAATGCATTCGTAAATAGATGTGCA CACGTAATTGTCTCTGCTTTCATGCACTTTTATTACTTGATTTTATTTTTTCTTACATAG GTTTTGATCATGTTCCTTATCTGGAATTTACTTAGCACATATAATTAGGAAGAAAGAGTT TAATAAATATATTCGATTTTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)