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Anopheles gambiae
cluster # 6053 cluster # 6053       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6053#0 length = 1277 sequences # 5  

consensusID : consensus_6053#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1277
fasta sequence
                              [CATAACATATTACTGTACTAGAGAGCTAAACAACAAACGATTAGGAGAAGAAGAACAAACGTTTATCACAAACCTACGAACTATCCCAGTCCTACACACGTCTATAAAACTTTGCGGTTGTTGAATAGATTTTTTGGCTAGTTTTCAAAGATTTGTAACGCATGTTTGGCATCATTAATGTATTAGAAAAATCGAAGGTATGTTAGCTTGAGTGAACAGAAACTGAGACACGACCGGATAGTCAAAAATAACTCTGCCCCTTTCCCTCCCTTTAACACGCCAAAGAATAAGTTTAGTAGAGCGTTTTCGTGATTCCTTTCGAAATGCTACAAAGTGGAGACATTTGCAAGTTGTACCTTCCCACATATACACCATATAATTGCGGCGAGCTACAGCGTGCGATGGTTATTTTGTATTATGCGTAACAATACCATTAATATTTATCACATGTGAGTAGAATGGCGATTTACTAGGGGAGATTGTGGGAACCAGCCCAGGAAATTGCTTAAACAAACACACACAACACTTACTACACACAAAGCTCACAAACCGCTAAACATGCTAAACTAGCGAAATTTGAATACTGTTAGCAATTCTCGGTTTTCCATTGGGCTGGAAAGTGAGCCTG-TTTTTTTTTAAATTGTGTATATATTAGACAGTTACACTATTGAGTTGTATTTAGTTAGTTTGGCTAGTGTCCGAGTAAGTCGGTTCCACCTGTGTATGTTTAGCCATTTTAAAGGTGTTATAGTTTTAAGATTGTTTTATTGTTTTATTTAGTTTGTCGCAAATCATTCGAACAATTGATGAATGGTTTTAAATCTTTTCAGTCAAATGTGTGTACCGTAGGGAAGGTGATTTTATACGCGCATACAAGAGAAATAGAACATTTTAACACGCTTATACTGATACCGAAAAGCGGTCGAAACAGTTTCACGAAAGGAAGGGCTTATGTTTACAGTGCAAAAATGTGTCAGTTCAGCAGTAGACAGTGTATTAGGACGAAAATATACACTAATAATTATTTAAATTCCTATTCAATTTTATCTTAGCCGTTCGCGGATTGCTACAAGCTGCAGCCTTCTACCAGCTTTGCTGTTACGTAGCTGCATTCTTCTAGCTTTGTTTTAATATGTTCGAATATTGCATAGTTTGTTAGCGT---ACAACAACAACAACAACCATACCACTCCCGAAAGCGAAAGCGTGCGAT--AATTCGTGATGTAAAAAACTACCCATTTGAGAAAAAAGGCAAATATAAGTAACCAATGCATTAGTAC]

[+] EMBL BX622705             [CATAACATATTACTGTACTAGAGAGCTAAACAACAAACGATTAGGAGAAGAAGAACAAACGTTTATCACAAACCTACGAACTATCCCAGTCCTACACACGTCTATAAAACTTTGCGGTTGTTGAATAGATTTTTTGGCTAGTTTTCAAAGATTTGTAACGCATGTTTGGCATCATTAATGTATTAGAAAAATCGAAGGTATGTTAGCTTGAGTGAACAGAAACTGAGACACGACCGGATAGTCAAAAATAACTCTGCCCCTTTCCCTCCCTTTAACACGCCAAAGAATAAGTTTAGTAGAGCGTTTTCGTGATTCCTTTCGAAATGCTACAAAGTGGAGACATTTGCAAGTTGTACCTTCCCACATATACACCATATAATTGCGGCGAGCTACAGCGTGCGAT GTTATTTTGTATTATGCGTAACAATACCATTAATATTTATCACATGTGAGTAGAATGGCGATTTACTAGGGGAGATTGTGGGAACCAGCCCAGGAAATTGCTTAAACAAACACACACAACACTTACTACACACAAAGCTCACAAACCGCTAAACATGCTAAACTAGCGAAATTTGAATACTGGTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BX623113             [                                                                                                                                                                                                               TTGAGTGGACCGAAACTGAGACACGACAGGATAGTCAAAAATAACTCTGCCCCTTTCCCTCCCTTTAACACGCCAAAGAATAAGTTTAGTAGAGCGTTTTCGTGATTCCTTTCGAAATGCTACAAAGTGGAGACATTTGCAAGTTGTACCTTCCCACAGATACACCATATAATTGCGGCGAGCTACAGCGTGCGATGGTTATTTTGTATTATGCGTAACAATACCATTAATATTTATCACATGTGAGTAGAATGGCGATTTACTAGGGGAGATTGTGGGAACCAGCCCAGGAAATTGCTTAAACAAACACACACAACACTTACTACACACAAAGCTCACAAACCGCTAAACATGCTAAACTAGCGAAATTTGAATACTGTTAGCAATTCTCGGTTTTCCATTGGGCTGGAAAGTGAGCCTG TTTTTTTTTAAATTGTGTATATATTAGACAGTTACACTATTGAGTTGTATTTAGTTAGTTTGGCTAGTGTCCGAGTAAGTCGGTTCCACCTGTGTATGTTTAGCCATTTTAAAGGTGTTATAGTTTTAAGATTGTTTTATTGTTTTATTTAGTTTGTCGCAAATCATTCGAACAATTGATGAATGGTTTTAAATCTTTTCAGTCAAATGTGTGTACCGTAGGGAAGGCGATTTTATACGCGCATACAAGAGAAATAGAACATTTTAACACGCTTATACTGATACCGAAAAGCGGTCGAAACAGTTTCACGAAAGGAAGGGCTTATGTTTACAGTGCAAAAATGTGTCAGTTCAGCAGTAGACAGTGTATTAGGACGAAAATATACACTAATAATTATTTAAATTC                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BM656957             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ccgGACATTTGCAAGTTGTACCTTCCCACATATACACCATATAATTGCGGCGAGCTACAGCGTGCGATGGTTATTTTGTATTATGCGTAACAATACCATTAATATTTATCACATGTGAGTAGAATGGCGATTTACTAGGGGAGATTGTGGGAACCAGCCCAGGAAATTGCTTAAACAAACACACACAACACTTACTACACACAAAGCTCACAAACCGCTAAACATGCTAAACTAGCGAAATTTGAATACTGTTAGCAATTCTCGGTTTTCCATTGGGCTGGAAAGTGAGCCTGTTTTTTTTTTAAATTGTGTATATATTAGACAGTTACACTATTGAGTTGTATTTAGTTAGTTTGGCTAGTGTCCGAGTAAGTCGGTTCCACCTGTGTATGTTTAGCCATTTTAAAGGTGTTATAGTTTTAAGATTGTTTTATAGTTTTATTTAGTTTGTCGCAAATCATTCGAACAATTGATGAATGGTTTTAAATCTTTTCAGTCAAATGTGTGTACCGTAGGGAAGGTGATTTTATACGCGCATACAAGAGAAATAGAACATTTTAACACGCTTATACTGATACCGAAAAGCTGTCGAAACAGTTTCACGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BX612497             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATTTTTTAGACAGTTACACTATTGAGTTGTATTTAGTTAGTTTGGCTAGTGTCCGAGTAAGTCGGTTCCACCTGTGTATGTTTAGCCATTTTAAAGGTGTTATAGTTTTAAGATTGTTTTATTGTTTTATTTAGTTTGTCGCAAATCATTCGAACAATTGATGAATGGTTTTAAATCTTTTCAGTCAAATGTGTGTACCGTAGGGAAGGTGATTTTATACGCGCATACAAGAGAAATAGAACATTTTAACACGCTTATACTGATACCGAAAAGCGGTCGAAACAGTTTCATGAAAGGAAGGGCTTATGTTTACAGTGCAAAAATGTGTCAGTTCTGCAGTAGACAGTGTTTTAGGACGAAAATACACAATAATAATTATTTAAATTCCTATTCAATTTTATCTTAGCCGTTCGCGGATTGCTACAAGCTGCAGCCTTCTACCAGCTTTGCTGTTACGTAGCTGCATTCTTCTAGCTTTGTTTTAATATGTTCGAATATTGCATAGTTTGTTAGCGTACAACAACAACAACAACAACCATACCACTCCCGAAAGCGAAAGCGTGCGATAAAATTCGTGATGTAAAAAACTACCCATTTGAGAAAAAAGGCAAATATAAGTAACCA            ]
[+] EMBL BM637881             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ccgGTACCGTAGGGAAGGTGATTTTATACGCGCATACAAGAGAAATAGAACATTTTAACACGCTTATACTGATACCGAAAAGCTGTCGAAACAGTTTCACGAAAGGAAGGGCTTATGTTTACAGTGCAAAAATGTGTCAGTTCAGCAGTAGACAGTGTATTAGGACGAAAATATACACTAATAATTATTTAAATTCCTATTCAATTTTATCTTAGCCGTTTGCGAATTGCTACAGGCTGCAGCCTTCTACCAGCTTTGCTGTTACGTAGCTGCATTCTTCTAGCTTTGTTTTAATATGTTCGAATATTGCATAGTTTGTTAGCGT   ACAACAACAACAACAACCATACCACTCCCGAAAGCGAAAGCGTGCGAT  AATTCGTGATGTAAAAAACTACCCATTTGAGAAAAAAGGCAAATATAAGTAACCAATGCATTAGTAC]


>consensus_6053#0 CATAACATATTACTGTACTAGAGAGCTAAACAACAAACGATTAGGAGAAGAAGAACAAAC GTTTATCACAAACCTACGAACTATCCCAGTCCTACACACGTCTATAAAACTTTGCGGTTG TTGAATAGATTTTTTGGCTAGTTTTCAAAGATTTGTAACGCATGTTTGGCATCATTAATG TATTAGAAAAATCGAAGGTATGTTAGCTTGAGTGAACAGAAACTGAGACACGACCGGATA GTCAAAAATAACTCTGCCCCTTTCCCTCCCTTTAACACGCCAAAGAATAAGTTTAGTAGA GCGTTTTCGTGATTCCTTTCGAAATGCTACAAAGTGGAGACATTTGCAAGTTGTACCTTC CCACATATACACCATATAATTGCGGCGAGCTACAGCGTGCGATGGTTATTTTGTATTATG CGTAACAATACCATTAATATTTATCACATGTGAGTAGAATGGCGATTTACTAGGGGAGAT TGTGGGAACCAGCCCAGGAAATTGCTTAAACAAACACACACAACACTTACTACACACAAA GCTCACAAACCGCTAAACATGCTAAACTAGCGAAATTTGAATACTGTTAGCAATTCTCGG TTTTCCATTGGGCTGGAAAGTGAGCCTGTTTTTTTTTAAATTGTGTATATATTAGACAGT TACACTATTGAGTTGTATTTAGTTAGTTTGGCTAGTGTCCGAGTAAGTCGGTTCCACCTG TGTATGTTTAGCCATTTTAAAGGTGTTATAGTTTTAAGATTGTTTTATTGTTTTATTTAG TTTGTCGCAAATCATTCGAACAATTGATGAATGGTTTTAAATCTTTTCAGTCAAATGTGT GTACCGTAGGGAAGGTGATTTTATACGCGCATACAAGAGAAATAGAACATTTTAACACGC TTATACTGATACCGAAAAGCGGTCGAAACAGTTTCACGAAAGGAAGGGCTTATGTTTACA GTGCAAAAATGTGTCAGTTCAGCAGTAGACAGTGTATTAGGACGAAAATATACACTAATA ATTATTTAAATTCCTATTCAATTTTATCTTAGCCGTTCGCGGATTGCTACAAGCTGCAGC CTTCTACCAGCTTTGCTGTTACGTAGCTGCATTCTTCTAGCTTTGTTTTAATATGTTCGA ATATTGCATAGTTTGTTAGCGTACAACAACAACAACAACCATACCACTCCCGAAAGCGAA AGCGTGCGATAATTCGTGATGTAAAAAACTACCCATTTGAGAAAAAAGGCAAATATAAGT AACCAATGCATTAGTAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)