These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6053#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1277 fasta sequence [CATAACATATTACTGTACTAGAGAGCTAAACAACAAACGATTAGGAGAAGAAGAACAAACGTTTATCACAAACCTACGAACTATCCCAGTCCTACACACGTCTATAAAACTTTGCGGTTGTTGAATAGATTTTTTGGCTAGTTTTCAAAGATTTGTAACGCATGTTTGGCATCATTAATGTATTAGAAAAATCGAAGGTATGTTAGCTTGAGTGAACAGAAACTGAGACACGACCGGATAGTCAAAAATAACTCTGCCCCTTTCCCTCCCTTTAACACGCCAAAGAATAAGTTTAGTAGAGCGTTTTCGTGATTCCTTTCGAAATGCTACAAAGTGGAGACATTTGCAAGTTGTACCTTCCCACATATACACCATATAATTGCGGCGAGCTACAGCGTGCGATGGTTATTTTGTATTATGCGTAACAATACCATTAATATTTATCACATGTGAGTAGAATGGCGATTTACTAGGGGAGATTGTGGGAACCAGCCCAGGAAATTGCTTAAACAAACACACACAACACTTACTACACACAAAGCTCACAAACCGCTAAACATGCTAAACTAGCGAAATTTGAATACTGTTAGCAATTCTCGGTTTTCCATTGGGCTGGAAAGTGAGCCTG-TTTTTTTTTAAATTGTGTATATATTAGACAGTTACACTATTGAGTTGTATTTAGTTAGTTTGGCTAGTGTCCGAGTAAGTCGGTTCCACCTGTGTATGTTTAGCCATTTTAAAGGTGTTATAGTTTTAAGATTGTTTTATTGTTTTATTTAGTTTGTCGCAAATCATTCGAACAATTGATGAATGGTTTTAAATCTTTTCAGTCAAATGTGTGTACCGTAGGGAAGGTGATTTTATACGCGCATACAAGAGAAATAGAACATTTTAACACGCTTATACTGATACCGAAAAGCGGTCGAAACAGTTTCACGAAAGGAAGGGCTTATGTTTACAGTGCAAAAATGTGTCAGTTCAGCAGTAGACAGTGTATTAGGACGAAAATATACACTAATAATTATTTAAATTCCTATTCAATTTTATCTTAGCCGTTCGCGGATTGCTACAAGCTGCAGCCTTCTACCAGCTTTGCTGTTACGTAGCTGCATTCTTCTAGCTTTGTTTTAATATGTTCGAATATTGCATAGTTTGTTAGCGT---ACAACAACAACAACAACCATACCACTCCCGAAAGCGAAAGCGTGCGAT--AATTCGTGATGTAAAAAACTACCCATTTGAGAAAAAAGGCAAATATAAGTAACCAATGCATTAGTAC] [+] EMBL BX622705 [CATAACATATTACTGTACTAGAGAGCTAAACAACAAACGATTAGGAGAAGAAGAACAAACGTTTATCACAAACCTACGAACTATCCCAGTCCTACACACGTCTATAAAACTTTGCGGTTGTTGAATAGATTTTTTGGCTAGTTTTCAAAGATTTGTAACGCATGTTTGGCATCATTAATGTATTAGAAAAATCGAAGGTATGTTAGCTTGAGTGAACAGAAACTGAGACACGACCGGATAGTCAAAAATAACTCTGCCCCTTTCCCTCCCTTTAACACGCCAAAGAATAAGTTTAGTAGAGCGTTTTCGTGATTCCTTTCGAAATGCTACAAAGTGGAGACATTTGCAAGTTGTACCTTCCCACATATACACCATATAATTGCGGCGAGCTACAGCGTGCGAT GTTATTTTGTATTATGCGTAACAATACCATTAATATTTATCACATGTGAGTAGAATGGCGATTTACTAGGGGAGATTGTGGGAACCAGCCCAGGAAATTGCTTAAACAAACACACACAACACTTACTACACACAAAGCTCACAAACCGCTAAACATGCTAAACTAGCGAAATTTGAATACTGGTAG ] [+] EMBL BX623113 [ TTGAGTGGACCGAAACTGAGACACGACAGGATAGTCAAAAATAACTCTGCCCCTTTCCCTCCCTTTAACACGCCAAAGAATAAGTTTAGTAGAGCGTTTTCGTGATTCCTTTCGAAATGCTACAAAGTGGAGACATTTGCAAGTTGTACCTTCCCACAGATACACCATATAATTGCGGCGAGCTACAGCGTGCGATGGTTATTTTGTATTATGCGTAACAATACCATTAATATTTATCACATGTGAGTAGAATGGCGATTTACTAGGGGAGATTGTGGGAACCAGCCCAGGAAATTGCTTAAACAAACACACACAACACTTACTACACACAAAGCTCACAAACCGCTAAACATGCTAAACTAGCGAAATTTGAATACTGTTAGCAATTCTCGGTTTTCCATTGGGCTGGAAAGTGAGCCTG TTTTTTTTTAAATTGTGTATATATTAGACAGTTACACTATTGAGTTGTATTTAGTTAGTTTGGCTAGTGTCCGAGTAAGTCGGTTCCACCTGTGTATGTTTAGCCATTTTAAAGGTGTTATAGTTTTAAGATTGTTTTATTGTTTTATTTAGTTTGTCGCAAATCATTCGAACAATTGATGAATGGTTTTAAATCTTTTCAGTCAAATGTGTGTACCGTAGGGAAGGCGATTTTATACGCGCATACAAGAGAAATAGAACATTTTAACACGCTTATACTGATACCGAAAAGCGGTCGAAACAGTTTCACGAAAGGAAGGGCTTATGTTTACAGTGCAAAAATGTGTCAGTTCAGCAGTAGACAGTGTATTAGGACGAAAATATACACTAATAATTATTTAAATTC ] [+] EMBL BM656957 [ ccgGACATTTGCAAGTTGTACCTTCCCACATATACACCATATAATTGCGGCGAGCTACAGCGTGCGATGGTTATTTTGTATTATGCGTAACAATACCATTAATATTTATCACATGTGAGTAGAATGGCGATTTACTAGGGGAGATTGTGGGAACCAGCCCAGGAAATTGCTTAAACAAACACACACAACACTTACTACACACAAAGCTCACAAACCGCTAAACATGCTAAACTAGCGAAATTTGAATACTGTTAGCAATTCTCGGTTTTCCATTGGGCTGGAAAGTGAGCCTGTTTTTTTTTTAAATTGTGTATATATTAGACAGTTACACTATTGAGTTGTATTTAGTTAGTTTGGCTAGTGTCCGAGTAAGTCGGTTCCACCTGTGTATGTTTAGCCATTTTAAAGGTGTTATAGTTTTAAGATTGTTTTATAGTTTTATTTAGTTTGTCGCAAATCATTCGAACAATTGATGAATGGTTTTAAATCTTTTCAGTCAAATGTGTGTACCGTAGGGAAGGTGATTTTATACGCGCATACAAGAGAAATAGAACATTTTAACACGCTTATACTGATACCGAAAAGCTGTCGAAACAGTTTCACGAA ] [+] EMBL BX612497 [ ATTTTTTAGACAGTTACACTATTGAGTTGTATTTAGTTAGTTTGGCTAGTGTCCGAGTAAGTCGGTTCCACCTGTGTATGTTTAGCCATTTTAAAGGTGTTATAGTTTTAAGATTGTTTTATTGTTTTATTTAGTTTGTCGCAAATCATTCGAACAATTGATGAATGGTTTTAAATCTTTTCAGTCAAATGTGTGTACCGTAGGGAAGGTGATTTTATACGCGCATACAAGAGAAATAGAACATTTTAACACGCTTATACTGATACCGAAAAGCGGTCGAAACAGTTTCATGAAAGGAAGGGCTTATGTTTACAGTGCAAAAATGTGTCAGTTCTGCAGTAGACAGTGTTTTAGGACGAAAATACACAATAATAATTATTTAAATTCCTATTCAATTTTATCTTAGCCGTTCGCGGATTGCTACAAGCTGCAGCCTTCTACCAGCTTTGCTGTTACGTAGCTGCATTCTTCTAGCTTTGTTTTAATATGTTCGAATATTGCATAGTTTGTTAGCGTACAACAACAACAACAACAACCATACCACTCCCGAAAGCGAAAGCGTGCGATAAAATTCGTGATGTAAAAAACTACCCATTTGAGAAAAAAGGCAAATATAAGTAACCA ] [+] EMBL BM637881 [ ccgGTACCGTAGGGAAGGTGATTTTATACGCGCATACAAGAGAAATAGAACATTTTAACACGCTTATACTGATACCGAAAAGCTGTCGAAACAGTTTCACGAAAGGAAGGGCTTATGTTTACAGTGCAAAAATGTGTCAGTTCAGCAGTAGACAGTGTATTAGGACGAAAATATACACTAATAATTATTTAAATTCCTATTCAATTTTATCTTAGCCGTTTGCGAATTGCTACAGGCTGCAGCCTTCTACCAGCTTTGCTGTTACGTAGCTGCATTCTTCTAGCTTTGTTTTAATATGTTCGAATATTGCATAGTTTGTTAGCGT ACAACAACAACAACAACCATACCACTCCCGAAAGCGAAAGCGTGCGAT AATTCGTGATGTAAAAAACTACCCATTTGAGAAAAAAGGCAAATATAAGTAACCAATGCATTAGTAC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||