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Anopheles gambiae
cluster # 6074 cluster # 6074       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6074#0 length = 1408 sequences # 5  

consensusID : consensus_6074#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1408
fasta sequence
                              [TGATTTTGCTTTCTTTTTCTTTGCAGTAATTATAATCTAACCATTCCAGTGCCGTTTACGATGCATATTATCTTACTGTAAGTTCTACCGTTTGTTCGAGTTACTTGCATCAAGTAGCATAATGCATGTCTTAAGATCATTGAGAAAGTTCAATGTTTGCTTATTCCATACCTGGAACCTACAACACGTGATCGTACGCTAATACGCTATGTATGAATGGAAGTATGTTGTTAGAATGGATAGAGAGGTACATATGAACACACGCCCTCCTACCTGTTTCAATGTATTACCCCCTAATCTATCGTTCCTGCTTACAGTGCTAACTTTTGCCTTTTGCTCATCAAACTTATGTCCCTCGCGATCGACCCCAGATTTGGGCCTGTTACCCTTTTTGAACATCGGTTTATCCTGTATCGTTCGTATACGTTTTGCACTCGGACGTGACTAATGATGAAATGTGGAAAGAACCTGTACCTCTCGGCTAAGGTGAAATAATTTGTTTGCGATTAAGCAGAAACATGCCTACCAAACTTTGGGTTGGCAGAAACAGGGTAACATACATTCTACGCAAGAATTAACATCAATTTCCTGCCTCTATATCTCACCATGGTGATGCAGATGATGA---------TTGGGTACTGTTACAAACACGCTAGCAGCTAATTCATGAGACTTTAGAC-CTACACGTCTATCGTATTTCTTGCTACGTCATTGTAATTCCAATTGTTCATGCATGGACGCGTTCAGAAACCAGACTTGAGAGTAAGAGAATACACACAATTTACACTCTAAAAACAACGTTGAGATATAAACCTTATGAAATTAAATTCTAAAACTATTTGCATTAACTCATCCAA-CGCTCCAATCAATGTGTGGTACACTAAATAAATCAGCAATTCACATACACACGGCGTACAGTACTACGACTGCTGTATCCCCTTCATCTTCGTCTTGCTACAATTTACTTGTACAATCGAATAAGCTTAACCAAGGGTCGCTGGCAATTTAAAAACCAATTTTGGTTTGACTATGCGCTCACCATACCATAGACTATAAAGCAGCGAAAATCGTTCGACTTTGGAAGTATATATTAATAAATAATAAACAGTTTTGTCTGCTAACGCTACCCAGTTGAGCGATCATTTCGATCCAGAACTTTTAACCACAGCTTTCCGCTTGGTTACCACAATGCGTTTCCAAAACAATTACAAAACAAAACTAATTTTAAAAAAAACCATGCTACTGAGCTATCATCTGCCGTCAAAAGCTATCTTAATCGCTTTGGAGCGCATTAATCTCCTTCCATTCTGTACACTTAAACAATATTATGATCAATTTGTCATGCACGATTGTATCCACTATCAATATCACCGTCATTTTTGTCAGCCAAAGATATTCTCCCACGCGTCCGCGG]

[+] EMBL CNS08SE0             [TGATTTTGCTTTCTTTTTCTTTGCAGTAATTATAATCTAACCATTCCAGTGCCGTTTACGATGCATATTATCTTACTGTAAGTTCTACCGTTTGTTCGAGTTACTTGCATCAAGTAGCATAATGCATGTCTTAAGATCATTGAGAAAGTTCAATGTTTGCTTATTCCATACCTGGAACCTACAACACGTGATCGTACGCTAATACGCTATGTATGAATGGAAGTATGTTGTTAGAATGGATAGAGAGGTACATATGAACACACGCCCTCCTACCTGTTTCAATGTATTACCCCCTAATCTATCGTTCCTGCTTACAGTGCTAACTTTTGCCTTTTGCTCATCAAACTTATGTCCCTCGCGATCGACCCCAGATTTGGTTTTTTTACCCTTTTTGAACATCGGTTTATCCTGTATCGTTCGTATACGTTTTGCACTCGGACGTGACTAATGATGAAATGTGGAAAGAACCTGTACCTCTCGGCTAAGGTGAAATAATTTGTTTGCGATTAAGCAGAAACATGCCTACCAAACTTTGGGTTGGCAGAAACAGGGTAACATACATTCTACGCAAGAATTAACATCAATTTCCTGCCTCTATATCTCATCATGGTGATGCAGATGATGA         TTGGGTACTGTTACAAACACGCTAGCAGCTAATTCATGAGACTTTAGAC CTACACGTCTATCGTATTTCTTGCTACGTCATTGTAATTCCAATTGTTCATTCATGGACGCGTTCAGAAACCAGACTTGAGAGTAAGAGAATACACACAATTTACACTCTAAAAACAACGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL BX616537             [                                                                                                                                                                                         ACGTGATCGTACGCTAATACGCTATGTATGAATGGAAGTATG TGTTAGAAT GATAGAGAGGTACATATGAACACACGCCCTCCTACCTGTTTCAATGTATTACCCCCTAATCCATCGTTCCTGCTTACAGTGCTAACTTTTGCCTTTTGCTCATCAAACTTATGTCCCTCGCGATCGACCCCAGATTTGGGCCTGTTACCCTTTTTGAACATCGGTTTATCCTGTATCGTTCGTATACGTTTTGCACTCGGACGTGACTAATGATGAAATGTGGAAAGAACCTGTACCTCTCGGCTAAGGTGAAATAATTTGTTTGCGATTAAGCAGAAACATGCCTACCAAACTCTAGGTTGGCAGAA  AGGGTAACATACATTCTACGCAAAAATTAACATCAATTTCCTGCCTCTATATCTCACCATGGTGATGCAGATGATGATAATGATGCTTGGGTATTGTTACAAACACGCTAGCAGCTAATTCATGAGACTTTAGAC CTACACGTCTATCGTAATTCATGCTACGTCATTGTAATTCCAATTGTTCATGCATGGACGCGTTCAGAAACCAGACTTGGGAGTAAGAGAATACACAC ATTTACACTCTAAAAACAACGTTGAGATATAAACCTTATGAAATTAAATTCTAAAACTATTTGCATTAACTCATCCAA CGCTCCAATCAATGTGTGGTACACTAAATAAATCAGCAATTCAAATACACACGGCGTACAGTACTACGACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CNS08SDZ             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CGACCCCAGATTTGGGCCTGTTACCCTTTTTGAACATCGGTTTATCCTGTATCGTTCGTATACGTTTTGCACTCGGACGTGACTAATGATGAAATGTGGAAAGAACCTGTACCTCTCGGCTAAGAAGAAATAATTTGTTTGCGATTAAGCAGAAACATGCCTACCAAACTTTGGGTTGGCAGAAACAGGGTAACATACATTCTACGCAAGAATTAACATCAATTTCCTGCCTCTATATCTCACCATGGTGATGCAGATGATGA         TTGGGTACTGTTACAAACACGCTAGCAGCTAATTCATGAGACTTTAGACACTACACGTCTATCGTATTTCTTGCTACGTCATTGTAATTCCAATTGTTCATGCATGGACGCGTTCAGAAACCAGACTTGAGAGTAAGAGAATACACACAATTTACACTCTAAAAACAACGTTGAGATGTAAACCTTATGAAATTAAATTCTAAAACTATTTGCATTAATTCATCCAACCGGTCCAATCAATGTGTGGTACACTAAATAAATCATCAATTCACATACACACGGCGTACAGTACAACGGCTGCTGTATCCCCTTCATCTTCGTCTTGCTACAATTTACTTGTACAATCGAATAAGCTTAACCAAGGGTCGCTGGCAATTTAAAAACCAATTTTGGTTTGACTATGCGCTCACCATACCATAGACTATAAAGCAGCGAAAATCGTTCGACTTTGGAAGTATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL AL693518             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CGTTCGTATACGTTTTGCACTCGGACGTGACTAATGATGAAATGTGGAAAGAACCTGTACCTCTCGGCTAAGGTGAAATAATTTGTTTGCGATTAAGCAGAAACATGCCTACCAAACTCTAGGTTGGCAGAA  AGGGTAACATACATTCTACGCAAAAATTAACATCAATTTCCTGCCTCTATATCTCACCATGGTGATGCAGATGATGATAATGATGCTTGGGTATTGTTACAAACACGCTAGCAGCTAATTCATGAGACTTTAGAC CTACACGTCTATCGTAATTCATGCTACGTCATTGTAATTCCAATTGTTCATGCATGGACGCGTTCAGAAACCAGACTTGGGAGTAAGAGAATACACAC ATTTACACTCTAAAAACAACGTTGAGATATAAACCTTATGAAATTAAATTCTAAAACTATTTGCATTAACTCATCCAA CGCTCCAATCAATGTGTGGTACACTAAATAAATCAGCAATTCACATACAC CGGCGTAC GTACTACGACTGCTGTATCCCCTT ATCCTCGggcgatt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL BM586715             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TAAATTCTAAAACTATTTGCATTAATTCATCCAA CGGTCCAATCAATGTGTGGTACACTAAATAAATCATCAATTCACATACACACGGCGTACAGTACAACGGCTGCTGTATCCCCTTCATCTTCGTCTTGCTACAATTTACTTGTACAATCGAATAA CTTAACCAAGGGTCGCTGGCAATTTAAAAACCAATTTTGGTTTGACTATGCGCTCACCATACCATAGACTATAAAGCAGCGAAAATCGTTCGACTTTGGAAGTAAATATTAATAAATAATAAACAGTTTTGTCTGCTAACGCTACCCAGTTGAGCGATCATTTCGATCCAGAACTTTTAACCACAGCTTTCCGCTTGGTTACCACAATGCGTTTCCAAAACAATTACAAAACAAAACTAATTTTAAAAAAAACCATGCTACTGAGCTATCATCTGCCGTCAAAAGCTATCTTAATCGCTTTGGAGCGCATTAATCTCCTTCCATTCTGTACACTTAAACAATATTATGATCAATTTGTCATGCACGATTGTATCCACTATCAATATCACCGTCATTTTTGTCAGCCAAAGATATTCTCCCACGCGTCCGCGG]


>consensus_6074#0 TGATTTTGCTTTCTTTTTCTTTGCAGTAATTATAATCTAACCATTCCAGTGCCGTTTACG ATGCATATTATCTTACTGTAAGTTCTACCGTTTGTTCGAGTTACTTGCATCAAGTAGCAT AATGCATGTCTTAAGATCATTGAGAAAGTTCAATGTTTGCTTATTCCATACCTGGAACCT ACAACACGTGATCGTACGCTAATACGCTATGTATGAATGGAAGTATGTTGTTAGAATGGA TAGAGAGGTACATATGAACACACGCCCTCCTACCTGTTTCAATGTATTACCCCCTAATCT ATCGTTCCTGCTTACAGTGCTAACTTTTGCCTTTTGCTCATCAAACTTATGTCCCTCGCG ATCGACCCCAGATTTGGGCCTGTTACCCTTTTTGAACATCGGTTTATCCTGTATCGTTCG TATACGTTTTGCACTCGGACGTGACTAATGATGAAATGTGGAAAGAACCTGTACCTCTCG GCTAAGGTGAAATAATTTGTTTGCGATTAAGCAGAAACATGCCTACCAAACTTTGGGTTG GCAGAAACAGGGTAACATACATTCTACGCAAGAATTAACATCAATTTCCTGCCTCTATAT CTCACCATGGTGATGCAGATGATGATTGGGTACTGTTACAAACACGCTAGCAGCTAATTC ATGAGACTTTAGACCTACACGTCTATCGTATTTCTTGCTACGTCATTGTAATTCCAATTG TTCATGCATGGACGCGTTCAGAAACCAGACTTGAGAGTAAGAGAATACACACAATTTACA CTCTAAAAACAACGTTGAGATATAAACCTTATGAAATTAAATTCTAAAACTATTTGCATT AACTCATCCAACGCTCCAATCAATGTGTGGTACACTAAATAAATCAGCAATTCACATACA CACGGCGTACAGTACTACGACTGCTGTATCCCCTTCATCTTCGTCTTGCTACAATTTACT TGTACAATCGAATAAGCTTAACCAAGGGTCGCTGGCAATTTAAAAACCAATTTTGGTTTG ACTATGCGCTCACCATACCATAGACTATAAAGCAGCGAAAATCGTTCGACTTTGGAAGTA TATATTAATAAATAATAAACAGTTTTGTCTGCTAACGCTACCCAGTTGAGCGATCATTTC GATCCAGAACTTTTAACCACAGCTTTCCGCTTGGTTACCACAATGCGTTTCCAAAACAAT TACAAAACAAAACTAATTTTAAAAAAAACCATGCTACTGAGCTATCATCTGCCGTCAAAA GCTATCTTAATCGCTTTGGAGCGCATTAATCTCCTTCCATTCTGTACACTTAAACAATAT TATGATCAATTTGTCATGCACGATTGTATCCACTATCAATATCACCGTCATTTTTGTCAG CCAAAGATATTCTCCCACGCGTCCGCGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)