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Anopheles gambiae
cluster # 6971 cluster # 6971       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6971#0 length = 1283 sequences # 6  

consensusID : consensus_6971#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1283
fasta sequence
                              [TCTTCCTCACATCATCCCTTGCTCGTCGCGGAGGACACAGATGAGCTTCGTTTGGTGAAATTTGACCTTTCTTTTGTAGCGGGCAGCTGTTTATCAGCAGCTTTTGGTGCTGTTTTGCTATTTTCCATCTGTTTGAAGGTGTTTTTCATGTGGTCCGATACGGTTTGTTTCCGGGCATAAGGCGTAGACGTGCGAATTGTGCTCTCCGTCGTTGATGCAGACGATTCGCTACCGGATGATTCCGAGGAGTCGAGGATGGTTCGTCCACGCTTTACCTTTTTCGTTGGCTTAAATTGAACTCGGTGCTGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCCACTTTTGCTCCGATTCTTCACATCATCGATGACGCGCGTTTTGGGCACCGATTTCAACGCACTTTTCAAGATGCTGCCCACATTCGTCTTTTTAAGCGCGTCGATGTTGACACC-CTTACTACTGCTGCCTCCTTTCGCAAGCTGCATTATCCTGTCCCTTGCCGATGCTTTCGACAGTTGCGTGGGCATTTTGAATGGCGTAATGTTCGGAATGCTTTCGACCAG-ACTGTTCAAATCCAACCT-AGACACTGTGCCCGGCGGCCCACTGGCACCTTCCGGCTCGATCGTCAGGTACGAGGAAATGATCGTCTTCTCTACCTGGTGCACAATGACCCGCTTGCTGCGATTGCTGTCCGAGTACACGCAGCTAGAATGGTTTTCCATTTCATACTGTTGCTTTGCCGTCTCGTTCAGTATCGAGACGTTCTCCTTGTGGGTCACGTCCATCTGGGCGCTTCCATCGTACTCCGTGAAGCGTGTTTCCCGCTCCTGCGTTATCTGC-TTGCCCGTGCCGGGCTGACACCCCTGCTGCAGCCACCGCTGTACGTGATCAACGCTGAGGGAAAAATTGCTATTAAAAATCTGCTCCATCCCGTTGCACTTCCACTCGGCGGTCCGTTGCTTCAGGGCAACCTGCAGCTGGTCCTTTAACGCAGCGTAACTGCTGCCCGACTGTTCATTCTCCTTGTCCGACGCATCATCATCATCGCTGCTTTCGCTCGCTTCTTCGACAGTTTGCTGCTGGTCGTCAGTTTCTTTATCCGTTTCCCCGTACAAGTCAACCGCATCGTCGAGCGTCAGACCGTTCTCATCGTTCTCGAATTGTTTGTTGTATTTATCTAACAAGTTTTTCCACGTAATATAACGATTGGCGATGGTTTTATCGTCCGGGAACACACCCTCCGCCTTTGGACTTTTCGATTTCCTGTTACTGGCCGGTTTAGGATTGTTAAG]

[+] EMBL CNS08JXJ             [TCTTCCTCACATCATCCCTTGCTCGTCGCGGAGGACACAGATGAGCTTCGTTTGGTGAAATTTGACCTTTCTTTTGTAGCGGGCAGCTGTTTATCAGCAGCTTTTGGTGCTGTTTTGCTATTTTCCATCTGTTTGAAGGTGTTTTTCATGTGGTCCGATACGGTTTGTTTCCGGGCATAAGGCGTAGACGTGCGAATTGTGCTCTCCGTCGTTGATGCAGACGATTCGCTACCGGATGATTCCGAGGAGTCGAGGATGGTTCGTCCACGCTTTACCTTTTTCGTTGGCTTAAATTGAACTCGGTGCTGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCCACTTTTGCTCCGATTCTTCACATCATCGATGACGCGCGTTTTGGGCACCGATTTCAACGCACTTTTCAAGATGCTGCCCACATTCGTCTTTTTAAGCGCGTCGATGTTGACACC CTTACTACTGCTGCCTCCTTTCGCAAGCTGCATTATCCTGTCCCTTGCCGATGCTTTCGACAGTGGCGTGGGCATTTTGAATGGCGTAATGTTCGGAATGCTTTCGACCAG ACTGTTCAAATCCAACCT AGACACTGTGCCCGGCGGCCCACTGGCACCTTCCGGCTCGATCGTCAGGTACGAGGAAATGATCGTCTTCTCTACCTGGTGCACAATGACCCGCTTGCTGCGATTGCTGTCCGAGTACACGCAGCTAGAATGGTTTTCCATTTCATACTGTTGCTTTGCCGTCTCGTTCAGTATCGAGACGTTCTCCTTGTGGGTCACGTCCATCTGGGCGCTTCCATCGTACTCCGTGAAGCGTGTTTCCCGCTCCTGCGTTATCTGC TTGCCCGTGCCGGGCTGACACCCCTGCTGCAGCCACCGCTGTACGTGATCAACGCTGAGGGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CNS08WTZ             [  TTCCTCACATCATCCCTTGCTCGTCGCGGAGGACACAGATGAGCTTCGTTTGGTGAAATTTGACCTTTCTTTTGTAGCGGGCAGCTGTTTATCAGCAGCTTTTGGTGCTGTTTTGCTATTTTCCATCTGTTTGAAGGTGTTTTTCATGTGGTCCGATACGGTTTGTTTCCGGGCATAAGGCGTAGACGTGCGAATTGTGCTCTCCGTCGTTGATGCAGACGATTCGCTACCGGATGATTCCGAGGAGTCGAGGATAGTTCGTCCACGCTTTACCTTTTTCGTTGGCTTAAATTGAACTCGGTGCTGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCCACTTTTGCTCCGATTCTTCACATCATCGATGACGCGCGTTTTGGGCTCCGATTTCAACGCACTTTTCAAGATGCTGCCCACATTCGTCTTTTTAAGCGCGTCGATGTTGACACCGCTTACTACTGCTGCCTCCTTTCGCAAGCTGCATTATCCTGTCCCTTGCCGATGCTTTCGACAGTTGCGTGGGCATTTTGAATGGCGTAATGTTCGGAATGCTTTCGACCAGAACTGTTCAAATCCAACCTAAGACACTGTGCCCGGCGGCCCACTGGCACCTTCCGGCTCGATCGTCAGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CNS08T3V             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTCCGATTCTTAAAAAAATCGATGACGCGCGTTTTGGGCACCCTTTTCAACGCACTTTTCAAGATGCTGCCCAAATTCGTCTTTTTAAGCGCGTCGATGTTGACACC CTTACTACTGCTGCCTCCTTTCGCAAGCTGCATTATCCTGTCCCTTGCCGATGCTTTCGACAGTGGCGTGGGCATTTTGAATGGCGTAATGTTCGGAATGCTTTCGACCAG ACTGTTCAAATCCAACCT AGACACTGTGCCCGGCGGCCCACTGGCACCTTCCGGCTCGATCGTCAGGTACGAGGAAATGATCGTCTTCTCTACCTGGTGCACAATGACCCGCTTGCTGCGATTGCTGTCCGAGTACACGCAGCTAGAATGGTTTTCCATTTCATACTGTTGCTTTGCCGTCTCGTTCAGTATCGAGACGTTCTCCTTGTGGGTCACGTCCATCTGGGCGCTTCCATCGTACTCCGTGAAGCGTGTTTCCCGCTCCTGCGTTATCTGC TTGCCCGTGCCGGGCTGACACCCCTGCTGCAGCCACCGCTGTACGTGATCAACGCTGAGGGAAAAATTGCTATTAAAAATCTGCTCCATCCCGTTGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CNS08T3U             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GCACTTTTCAAGATGCTGCCCACATTCGTCTTTTTAAGCGCGTCGATG TGACACC CTTACTACTGCTGCCTCCTTTCGCAAGCTGCATTATCCTGTCCCTTGCCGATGCTTTCGACAGTTGCGTGGGCATTTTGAATGGCGTAATGTTCGGAATGCTTTCGACCAG ACTGTTCAAATCCAACCT AGACACTGTGCCCGGCGGCCCACTGGCACCTTCCGGCTCGATCGTCAGGTACGAGGAAATGATCGTCTTCTCTACCTGGTGCACAATGACCCGCTTGCTGCGATTGCTGTCCGAGTACACGCAGCTAGAATGGTTTTCCATTTCATACTGTTGCTTTGCCGTCTCGTTCAGTATCGAGACGTTCTCCTTGTGGGTCACGTCCATCTGGGCGCTTCCATCGTACTCCGTGAAGCGTGTTTCCCGCTCCTGCGTTATCTGC TT TCCGTGCCGGGCTGACACCCCTGCTGCAGCCACCGCTGTACGTGATCAACGCTGAGGGAAAAATTGCTATTAAAAATCTGCTCCATCCCGTTGCACTTCCACTCGGCGGTCCGTTGCTTCAGGGCAACCTGCAGCTGGTCCTTTAACGCTTTGTAACTGCTGCCCGACTGTTCATTCTCCTTGTCCGACGCATCATCATCATCGCTG TTTTTTTCGCTTCTTCGACAGTTTGCTGCTGGTCGTCAGTTTCTTTATCCGTTTCCCCGTACAAGTCAACCGCATCGTCGAGCGTCAGACCGTTCTCATCGTTCTCGAATTGTTTGTTGTATTTATCTAACAAGTTTTTCCACGTAATATAACGATTGGCGATGGTTTTATCGTCCGGGAACACACCCTCCGCCTTTGGACTTTTCGATTTCCTGTTACTGGCCGGTTTAGGATTGTTAAG]
[-] EMBL CNS08WTY             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CGCGTCGATG TGACACC CTTACTACTGCTGCCTCCTTTCGCAAGCTGCATTATCCTGTCCCTTGCCGATGCTTTCGACAGTTGCGTGGGCATTTTGAATGGCGTAATGTTCGGAATGCTTTCGACCAG ACTGTTCAAATCCAACCT AGACACTGTGCCCGGCGGCCCACTGGCACCTTCCGGCTCGATCGTCAGGTACGAGGAAATGATCGTCTTCTCTACCTGGTGCACAATGACCCGCTTGCTGCGATTGCTGTCCGAGTACACGCAGCTAGAATGGTTTTCCATTTCATACTGTTGCTTTGCCGTCTCGTTCAGTATCGAGACGTTCTCCTTGTGGGTCACGTCCATCTGGGCGCTTCCATCGTACTCCGTGAAGCGTGTTTCCCGCTCCTGCGTTATCTGC TT TCCGTGCCGGGCTGACACCCCTGCTGCAGCCACCGCTGTACGTGATCAACGCTGAGGGAAAAATTGCTATTAAAAATCTGCTCCATCTCGTTGCACTTCCACTCGGCGGTCCGTTGCTTCAGGGCAACCTGCAGCTGGTCCTTTAACGCAGCGTAACTGCTGCCCGACTGTTCATTCACCTTGTCCGACGCATCATCATCATCGCTGCTTTCGCTCGCTTCTTCGACAGTTTGCTGCTGGTCGTCAGTTTCTTTATCCGTTTCCCCGTACAAGTCAACCGCATCGTCGAGCGTCAGACCGTTCTCATCGTTCTCGAATTGTTTGTTGTATTTATCTAACAAGTTTTTCCACGTAATATAACGATTGGCGATGGTTTTATCGTCCGGGAACACACCCTCCGCCTTTGGACTTTTCGATTTCCTGTTACTGGCCGGTTTAGGATTGTTAA ]
[-] EMBL CNS08JXI             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGCCTCCTTTCGCAAGCTGCATTATCCTGTCCCTTGCCGATGCTTTCGACAGTTGCGTGGGCATTTTGAATGGCGTAATGTTCGGAATGCTTTCGACCAG ACTGTTCAAATCCAACCT AGACACTGTGCCCGGCGGCCCACTGGCACCTTCCGGCTCGATCGTCAGGTACGAGGAAATGATCGTCTTCTCTACCTGGTGCACAATGACCCGCTTGCTGCGATTGCTGTCCGAGTACACGCAGCTAGAATGGTTTTCCATTTCATACTGTTGCTTTGCCGTCTCGTTCAGTATCGAGACGTTCTCCTTGTGGGTCACGTCCATCTGGGCGCTTCCATCGTACTCCGTGAAGCGTGTTTCCCGCTCCTGCGTTATCTGCGTTG CCGTGCCGGGCTGACACCCCTGCTGCAGCCACCGCTGTACGTGATCAACGCTGAGGGAAAAATTGCTATTAAAAATCTGCTCCATCCCGTTGCACTTCCACTCGGCGGTCCGTTGCTTCAGGGCAACCTGCAGCTGGTCCTTTAACGCAGCGTAACTGCTGCCCGACTGTTCATTCTCCTTGTCCGACGCATCATCATCATCGCTGCTTTCGCTCGCTTCTTCGACAGTTTGCTGCTGGTCGTCAGTTTCTTTATCCGTTTCCCCGTACAAGTCAACCGCATCGTCGAGCGTCAGACCGTTCTCATCGTTCTCGAATTGTTTGTTGTATTTATCTAACAAGTTTTTCCACGTAATATAACGATTGGCGATGGTTTTATCGTCCGGGAACACACCCTCCGCCTTTGGACTTTTCGATTTCCTGTTACTGGCCGGTTTAGGATTGTTAA ]


>consensus_6971#0 TCTTCCTCACATCATCCCTTGCTCGTCGCGGAGGACACAGATGAGCTTCGTTTGGTGAAA TTTGACCTTTCTTTTGTAGCGGGCAGCTGTTTATCAGCAGCTTTTGGTGCTGTTTTGCTA TTTTCCATCTGTTTGAAGGTGTTTTTCATGTGGTCCGATACGGTTTGTTTCCGGGCATAA GGCGTAGACGTGCGAATTGTGCTCTCCGTCGTTGATGCAGACGATTCGCTACCGGATGAT TCCGAGGAGTCGAGGATGGTTCGTCCACGCTTTACCTTTTTCGTTGGCTTAAATTGAACT CGGTGCTGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCCACTTTTGCTCCGATTCTTCACATCATCGATG ACGCGCGTTTTGGGCACCGATTTCAACGCACTTTTCAAGATGCTGCCCACATTCGTCTTT TTAAGCGCGTCGATGTTGACACCCTTACTACTGCTGCCTCCTTTCGCAAGCTGCATTATC CTGTCCCTTGCCGATGCTTTCGACAGTTGCGTGGGCATTTTGAATGGCGTAATGTTCGGA ATGCTTTCGACCAGACTGTTCAAATCCAACCTAGACACTGTGCCCGGCGGCCCACTGGCA CCTTCCGGCTCGATCGTCAGGTACGAGGAAATGATCGTCTTCTCTACCTGGTGCACAATG ACCCGCTTGCTGCGATTGCTGTCCGAGTACACGCAGCTAGAATGGTTTTCCATTTCATAC TGTTGCTTTGCCGTCTCGTTCAGTATCGAGACGTTCTCCTTGTGGGTCACGTCCATCTGG GCGCTTCCATCGTACTCCGTGAAGCGTGTTTCCCGCTCCTGCGTTATCTGCTTGCCCGTG CCGGGCTGACACCCCTGCTGCAGCCACCGCTGTACGTGATCAACGCTGAGGGAAAAATTG CTATTAAAAATCTGCTCCATCCCGTTGCACTTCCACTCGGCGGTCCGTTGCTTCAGGGCA ACCTGCAGCTGGTCCTTTAACGCAGCGTAACTGCTGCCCGACTGTTCATTCTCCTTGTCC GACGCATCATCATCATCGCTGCTTTCGCTCGCTTCTTCGACAGTTTGCTGCTGGTCGTCA GTTTCTTTATCCGTTTCCCCGTACAAGTCAACCGCATCGTCGAGCGTCAGACCGTTCTCA TCGTTCTCGAATTGTTTGTTGTATTTATCTAACAAGTTTTTCCACGTAATATAACGATTG GCGATGGTTTTATCGTCCGGGAACACACCCTCCGCCTTTGGACTTTTCGATTTCCTGTTA CTGGCCGGTTTAGGATTGTTAAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)