Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Anopheles gambiae
cluster # 7119 cluster # 7119       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7119#0 length = 648 sequences # 6  

consensusID : consensus_7119#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 648
fasta sequence
                              [CCCCCGAGGTTTTGAACGGCTT-AGGGACGGTCGGCAGCCCGCATTGTTCGGTTGTTTACCAGCGTGTACCAGCGACGAGAACCCGTTTGTGGGAAGGAAAATCTAAACCGAAAACAACCACCAAAGTTTCAAGAAACACTTACCAGTATGGCAAATTTGCTTTG-G-TCCATCATTTGGCTGATCGTGCTAATCGTGGTCGGCTTCTGGG-TTGCGTTCTTCTGTGCGGGTTGG-TATGTTCTCATCTACCCGCTAACGGTGTGCGTGCCGGATATATCGGTCGTGTCCGATTTCCTTCTGATGGGAGCACAGTTCGCGCATTACTGTGCCAAGTGCATGATGGAGGGAAAATCTCTGTTCTAAGGTCGCCGATGTTTATGTTCATATTATCAATGCATCGATGCACACGTGCACGCAAATTGTGTGTATGTGTGTATTGAAGTAAAACGCAACATACAGACA-GGGGAGGTTAAACAGGGAGGAATCGACCAGAAGACCGCATGGTGTTATGTTTTAAATTCTACAATAGCAGCATTAATTAACATTATG-TTTTGTAAGTGTAAAGTCTATGCGTCGATGAGCAATAAATATAATTGTGTTCACGGTTAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACATGTGCCCGAGCTGGGTTTTTTT]

[+] EMBL AL932702             [CCCCCGAGGTTTTGAACGGCTT AGGGACGGTCGGCAGCCCGCATTGTTCGGTTGTTTACCAGCGTGTACCAGCGACGAGAACCCGTTTGTGGGAAGGAAAATCTAAACCGAAAACAACCACCAAAGTTTCAAGAAACACTTACCAGTATGGCAAATTTGCTTTG G TCCATCATTTGGCTGATCGTGCTAATCGTGGTCGGCTTCTGGGCTTGCGTTCTTCTGTGCGGGTTGGCTATGTTCTCATCTACCCGCTAACGGTGTGCGTGCCGGATATATCGGTCGTGTCCGATTTCCTTCTGATGGGAGCACAGTTCGCGCATTACTGTGCCAAGTGCATGATGGAGGGAAAATCTCTGTTCTAAGGTCGCCGATGTTTATGTTCATATTATCAATG                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BM619246             [      ccgaTTTGAACGGCTTAAGGGACGGTCGGCAGCCCGCATTGTTCGGTTGTTTACCAGCGTGTACCAGCGACGAGAACCCGTTTGTGGGAAGGAAAATCTAAACCGAAAACTACCACCAAAGTTTCAAGAAACACTCACCAGTATGGCAAATTTGCTTTG G TCCATCATTTGGCTGATCGTGCTAATCGTGGTCGGCTTCTGGG TTGCGTTCTTCTGTGCGGGTTGG TATGTTCTCATCTACCCGCTAACGGTGTGCGTGCCGGATATATCGGTCGTGTCCGATTTCCTTCTGATGGGAGCACAGTTCGCGCATTACTGTGCCAAGTGCATGATGGAGGGAAAATCTCTGTTCTAAGGACGCCGATGTTTATGTTCGTATTATCAATGCATCGATGCACACGTGCACGCAAATTGTGTGTATGTGTGTATTGAAGTAAAACGCAACATACAGACA GGGGAGGTTAAACAGGGAGGAATCGACCAGAAGACCGCATGGTGTTATGTTTTAAATTCTACAATAGCAGCATTAATTAACATTATG TTTTGTAAGTGTAAAGTCTATGCGTCGATGAGCAATAAATATAATTGTGTTCACGGTTAA                                          ]
[+] EMBL BM601083             [                           cCGGTCGGCAGCCCGCATTGTTCGGTTGTTTACCAGCGTGTACCAGCGACGAGAACCCGTTTGTGGGAAGGAAAATCTAAACCGAAAACAACCACCAAAGTTTCAAGAAACACTCACCAGTATGGCAAATTTGCTTTG G TCCATCATTTGGCTGATCGTGCTAATCGTGGTCGGCTTCTGGG TTGCGTTCTTCTGTGCGGGTTGG TATGTTCTCATCTACCCGCTAACGGTGTGCGTGCCGGATATATCGGTCGTGTCCGATTTCCTTCTGATGGGAGCACAGTTCGCGCATTACTGTGCCAAGTGCATGATGGAGGGAAAATCTCTGTTCTAAGGACGCCGATGTTTATGTTCGTATTATCAATGCATCGATGCACACGTGCACGCAAATTGTGTGTATGTGTGTATTGAAGTAAAACGCAACATACAGACAGGGGGAGGTTAAACAGGGAGGAATCGACCAGAAGACCGCATGGTGTTATGTTTTAAATTCTACAATAGCAGCATTAATTAACATTATGTTTTTGTAAGTG                                                                                           ]
[+] EMBL CNS0943F             [                             GGTCGGCAGCCCGCATTGTTCGGTTGTTTACCAGCGTGTACCAGCGACGAGAACCCGTTTGTGGGAGGGAAAATCTAAACCGAAAACAACCACCAAAGTTTCAAGAAACACTTACCAGTATGGCAAATTTGCTTTGCGCTCCATCATTTGGCTGATCGTGCTAATCGTGGTCGGCTTCTGGG TTGCGTTCTTCTGTGCGGGTTGG TATGTTCTCATCTACCCGCTAACGGTGTGCGTGCCGGATATATCGGTCGTGTCCGATTTCCTTCTGATGGGAGCACAGTTCGCGCATTACTGTGCCAAGTGCATGATGGAGGGAAAATCTCTGTTCTAAGGTCGCCGATGTTTATGTTCATATTATCAATGCATCGATGCATACGTGCACG                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CNS08P69             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tactggATCAATGTATCGATGCATACGTGCACGCAAATTGTGTGTATGTGTGTATTGAAGTAAAACGCAACATACAGACA GGGGAGGTTAAACAGGGAGGATTCGACCAGAAGACCGCATGGTGTTATGTTTTAAATTCTACAATAGCAGCATTAATTAACATTATG TTTTGTAAGTGTAAAGTCTATGCGTCGATGAGCAATAAATATAATTGTGTTCACGGTTAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACATGTGCCCGAGCTGGGTTTTTTT]
[+] EMBL BM575116             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ccgATACAGACA GGGGAGGTTAAACAGGGAGGATTCGACCAGAAGACCGCATGGTGTTATGTTTTAAATTCTACAATAGCAGCATTAATTAACATTATG TTTTGTAAGTGTAAAGTCTATGCGTCGATGAGCAATAAATATAATTGTGTTCACGGTT                                            ]


>consensus_7119#0 CCCCCGAGGTTTTGAACGGCTTAGGGACGGTCGGCAGCCCGCATTGTTCGGTTGTTTACC AGCGTGTACCAGCGACGAGAACCCGTTTGTGGGAAGGAAAATCTAAACCGAAAACAACCA CCAAAGTTTCAAGAAACACTTACCAGTATGGCAAATTTGCTTTGGTCCATCATTTGGCTG ATCGTGCTAATCGTGGTCGGCTTCTGGGTTGCGTTCTTCTGTGCGGGTTGGTATGTTCTC ATCTACCCGCTAACGGTGTGCGTGCCGGATATATCGGTCGTGTCCGATTTCCTTCTGATG GGAGCACAGTTCGCGCATTACTGTGCCAAGTGCATGATGGAGGGAAAATCTCTGTTCTAA GGTCGCCGATGTTTATGTTCATATTATCAATGCATCGATGCACACGTGCACGCAAATTGT GTGTATGTGTGTATTGAAGTAAAACGCAACATACAGACAGGGGAGGTTAAACAGGGAGGA ATCGACCAGAAGACCGCATGGTGTTATGTTTTAAATTCTACAATAGCAGCATTAATTAAC ATTATGTTTTGTAAGTGTAAAGTCTATGCGTCGATGAGCAATAAATATAATTGTGTTCAC GGTTAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACATGTGCCCGAGCTGGGTTTTTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)