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Anopheles gambiae
cluster # 7149 cluster # 7149       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7149#0 length = 1672 sequences # 6  

consensusID : consensus_7149#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1672
fasta sequence
                              [ATCGTCCTGCTTTTCGGCAAACACGAATAGATGCGTTTGGAATTTCATAATGCTGATGCGTCACCTGGTTAGGGAAATAGATTGCCCCACGAATGCTGGAGTTAGGAACTAAAAATGTCGTGAAGCGCAGGACTTACCTGTACTGCTTTCGTAACGAACCTTTCGGAAAGGAGTTCGGATGAATGAAACATTGCCTTTGCTTTGCTGCAAACCTTTCCCTTATACATCAGTAATCGTCCGGCTTGGAACGGGTTTTTATTACATCG-TTTTTTCTGTTTTGTTTTTGATTAACAAGATACGAGACGGTGGCACATGGCAGTCTCCGTACAGCTAGGTATTGTATTGATGATAGTTTTATTCGTTCGGGCACTCGAGCCCAGCGCTGCTTCATACTGCTCTGTCTCTAATGTTCTTTCCCGCTGTGAAGTGCGAATCTATTTAAAATACATTTTACACATATACTTCCCCAACATTCATACACACGGACACACATACACTCCTTCGGTATATTTATGGGGCCAGTTTCGGGAACCGTTCCTACCGTCAACAAGCCAATTAAAATTTGTTCCATTCACAGACTTAGAGCCTACCTTTAATTGCCTCAATCCTTGGCCGGGAAGGAACCATTTTCCTGTCGGACGTGCATGCCATGTTTTTGGCGGCTTGGCAGCCATTTTTGGAGTGCGTCGAGCTACTGGCGACGTTAACGGTTAACATAAACCACATATTGGCCGGTTTTCTCCCCCTCCTCTGTATTATACGGTTCCCGCTCTAGTAGCTTTCGGTTATTTATAGGTAAACGTGTTATAATCATCATCATCACAGCTATTCATGTGTATTCGAGAAAGGCAATTTAAAACTGCAGAAAACACGGACACGGATACGGTACACAAAACACCACAGTTACAAAACACCCACCGTAACGTTAACTCCCCCGGACCTAACCGACCGGCGGCAATCGATGGTGGACGATTTTTTTAAATTGTTGGAAAACAGAAGAAACTTCGCAGAGGGACGCCAACGTTCAAGGAACAAGTTGCATTTTTCATTTCGCGAACATCGATAAGGACACAGACAAGACATCTTGTCTTTGAAAAGAGAGCAAGGGAAC-----GAAGTGTTGTTAGAAAAATAAAACCATTAAAAGGGTATCGGTTTGATTCCGCGGTTCACAACGAATGACTTTGACTGTTTGCATACATGTTAGTCATCGGCGGAACGGAACGGCTGCGAAGGAACGGCTTAAGGGCAACCAAAGGGAGGCAGCGTTATTTGTCCACCATCGTGCCACTTTAGACCGTGTGTATAAGCGTGTGAGCGGGTGTGCGCGCACGCCTTGCATTATTGAACTGCACAGATGCAGTTTCCCACCTACGCTGTACGCTACGTCGTCTCAACATAAGTTCATTTCTATTGTTCCCTTGGAGTCGTATTGGTTTTCCATTCTGCCGTACGGCGTGTACTGGTTCTAATTGTCCAGTTTTCACTCTTTTTGCAGGGCCACTATATTGTATTAGAATCGTTTGCTTCCCCACCTCTTTTGGGTATGTATAGGAGAAGAGGATCAGTCGTGCTTTTGTGTTCTTCTTGTGCTCTGTTTCTTCGCTCCGTTCCGATAGTGTTTGATATTTAAGTTTCAGTTGTGGCGGGGTTTGCCCTGCATCACAATCAATAT]

[+] EMBL CNS09AQJ             [ATCGTCCTGCTTTTCGGCAAACACGAATAGATGCGTTTGGAATTTCATAATGCTGATGCGTCACCTGGTTAGGGAAATAGATTGCCCCACGAATGCTGGAGTTAGGAACTAAAAATGTCGTGAAGCGCAGGACTTACCTGTACTGCTTTCGTAACGAACCTTTCGGAAAGGAGTTCGGATGAATGAAACATTGCCTTTGCTTTGCTGCAAACCTTTCCCTTATACATCAGTAATCGTCCGGCTTGGAACGGGTTTTTATTACATCG TTTTTTCTGTTTTGTTTTTGATTAACAAGATACGAGACGGTGGCACATGGCAGTCTCCGTACAGCTAGGTATTGTATTGATGATAGTTTTATTCGTTCGGGCACTCGAGCCCAGCGCTGCTTCATACTGCTCTGTCTCTAATGTTCTTTCCCGCTGTGAAGTGCGAATCTATTTAAAATACATTTTACACATATACTTCCCCAACATTCATACACACGGACACACATACACTCCTTCGGTATATTTATGGGGCCAGTTTCGGGAACCGTTCCTACCGTCAACAAGCCAATTAAAATTTGTTCCATTCACAGACTTAGAGCCTACCTTTAATTGCCTCAATCCTTGGCCGGGAAGGAACCATTTTCCTGTCGGACGTGCATGCCATGTTTTTGGCGGCTTGGCAGCCATTTTTGGAGTGCGTCGAGCTACTGGCGACGTTAACGGTTAACATAAACCACATATTGGCCGGTTTTCTCCCCCTCCTCTGTATTATACGGTTCCCGCTCTAGTAGCTTTCGGTTATTTATAGGTAAACGTGTTATAATCATCATCATCACAGCTATTCATGTGTATTCGAGAAAGGCAATTTAAAACTGCAGAAAACACGGACACGGATACGGTACACAAAACACCACAGTTACAAAACACCCACCGTAACGTTAACTCCCCCGGACCTAACCGACCGGCGGCAATCGATGGTGGACGATTTTTTTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL BX612831             [                                                                                                                                                                                                                     TTTCCCTTATACATCAGTAATCGTCCGGCTTGGAACGGGTTTTTATTACATCGTTTTTTTCTGTTTTGTTTTTGATTAACAAGATACGAGACGGTGGCACATGGCGGGCTCCGTACAGCTAGGTATTGTATTGATGATAGTTTTATTCGTTCGGGCACTCGAGCCCAGCGCTGCTTCACACTGCTCTGTCTCTAATGTTCTTTCCCGCTGTGAAGTGCGAATCTATTTAAAATACATTTTACACATATACTTCCCCAACATTCATACACACGGACACACATACACTCCTTCGGTATATTTATGGGGCCAGTTTCGGGAACCGTTCCTACCGTCAACAAGCCAATTAAAATTTGTTCCATTCACAGACTTAGAGCCTACCTTTAATTACCTCAATCCTTGGCCGGGAAGGAACCATTTTCCTGTCGGACGTGCATGCCATGGTTTTGGCGGCTTGGCAGCCATTTTTGGAGTGCGTCGAGCTACTGGCGACGTTAACGGTTAACATAAACCACATATTGGCCGATTTTCTCCCCCTCCTCTGTATTATACGGTTCCCGCTCTAGTAGCTTTCGGTTATTTATAGGTAAACGTGTTATAATCATCATCATCACAGCTATTCATGTGTATTCGAGAAAGGCAATTTAAAACTGCAGAAAACACGGACACGGATACGGTACACAAAACACCACAGTTACAAAACACCCACCGTAACGTTAACTCCCCCCGACCTAACCGACCGGCGGCAATCGATGGTGTACGATTTTTTTAAATTGTTGGAAAACAGAAGAAACTTCGCAGAGGGACGCCAACGTTCAAGGAACAGGTTGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CNS094OD             [                                                                                                                                                                                                                                   CAGTAATCGTCCGGCTTGGAACGGGTTTTTATTACATCG TTTTTTCTGTTTTGTTTTTGATTAACAAGATACGAGACGGTGGCACATGGCAGTCTCCGTACAGCTAGGTATTGTATTGATGATAGTTTTATTCGTTCGGGCACTCGAGCCCAGCGCTGCTTCATACTGCTCTGTCTCTAATGTTCTTTCCCGCTGTGAAGTGCGAATCTATTTAAAATACATTTTACACATATACTTCCCCAACATTCATACACACGGACACACATACACTCCTTCGGTATATTTATGGGGCCAGTTTCGGGAACCGTTCCTACCGTCAACAAGCCAATTAAAATTTGTTCCATTCACAGACTTAGAGCCTACCTTTAATTGCCTCAATCCTTGGCCGGGAAGGAACCATTTTCCTGTCGGACGTGCATGCCATGTTTTTGGCGGCTTGGCAGCCATTTTTGGAGTGCGTCGAGCTACTGGCGACGTTAACGGTTAACATAAACCACATATTGGCCGGTTTTCTCCCCCTCCTCTGTATTATACGGTTCCCGCTCTAGTAGCTTTCGGTTATTTATAGGTAAACGTGTTATAATCATCATCATCACAGCTATTCATGTGTATTCGAGAAAGGCAATTTAAAACTGCAGAAAACACGGACACGGATACGGTACACAAAACACCACAGTTACAAAACACCCACCGTAACGTTAACTCCCCCGGACCTAACCGACCGGCGGCAATCGATGGTGGACGATTTTTTTAAATTGTTGGAAAGCAGAAGAAACTTCGCAGAGGGACGCCAACGTTCAAGGAACAAGTTGCATTTTTCATTTCGCGAACATCGATAAGGACACAGACAAGACATCTTGTCTTTGAAAAGAGAGCAAGGGAAC     GAA TTTTGTTAGAAAAAT AAACCATTAAAAGGGTATCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CNS09AQK             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCCCCAACATTCATACACACGAAAACACATAAACTCCTTCGGTATATTTATGGGGCCAGTTTCGGGAACCGTTCCTACCGTCAACAAGCCAATTAAAATTTGTTCCATTCACAGACTTAGAGCCTACCTTTAATTGCCTCAATCCTTGGCCGGGAAGGAACCATTTTCCTGTCGGACGTGCATGCCATGTTTTTGGCGGCTTGGCAGCCATTTTTGGAGTGCGTCGAGCCACTGGCGACGTTAACGGTTAACATAAACCAAATATTGGCCGGTTTTCTCCCCCTCCTCTGTATTATACGGTTCCCGCCCTAGTAGCTTTCGGTTATTTATAGGTAAACGTGTTATAATCATCATCATCACAGCTATTCATGTGTATTCGAGAAAGGCAATTTAAAACTGCAGAAAACACGGACACGGATACGGTACACAAAACACCACAGTTAAAAAACACCCACCGTAACGTTAACTCCCCCGGACCTAACCGACCGGCGGCAATCGATGGTGGACGATTTTTTTAAATTGTTGGAAAACAGAAGAAACTTCGCAGAGGGACGCCAACGTTCAAGGAACAAGTTGCATTTTTCATTTCGCGAACATCGATAAGGACACAGACAAGACATCTTGTCTTTGAAAAGAGAGCAAGGGAACGAAGTGAAGTGTTGTTAGAAAAATAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL BX627806             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GCATGCCATGTTTTTGGCGGCTTGGCAGCCATTTATGGAGTGCGTCGAGCTACTGGCGACGTTAACGGTTAACATAAACCACATATTGGCCGGTTTTCTCCCTCACCTCTGTATTATACGGTTCCCGCTCTAGTAGCTTTCGGTTATTTATAGGTAAACGTGTTATAATCATCATCATCACAGCTATTCGTGTGTATTCGAGAAAGGCAATTTAAAACTGCAGAAAACACGGACACGGACACGGTACACAAAACACCACAGTTACAAAACACCCACCGTAACGTTAACTCCCCCCGACCTAACCGACCGGCTGCAATCGATGGTGGACGATTTTTTT TATTGTTGGAAAACAGAAGAAACTTCGCAGAGGGACACCAACGTTCAAGGAACAAGTTGCATTTTTCATTTCTCGAACATCGATAAGGACACAGACAAGACATCTTGTCTTCCAAAAGAGAGTAAGGGAAC     GAAGGGTTTTTGGAAAAATAAAACCATTAAAAGGGTATCTGTTTGATTCCGCGGTTCACAACGAATGACTTTGACTGTTTGCATACATGTTAGTCATCGGCGGAACGGAACGGCTGCGAAGGAACGGCTTAAGGGCAACCAAAGGGAGGCAGCGTTATTTGTCCACCATCGTGCCACTTTAGACCGTGTGTATAAGCGTGTGAGCGGGTGTGCGCGCACGCCTTGCATTATTGAACTGCACAGATGCAGTTTCCCACCTACGCTGTACGCTACGTCGTCTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CNS094OC             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTGGCCGGTTTTCTCCCCCTCCTCTGTATTATACGGTTCCCGCTCTAGTAGCTTTCGGTTATTTATAGGTAAACGTGTTATAATCATCATCATCACAGCTATTCATGTGTATTCGAGAAAGGCAATTTAAAACTGCAGAAAACACGGACACGGATACGGTACACAAAACACCACAGTTACAAAACACCCACCGTAACGTTAACTCCCCCGGACCTAACCGACCGGCGGCAATCGATGGTGGACGATTTTTTTAAATTGTTGGAAAGCAGAAGAAACTTCGCAGAGGGACGCCAACGTTCAAGGAACAAGTTGCATTTTTCATTTCGCGAACATCGATAAGGACACAGACAAGACATCTTGTCTTTGAAAAGAGAGCAAGGGAAC     GAAGTGTTGTTAGAAAAATAAAACCATTAAAAGGGTATCCGTTCGATTCCGCGGTTCACCACGAATGACTTTGACTGTTTGCATACATGTTAGTCATCGGCGGAACGGAACGGCTGCGAAGGACCGGCTCAGGGGCAACCAAAGGGAGGCAGCGTTATCTGTCCACCATCGTGCCACTTTAGACCGTGTGTATAAGCGTGTGAGCGGGTGTGCGCGCACGCCTTGCATTATTGAACTGCACAGTTGCAGTTTCCCACCTACGCAGTACGCTACGTCGTCTCAACATAAGTTCATTTCTATTGTTCCCTTGGAGTCGTATTGGTTTTCCATTCTGCCGTACGGCGTGTACTGGTTCTAATTGTCCAGTTTTCACTCTTTTTGCAGGGCCACTATATTGTATTAGAATCGTTTGCTTCCCCACCTCTTTTGGGTATGTATAGGAGAAGAGGATCAGTCGTGCTTTTGTGTTCTTCTTGTGCTCTGTTTCTTCGCTCCGTTCCGATAGTGTTTGATATTTAAGTTTCAGTTGTGGCGGGGTTTGCCCTGCATCACAATCAATAT]


>consensus_7149#0 ATCGTCCTGCTTTTCGGCAAACACGAATAGATGCGTTTGGAATTTCATAATGCTGATGCG TCACCTGGTTAGGGAAATAGATTGCCCCACGAATGCTGGAGTTAGGAACTAAAAATGTCG TGAAGCGCAGGACTTACCTGTACTGCTTTCGTAACGAACCTTTCGGAAAGGAGTTCGGAT GAATGAAACATTGCCTTTGCTTTGCTGCAAACCTTTCCCTTATACATCAGTAATCGTCCG GCTTGGAACGGGTTTTTATTACATCGTTTTTTCTGTTTTGTTTTTGATTAACAAGATACG AGACGGTGGCACATGGCAGTCTCCGTACAGCTAGGTATTGTATTGATGATAGTTTTATTC GTTCGGGCACTCGAGCCCAGCGCTGCTTCATACTGCTCTGTCTCTAATGTTCTTTCCCGC TGTGAAGTGCGAATCTATTTAAAATACATTTTACACATATACTTCCCCAACATTCATACA CACGGACACACATACACTCCTTCGGTATATTTATGGGGCCAGTTTCGGGAACCGTTCCTA CCGTCAACAAGCCAATTAAAATTTGTTCCATTCACAGACTTAGAGCCTACCTTTAATTGC CTCAATCCTTGGCCGGGAAGGAACCATTTTCCTGTCGGACGTGCATGCCATGTTTTTGGC GGCTTGGCAGCCATTTTTGGAGTGCGTCGAGCTACTGGCGACGTTAACGGTTAACATAAA CCACATATTGGCCGGTTTTCTCCCCCTCCTCTGTATTATACGGTTCCCGCTCTAGTAGCT TTCGGTTATTTATAGGTAAACGTGTTATAATCATCATCATCACAGCTATTCATGTGTATT CGAGAAAGGCAATTTAAAACTGCAGAAAACACGGACACGGATACGGTACACAAAACACCA CAGTTACAAAACACCCACCGTAACGTTAACTCCCCCGGACCTAACCGACCGGCGGCAATC GATGGTGGACGATTTTTTTAAATTGTTGGAAAACAGAAGAAACTTCGCAGAGGGACGCCA ACGTTCAAGGAACAAGTTGCATTTTTCATTTCGCGAACATCGATAAGGACACAGACAAGA CATCTTGTCTTTGAAAAGAGAGCAAGGGAACGAAGTGTTGTTAGAAAAATAAAACCATTA AAAGGGTATCGGTTTGATTCCGCGGTTCACAACGAATGACTTTGACTGTTTGCATACATG TTAGTCATCGGCGGAACGGAACGGCTGCGAAGGAACGGCTTAAGGGCAACCAAAGGGAGG CAGCGTTATTTGTCCACCATCGTGCCACTTTAGACCGTGTGTATAAGCGTGTGAGCGGGT GTGCGCGCACGCCTTGCATTATTGAACTGCACAGATGCAGTTTCCCACCTACGCTGTACG CTACGTCGTCTCAACATAAGTTCATTTCTATTGTTCCCTTGGAGTCGTATTGGTTTTCCA TTCTGCCGTACGGCGTGTACTGGTTCTAATTGTCCAGTTTTCACTCTTTTTGCAGGGCCA CTATATTGTATTAGAATCGTTTGCTTCCCCACCTCTTTTGGGTATGTATAGGAGAAGAGG ATCAGTCGTGCTTTTGTGTTCTTCTTGTGCTCTGTTTCTTCGCTCCGTTCCGATAGTGTT TGATATTTAAGTTTCAGTTGTGGCGGGGTTTGCCCTGCATCACAATCAATAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)