These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7195#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1129 fasta sequence [TTGGACAAGGTTACGGGATTCCTATTTTTCTTGTCTAAGTTACTCCTTGCTTCTGGAATGGCAGCCGTAACGTACACGTATTTTGATAGTGATCTACCAAAGATGCAACTAAATTACCCTTTTGTGCCAGCTGTACTCGTTTTCATTGGAACGTTCATTATTGCGTCCATATTCTTCAGCGTTTACTCTGTTGCTGTTGACACCTTATTTTTGTGTTTTTTGGAAGACATAGAACGAAACGATGGCAGTGCCGAACGACCGTTTTATATGTCCAGAGGATTGCAAAAAATATTGGGGAAGAAGCAAAAGTAAATTGAAGATATCACCAAAGATTTATTGTCTACCGTCAACACTGTCGCGGGGTAGCAGCACCAATCAACTGCAGTTCTTCCTATGGACTATTTGGATAATGCGTGACCAAGCAAATATTTCCACGCACATAGAATTCTAAACCTTTAAGCCAATACAGCCCATTTGTAAATATTTGGATGAAACAGCTGCTTAATAGTGTATGTCATTTTGTTCACATATGAACTAATTTAAGTCTATATTTTGATACTAATTTATACATAATGCGTACCATGGGTATGATGAAATGAAATTCAACGAGAATTTAGAAGAACAGATGAGAGTAGGCATTTAAATCAAGAATATATTGTGATTGATAATATTGGTGGATCTTATAAGAATTCAAAACTCATAAATGCAAATTACACCTTGATAATTTTCTAATGTATTGAATATTTCTACAACCATCACTAGATGAATTGTAATTATTATATACATACAGTAATTTACAGTAAGTAAAAAACTATACGACCAAAGTATGTACTGTTCGGTAAATATTGGAAATTCATATCTGGAATTGATAGTGAAACATTAGATTGTACTATAATGATGATCAAAGGAACAGATTTCTTGTTTTGACAATGGTATAGTAATGAAAATATCAATTTTTCAAATTTAACTTACACCCGTGTTTTATTCATAATGTTGTGGAAAACATTGAAGAAAGCATAAAAACTCGGTGTTCTTATAGTTTTGAAAAGAATTGTATACACTAATATTC-ATGTGAAGC-ATACGTTCTAGCCTTTCCTTCTGATAAAAAAAAAAACACCTCGGGGCGATC] [+] EMBL BX625495 [TTGGACAAGGTTACGGGATTCCTATTTTTCTTGTCTAAGTTACTCCTTGCTTCTGGAATGGCAGCCGTAACGTACACGTATTTTGATAGTGATCTACCAAAGATGCAACTAAATTACCCTTTTGTGCCAGCTGTACTCGTTTTCATTGGAACGTTCATTATTGCGTCCATATTCTTCAGCGTTTACTCTGTTGCTGTTGACACCTTATTTTTGTGTTTTTTGGAAGACATAGAACGAAACGATGGCAGTGCCGAACGACCGTTTTATATGTCCAGAGGATTGCAAAAAATATTTGGGAAGAAGCAAAAGTAAATTGAAGATATCACCAAAGATTTATTGTCTACCGTCAACACTGTCGCGGGGTAGCAGCACCAATCAACTGCAGTTCTTCCTATGGACTATTTGGATAATGCGTGACCAAGCAAATATTTCCACGCACATAGAATTCTAAACC TAAGCCAATACAGCCCATTTGTAAATATTTGGATGAAACAGCTGCTTAATAGTGTATGTCATTTTGTTCACATATGAACTAATTTAAGTCTATATTTTGATACTAATTTATACATAATGCGTACCATGGGTATGATGAAATGAAATTCAACGAGAATTTAGAAGAACAGATGAGAGTAGGCATTTAAATCAAGAATATATTGTGATTGATAATATTGGTGGATCTTATAAGAATTCAAAACTCATAAATGCNAATTACACCTTGATAATTTTCTAATGNATTGAATATTTCTACCACCATCACTAGATGAATTGTAATTATTATATACATA ] [+] EMBL BX623568 [ AACTAAATTACCCTTTTGTGCCAGCTGTACTCGTTTTCATTGGAACGTTCATTATTGCGTCCATATTCTTCAGCGTTTACTCTGTTGCTGTTGACACCTTATTTTTGTGTTTTTTGGAAGACATAGAACGAAACGATGGCAGTGCCGAACGACCGTTTTATATGTCCAGAGGATTGCAAAAAATATTGGGGAAGAAGCAAAAGTAAATTGAAGATATCACCAAAGATTTATTGTCTACCGTCAACACTGTCGCGGGGTAGCAGCACCAATCAACTGCAGTTCTTCCTATGGACTATTTGGATAATGCGTGACCAAGCAAATATTTCCACGCACATAGAATTCTAAACCTTTAAGCCAATACAGCCCATTTGTAAATATTTGGATGAAACAGCTGCTTAATAGTGTATGTCATTTTGTTCACATATTAACTAATTTAAGTCTATATTTTGATACTAATTTATACATAATGCGTACCATGGGTATGATGAAATGAAATTCAACGAGAATTTAGAAGAACAGATGAGAGTAGGCATTTAAATCAAGAATATATTGTGATTGATAATATTGGTGG ] [+] EMBL BX626317 [ GCAGTGCCGAACGACCGTTTTATATGTCCAGAGGATTGCAAAAAATATTGGGGAAGAAGCAAAAGTAAATTGAAGATATCACCAAAGATTTATTGTCTACCGTCAACACTGTCGCGGGGTAGCAGCACCAATCAACTGCAGTTCTTCCTATGGACTATTTGGATAATGCGTGACCAAGCTAATATTTCCACTCACATAGAATTCTAAACCTTTAAGCCAATACAGCCCATTTGTAAATATTTGGATGAAACAGCTGCTTAATAGTGTATGTCATTTTGTTCACATATGAACTAATTTAAGTCTATATTTTGATACTAATTTATACATAATGCGTACCATGGGTATGATGAAATGAAATTCAACGAGAATTTAGAAGAAGAGATGAGAGTAGGCATTTAAATCAAGAATATATTGTGATTGATAATATTGGTGGATCTTATAAGAATTCAAAACTCATAAATGCAAATTACACCTTGATAATTTTCTAATGTATTGAATATTTCTACAACCATCACTAGATGAATTGTAATTACTATATACATACAGTAATTTACAGTAAGTAAAAAACTATACGACCAAAGTATGTACTGTTCGGTAAATATTGGAAATTCATATCTGGAATTGATAGTGAAACATTAGATTGTACTAT ] [+] EMBL BX613251 [ TTGGATGAAACAGCTGTTTAATAGTGTATGTCATTTTGTTCAGATATGAACTAATTTAAGTCTATATTTTGATACTAATTTATACATAATGCGTATAATGGGTATGAAGAAATGAAATTCAAGGAGAATTTAGAAGAACAGATGAGAGTAGGCATTTAAATTAAGAATATATTGTGATTGATAATATTGGTGGATCTTATAAGAATTCAAAACTTATAAATGCAAATTACAAGTTGATAATTTTCTAATGTATTGAATATTTCTACAACCATCACTAGATGAATTGTAATTA TATATACATACAGTAATT ] [-] EMBL AL931104 [ TCTATATTTTGATACTAATTTATACATAATGCGTACCATGGGTATGATGAAATGAAATTCAACGAGAATTTAGAAGAACAGATGAGAGTAGGCATTTAAATCAAGAATATATTGTGATTGATAATATTGGTGGATCTTATAAGAATTCAAAACTCATAAATGCAAATTACACCTTGATAATTTTCTAATGTATTGAATATTTCTACAACCATCACTAGATGAATTGTAATTATTATATAAATACAGTAATTTACAGTAAGTAAAAAACTATACGACCAAAGTATGTACTGTTCGGTAAATATTGGAAATTCATATCTGGAATTGATAGTGAAACATTAGATTGTACTATAATGATGATCAAAGGAACAGATTTCTTGTTTTGACAATGGTATAGTAATGAAAATATCAATTTTTCAAATTTAACTTACACCCGTGTTTTATTCATAATGTTGTGGAAAACATTGAAGAAAGCATAAAAACTCGGTGTTCTTATAGTTTTGAAAAGAATTGTATACACTAATATTC ATGTGAAGC ATACGTTCTAGCCTTTCCTTCTGATAAAAAAAAAAACACCTCGGGGCGATC] [+] EMBL BM626426 [ ccgATGAAATTCAACGAGAATTTAGAAGAACAGATGAGAGTAGGCATTTAAATCAAGAATATATTGTGATTGATAATATTGGTGGATCTTATAAGAATTCAAAACTCATAAATGCAAATTACACCTTGATAATTTTCTAATGTATTGAATATTTCTACAACCATCACTAGATGAATTGTAATTACTATATACATACAGTAATTTACAGTAAGTAAAAAACTATACGACCAAAGTATGTACTGTTCGGTAAATATTGGAAATTCATATCTGGAATTGATAGTGAAACATTAGATTGTACTATAATGATGATCAAAGGAACAGATTTCTTGTTTTGACAATGGTATAGTAATGAAAATATCAATTTTTCAAATTTAACTTACACCCGTGTTTTATTCATAATGTTGTGGAAAACATTGAAGAAAGCATAAAAACTCGGTGTTCTTATAGTTTTGAAAAGAATTGTATACACTAATATTCAATGTGAAGCAATACGTTC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||