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Anopheles gambiae
cluster # 7416 cluster # 7416       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7416#0 length = 1208 sequences # 7  

consensusID : consensus_7416#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1208
fasta sequence
                              [CCGGACAAACTAGAGCGAATGGAATTGATTAAAGATGAAGACGTTCTGTTTGAATGGCATAGTCCACTATACATGAACTTTACACATGTAGGTATTATGTTTAAGATGGAAGAAATTTTCCGAGAAAAAGTAAATGGAAGACTAGAGGGTCACATTTATGGCGACATTTACGTACACGAATGTCCCGATGAGTTGAACTTAGTGCTAGAACCATTAGCAGCGAATGAAGTGATCATGAAACCGCTGTGCATCGACGACGTAAAGGATATACACGATTTATATCCGGCAGGTGATATCGAAAGTTTAGAGTTATTTGAAAAGCTAGTCATCCAGCTTCCAGGCTTCGGTGTATTTAATCAATCGGATAATGAACTAGCTGCATGGAGTTTGCAGTC--ATTATGGTGGAATGTTCTCCATGCAAACAAAACCAAAATTTAGAAGAAAAGGATACGGTATTCAGCTAGCACAATCTCTGACTAAGTTGGTAATTCGTCGCGGATATATACCGTTTGTTGTCATAAGGCCAGAAAACGACGCTTCTCGTGGACTTTATACGAAGCTAGGTTTCAGAAAAGCTTTTGAAAGTGTTCGTGGCACATTTGTGCCTTTAGTTGGCGAAAATCATTTGCAGAATAATTTGACGGCCTACAAACAGCGTCAAATTTCAAATGAAGAAAATTGCACAATAGAACCAGCTGAGCTAACTAATGGTATTGCATCATACAAGGATAATGATAATTGCTGAATTTCATGGACCGTAATACATCTCTTAAAAGACCTGTATAGGATTGACATAACCTACTTTGAATGCGTTTTAAAATGAATTATAATTCAAGCGGATTAATATTTAACATAATAGCAAAATCAAGCTGAAACTAACAACTCTAAACAACAAAGCCATCAGCAGCTAAAAAGCAACAACAGCAACAGCAGTTATAATATCCGCGATAACAGCAGCTACAGCGGAAGTAGTAGCCGCCTTAGCAGCGACAACAGCAGCCGACGCCGCCGCCGCAACAGCAGAAGCAGCAGTACCATGAACAAAATCAGATTCAGCAGCAGCAACAGCAACGTCAATAAAATGATTATATTAATGAGTTACTGCTGTTGATTTGCTGTCAGAAAGCCTACACCCTCTACAGCCTTTGCAGTCACAAATAATAGATAGATTTCTTAAATGAATTTCAAACTAATATATAATAACTTTG]

[+] EMBL BM647877             [CCGGACAAACTAGAGCGAATGGAATTGATTAAAGATGAAGACGTTCTGTTTGAATGGCATAGTCCACTATACATGAACTTTACACATGTAGGTATTATGTTTAAGATGGAAGAAATTTTCCGAGAAAAAGTAAATGGAAGACTAGAGGGTCACATTTATGGCGACATTTACGTACACGAATGTCCCGATGAGTTGAACTTAGTGCTAGAACCATTAGCAGCGAATGAAGTGATCATGAAACCGCTGTGCATCGACGACGTAAAGGATATACACGATTTATATCCGGCAGGTGATATCGAAAGTTTAGAGTTATTTGAAAAGCTAGTCATCCAGCTTCCAGGCTTCGGTGTATTTAATCAATCGGATAATGAACTAGCTGCATGGAGTTTGCAGTCATATTATGGTGGAATGTTCTCCATGCAAACAAAACCAAAATTTAGAAGAAAAGGATACGGTATTCAGCTAGCACAATCTCTGACTAAGTTGGTAATTCGTCGCGGATATATACCGTTTGTTGTCATAAGGCCAGAAAACGACGCTTCTCGTGGACTTTATACGAAGCTAGGTTTCAGAAAAGCTTTTGAAAGTGTTCGTGGCACATTTGTGCCTTTAGTTGGCGAAAATCATTTGCAGAATAATTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BX614086             [                                                                                                                                                                  GACATTTACGTACACGAATGTCCCGATGAGTTGAACTTAGTGCTAGAACCATTAGCAGCGAATGAAGTGATCATGAAACCGCTGTGCATCGACGACGTAAAGGATATACACGATTTATATCCGGCAGGTGATATCGAAAGTTTAGAGTTATTTGAAAAGCTAGTCATCCAGCTTCCAGGCTTCGGTGTATTTAATCAATCGGATAATGAACTAGCTGCATGGAGTTTGCAGTC  ATTATGGTGGAATGTTCTCCATGCAAACAAAACCAAAATTTAGAAGAAAAGGATACGGTATTCAGCTAGCACAATCTCTGACTAAGTTGATAATTCGTCGCGGATATATACCGTTTGTTGTCATAAGGCCAGAAAACGACGCTTCTCGTGGACTTTATACGAAGCTAGGTTTCAGAAAAGCTTTTGAAAGTGTTCGTGGCACATTTGTGCCTTTAGTTGGCGAAAATCATTTGCAGAATAATTTGACGGCCTAC  ACAGCGTCAAATTTCAAATGAAGAAAATTGCACAATAGAACCAGCTGAGCTAACTAATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BX614087             [                                                                                                                                                                             ACACGAATGTCCCGATGAGTTGAACTTAGTGCTAGAACCATTAGCAGCGAATGAAGTGATCATGAAACCGCTGTGCATCGACGACGTAAAGGATATACACGATTTATATCCGGCAGGTGATATCGAAAGTTTAGAGTTATTTGAAAAGCTAGTCATCCAGCTTCCAGGCTTCGGTGTATTTAATCAATCGGATAATGAACTAGCTGCATGGAGTTTGCAGTC  ATTATGGTGGAATGTTCTCCATGCAAACAAAACCAAAATTTAGAAGAAAAGGATACGGTATTCAGCTAGCACAATCTCTGACTAAGTTGGTAATTCGTCGCGGATATATACCGTTTGTTGTCATAAGGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BX614085             [                                                                                                                                                                                                                                  AAGTGATCATGAAACCGCTGTGCATCGACGACGTAAAGGATATACACGATTTATATCCGGCAGGTGATATCGAAAGTTTAGAGTTATTTGAAAAGCTAGTCATCCAGCTTCCAGGCTTCGGTGTATTTAATCAATCGGATAATGAACTAGCTGCATGGAGTTTGCAGTC  ATTATGGTGGAATGTTCTCCATGCAAACAAAACCAAAATTTAGAAGAAAAGGATACGGTATTCAGCTAGCACAATCTCTGACTAAGTTGGTAATTCGTCGCGGATATATACCGTTTGTTGTCATAAGGCCAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BX615517             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAGCTAGCACAATCTCTGACTAAGTTGGTAATTCGTCGCGGATATATACCGTTTGTTGTCATAAGGCCAGAAAACGACGCTTCTCGTGGACTTTATACGAAGCTAGGTTTCAGAAAAGCTTTTGAAAGTGTTCGTGGCACATTTGTGCCTTTAGTTGGCGAAAATCATTTGCAGAATAATTTGACGGCCTACAAACAGCGTCAAATTTCAAATGAAGAAAATTGCACAATAGAACCAGCTGAGCTAACTAATGGTATTGCATCATACAAGGATAATGATAATTGCTGAATTTCATGGACCGTAATACATCTCTTAAAAGACCTGTATAGGATTGACATAACCTACTTTGAATGCGTTTTAAAATGAATTATAATTCAAGCGGATTAATATTTAACATAATAGCAAAATCAAGCTGAAACTAACAACTCTAAACAACAAAGCCATCAGCAGCTAAAAAGCAACAACAGCAACAGCAGTTATAATATCCGCGATAACAGCAGCTACAGCGGAAGTAGTAGCCGCCTTAGCAGCGACAACAGCAGCCGACGCCGCCGCCGCAACAGCAGAAGCAGCAGTACCATGAACAAAATCAGATTCA                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BM594029             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ccgAAATCATTTGCAGAATAATTTGACGGCCTACAAACAGCGTCAAATTTCAAATGAAGAAAACTGCACAATAGAACCAGCTGAGCTAACTAATGGTATTGCATCATACAAGGATAATGATAATTGCTGAATTTCATGGACCGTATTACATCTCTTAAAAGACCTGTATAGGATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL BX611620             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GGTATTGCATCATACAAGGATAATGATAATTGCTGAATTTCATGGACCGTAATACATCTCTTAAAAGACCTGTATAGGATTGACATAACCTACTTTGAATGCGTTTTAAAATGAATTATAATTCAAGCGGATTAATATTTAACATAATAGCAAAATCAAGCTGAAACTAACAACTCTAAACAACAAAGCCATCAGC  CTAAAAAGCAACAACAGCAACAGCAGTTATAATATCCGCGATAACAGCAGCTACAGCGGAATTAGTAGCCGCCTTAGCAGCGACAACAGCAGCCGACGCCGCCGCCGCAACAGCAGAAGCAGCAGTACCATGAACAAAATCAGATTCAGCAGCAGCAACAGCAACGTCAATAAAATGATTATATTAATGAGTTACTGCTGTTGATTTGCTGTCAGAAAGCCTACACCCTCTACAGCCTTTGCAGTCACAAATAATAGATAGATTTCTTAAATGAATTTCAAACTAATATATAATAACTTTG]


>consensus_7416#0 CCGGACAAACTAGAGCGAATGGAATTGATTAAAGATGAAGACGTTCTGTTTGAATGGCAT AGTCCACTATACATGAACTTTACACATGTAGGTATTATGTTTAAGATGGAAGAAATTTTC CGAGAAAAAGTAAATGGAAGACTAGAGGGTCACATTTATGGCGACATTTACGTACACGAA TGTCCCGATGAGTTGAACTTAGTGCTAGAACCATTAGCAGCGAATGAAGTGATCATGAAA CCGCTGTGCATCGACGACGTAAAGGATATACACGATTTATATCCGGCAGGTGATATCGAA AGTTTAGAGTTATTTGAAAAGCTAGTCATCCAGCTTCCAGGCTTCGGTGTATTTAATCAA TCGGATAATGAACTAGCTGCATGGAGTTTGCAGTCATTATGGTGGAATGTTCTCCATGCA AACAAAACCAAAATTTAGAAGAAAAGGATACGGTATTCAGCTAGCACAATCTCTGACTAA GTTGGTAATTCGTCGCGGATATATACCGTTTGTTGTCATAAGGCCAGAAAACGACGCTTC TCGTGGACTTTATACGAAGCTAGGTTTCAGAAAAGCTTTTGAAAGTGTTCGTGGCACATT TGTGCCTTTAGTTGGCGAAAATCATTTGCAGAATAATTTGACGGCCTACAAACAGCGTCA AATTTCAAATGAAGAAAATTGCACAATAGAACCAGCTGAGCTAACTAATGGTATTGCATC ATACAAGGATAATGATAATTGCTGAATTTCATGGACCGTAATACATCTCTTAAAAGACCT GTATAGGATTGACATAACCTACTTTGAATGCGTTTTAAAATGAATTATAATTCAAGCGGA TTAATATTTAACATAATAGCAAAATCAAGCTGAAACTAACAACTCTAAACAACAAAGCCA TCAGCAGCTAAAAAGCAACAACAGCAACAGCAGTTATAATATCCGCGATAACAGCAGCTA CAGCGGAAGTAGTAGCCGCCTTAGCAGCGACAACAGCAGCCGACGCCGCCGCCGCAACAG CAGAAGCAGCAGTACCATGAACAAAATCAGATTCAGCAGCAGCAACAGCAACGTCAATAA AATGATTATATTAATGAGTTACTGCTGTTGATTTGCTGTCAGAAAGCCTACACCCTCTAC AGCCTTTGCAGTCACAAATAATAGATAGATTTCTTAAATGAATTTCAAACTAATATATAA TAACTTTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)