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Anopheles gambiae
cluster # 7430 cluster # 7430       Sequences # 7       consensus # 4


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7430#0 length = 1011 sequences # 4  
consensus_7430#1 length = 664 sequences # 1  
consensus_7430#2 length = 605 sequences # 1  
consensus_7430#3 length = 511 sequences # 1  

consensusID : consensus_7430#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1011
fasta sequence
                              [AGATCCCCGAGGGTTGACTAAAATAGGCTTGTTTTTCTCTGTATTTTCTAGTACCACTTTTAGCGGACGCATCATTTGCTCCTGATGAGAGTATGTTCAGTTCTTTCTTTGTATGTGTTGTAAAAAAAAAATCGGATTCTAAAATACGCTAAAAATGTAACGAAATTCAAATTATGTTAGGGAAGCAAAGCGGTTCG---TTG---TTCGGATAAAAGTTAAGTCTCCGCCACTGTACTAAATTGTACTAAAATATTTAAGAACTTTTACTTTTTAACAAACCGCGACAGGAAAAGGAAACTGATAAAGTAGTGACTTATGTTTTTAGGTTGTTTTTCTAACAGCGTTGCTTCCTTATAAGCGAAAAGAATTGGACGAAATTTAGAC-AAAAAAA--AATAAAAA-AGGAATTGGTCGACAAAAGTGACTCAAAAAAAGCGAACAAACACGACTAATCGATAAAGAAGATAGGAATAAAAGAAATGGTTTAATAAATAAAAGAATCGTAGGGAAAGAAGGACTTACCAAAATTG-AAAAGGTGATCCAATGCAACATACCAGAGGACGTCCTTCAGTCGTGCTCCTGTCAAGGTACGATGGTAATCTTACGATTTAAACAAAACTTCCTTGTACGCTTTCCCCTATCACCCCCACTGCAACGATGTGTTCGAAGGCCCTAGTTTCC--TTTTTTTTGTTGTTAAGTTTTGTTTTAAGTTGCAGAACCGATAGGCAAACATACGGGGGGACAGAAAAAGGTAGTAGCTGTAGTTAGTTAATGTTAGTAAAGCAAATCGATTGATCAGTGGTAGCAAATGCACTTTTGCACACCTAATAACTAACATAAGTGTTGCTATTGGAGGAGTGTTGCTATTGGACAAACACAAACCAACACATTGATACATGTTAAAGAGACAGACATATATATGGTGCCTTTCTTTTGTTTTGTTGTGCGTTATTTGTATCTTTTACTATTATTACTACTACCACTACTACTACTACGACAGCAAACCCCTTAACGTTA]

[+] EMBL AL931582             [AGATCCCCGAGGGTTGACTAAAATAGGCTTGTTTTTCTCTGTATTTTCTAGTACCACTTTTAGCGGACGCATCATTTGCTCCTGATGAGAGTATGTTCAGTTCTTTCTTTGTATGTGTTGTAAAAAAAAAATCGGATTCTAAAATACGCTAAAAATGTAACGAAATTCAAATTATGTTAGGGAAGCAAAGCGGTTCG   TTG   TTCGGATAAAAGTTAAGTCTCCGCCACTGTACTAAATTGTACTAAAATATTTAAGAACTTTTACTTTTTAACAAACCGCGACAGGAAAAGGAAACTGATAAAGTAGTGACTTATGTTTTTAGGTTGTTTTTCTAACAGCGTTGCTTCCTTATAAGCGAAAAGAATTGGACGAAATTTAGAC AAAAAAA  AATAAAAACAGGAATTGGTCGACAAAAGTGACTCAAAAAAAGCGAACAAACACGACTAATCGATAAAGAAGATAGGAATAAAAGAAATGGTTTAATAAATAAAAGAATCGTAGGGAAAGAAGGACTTACCAAAATTG AAAAGGTGATCCAATGCAACATACCAGAGGACGTCCTTCAGTCGTGCTCCTGTC AGGTACGATGGTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BX620940             [                                                                                                                                                                     TTCAAATTATGTTAGGGAAGCAAAGCGGTTCGTTTTTGTTTTTCGGATAAAAGTTAAGTCTCCGCCACTGTACTAAATTGTACTAAAATATTTAAGAACTTTTACTTTTTAACAAACCGCGACAGGAAAAGGAAACTGATAAAGTAGTGACTTATGTTTTTAGGTTGTTTTTCTAACAGCGTTGCTTCCTTATAAGCGAAAAGAATTGGACGAAATTTAGAC AAAAAAA  AATAAAAA AGGAATTGGTCGACAAAAGTGACTCAAAAAAAGCGAACAAACACGACTAATCGATAAAGAAGATAGGAATAAAAGAAATGGTTTAATAAATAAAAGAATCGTAGGGAAAGAAGGACTTACCAAAATTG AAAAGGTGATCCAATGCAACATACCAGAGGACGTCCTTCAGTCGTGCTCCTGTCAAGGTACGATGGTAATCTTACGATTTAAACAAAACTTCCTTGTACGCTTTCCCCTATCACCCCCACTGCAACGATGTGTTCGAAGGCCCTAGTTTCC  TTTTTTTTGTTGTTAAGTTTTGTTTTAAGTTGCAGAACCGATAGGCAAACATACGGGGGGACAGAAAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BX606756             [                                                                                                                                                                                                                         GTTAAGTCTCCGCCACTGTACTAAATTGTACTAAAATATTTAAGAACTTTTACTTTTTAACAAACCGCGGCAGGAAAAGGAAACTGATAAAGTAGTGACTTATGTTTTTAGGTTGTTTTTCTAACAGCGTTGCTTCCTTATAAGCGAAAAGAATTTGACGAAATTTAGAC AAAAAAAATAATAAAAA AGGAATTGGTCGACAAAAGTGACTC AAAAAAGCGAACAAACACGGCTAATCGATAAAGAAGATAGGAATAAAAGAAATGGTTTAATAAATAAAAGAATCGTTGGGAAAGAAGGACTTACCAAAATCGAAAAAGGTGATCCAATGCAACATACCAGAAGACGTTCTTCAGTCGTGCTCCTGTCAAGGTACGATGGTAATCTTACGATTTAAACAAAACTTCCTTGTACGCTTTCCCCTATCACCCCCACTGCAACGATGTGTTCGAAGGCCCTAGTTTCCTTTTTTTTTTGTTGTTAAGTTTT TTTTAAGTTGCAGAACCGATAGGCAAACATACGGGGG                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BX616918             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTCTAACAGCGTTGCTTCCTTATAAGCGAAAAGAATTGGACGAAATTTAGACAAAAAAAA  AATAAAAA AGGAATTGGTCGACAAAAGTGACTCAAAAAAAGCGAACAAACACGACTAATCGATAAAGAAGATAGGAATAAAAGAAATGGTTTAATAAATAAAAGAATCGTAGGGAAAGAAGGACTTACCAAAATTG AAAAGGTGATCCAATGCAACATACCAGAGGACGTCCTTCAGTCGTGCTCCTGTCAAGGTACGATGGTAATCTTACGATTTAAACAAAACTTCCTTGTACGCTTTCCCCTATCACCCCCACTGCAACGATGTGTTCGAAGGCCCTAGTTTCC  TTTTTTTTGTTGTTAAGTTTTGTTTTAAGTTGCAGAACCGATAGGCAAACATACGGGGGGACAGAAAAAGGTAGTAGCTGTAGTTAGTTAATGTTAGTAAAGCAAATCGATTGATCAGTGGTAGCAAATGCACTTTTGCACACCTAATAACTAACATAAGTGTTGCTATTGGAGGAGTGTTGCTATTGGACAAACACAAACCAACACATTGATACATGTTAAAGAGACAGACATATATATGGTGCCTTTCTTTTGTTTTGTTGTGCGTTATTTGTATCTTTTACTATTATTACTACTACCACTACTACTACTACGACAGCAAACCCCTTAACGTTA]


>consensus_7430#0 AGATCCCCGAGGGTTGACTAAAATAGGCTTGTTTTTCTCTGTATTTTCTAGTACCACTTT TAGCGGACGCATCATTTGCTCCTGATGAGAGTATGTTCAGTTCTTTCTTTGTATGTGTTG TAAAAAAAAAATCGGATTCTAAAATACGCTAAAAATGTAACGAAATTCAAATTATGTTAG GGAAGCAAAGCGGTTCGTTGTTCGGATAAAAGTTAAGTCTCCGCCACTGTACTAAATTGT ACTAAAATATTTAAGAACTTTTACTTTTTAACAAACCGCGACAGGAAAAGGAAACTGATA AAGTAGTGACTTATGTTTTTAGGTTGTTTTTCTAACAGCGTTGCTTCCTTATAAGCGAAA AGAATTGGACGAAATTTAGACAAAAAAAAATAAAAAAGGAATTGGTCGACAAAAGTGACT CAAAAAAAGCGAACAAACACGACTAATCGATAAAGAAGATAGGAATAAAAGAAATGGTTT AATAAATAAAAGAATCGTAGGGAAAGAAGGACTTACCAAAATTGAAAAGGTGATCCAATG CAACATACCAGAGGACGTCCTTCAGTCGTGCTCCTGTCAAGGTACGATGGTAATCTTACG ATTTAAACAAAACTTCCTTGTACGCTTTCCCCTATCACCCCCACTGCAACGATGTGTTCG AAGGCCCTAGTTTCCTTTTTTTTGTTGTTAAGTTTTGTTTTAAGTTGCAGAACCGATAGG CAAACATACGGGGGGACAGAAAAAGGTAGTAGCTGTAGTTAGTTAATGTTAGTAAAGCAA ATCGATTGATCAGTGGTAGCAAATGCACTTTTGCACACCTAATAACTAACATAAGTGTTG CTATTGGAGGAGTGTTGCTATTGGACAAACACAAACCAACACATTGATACATGTTAAAGA GACAGACATATATATGGTGCCTTTCTTTTGTTTTGTTGTGCGTTATTTGTATCTTTTACT ATTATTACTACTACCACTACTACTACTACGACAGCAAACCCCTTAACGTTA



consensusID : consensus_7430#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 664
fasta sequence
                              [TTAGTAAAGCAAATCGATTGATCAGTGGTAGCAAATGCACTTTTGCACACCTAATAACCAACATAAGTGTTGCTATTGGAGGATAACAAAATGATTTAAAAAAACTCCCCACAAACACAAACCAACACATTGATACATGTTAAAGAGACAGACATATATATATGGTGCCTTTCTTTTGTTTTGTTGTGCGTTATTTGTATCTTTTACTATTATTACTACTACCACTACTACGACAGCAAACACCTTAACGTTAGAATTATCGATTTCGTGGAAGTTTCTAAAAGTAGATTTAAAGTTGTGTATGTGTAAACTTTTCGTAAAGTAAAAAAAAAAAGGGAAGATGAAGCAAAACAATCGTTGGTTTAGTTGGATTTTTTAAATGTAAAATGTAACAATTGAGCGAGATATGTAAGAGAGGGAGGGTACCTGTGCTCGCAATCACGATTCATCATGTAAATGTTTATTTTTGTGTACGTTTATCCCGTTTCCCCTTAATTAATGTTCTTCCACGTTCTGTAACTGTCGCTCGTCGAACAATCCCAGAATTGAATTCGATGTAACCTCACCGAAACAAGTTAGTGAAAGTAAATAAATATATGTATGGAAAATGAATTTGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCACGCGTCCGCCCACGCGTCCGCGG]

[-] EMBL BM579851             [TTAGTAAAGCAAATCGATTGATCAGTGGTAGCAAATGCACTTTTGCACACCTAATAACCAACATAAGTGTTGCTATTGGAGGATAACAAAATGATTTAAAAAAACTCCCCACAAACACAAACCAACACATTGATACATGTTAAAGAGACAGACATATATATATGGTGCCTTTCTTTTGTTTTGTTGTGCGTTATTTGTATCTTTTACTATTATTACTACTACCACTACTACGACAGCAAACACCTTAACGTTAGAATTATCGATTTCGTGGAAGTTTCTAAAAGTAGATTTAAAGTTGTGTATGTGTAAACTTTTCGTAAAGTAAAAAAAAAAAGGGAAGATGAAGCAAAACAATCGTTGGTTTAGTTGGATTTTTTAAATGTAAAATGTAACAATTGAGCGAGATATGTAAGAGAGGGAGGGTACCTGTGCTCGCAATCACGATTCATCATGTAAATGTTTATTTTTGTGTACGTTTATCCCGTTTCCCCTTAATTAATGTTCTTCCACGTTCTGTAACTGTCGCTCGTCGAACAATCCCAGAATTGAATTCGATGTAACCTCACCGAAACAAGTTAGTGAAAGTAAATAAATATATGTATGGAAAATGAATTTGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCACGCGTCCGCCCACGCGTCCGCGG]


>consensus_7430#1 TTAGTAAAGCAAATCGATTGATCAGTGGTAGCAAATGCACTTTTGCACACCTAATAACCA ACATAAGTGTTGCTATTGGAGGATAACAAAATGATTTAAAAAAACTCCCCACAAACACAA ACCAACACATTGATACATGTTAAAGAGACAGACATATATATATGGTGCCTTTCTTTTGTT TTGTTGTGCGTTATTTGTATCTTTTACTATTATTACTACTACCACTACTACGACAGCAAA CACCTTAACGTTAGAATTATCGATTTCGTGGAAGTTTCTAAAAGTAGATTTAAAGTTGTG TATGTGTAAACTTTTCGTAAAGTAAAAAAAAAAAGGGAAGATGAAGCAAAACAATCGTTG GTTTAGTTGGATTTTTTAAATGTAAAATGTAACAATTGAGCGAGATATGTAAGAGAGGGA GGGTACCTGTGCTCGCAATCACGATTCATCATGTAAATGTTTATTTTTGTGTACGTTTAT CCCGTTTCCCCTTAATTAATGTTCTTCCACGTTCTGTAACTGTCGCTCGTCGAACAATCC CAGAATTGAATTCGATGTAACCTCACCGAAACAAGTTAGTGAAAGTAAATAAATATATGT ATGGAAAATGAATTTGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCACGCGTCCGCCCACGCGTCC GCGG



consensusID : consensus_7430#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 605
fasta sequence
                              [TCGCCCGAGGTTAATCGTAGGAAAGAAGGACTTACCAAAATTGAAAAGGTGATCCAATGCAACATACCAGAGGACGTCCTTCAGTCGTGCTCCTGTCAAGGTACGATGGTAATCTTACGATTTAAACAAAACTTCCTTGTACGCTTTCCCCTATCACCCCCACTGCAACGATGTGTTCGAAGGCCCTAGTTTCCTTTTTTTTGTTCGTTAAGTTTTGTTTTAAGTTGCAGAACCGATAGGCAAACATACGGGGGGACAGAAAAAGGTAGTAGCTGTAGTTAGTTAATGTTAGTAAAGCAAATCGATTGATCAGTGGTAGCAAATGCACTTTTGCACACCTAATAACTAACATAAGTGTTGCTATTGGAGGAGTGTTGCTATTGGACAAACACAAACCAACACATTGATACATGTTAAAGAGACAGNACACTATATATGGTGCCTTTCTTATCGTAAAGTAGTGCGCTCATTCGTATCTTCTTACTATTATTACTACTACCACTACTACTACTACGACAGCAAACCCCTTAACGTTAGAATTATCGATTTCGTGGAAGTTCTANAAGTNCATTTAAACGCTNGNGTCATGTCGTAAACTTTCNGNA]

[+] EMBL AL934711             [TCGCCCGAGGTTAATCGTAGGAAAGAAGGACTTACCAAAATTGAAAAGGTGATCCAATGCAACATACCAGAGGACGTCCTTCAGTCGTGCTCCTGTCAAGGTACGATGGTAATCTTACGATTTAAACAAAACTTCCTTGTACGCTTTCCCCTATCACCCCCACTGCAACGATGTGTTCGAAGGCCCTAGTTTCCTTTTTTTTGTTCGTTAAGTTTTGTTTTAAGTTGCAGAACCGATAGGCAAACATACGGGGGGACAGAAAAAGGTAGTAGCTGTAGTTAGTTAATGTTAGTAAAGCAAATCGATTGATCAGTGGTAGCAAATGCACTTTTGCACACCTAATAACTAACATAAGTGTTGCTATTGGAGGAGTGTTGCTATTGGACAAACACAAACCAACACATTGATACATGTTAAAGAGACAGNACACTATATATGGTGCCTTTCTTATCGTAAAGTAGTGCGCTCATTCGTATCTTCTTACTATTATTACTACTACCACTACTACTACTACGACAGCAAACCCCTTAACGTTAGAATTATCGATTTCGTGGAAGTTCTANAAGTNCATTTAAACGCTNGNGTCATGTCGTAAACTTTCNGNA]


>consensus_7430#2 TCGCCCGAGGTTAATCGTAGGAAAGAAGGACTTACCAAAATTGAAAAGGTGATCCAATGC AACATACCAGAGGACGTCCTTCAGTCGTGCTCCTGTCAAGGTACGATGGTAATCTTACGA TTTAAACAAAACTTCCTTGTACGCTTTCCCCTATCACCCCCACTGCAACGATGTGTTCGA AGGCCCTAGTTTCCTTTTTTTTGTTCGTTAAGTTTTGTTTTAAGTTGCAGAACCGATAGG CAAACATACGGGGGGACAGAAAAAGGTAGTAGCTGTAGTTAGTTAATGTTAGTAAAGCAA ATCGATTGATCAGTGGTAGCAAATGCACTTTTGCACACCTAATAACTAACATAAGTGTTG CTATTGGAGGAGTGTTGCTATTGGACAAACACAAACCAACACATTGATACATGTTAAAGA GACAGNACACTATATATGGTGCCTTTCTTATCGTAAAGTAGTGCGCTCATTCGTATCTTC TTACTATTATTACTACTACCACTACTACTACTACGACAGCAAACCCCTTAACGTTAGAAT TATCGATTTCGTGGAAGTTCTANAAGTNCATTTAAACGCTNGNGTCATGTCGTAAACTTT CNGNA



consensusID : consensus_7430#3
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 511
fasta sequence
                              [CCGCTAATAACTAACATAAGTGTTGCTATTGGACAAACACAAACCAACACATTGATACATGTTAAAGAGACAGACATATATATGGTGCCTTTCTTTTGTTTTGTTGTGCGTTATTTGTATCTTTTACTATTATTACTACTACCACTACTACTACTACGACAGCAAACCCCTTAACGTTAGGATTATCGATTTCGTGGAAGTTTCTTAAAATAGATTTAAAGTTGTGTATGTGTAAACTTTTTGTAAAGTAAAAAAAAGGGAAGATGAAGCAAAACAATCGTTGGTTTAGTTGGATTTTTTAAAAGTGAAATGTAACAATGGAGCGAGATATGTAAGAGAGGGAGGGTACCTGTGCTCGCACTCACGATTCATTATGTAAATGTTTATTTTTGTGTATGTTTATCCCGTTTCCCCTTAATTAATGTTCTTCCACGTTCTGTAACTGTCGCTCGTCGAACAATCCCAGAATTGTATTCGATGTAACCTCACCGAAACAAGTTAGTGAAAGTAA]

[+] EMBL BM579585             [CCGCTAATAACTAACATAAGTGTTGCTATTGGACAAACACAAACCAACACATTGATACATGTTAAAGAGACAGACATATATATGGTGCCTTTCTTTTGTTTTGTTGTGCGTTATTTGTATCTTTTACTATTATTACTACTACCACTACTACTACTACGACAGCAAACCCCTTAACGTTAGGATTATCGATTTCGTGGAAGTTTCTTAAAATAGATTTAAAGTTGTGTATGTGTAAACTTTTTGTAAAGTAAAAAAAAGGGAAGATGAAGCAAAACAATCGTTGGTTTAGTTGGATTTTTTAAAAGTGAAATGTAACAATGGAGCGAGATATGTAAGAGAGGGAGGGTACCTGTGCTCGCACTCACGATTCATTATGTAAATGTTTATTTTTGTGTATGTTTATCCCGTTTCCCCTTAATTAATGTTCTTCCACGTTCTGTAACTGTCGCTCGTCGAACAATCCCAGAATTGTATTCGATGTAACCTCACCGAAACAAGTTAGTGAAAGTAA]


>consensus_7430#3 CCGCTAATAACTAACATAAGTGTTGCTATTGGACAAACACAAACCAACACATTGATACAT GTTAAAGAGACAGACATATATATGGTGCCTTTCTTTTGTTTTGTTGTGCGTTATTTGTAT CTTTTACTATTATTACTACTACCACTACTACTACTACGACAGCAAACCCCTTAACGTTAG GATTATCGATTTCGTGGAAGTTTCTTAAAATAGATTTAAAGTTGTGTATGTGTAAACTTT TTGTAAAGTAAAAAAAAGGGAAGATGAAGCAAAACAATCGTTGGTTTAGTTGGATTTTTT AAAAGTGAAATGTAACAATGGAGCGAGATATGTAAGAGAGGGAGGGTACCTGTGCTCGCA CTCACGATTCATTATGTAAATGTTTATTTTTGTGTATGTTTATCCCGTTTCCCCTTAATT AATGTTCTTCCACGTTCTGTAACTGTCGCTCGTCGAACAATCCCAGAATTGTATTCGATG TAACCTCACCGAAACAAGTTAGTGAAAGTAA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_7430#1      ------------------------------------------------------------
consensus_7430#3      ------------------------------------------------------------
consensus_7430#0      AGATCCCCGAGGGTTGACTAAAATAGGCTTGTTTTTCTCTGTATTTTCTAGTACCACTTT 60
consensus_7430#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7430#1      ------------------------------------------------------------
consensus_7430#3      ------------------------------------------------------------
consensus_7430#0      TAGCGGACGCATCATTTGCTCCTGATGAGAGTATGTTCAGTTCTTTCTTTGTATGTGTTG 120
consensus_7430#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7430#1      ------------------------------------------------------------
consensus_7430#3      ------------------------------------------------------------
consensus_7430#0      TAAAAAAAAAATCGGATTCTAAAATACGCTAAAAATGTAACGAAATTCAAATTATGTTAG 180
consensus_7430#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7430#1      ------------------------------------------------------------
consensus_7430#3      ------------------------------------------------------------
consensus_7430#0      GGAAGCAAAGCGGTTCGTTGTTCGGATAAAAGTTAAGTCTCCGCCACTGTACTAAATTGT 240
consensus_7430#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7430#1      ------------------------------------------------------------
consensus_7430#3      ------------------------------------------------------------
consensus_7430#0      ACTAAAATATTTAAGAACTTTTACTTTTTAACAAACCGCGACAGGAAAAGGAAACTGATA 300
consensus_7430#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7430#1      ------------------------------------------------------------
consensus_7430#3      ------------------------------------------------------------
consensus_7430#0      AAGTAGTGACTTATGTTTTTAGGTTGTTTTTCTAACAGCGTTGCTTCCTTATAAGCGAAA 360
consensus_7430#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7430#1      ------------------------------------------------------------
consensus_7430#3      ------------------------------------------------------------
consensus_7430#0      AGAATTGGACGAAATTTAGACAAAAAAAAATAAAAAAGGAATTGGTCGACAAAAGTGACT 420
consensus_7430#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7430#1      -----TTAGTAAAGCAAATCGATTGATCAGTGGTAGCAAATGCACTTTTGCACACCTAAT 55
consensus_7430#3      ----------------------------------------------------CCGCTAAT 8
consensus_7430#0      CAAAAAAAGCGAACAAACACGACTAATCGATAAAGAAGATAGGAATAAAAGAAATGGTTT 480
consensus_7430#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7430#1      AACCAACATAAGTGTTGCTATTGGAGGATAACAAAATGATTTAAAAAAACTCCCCACAAA 115
consensus_7430#3      AACTAACATAAGTGTTGCTATTGGA-------------------------------CAAA 37
consensus_7430#0      AATAAATAAAAG---AATCGTAGGG----AAAGAAGGACTTACCAAAATTGAAAAGGTGA 533
consensus_7430#2      --TCGCCCGAGGT-TAATCGTAGG-----AAAGAAGGACTTACCAAAATTGAAAAGGTGA 52
                               * *        * **                                   *

consensus_7430#1      CACAAACCAACACATTGATACATGTTAAAGAGACAGACATATATATATGGTGCCTTTCTT 175
consensus_7430#3      CACAAACCAACACATTGATACATGTTAAAGAGACAGACATATATAT--GGTGCCTTTCTT 95
consensus_7430#0      TCCAATGCAACATACCAGAGGACGTCCTTCAGTCGTGCTCCTGTCAA-GGTACGATGGTA 592
consensus_7430#2      TCCAATGCAACATACCAGAGGACGTCCTTCAGTCGTGCTCCTGTCAA-GGTACGATGGTA 111
                        ***  ***** *       * **     ** *   *   * *    *** *  *  * 

consensus_7430#1      TTGTTTTGTTGTGCGTTATTTGTATCTTTTACTATTATTACTACTACCACTACTAC---- 231
consensus_7430#3      TTGTTTTGTTGTGCGTTATTTGTATCTTTTACTATTATTACTACTACCACTACTACTACT 155
consensus_7430#0      ATCTTACGATTTAAACAAAACTT-CCTTGTACGCTTTCCCCTATCACCCCCACTGCAACG 651
consensus_7430#2      ATCTTACGATTTAAACAAAACTT-CCTTGTACGCTTTCCCCTATCACCCCCACTGCAACG 170
                       * **  * * *     *    *  *** ***  **    ***  *** * *** *    

consensus_7430#1      --GACAGCAAACACCTTAACGTTAGAATTATCGATTTCGTGGAAGTTTCTAAAAGTAGAT 289
consensus_7430#3      ACGACAGCAAACCCCTTAACGTTAGGATTATCGATTTCGTGGAAGTTTCTTAAAATAGAT 215
consensus_7430#0      ATGTGTTCGAAGGCCCTAGTTTCCTTTTTTTTG--TT-GTTAAGTTTTGTTTTA--AGTT 706
consensus_7430#2      ATGTGTTCGAAGGCCCTAGTTTCCTTTTTTTTG--TTCGTTAAGTTTTGTTTTA--AGTT 226
                        *    * **  ** **   *     ** * *  ** **  *  *** *   *  ** *

consensus_7430#1      TTAAAGTTGTGTATGTGTAAACTTTTCGTAAAGTAAAAAAAAAAAGGGAAGATGAAGCAA 349
consensus_7430#3      TTAAAGTTGTGTATGTGTAAACTTTTTGTAAAGTAAAAAAAA---GGGAAGATGAAGCAA 272
consensus_7430#0      GCAGAACCG---ATAGGCAAACATACGGGGGGACAGAAAAAGG--TAGTAGCTGTAGTTA 761
consensus_7430#2      GCAGAACCG---ATAGGCAAACATACGGGGGGACAGAAAAAGG--TAGTAGCTGTAGTTA 281
                        * *   *   **  * **** *   *      * *****      * ** ** **  *

consensus_7430#1      AACAATCGTTGGTTTAGT---TGGATTTTTTAAATGTA--AAATGTAACAATTGA-GCGA 403
consensus_7430#3      AACAATCGTTGGTTTAGT---TGGATTTTTTAAAAGTG--AAATGTAACAATGGA-GCGA 326
consensus_7430#0      GTTAAT-GTTAGTAAAGCAAATCGATTGATCAGTGGTAGCAAATGCACTTTTGCACACCT 820
consensus_7430#2      GTTAAT-GTTAGTAAAGCAAATCGATTGATCAGTGGTAGCAAATGCACTTTTGCACACCT 340
                         *** *** **  **    * ****  * *   **   ***** *    *  *  *  

consensus_7430#1      GATATGTAAGAGAGGGAGGGTACCTGTGCTCGCAATCACGATTCATCA--TGTAAATGTT 461
consensus_7430#3      GATATGTAAGAGAGGGAGGGTACCTGTGCTCGCACTCACGATTCATTA--TGTAAATGTT 384
consensus_7430#0      AATAACTAACATAAGTGTTGCTATTGGAGGAGTG-TTGCTATTGGACAAACACAAACCAA 879
consensus_7430#2      AATAACTAACATAAGTGTTGCTATTGGAGGAGTG-TTGCTATTGGACAAACACAAACCAA 399
                       ***  *** * * *    *    **     *   *  * ***    *     ***    

consensus_7430#1      TATTTTTGTGTACGTTTATCCCGTTTCCCCTTAATTAATGTTCTTCCACGTTCTGTAACT 521
consensus_7430#3      TATTTTTGTGTATGTTTATCCCGTTTCCCCTTAATTAATGTTCTTCCACGTTCTGTAACT 444
consensus_7430#0      CACATTGATACATGTTAAAGAGACAGA-CA-TATATATGGTGCCTTT-CTT-TTGTTT-T 934
consensus_7430#2      CACATTGATACATGTTAAAGAGACAGNACACTATATATGGTGCCTTT-CTTATCGTAA-A 457
                       *  **  *  * *** *          *  **  **  ** * *   * *   **    

consensus_7430#1      GTCGCTCGTCGAACAATCCCAGAATTGAATTCGATGTAACCTCACCGAAACAAGTTAGTG 581
consensus_7430#3      GTCGCTCGTCGAACAATCCCAGAATTGTATTCGATGTAACCTCACCGAAACAAGTTAGTG 504
consensus_7430#0      GTTGTGCGTT-ATTTGTATCTT-TTACTATTATTACTACTACCACTACTACTACT--ACG 990
consensus_7430#2      GTAGTGCGCTCATTCGTATCTTCTTACTATTATTACTACTACCACTACTACTACT--ACG 515
                      ** *  **   *    *  *    *   ***     **    ***    ** * *    *

consensus_7430#1      AAAGTAAATAAATATATGTATGGAAAATGAATTTGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCA 641
consensus_7430#3      AAAGTAA----------------------------------------------------- 511
consensus_7430#0      ACAGCAAACCCCTTAACGTTA--------------------------------------- 1011
consensus_7430#2      ACAGCAAACCCCTTAACGTTAGAATTATCGATTTCGTGGAAGTTCTANAAGTNCATTTAA 575
                      * ** **                                                     

consensus_7430#1      CGCGTCCGCCCACGCGTCCGCGG------- 664
consensus_7430#3      ------------------------------
consensus_7430#0      ------------------------------
consensus_7430#2      ACGCTNGNGTCATGTCGTAAACTTTCNGNA 605
                                                    




Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)