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Anopheles gambiae
cluster # 8161 cluster # 8161       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8161#0 length = 1459 sequences # 9  

consensusID : consensus_8161#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1459
fasta sequence
                              [CCGGGATTTGCTGCGAGAGGATGCCGTCGACGAAGTCGTGGTGGGTGATGATTTGATCAATAGCGCTTCCGGTACTTCCGCTGCTGGTGGTGTTGATTCGAGCGATACACTTAAGCGGGCCAAACCGAAGCAAGCTTTCTTCAGAGCGAACAGCGATCTGGAGTTTCTCGAGAACAACTGATCCGTGTGTGCGTGTTGGTTTGTGCTCTTTGTGATGCAAAAAAAAACGACCGTTACACCGGCACCGAGGGGGACGATCGACGATTTCGCTTCCCGCCAGAAGTGCAATACGCTTCGAGTGCACAAAGGAATGCGATGCGGAGTGGG-GA-TATCCTTCCCCCTTCGTGCGG---TGTAACGATGAATCG-AAAACGCGATAAAGAGAGGAGGTATAGAGTTAAGAAACATTAAATTTC-TTTTTTTTTGTTATTGAATTAAAATATGCACTCATAGAGGTTTAAATTGTAAGTTTGATGATTTATACTCA-TCATTCATTCATTCATTCATTTATGATTTTGTTGTTGCTGTTGTTTTAGTGAAGCGTGTTACAGGCTCAAACGAATTTAAACTAACATAAATACGCGCCGCATCATCATCATC----TCCCGGAGCTCATCGCACGATTTATTTATGCGTGATATTGTCACGTTTACGTTATTTCATCAAATCTTCACTAAACTCTGCACTGATTTTATTCAGCTAGTCGAACACACTTACAATAGTCGTAATTCCGGGGGATGTGTAGGGGAAGAAACTAAGCAAAAAAAACGAAAATATTAGCAAAGAAGGGACCGAGTGAGAGCCGCATTGAACTGGAATTACAACCAAATGAACTCTCAATCTCTCATCAAAGAACAATTAGTAGACCCATTTTATGCTAACGTATGCAAATTATTGTTTTTCACGAATATAACGCCTTAAACTATTAAACGAATGATTTGAAAAATGTGCCTTCCATTAAAAAAAAAACTTCCATCCAGAGCGCTACCTCTATCAGTGGGCGAAGAAGTTAGAATGTAGCCCCGTGTTGTAGAAAACAATCTAAAACACTGAAGCAAAGTAAGTGCCTTACATTACATTGTGATTGTTGTTTCGTTATAAAGGAAAATCTCCAGTGAGTGCAGTCCTCGCAAAAATGAATCCAAAAACAGAAGCTGAAAATGCAAAGGGCTCTCCATTATCTGGCGTGCAGCTATAATAACATTGTACAAAATCCCTTTCGTTATGCGACATGAGAATAGTGTGAGTGAGGCACAACAATCAAACAAATATGTTTGGTACAACGACCAA-CCGTCGCGAAATTCAAACAGC-GTTAAACGCACCAACAAAATGAAGGAAACAAAACTAAAAAGGGTTTATCAATCCCAGATTGTTACTATTTATAACTATTACTCAGCACTGTTGTTGTTGTTACTAAAACACATCCCGAAGAACTTAAATAAAGGGCTATCGTACGCGAATGTGT]

[+] EMBL BM603417             [CCGGGATTTGCTGCGAGAGGATGCCGTCGACGAAGTCGTGGTGGGTGATGATTTGATCAATAGCGCTTCCGGTACTTCCGCTGCTGGTGGTGTTGATTCGAGCGATACACTTAAGCGGGCCAAACCGAAGCAAGCTTTCTTCAGAGCGAACAGCGATCTGGAGTTTCTCGAGAACAACTGATCCGTGTGTGCGTGTTGGTTTGTGCTCTTTGTGATGCAAAAAAAAACGACCGTTACACCGGCACCGAGGGGGACGATCGACGATTTCGCTTCCCGCCAGAAGTGCAATACGCTTCGAGTGCACAAAGGAATGCGATGCGGAGTGGGAGA TATCCTTCCCCCTTCGTGCGG   TGTAACGATGAATCG AAAACGCGATAAAGAGAGGAGGTATAGAGTTAAGAAACATTAAATTTCTTTTTTTTTTGTTATTGAATTAAAATATGCACTCATAGAGGTTTAAATTGTAAGTTTGATGATTTATAC    TCATTCATTCATTCATTCATTTATGATTTTGTTGTTGCTGTTCTTTTAGTGAAGCGTGTTACCGGCTCAAACGAATTTAAACTAACATAAATACGCGCCGCATCATCATCATCATCATCCCGGAGCTCATCGCACGATTTATTTATGCGTGGTATTGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BM625368             [                                                                 ccgCCGGTACTTCCGCTGCTGGTGGTGTTGATTCGAGCGATACACTTAAGCGGGCCAAACCGAAGCAAGCTTTCTTCAGAGCGAACAGCGATCTGGAGTTTCTCGAGAACAACTGATCCGTGTGTGCGTGTTGGTTTGTGCTCTTTGTGATGCAAAAAAAAACGACCGTTACACCGGCACCGAGGGGGACGATCGACGATTTCGCTTCCCGCCAGAAGTGCAATACGCTTCGAGTGCACAAAGGAATGCGATGCGGAGTGGGAGA TATCCTTCCCCCTTCGTGCGG   TGTAACGATGAATCG AAAACGCGATAAAGAGAGGAGGTATAGAGTTAAGAAACATTAAATTTCTTTTTTTTTTGTTATTGAATTAAAATATGCACTCATAGAGGTTTAAATTGTAAGTTTGATGATTTATAC    TCATTCATTCATTCATTCATTTATGATTTTGTTGTTGCTGTTGTTTTAGTGAAGCGTGTTACAGGCTCAAACGAATTTAAACTAACATAAATACGCGCCGCATCATCATCATCATCATCCCGGAGCTCATCGCACGATTTATTTATGCGTGGTATTGTCACGTTTACGTTACTTCATCATATCTTCtgcactgat                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BM644776             [                                                                                                                                                                                                                                  ACGACCGTTACACCGGCACCGAGGGGGACGATCGACGATTTCTCTTCCCGCCAGAAGTGCAATACGCTTCGAGGGCACAAAGGAATGCGATGCGGTGTGGG GAGTATCCTTCCCCCTTCGTGCGGTGTTGTAACGATGAATCGAAAAACGCGATAAAGAGAGGAGGTAAAGAGTTAAGAAACATTAAATTTC TTTTTTTTTGTTATTGAATTAAAATATGCACTCATAGAGGTTTAAATTGTAAGTTTGATGATTTATACTCA  C  TCATTCATTCATTCATTTATGATTTTGTTGTTGCTGTTGTTTTAGTGAAGCGTGTTACAGGCTCAAACGAATTTAAACTAACATAAATACGCGCCGCATCATCATCATCATCATCCCGGAGCTCATCGCACGATTTATTTATGCGTGATATTGTCACGTTTACGTTATTTCATCATATCTTCACTAAACTCTGCACTGATTTTATCCAGCTAGTCGAACACACTTACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
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[+] EMBL CNS09G5H             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GAGATTTAAATTGTAAGTTTGATGATTTATACTCATTCATTCATTCATTCATTCATTTATGATTTTGTTGTTGCTGTTGTTTTAGTGAAGCGTGTAACAGGCTCAAACGAATTTAAACTAACATAAATACGCGCCGCATCGTCATCATC    TTCGGAATTTCATTGCACGATTTATTTATGCGTGATATTGTCACGTTTACGTTATTTCATCAAATCTTCACTAAACTCTGCACTGATTTTATTCAGCTAGTCGAACACACTTACAATAGTCGTAATTCCGGGGGATGTGTAGGGGAAGAAACTAAGCAAAAAAAACGAAAATATTAGCAAAGAAGGGACCGAGTTAGAGCCGCATTGAACTGGAATTACAACCAAATGAACTCTCAATCTCTCATCAAAGAACAATTAGTAGACCCATTTTATGCTAACGTATGCAAATTATTGTTTTTCACGAATATAACGCCTTAAACTATTAAACGAATGATTTGAAAAATGTGCCTTCCATTAAAAAAAAAACTTCCATCCAGAGCGCTACCTCTATCAGTGGGCGAAGAAGTTAGAATGTAGCCCCGTGTTGTAGAAAACAATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CNS0946X             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTGATGATTTATACTCATTCATTCATTCATTCATTCATTTATGATTTTGTTGTTGCTGTTGTTTTAGTGAAGCGTGTAACAGGCTCAAACGAATTTAAACTAACATAAATACGCGCCGCATCGTCATCATC    TTCGGAATTTCATTGCACGATTTATTTATGCGTGATATTGTCACGTTTACGTTATTTCATCAAATCTTCACTAAACTCTGCACTGATTTTATTCAGCTAGTCGAACACACTTACAATAGTCGTAATTCCGGGGGATGTGTAGGGGAAGAAACTAAGCAAAAAAAACGAAAATATTAGCAAAGAAGGGACCGAGTGAGAGCCGCATTGAACTGGAATTACAACCAAATGAACTCTCAATCTCTCATCAAAGAACAATTAGTAGACCCATTTTATGCTAACGTATGCAAATTATTGTTTTTCACGAATATAACGCCTTAAACTATTAAACGAATGATTTGAAAAATGTGCCTTCCATTAAAAAAAAAACTTCCATCCAGTTTTCTACCTCTATCAGTGGGCGAAGAAGTTAGAATGTAGCCCCGTGTTGTAGAAAACAATCTAAAACACTGAAGCAAAGTAAGTGCCTTACATTACATTGTGATTGTTGTTTCGTTATAAAGGAAAATCTCCAGTGAGTGCAGTCCTCGCAAAAATGAATCCAAAAACAGAAGCTGAAAATGCAAAGGGCTCTCCATTATCTGGCGTGCAGCTATAATAACATTGTACAAAATCCCTTTCGTTATGCGACATGAGAATAGTGTGAGTGAGGCACAACAATCAAAAAAATATGTTTGGTACAACGACCAA CCGTCGCGAAATTCAAACAGC GTTAAACGCACCAAC                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CNS092NG             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CGCATTGGACTGGAATTACAACCAAATGGATTTTTAATCTTTCATCAAAGAACAATTAGTAGACCCATTTTATGCTAACGTATGCAAATTATTGTTTTTCACGAATATAACGCCTTAAACTATTAAACGAATGATTTGAAAAATGTGCCTTCCATTAAAAAAAAAACTTCCATCCAGAGGGCTACCTCTATCAGTGGGCGAAGAAGTTAGAATGTAGCCCCGTGTTGTAGAAAACAATCTAAAAAACTGAAGCAAAGTAAGTGCCTTACATTACATTGTGATTGTTGTTTCGTTATAAAGGAAAATCTCCAGTGAGTGCAGTCCTCGCAAAAATGAATCCAAAAACAGAAGCTGAAAATGCAAAGGGGTCTCCATTATCTGGCGTGCAGCTATAATAACATTGTACAAAATCCCTTTCGTTATGCGACATGAGAATAGTGTGAGTGAGGGACAACAATCAAACAAATATGTTTGGTACAACGACCAA CCGTCGCGAAATTCAAACAGCGGTTAAACGCACCAACAAAATGAAGGAAACAAAACTAAAAAGGGTTTATCAATCCCAGATTGTTACTATTTATAACTATTACTCAGCACTGTTGTTGTTGTTACTAAAACACATCCCGAAGAACTTAAATAAAGGGCTATCGTACGCGAATGTGT]
[-] EMBL CNS0946Y             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GCTAACGTATGCAAATTTTTGTTTTTCCCGAATATAACGCCTTAAACTATTAAAAGAATGATTTGAAAAATGTGCCTTCCATTAAAAAAAAAACTTCCATCCAGAGCGCTACCTCTATCAGTGGGCGAAGAAGTTAGAATGTAGCCCCGTGTTGTAGAAAACAATCTAAAACACTGAAGCAAAGTAAGTGCCTTACATTACATTGTGATTGTTGTTTCGTTATAAAGGAAAATCTCCAGTGAGTGCAGTCCTCGCAAAAATGAATCCAAAAACAGAAGCTGAAAATGCAAAGGGCTCTCCATTTTCTGGCGTGCAGCTATAATAACATTGTAAAAAATCCCTTTCGTTATGCGACATGAGAATAGTGTGAGTGAGGCACAAAAATCAAACAAATATGTT                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CNS09G5I             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCCATCCAGAGCGCTACCTCTATCAGTGGGCGAAGAAGTTAGAATGTAGCCCCGTGTTGTAGAAAACAATCTAAAAAACTGAAGCAAAGTAAGTGCCTTACATTACATTGTGATTGTTGTTTCGTTATAAAGGAAAATCTCCAGTGAGTGCAGTCCTCGCAAAAATGAATCCAAAAACAGAAGCTGAAAATGCAAAGGGGTCTCCATTTTCTGGCGTGCAGCTATAATAACATTGTACAAAATCCCTTTCGTTATGCGACATGAGAATAGTGTGAGTGAGGGACAACAATCAAACAAATATGTTTGGTACAACGACCAACCCGTCGCGAAATTCAAACAGC GTTAAACGCACCAACAAAATGAAGGAAACAAAACTAAAAAGGGTTTATCAATCCCAGATTGTTACTATTTATAACTATTACTCAGGACTGTTGTTGTTGTTACTAAAACACATCCCGAAGAACTTAAATAAAGCGCTATCGTACGCGAATGTGT]


>consensus_8161#0 CCGGGATTTGCTGCGAGAGGATGCCGTCGACGAAGTCGTGGTGGGTGATGATTTGATCAA TAGCGCTTCCGGTACTTCCGCTGCTGGTGGTGTTGATTCGAGCGATACACTTAAGCGGGC CAAACCGAAGCAAGCTTTCTTCAGAGCGAACAGCGATCTGGAGTTTCTCGAGAACAACTG ATCCGTGTGTGCGTGTTGGTTTGTGCTCTTTGTGATGCAAAAAAAAACGACCGTTACACC GGCACCGAGGGGGACGATCGACGATTTCGCTTCCCGCCAGAAGTGCAATACGCTTCGAGT GCACAAAGGAATGCGATGCGGAGTGGGGATATCCTTCCCCCTTCGTGCGGTGTAACGATG AATCGAAAACGCGATAAAGAGAGGAGGTATAGAGTTAAGAAACATTAAATTTCTTTTTTT TTGTTATTGAATTAAAATATGCACTCATAGAGGTTTAAATTGTAAGTTTGATGATTTATA CTCATCATTCATTCATTCATTCATTTATGATTTTGTTGTTGCTGTTGTTTTAGTGAAGCG TGTTACAGGCTCAAACGAATTTAAACTAACATAAATACGCGCCGCATCATCATCATCTCC CGGAGCTCATCGCACGATTTATTTATGCGTGATATTGTCACGTTTACGTTATTTCATCAA ATCTTCACTAAACTCTGCACTGATTTTATTCAGCTAGTCGAACACACTTACAATAGTCGT AATTCCGGGGGATGTGTAGGGGAAGAAACTAAGCAAAAAAAACGAAAATATTAGCAAAGA AGGGACCGAGTGAGAGCCGCATTGAACTGGAATTACAACCAAATGAACTCTCAATCTCTC ATCAAAGAACAATTAGTAGACCCATTTTATGCTAACGTATGCAAATTATTGTTTTTCACG AATATAACGCCTTAAACTATTAAACGAATGATTTGAAAAATGTGCCTTCCATTAAAAAAA AAACTTCCATCCAGAGCGCTACCTCTATCAGTGGGCGAAGAAGTTAGAATGTAGCCCCGT GTTGTAGAAAACAATCTAAAACACTGAAGCAAAGTAAGTGCCTTACATTACATTGTGATT GTTGTTTCGTTATAAAGGAAAATCTCCAGTGAGTGCAGTCCTCGCAAAAATGAATCCAAA AACAGAAGCTGAAAATGCAAAGGGCTCTCCATTATCTGGCGTGCAGCTATAATAACATTG TACAAAATCCCTTTCGTTATGCGACATGAGAATAGTGTGAGTGAGGCACAACAATCAAAC AAATATGTTTGGTACAACGACCAACCGTCGCGAAATTCAAACAGCGTTAAACGCACCAAC AAAATGAAGGAAACAAAACTAAAAAGGGTTTATCAATCCCAGATTGTTACTATTTATAAC TATTACTCAGCACTGTTGTTGTTGTTACTAAAACACATCCCGAAGAACTTAAATAAAGGG CTATCGTACGCGAATGTGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)