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Anopheles gambiae
cluster # 8721 cluster # 8721       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8721#0 length = 1670 sequences # 11  

consensusID : consensus_8721#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 1670
fasta sequence
                              [CTGCAGGGGACAAACTATCCTGATTTAATGTGAGTAATCGCGGTCCAAACGGTTATTTCTCAACCGATGTTATGAGAAGGTAGTTAGTTTTGCTCCGATGCGAGTTACGCCGCACTAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGTTACGTATTAGTAGCTTTCTTTTTCAAACTGCCAGACAGATACACACAC--ACACAG--ACACAGATAT--ACACACACACACAAACGCGCTCACAGTGGATGTTGCGCTGGTGGATGTGTGTTTTATTTTCTGCCCTGTGCGCTCTCGAAGCAAGGTCTTCGAAAGCAGACTTGCAACATGGCGCTGCATGCGGCAAGTTAAAATTATAATGGTTATTC-TTTTTTTTTGCCTCAAATCCCCCTTTTCATGCCA-TTTTTTTTAGCTGAATGGCTGAATC---CTGATGTTCCTACAAACACAAAGCAAGAGAAAAACAAAAACAACCCAATAACGAAACCAGTAGAGGAATACTAGTATTTCTGCCCCGATATTAAACTGCGCGCGAACCTATCGAAGTAGATACGCGGAAGGCCTCTACGCGAAACCGCCCTGTAGGTGTAAAGTTCATTGTATTCGCACTTT-GATGGTGTGATCCGACAACAGGAGACAAGCAGGAGAAACACACGAAGTGTGGCTGCGTAGTAAAACGATAAAAAGTACGAAAAAGAGTAGACAGCAGATAC--AAAAAAACTACTCAGGCATCTCTGCTTGGCTGGTTACACG-CCCCGAGGCTTGTATTTTTAGGCAGTACAAGCCGAGATGGGGGAAGGCTTGGCGTCTCTGCACCGACACCCTATCCAAATTAGAACTCCCATACATCCGTCGTACACCACACGGCTGGTACATAATGATAACTGCACCGACGTTTATTATTATTGTG-TTTTTTTTGTTTGTT-GTGGAGCCATAGTTGTACATGGATTTGT-GTGTGGGTGTTCAAGTGTTAAGCTACCGGCTTGCGTTATGGGTAGCGTAAATGGTAACGTGTCTGCTTTGCAAACAACAAGCTGCACGTGTACCGGTTGTGCACATGTGTTATTACGAAGTGGGTGGAATAACACTTAAGTGAAAGTATAAAGCGTATATACTTACCGTGCTTTAGATGTAGTGCAGGACTGTAAAGTGGAAAATGATTGAATTTGGTTTTGTGTGTCTGTGTTTAGGGTGGCCGTTTCAGTGGTGTGGTTCCCCCGCCCCGCACGATTTGTAGTCAGCCGTGCAAGAATAACACAAAACACACGATATCTGTGCGCTAAAGAAGAAAAAAAAACGCAAATGGGGGTCTTTATTTAAACACGCTATAATCAGGTTTGTTAGTTTTTGTCAGGATGAATTTGTTGATTTCCGTACAAAATAATACTGTGACCGTGCTCTGTAACTCCGTAACCAGAGGTGTACTAAGAATGCAACTATAGAGGAATT-TTCAAAATTTGCGAATGAGGCGCGGTCGGTTTCTCACGTGTTTGATAAGTTTTGTACGCCACTCATTTGTTCTCACACCGTTGTGCCCTGATCCTCCCTATGCTTATTATGCTTTACATCTACTAATTTGTGTTAATTTTTGCGCTCACACTGATGCGCGTGCCTGACACTGATAGTTGTGTGTTTTCTGCTATTGCTCTGTAATTGGTATGTTTTTTTCAATTGGGCCTAT]

[-] EMBL AGA282573            [CTGCAGGGGACAAACTATCCTGATTTAATGTGAGTAATCGCGGTCCAAACGGTTATTTCTCAACCGATGTTATGAGAAGGTAGTTAGTTTTGCTCCGATGCGAGTTACGCCGCACTAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGTTACGTATTAGTAGCTTTCTTTTTCAAACTGCCAGACAGATACACACACAGACACAGATACACAGATATACACACACACACACAAACGCGCTCACAGTGGATGTTGCGCTGGTGGATGTGTGTTTTATTTTCTGCCCTGTGCGCTCTCGAAGCAAGGTCTTCGAAAGCAGACTTGCAACATGGCGCTGCATGCGGCAAGTTAAAATTATAATGGTTATTC TTTTTTTTTGCCTCAAATCCCCCTTTTCATGCCATTTTTTTTTAGCTGAATGGCTGAATC   CTGATGTTCCTACAAACACAAAGCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BM587247             [                                                          ccgAACCGATGTTATGAGAAGGTAGTTAGTTTTGCTCCGATGCGAGTTACGCCGCACTAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGTTACGTATTAGTAGCTTTCTTTTTCAAACTGCCAGACAGATACACACACAGACACAGATACACAGATATACACACACACACACAAACGCGCTCACAGTGGATGTTGCGCTGGTGGATGTGTGTTTTATTTTCTGCCCTGTGCGCTCTCGAAGCAAGGTCTTCGAAAGCAGACTTGCAACATGGCGCTGCATGCGGCAAGTTAAAATTATAATGGTTATTC TTTTTTTTTGCCTCAAATCCCCCTTTTCATGCCATTTTTTTTTAGCTGAATGGCTGAATC   CTGATGTTCCTACAAACACAAAGCAAGAGAAAAACAAAAACAACCCGATAACGAAACCAGTAGAGGAATACTAGTATTTCTGCCCCGATATTAAACTGCGCGCGAACCTATCGAAGTAGATACGCGGAAGGCCTCTACGCGAAACCGCCCTGTAGGTGTAAAGTTCATTGTATTCGCACTTTGGATGGTGTGATCCGACAACAGGAGACAAGCAGGAGAAACACACGAAGTGTGGCTGCGTAGTAAAACGATAAAAAGTACGAAAAAGAGTAGACAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BM611852             [                                                                                                                 ccgctaaAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGTTACGTATTAGTAGCTTTCTTTTGCAAACTGCCAGACAGATACACACAC  ACACAG  ACACAGATAT  ATACACACACACAAACGCGCTCACAGTGGATGTTGCGCGGGTGGATGTGTGTTTTATTTTCTGCCCTGTGCGCTCTCGAAGCAAGGTCTTCGAAAGCAGACTTGCAACATGGCGCTGCATGCGGCAAGTTAAAATTATAATGGTTATTCTTTTTTTTTTGCCTCAAATCCCCCTTTTCATGCCA  TTTTTTTAGCTGAATGGCTGAATCTTATTGATGTTCCTACAAACACAAAGCAAGAGAAAAACAAAAACAACCCAATAACGAAACCAGTAGAGGAATACTAGTATTTCTGCCCCGATATTAAACTGCGCGCGAACCTATCGAAGTAGATACGCGGAAGGCCTCTACGCGAAACCGCCCTGTAGGTGTAAAGCTCATTGTATTCGCACTTT GATGGTGTGATCCGACAACAGGAGACAAGCAGGAGAAACACACGAAGTGTGGCTGCGTAGTAAAACGATAAAAAGTACGAAAAAGAGTAGACAGCAGATAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BX627044             [                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGCCCTGTGCGCTCTCGAAGCAAGGTCTTCGAAAGCAGACTTGCAACATGGCGCTGCATGCGGCAAGTTAAAATTATAATGGTTATTCTTTTTTTTTTGCCTCAAATCCCCCTTTTCATGCCA TTTTTTTTAGCTGAATGGCTGAATCTTATTGATGTTCCTACAAACACAAAGCAAGAGAAAAACAAAAACAACCCAATAACGAAACCAGTAGAGGAATACTAGTATTTCTGCCCCGATATTAAACTGCGCGCGAACCTATCGAAGTAGATACGCGGAAGGCCTCTACGCGAAACCGCCCTGTAGGTGTAAAGCTCATTGTATTCGCACTTT GATGGTGTGATCCGACAACAGGAGACAAGCAGGAGAAACACACGAAGTGTGGCTGCGTAGTAAAACGATAAAAAGTACGAAAAAGAGTAGACAGCAGATACAAAAAAAAACTACTCAGGCATCTCTGCTTGGCTGGGTACACGCCCCCGAGGCTTGTATTTTTAGGCAGTACAAGCCNAGATGGGGGAAGGNTTGGCGTCTCTGCACCGACACCCTATCCAAATTANAACTCCCATACATCCGTCGTACACCACACGGCTGGNACATAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BM618034             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ccgCGAAACCAGTAGAGGAATACTAGTATTTCTGCCCCGATATTAAACTGCGCGCGAACCTATCGAAGTAGATACGCGGAAGGCCTCTACGCGAAACCGCCCTGTAGGTGTAAAGTTCATTGTATTCGCACTTT GATGGTGTGATCCGACAACAGGAGACAAGCAGGAGAAACACACGAATTGTGGCTTCGTAGTAAAACGATAAAAAGTACGAAAAAGAGTAGAGAACAGATAC  AAAAAAACTACTCAGGCATCTCTGCTTGGCTGGTTACACG CCCTGAGGCTTGTATTTTTAGGCAGTACAAGCCGAGATGGGGGAAGGCTTGGCGTCTCTGCACCGACACCCTATCCAAATTAGAACTCCCATACATCCGTCGTACACCACACGGCTGGTACATAATGATAACTGCACCGACGTTTATTATTATTGTG TTTTTTTTGTTTGTT GTGGAGCCATAGTTGTACATGGATTTGT GTGTGGGTGTTCAAGTGTTAAGCTACCGGCTTGCGTTATGGGTAGCGTAAATGGTAACGTGTCTGCTTTGCAAACAACAAGCTGCACGTGTACCGGTTGTGCACATGTGTTATTACGAAGTGGGTGGAATAACACTTAAGTGAAAGTATAAAGCGTATATACTTACCGTGCTTTAGATGTAGTGCAGGACTGTAAAGTGGAAAATGATTGAATTTGGTTTTGGGTGGCTGGGTTTAAGGGGGCCGTTTCTGGGGTGTGGTTCCCCCGCCCC CACGATTTGTAGTCAGCCGGGCGAGAATAACCCAcaca                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AL930172             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gcccgaggCGAC ACAGGAGACAAGCAGGAGAAACACACGAAGTGTGGCTGCGTAGTAAAACGATAAAAAGTACGAAAAAGAGTAGACAGCAGATAC  AAAAAAACTACTCAGGCATCTCTGCTTGGCTGGTTACACG CCCCGAGGCTTGTATATTTAGGCAGTACAAGCCGAGATGGGGGAAGGCTTGGCGTCTCTGCACCGACACCCTATCCAAATTAGAACTCCCATACATCCGTCGTACACCACACGGCTGGTACATAATGATAACTGCACCGACGTTTATTATTATTGTGTTTTTTTTTGTTTATTGGTGGAGCCATAGTTGTACATGGATTTGTGGTGTGGGTGTTCAAGTGTTAAGCTACCGGCTTGCGTTATGGGTAGCGTAAATGGTAACGTGTCTGCTTTGCAAACAACAAGCTGCACGTGTACCGGTTGTGCACATGTGTTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BM646660             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T GTGGAGCCATAGTTGTACATGGATTTGT GTGTGGGTGTTCAAGTGTTAAGCTACCGGCTTGCGTTATGGGTAGCGTAAATGGTAACGTGTCTGCTTTGCAAACAACAAGCTGCACGTGTACCGGTTGTGCACATGTGTTATTACGAAGTGGGTGGAATAACACTTAAGTGAAAGTATAAAGCGTATATACTTACCGTGCTTTAGATGTAGTGCAGGACTGTAAAGTGGAAAATGATTGAATTTGGTTTTGTGTGTCTGTGTTTAGGGTGGCCGTTTCAGTGGTGTGGTTCCCCCGCCCCGCACGATTTGTAGTCAGCCGTGCAAGAATAACACAAAACACACGATATCTGTGCGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BM580412             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ccGGGTAGCGTAAATGGTAACGTGTCTGCTTTGCAAACAACAAGCTGCACGTGTACCGGTTGTGCACATGTGTTATTACGAAGTGGGTGGAATAACACTTAAGTGAAAGTATAAAGCGTATATACTTACCGTGCTTTAGATGTAGTGCAGGACTGTAAAGTGGAAAATGATTGAATTTGGTTTTGTGTGTCTGTGTTTAGGGTGGCCGTTTCAGTGGTGTGGTTCCCCCGCCCCGCACGATTTGTAGTCAGCCGTGCAAGAATAACACAAAACACACGATATCTGTGCGCTAAAGAAGAAAAAAAAACGCAAATGGGGGTCTTTATTTAAACACGCTATAATCAGGTTTGTTAGTTTTTGTCAGGATGAATTTGTTGATTTCCGCACAAAATAATACTGTGACCGTGCTCTGTAACTCCGTAACCAGAGGTGTACTAAGAATGCAACTATAGAGGAATT TTCAAAATTTGCGAATGAGGCGCGGTCGGTTTCTCACGTGTTTGATAAGTTTTGTACGCCACTCATTTGTTCTCACACCGTTGTGCCCTGATCCTCCCTATGCTTATTATGCTTTACATCTACTAATTTGTGTTAATTTTTGCGCTCACACTGATGCGCGTGCCTGACACTGATAGTTGTGTGTTTTCTGCTATTGCTCT                                ]
[+] EMBL BM592231             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ccGGGTAGCGTAAATGGTAACGTGTCTGCTTTGCAAACAACAAGCTGCACGTGTACCGGTTGTGCACATGTGTTATTACGAAGTGGGTGGAATAACACTTAAGTGAAAGTATAAAGCGTATATACTTACCGTGCTTTACATGTAGTGCAGGACTGTAAAGTGGAAAATGATTGAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BX623044             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GTACCGGTTGTGCACATGTGTTATTACGAAGTGGGTGGAATAACACTTAAGTGAAAGTATAAAGCGTATATACTTACCGTGCTTTAGATGTAGTGCAGGACTGTAAAGTGGAAAATGATTGAATTTGGTTTTGTGTGTCTGTGTTTAGGGTGGCCGTTTCAGTGGTGTGGTTCCCCCGCCCCGCACGATTTGTAGTCAGCCGTGCAAGAATAACACAAAACACACGATATCTGTGCGCTAAAGAAGAAAAAAAAACGCAAATGGGGGTCTTTATTTAAACACGCTATAATCAGGTTTGTTAGTTTTTGTCAGGATGAATTTGTTGATTTCCGTACAAAATAATACTGTGACCGTGCTCTGTAACTCCGTAACCAGAGGTGTACTAAGAATGCAACTATAGAGGAATT TTCAAAATTTGCGAATGAGGCGCGGTCGGTTTCTCACGTGTTTGATAAGTTTTGTACGCCACTCATTTGTTCTCACACCGTTGTGCCCTGATCCTCCCTATGCTTATTATGCTTTACATCTACTAATTTGTGTTAATTTTTGCGCTCACACTGATGCGCGTGCCTGACACTGATAGTTGTGTGTTTTCTGCTATTGCTCTGTAATTGGTATGTTTTTTTCAATTGGGCCTAT]
[+] EMBL BX614525             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCAAGAATAACACAAAACACACGATATCTGTGCGCTAAAGAAGAAAAAAAAACGCAAATGGGGGTCTTTATTTAAACACGCTATAATCAGGTTTGTTAGTTTTTGTCAGGGTGAATTTGTTGATTTCCGTACAAAATAATACTGTGACCGTGCTCTGTAACTCCGTAACCAGAGGTGTACTAAGAATGCAACTATAGAGGAATTATTCAAAATTTGCGAATGAG                                                                                                                                                                                                                     ]


>consensus_8721#0 CTGCAGGGGACAAACTATCCTGATTTAATGTGAGTAATCGCGGTCCAAACGGTTATTTCT CAACCGATGTTATGAGAAGGTAGTTAGTTTTGCTCCGATGCGAGTTACGCCGCACTAGCG AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGTTACGTATTAGTAGCTTTCTTTTTCAAACTGCCA GACAGATACACACACACACAGACACAGATATACACACACACACAAACGCGCTCACAGTGG ATGTTGCGCTGGTGGATGTGTGTTTTATTTTCTGCCCTGTGCGCTCTCGAAGCAAGGTCT TCGAAAGCAGACTTGCAACATGGCGCTGCATGCGGCAAGTTAAAATTATAATGGTTATTC TTTTTTTTTGCCTCAAATCCCCCTTTTCATGCCATTTTTTTTAGCTGAATGGCTGAATCC TGATGTTCCTACAAACACAAAGCAAGAGAAAAACAAAAACAACCCAATAACGAAACCAGT AGAGGAATACTAGTATTTCTGCCCCGATATTAAACTGCGCGCGAACCTATCGAAGTAGAT ACGCGGAAGGCCTCTACGCGAAACCGCCCTGTAGGTGTAAAGTTCATTGTATTCGCACTT TGATGGTGTGATCCGACAACAGGAGACAAGCAGGAGAAACACACGAAGTGTGGCTGCGTA GTAAAACGATAAAAAGTACGAAAAAGAGTAGACAGCAGATACAAAAAAACTACTCAGGCA TCTCTGCTTGGCTGGTTACACGCCCCGAGGCTTGTATTTTTAGGCAGTACAAGCCGAGAT GGGGGAAGGCTTGGCGTCTCTGCACCGACACCCTATCCAAATTAGAACTCCCATACATCC GTCGTACACCACACGGCTGGTACATAATGATAACTGCACCGACGTTTATTATTATTGTGT TTTTTTTGTTTGTTGTGGAGCCATAGTTGTACATGGATTTGTGTGTGGGTGTTCAAGTGT TAAGCTACCGGCTTGCGTTATGGGTAGCGTAAATGGTAACGTGTCTGCTTTGCAAACAAC AAGCTGCACGTGTACCGGTTGTGCACATGTGTTATTACGAAGTGGGTGGAATAACACTTA AGTGAAAGTATAAAGCGTATATACTTACCGTGCTTTAGATGTAGTGCAGGACTGTAAAGT GGAAAATGATTGAATTTGGTTTTGTGTGTCTGTGTTTAGGGTGGCCGTTTCAGTGGTGTG GTTCCCCCGCCCCGCACGATTTGTAGTCAGCCGTGCAAGAATAACACAAAACACACGATA TCTGTGCGCTAAAGAAGAAAAAAAAACGCAAATGGGGGTCTTTATTTAAACACGCTATAA TCAGGTTTGTTAGTTTTTGTCAGGATGAATTTGTTGATTTCCGTACAAAATAATACTGTG ACCGTGCTCTGTAACTCCGTAACCAGAGGTGTACTAAGAATGCAACTATAGAGGAATTTT CAAAATTTGCGAATGAGGCGCGGTCGGTTTCTCACGTGTTTGATAAGTTTTGTACGCCAC TCATTTGTTCTCACACCGTTGTGCCCTGATCCTCCCTATGCTTATTATGCTTTACATCTA CTAATTTGTGTTAATTTTTGCGCTCACACTGATGCGCGTGCCTGACACTGATAGTTGTGT GTTTTCTGCTATTGCTCTGTAATTGGTATGTTTTTTTCAATTGGGCCTAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)