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Anopheles gambiae
cluster # 9169 cluster # 9169       Sequences # 14       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9169#0 length = 990 sequences # 13  
consensus_9169#1 length = 214 sequences # 1  

consensusID : consensus_9169#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 13
consensus length = 990
fasta sequence
                              [GAATTATTGGTT-GCTGA-TTATTTATTTATTCAACAAAAGTAATTGAGCCACTATTC-CGGTTGCAGTTACACTAAGATAGCAACTAGCAGTATTTTTGCAATTTCACGCCTGTTTGGTTTGTGTTTTTGCAGTCATAAATTTTCAGATGTCTCGTATGGATTTTAATAAAATCGCAAACATATGACTATCTATATACATTACTAATTCATGATTTGTCTTTTTTTTGTAAGGCCTTAACCCGTAGCCAAAAACTGCAGCTTTTGCGCTGCATT-AAAA-ACACCCCTTGCTCTGGCAGACAAAACATATATATTATGGCAATAACAGCCTTACTGCCAGGGCATGGGGTGCAATAGCTGCCGGGCTACGTAGCACGGTGCCCACTTGTAAAAAAGTGTGGCAGCAGCTCAGGTTCCGCTATCGGCAAGTTCAGATGCGCGTAATCGCTGCGAATTGCAACGACGAAAGTAAGTAAGAAGTTGCTTGACGCGCTGTAAATGCATGAAGTAAGACATATTCAGTCGTACCT-TGCATATAAATGGATACCAGCATTACATGCCAATCATAGAACACGTAAATTTTTAAAGCGCAACGCTATAAAATGAGTGCGAGAACATAGCACAGTTCAGTTACGCAG-CCGGTAACGTAATAGGATTCGAGCAGTAGCATCGATTAAAAATTGCAGAGGTTTGTTAAAA-------GATGCTTGATGCGCATTGCTTTCCTCCAGGATGACGACGAATGGACGAATCTCGATAGAGAAACGCTATCGAGCTACCAAAATATCTACTTGACACTTGGAACCTGTGCTACACGAATGACGAGCAGCACAATATCCGATGCAATTGTAGCGGTCAGTGATATATTCAATTGGTTGCTTTCTTCCAGGACGAGTCCTATTGATCCCATTATAATGATGAAAGATCAAACACGAATATATCAAACAGAAATATTA-ACAGGACAATAATAGCTCAACCGCACAGTTTGGCGCTCTCA]

[-] EMBL BX623673             [GAATTATTGGTT GCTGA TTATTTA TTATTCAACAAAAGTAATTGAGCCACTATTCNCGGTNGCAGTTACACTAAGATAGCAACTAGCAGTATTTTTGCAATTTCACGCCTGTGTGGTTNGTGTTTTTGCAGTCATACATTTTCAGATGTCTCGTATGGATTTTAATAAAATCGCAAACATATGACTATCTATATACAGTACTAATTCATGATTTGTC TTTTTTTGTAAGGCCTTAACCCGTAGCCAAAAACTGCAGCTTTTGCGCTGCATTGAAAA ACACCCCTTGCTCAGGCAGACAAGTCATATGTACTATGGCAATAAAACCCTTACTGCCAGGGCATGGGGTGCAATAGCTGCCGGGCTACGTAGCACGGTACCCACTTGTATAAAAGTGTGGCAGCAACTCATGTTCCGCTATCGGCAGGTTCGGATGCGCGTAATCGCTGCGAATTGCAACGACGAAAGTAAGTAAGAAGTTGCTTGACGCGCAGTAAATTCATGAAGTAAGACATATTCAGTCGTACCT TCCATAGAAATGGATACCAGCATTACGTGTCAATCATAGAACACGTAAGTTTTTAAAGCGCAACGCTATAAAATGAGTGCGAGAACATAGCACAGTTCAGTTACGCAG CCGGTAACGTAATAGGATTCGAGCAGTAGCATCGATTAAAAATTGCAGAGGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CNS09FL4             [   TTATTGTTTATATGATTTATTTATTTATTCAACAAAAGTAATTGAGCCACTATTC CGGTTGCAGTTACACTAAGATAGCAACTAGCAGTATTTTTGCAATTTCACGCCTGTTTGGTTTGTGTTTTTGCAGTCATAAATTTTCAGATGTCTCGTATGGATTTTAATAAAATCGCAAACATATGACTATCTATATACATTACTAATTCATGATTTGTCTTTTTTTTGTAAGGCCTTAACCCGTAGCCAAAAACTGCAGCTTTTGCGCTGCATT AAAA ACACCCCTTGCTCTGGCAGACAAAACATATATATTATGGCAATAACAGCCTTACTGCCAGGGCATGGGGTGCAATAGCTGCCGGGCTACGTAGCACGGTGCCCACTTTTAAAAAAGTTTGGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CNS08HWR             [                    TATTTATTTATTCAACAAAAGTAATTGAGCCACTATTC CGGTTGCAGTTACACTAAGATAGCAACTAGCAGTATTTTTGCAATTTCACGCCTGTTTGGTTTGTGTTTTTGCAGTAATAAATTTTCAGATGTCTCGTATGGATTTTAATAAAATCGCAAACATATGACTATCTATATACATTACTAATTCATGATTTGTCTTTTTTTTGTAAGGCCTTAACCCGTAGCCAAAAACTGCAGCTTTTGCGCTGCATT AAAA ACACCCCTTGCTCTGGCAGACAAAACATATATATTATGGCAATAACAGCCTTACTGCCAGGGCATGGGGTGCAATAGCTGCCGGGCTACGTAGCACGGTGCCCACTTGTAAAAAAGTGTTTCAGCAGCTCAGGTTCCGCTATCGGCAAGTTCAGATGCGCGTAATCGCTGCGAATTGCAACGACGAAAGTAAGTAAGAAGTTGCTTGACGCGCTGTAAATGCATGAAGTAAGAAATATTCAGTCGTACCT TGCATATAAATGGATACCAGCATTACATGCCAATCATAGAACACGTAAATTTTTAAAGCGCAACGCTATAAAATGAGTGCGAGAACATAGCACAGTTCAGTTACGCAG CCGGTAACGTAATAGGATTCGAGCAGTAGCATCGATTAAAAATTGCAGAGGTTTGTTAAAA       GATGCTTGATGCGCATTGCTTTCCTCCAGGATGACGACGAATGGACGAATCTCGATAGAAAAACGCTATCGAGCTACCAAAATATCTACTTGACACTTGGAACCTGTGCTACACGAATGACGAGCAGCACAATATCCGATGCAATTGTAGCGGTCAGTGATATATTCAATTGGTTGCTTTCTTCCAGGACGAGTCCTATTGATCCCATTATAA                                                                                   ]
[-] EMBL BM579507             [                     ATTTATTTATTCAACAAAAGTAATTGAGCCACTATTC CGGTTGCAGTTACACTAAGATAGCAACTAGCAGTATTTTTGCAATTTCACGCCTGTGTGGTTTGTGTTTTTGCAGTCATACATTTTCAGATGTCTCGTATGGATTTTAATAAAATCGCAAACATATGACTATCTATATACAGTACTAATTCATGATTTGTC TTTTTTTGTAAGGCCTTAACCgg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CNS08Z3T             [                      TTTATTTATTCAACAAAAGTAATTGAGCCACTATTC CGGTTGCAGTCACACTAAGATAGCAACTAGCAGTATTTTTGCAATTTCACGCCTGTTTGGTTTGTGTTTTTGCAGTAATAAATTTTCAGATGTCTCGTATGGATTTTAATAAAATCGCAAACATATGACTATCTATATACATTACTAATTCATGATTTGTCTTTTTTTTGTAAGGCCTTAACCCGTAGCCAAAAACTGCAGCTTTTGCGCTGCATT AAAACACACCCCTTGCTCTGGCAGACAAAACATATATATTATGGCAATAACAGCCTTACTGCCAGGGCATGGGGTGCAATAGCTGCCGGGCTACGTAGCACGGTGCCCACTTGTAAAAAAGTGTGGCAGCAGCTCAGGTTCCGCTATCGGCAAGTTCAGATGCGCGTAATCGCTGCGAATTGCAAAGACGAAAGTAAGTAAGAAGTTGCTTGACGCGCTGTAAATGCATGAAGTAAGACATATTCAGTCGTACCT TGCATATAAATGGATACCAGCATTACATGCCAATCATAGAACACGTAAATTTTTAAAGCGCAACGCTATAAAATGAGTGCGAGAACATAGCACAGTTCAGTTACGCAG CCGGTAACGTAATAGGATTCGAGCAGTAGCATCGATTAAAAATTGCAGAGGTTTGTT AAA       GATGCTTGATGCGCATTGCTTTCCTCCAGGATGACGACG ATGGACGAATCTCGATAGAGAAACGCTATCGAGCTACCAAAATATCTACTTGACACTGGG                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CNS08FB0             [                        TATTTATTCAACAAAAGTAATTGAGCCACTATTC CGGTTGCAGTTACACTAAGATAGCAACTAGCAGTATTTTTGCAATTTCACGCCTGTTTGGTTTGTGTTTTTGCAGTAATAAATTTTCAGATGTCTCGTATGGATTTTAATAAAATCGCAAACATATGACTATCTATATACATTACTAATTCATGATTTGTCTTTTTTTTGTAAGGCCTTAACCCGTAGCCAAAAACTGCAGCTTTTGCGCTGCATT AAAA ACACCCCTTGCTCTGGCAGACAAAACATATATATTATGGCAATAACAGCCTTACTGCCAGGGCATGGGGTGCAATAGCTGCCGGGCTACGTAGCACGGTGCCCACTTGTAAAAAAGTGTGGCAGCAGCTCAGGTTCCGCTATCGGCAAGTTCAGATGCGCGTAATCGCTGCGAATTGCAACGACGAAAGTAAGTAAGAAGTTGCTTGACGCGCTGTAAATGCATGAAGTAAGAAATATTCAGTCGTACCT TGCATATAAATGGATACCAGCATTACATGCCAATTATAGAACACGTAAATTTTTAAAGCGCAACGCTATAAAATGAGTTCGAGAACATAGCACAGTTCAGTTACGCAGCCCGGTAACGTAATAGGATTCGAGCAGTAGCATCGATTAAAAATTGCAGAGGTTTGTTAAAA       GATGCTTGATGCGCATTGCTTTCCTCCAGGATGACGACGAATGGACGAATCTCGATAGAGAAACGCTATCGAGCTACCAAAATATCTACTTGACACTTGGAACCTGTCCTACACGAATTACGAGCAGCACAATATCCGATGCAATTGTAGCGGTCAGTGATATATTCAATTGGTTGCTTTCTTCCAGGACGAGTCCTATTGATCCCATTATAATGATGAAAGATCAAACACGAATATATCAAACAGAAATATTA A                                        ]
[-] EMBL CNS08FAZ             [                                                      ATTC CGGTTGCAGTTACACTAAGATAGCAACTAGCAGTATTTTTGCAATTTCACGCCTGTGTGGTTTGTGTTTTTGCAGTCATAAATTTTCAGATGTCTCGTATGGATTTTAATAAAATCGCAAACATATGACTATCTATATACATTACTAATTCATGATTTGTCTTTTTTTTGTAAGGCCTTAACCCGTAGCCAAAAACTGCAGCTTTTGCGCTGCATT AAAA ACACCCCTTGCTCTGGCAGACAAAACATATATATTATGGCAATAACAGCCTTACTGCCAGGGCATGGGGTGCAATAGCTGCCGGGCTACGTAGCACGGTGCCCACTTGTAAAAAAGTGTGGCAGCAGCTCAGGTTCCGCTATCGGCAAGTTCAGATGCGCGTAATCGCTGCGAATTGCAACGACGAAAGTAAGTAAGAAGTTGCTTGACGCGCTGTAAATGCATGAAGTAAGACATATTCAGTCGTACCT TGCATATAAATGGATACCAGCATTACATGCCAATCATAGAACACGTAAATTTTTAAAGCGCAACGCTATAAAATGAGTGCGAGAACATAGCACAGTTCAGTTACGCAG CCGGTAACGTAATAGGATTCGAGCAGTAGCATCGATTAAAAATTGCAGAGGTTTGTTAAAA       GATGCTTGATGCGCATTGCTTTCCTCCAGGATGACGACGAATGGACGAATCTCGATAGAGAAACGCTATCGAGCTACCAAAATATCTACTTGACACTTGGAACCTGTGCTACACGAATGACGAGCAGCACAATATCCGATGCAATTGTAGCGGTCAGTGATATATTCAATTGGTTGCTTTCTTCCAGGACGAGTCCTATTGATCCCATTATAATGATGAAAGATCAAACACGAATATATCAAACAGAAATATTA ACAGGACAATAATAGCTCAACCGCACAGTTT          ]
[-] EMBL CNS08HWQ             [                                                                                                                           TGTTTTTGCAGTCATAAATTTTCAGATGTCTCGTATGGATTTTAATAAAATCGCAAACATATGACTATCTATATACATTACTAATTCATGATTTGTCTTTTTTTTGTAAGGCCTTAACCCGTAGCCAAAAACTGCAGCTTTTGCGCTGCATT AAAA ACACCCCTTGCTCTGGCAGACAAAACATATATATTATGGCAATAACAGCCTTACTGCCAGGGCATGGGGTGCAATAGCTGCCGGGCTACGTAGCACGGTGCCCACTTGTAAAAAAGTGTGGCAGCAGCTCAGGTTCCGCTATCGGCAAGTTCAGATGCGCGTAATCGCTGCGAATTGCAACGACGAAAGTAAGTAAGAAGTTGCTTGACGCGCTGTAAATGCATGAAGTAAGACATATTCAGTCGTACCT TGCATATAAATGGATACCAGCATTACATGCCAATCATAGAACACGTAAATTTTTAAAGCGCAACGCTATAAAATGAGTGCGAGAACATAGCACAGTTCAGTTACGCAG CCGGTAACGTAATAGGATTCGAGCAGTAGCATCGATTAAAAATTGCAGAGGTTTGTTAAAA       GATGCTTGATGCGCATTGCTTTCCTCCAGGATGACGACGAATGGACGAATCTCGATAGAGAAACGCTATCGAGCTACCAAAATATCTACTTGACACTTGGAACCTGTGCTACACGAATGACGAGCAGCACAATATCCGATGCAATTGTAGCGGTCAGTGATATATTCAATTGGTTGCTTTCTTCCAGGACGAGTCCTATTGATCCCATTATAATGATGAAAGATCAAACACGAATATATCAAACAGAAATATTA ACAGGACAATAATAGCTCAACCGCACAGTTTGGCGCTCTCA]
[-] EMBL CNS08Z3S             [                                                                                                                                                    ATGTCTCGTATGGATTTTAATAAAATCGCAAACATATGACTATCTATATACATTACTAATTCATGATTTGTCTTTTTTTTGTAAGGCCTTAACCCGTAGCCAAAAACTGCAGCTTTTGCGCTGCATT AAAA ACACCCCTTGCTCTGGCAGACAAAACATATATATTATGGCAATAACAGCCTTACTGCCAGGGCATGGGGTGCAATAGCTGCCGGGCTACGTAGCACGGTGCCCACTTGTAAAAAAGTGTGGCAGCAGCTCAGGTTCCGCTATCGGCAAGTTCAGATGCGCGTAATCGCTGCGAATTGCAACGACGAAAGTAAGTAAGAAGTTGCTTGACGCGCTGTAAATGCATGAAGTAAGACATATTCAGTCGTACCT TGCATATAAATGGATACCAGCATTACATGCCAATCATAGAACACGTAAATTTTTAAAGCGCAACGCTATAAAATGAGTGCGAGAACATAGCACAGTTCAGTTACGCAG CCGGTAACGTAATAGGATTCGAGCAGTAGCATCGATTAAAAATTGCAGAGGTTTGTTAAAA       GATGCTTGATGCGCATTGCTTTCCTCCAGGATGACGACGAATGGACGAATCTCGATAGAGAAACGCTATCGAGCTACCAAAATATCTACTTGACACTTGGAACCTGTGCTACACGAATGACGAGCAGCACAATATCCGATGCAATTGTAGC GTCAGTGATATATTCAATTGGTTGCTTTCTTCCAGGACGAGTCCTATTGATCCCATTATAATGATGAAAGATCAAACACGAATATATCAAACAGAAATATTA ACAGGACAATAATAGCTCAACCGCACAGTTT          ]
[-] EMBL CNS09FL3             [                                                                                                                                                                                                                                                              CTGCAGCTTTTGCGCTGCATT AAAA ACACCCCTTGCTCTGGCAGACAAAACATATATATTATGGCAATAACAGCCTTACTGCCAGGGCATGGGGTGCAATAGCTGCCGGGCTACGTAGCACGGTGCCCACTTGTAAAAAAGTGTGGCAGCAGCTCAGGTTCCGCTATCGGCAAGTTCAGATGCGCGTAATCGCTGCGAATTGCAACGACGAAAGTAAGTAAGAAGTTGCTTGACGCGCTGTAAATGCATGAAGTAAGACATATTCAGTCGTACCTGTGCATATAAATGGATACCAGCATTACATGCCAATCATAGAACACGTAAATTTTTAAAGCGCAACGCTATAAAATGAGTGCGAGAACATAGCACAGTTCAGTTACGCAG CCGGTAACGTAATAGGATTCGAGCAGTAGCATCGATTAAAAATTGCAGAGGTTTGTTAAAAGATGCTTGATGCTTGATGCGCATTGCTTTCCTCCAGGATGACGACGAATGGACGAATCTCGATAGAGAAACGCTATCGAGCTACCAAAATATCTACTTGACACTTGGAACCTGTGCTACACGAATGACGAGCAGCACAATATCCGATGCAATTGTAGCGGTCAGTGATATATTCAATTGGTTGCTTTCTTCCAGGATGAGTCCTATTGATCCCATTATAATGATGAAAGATCAAACACGAATATATCAAACAGAAATATTA ACAGGACAATAATAGCTCAACCGCACAGTTT GCGCTCTt ]
[-] EMBL BM604100             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CAGGGCATGGGGTGCAATAGCTGCCGGGCTACGTAGCACGGTGCCCACTTGTAAAAAAGTGTGGCAGCAGCTCAGGTTCCGCTATCGGCAAGTTCAGATGCGCGTAATCGCTGCGAATTGCAACGACGAAAGTAAGTAAGAAGTTGCTTGACGCGCTGTAAATGCATGAAGTAAGACATATTCAGTCGTACCT TGCATATAAATGGATACCAGCATTACATGCCAATCATAGAACACGTAAATTTTTAAAGCGCAACGCTATAAAATGAGTGCGAGAACATAGCACAGTTCAGTTACGCAG CCGGTAACGTAATAGGATTCGAGCAGTAGCATCGATTAAAAATTGCAGAGGTTTGTTAAAA       GATGCTTGATGCGCATTGCTTTCCTCCAGGATGACGACGAATGGACGAATCTCGATAGAGAAACGCTATCGAGCTACCAAAATATCTACTTGACACTTGGAACCTGTGCTACACGAATGACGAGCAGCACAATATCCGATGCAATTGTAGCGGTCAGTGATATATTCAATTGGTTGCTTTCTTCCAGGACGAGTCCTATTGATCCCATTATAATGATGAAAGATCAAACACGAATATATCAAACAGAAATATTA ACAGGACAATAATAGCTCAACCGCACAGTTTGGCcgg    ]
[-] EMBL CNS08SAF             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGCTCAGGTTCCGCTATCGGCAAGTTCAGATGCGCGTAATCGCTGCGAATTGCAACGACGAAAGTAAGTAAGAAGTTGCTTGACGCGCTGTAAATGCATGAAGTAAGACATATTCAGTCGTACCT TGCATATAAATGGATACCAGCATTACATGCCAATCATAGAACACGTAAATTTTTAAAGCGCAACGCTATAAAATGAGTGCGAGAACATAGCACAGTTCAGTTACGCAG CCGGTAACGTAATAGGATTCGAGCAGTAGCATCGATTAAAAATTGCAGAGGTTTGTTAAAA       GATGCTTGATGCGCATTGCTTTCCTCCAGGATGACGACGAATGGACGAATCTCGATAGAGAAACGCTATCGAGCTACCAAAATATCTACTTGACACTTGGAACCTGTGCTACACGAATGACGAGCAGCACAATATCCGATGCAATTGTAGCGGTCAGTGATATATTCAATTGGTTGCTTTCTTCCAGGACGAGTCCTATTGATCCCATTATAATGATGAAAGATCAAACACGAATATATCAAACACAAATATTATACAG                                     ]
[-] EMBL BM593185             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GCGCGTAATCGCTGCGAATTGCAACGACGAAAGTAAGTAAGAAGTTGCTTGACGCGCTGTAAATGCATGAAGTAAGACATATTCAGTCGTACCT TGCATATAAATGGATACCAGCATTACATGCCAATCATAGAACACGTAAATTTTTAAAGCGCAACGCTATAAAATGAGTGCGAGAACATAGCACAGTTCAGTTACGCAG CCGGTAACGTAATAGGATTCGAGCAGTAGCATCGATTAAAAATTGCAGAGGTTTGTTAAAA       GATGCTTGATGCGCATTGCTTTCCTCCAGGATGACGACGAATGGACGAATCTCGATAGAGAAACGCTATCGAGCTACCAAAATATCTACTTGACACTTGGAACCTGTGCTACACGAATGACGAGCAGCACAATATCCGATGCAATTGTAGCGGTCAGTGATATATTCAATTGGTTGCTTTCTTCCAGGACGAGTCCTATTGATCCCATTATAATGATGAAAGATCAAACACGAATATATCAAACAGAAATATTA ACAGGACAATAATAGCTCAACCGCACAGTTTGGCGCcgg  ]


>consensus_9169#0 GAATTATTGGTTGCTGATTATTTATTTATTCAACAAAAGTAATTGAGCCACTATTCCGGT TGCAGTTACACTAAGATAGCAACTAGCAGTATTTTTGCAATTTCACGCCTGTTTGGTTTG TGTTTTTGCAGTCATAAATTTTCAGATGTCTCGTATGGATTTTAATAAAATCGCAAACAT ATGACTATCTATATACATTACTAATTCATGATTTGTCTTTTTTTTGTAAGGCCTTAACCC GTAGCCAAAAACTGCAGCTTTTGCGCTGCATTAAAAACACCCCTTGCTCTGGCAGACAAA ACATATATATTATGGCAATAACAGCCTTACTGCCAGGGCATGGGGTGCAATAGCTGCCGG GCTACGTAGCACGGTGCCCACTTGTAAAAAAGTGTGGCAGCAGCTCAGGTTCCGCTATCG GCAAGTTCAGATGCGCGTAATCGCTGCGAATTGCAACGACGAAAGTAAGTAAGAAGTTGC TTGACGCGCTGTAAATGCATGAAGTAAGACATATTCAGTCGTACCTTGCATATAAATGGA TACCAGCATTACATGCCAATCATAGAACACGTAAATTTTTAAAGCGCAACGCTATAAAAT GAGTGCGAGAACATAGCACAGTTCAGTTACGCAGCCGGTAACGTAATAGGATTCGAGCAG TAGCATCGATTAAAAATTGCAGAGGTTTGTTAAAAGATGCTTGATGCGCATTGCTTTCCT CCAGGATGACGACGAATGGACGAATCTCGATAGAGAAACGCTATCGAGCTACCAAAATAT CTACTTGACACTTGGAACCTGTGCTACACGAATGACGAGCAGCACAATATCCGATGCAAT TGTAGCGGTCAGTGATATATTCAATTGGTTGCTTTCTTCCAGGACGAGTCCTATTGATCC CATTATAATGATGAAAGATCAAACACGAATATATCAAACAGAAATATTAACAGGACAATA ATAGCTCAACCGCACAGTTTGGCGCTCTCA



consensusID : consensus_9169#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 214
fasta sequence
                              [TAATTGAGCAATATTGGGGTTGGAGTTACACTAAGATAGCAACTAGGAGTATTTTTGGAATTTCACGCCTGTATGGTTTGTGTTTTTGCAGTAATAAATTTTCAGATGTGTGGTATGGATTTTAATAAAATGGGAAACATATGACTATCTATATACATTACTAATTCATGATTTGTCTTTTTTTTGTAAGGGCTTAACCGGTAGGCAAAAAATG]

[+] EMBL CNS08SAG             [TAATTGAGCAATATTGGGGTTGGAGTTACACTAAGATAGCAACTAGGAGTATTTTTGGAATTTCACGCCTGTATGGTTTGTGTTTTTGCAGTAATAAATTTTCAGATGTGTGGTATGGATTTTAATAAAATGGGAAACATATGACTATCTATATACATTACTAATTCATGATTTGTCTTTTTTTTGTAAGGGCTTAACCGGTAGGCAAAAAATG]


>consensus_9169#1 TAATTGAGCAATATTGGGGTTGGAGTTACACTAAGATAGCAACTAGGAGTATTTTTGGAA TTTCACGCCTGTATGGTTTGTGTTTTTGCAGTAATAAATTTTCAGATGTGTGGTATGGAT TTTAATAAAATGGGAAACATATGACTATCTATATACATTACTAATTCATGATTTGTCTTT TTTTTGTAAGGGCTTAACCGGTAGGCAAAAAATG



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9169#0      GAATTATTGGTTGCTGATTATTTATTTATTCAACAAAAGTAATTGAGCCACTATTCCGGT 60
consensus_9169#1      ---------------------------------------TAATTGAGC-AATATTGGGGT 20
                                                             ********* * ****  ***

consensus_9169#0      TGCAGTTACACTAAGATAGCAACTAGCAGTATTTTTGCAATTTCACGCCTGTTTGGTTTG 120
consensus_9169#1      TGGAGTTACACTAAGATAGCAACTAGGAGTATTTTTGGAATTTCACGCCTGTATGGTTTG 80
                      ** *********************** ********** ************** *******

consensus_9169#0      TGTTTTTGCAGTCATAAATTTTCAGATGTCTCGTATGGATTTTAATAAAATCGCAAACAT 180
consensus_9169#1      TGTTTTTGCAGTAATAAATTTTCAGATGTGTGGTATGGATTTTAATAAAATGGGAAACAT 140
                      ************ **************** * ******************* * ******

consensus_9169#0      ATGACTATCTATATACATTACTAATTCATGATTTGTCTTTTTTTTGTAAGGCCTTAACCC 240
consensus_9169#1      ATGACTATCTATATACATTACTAATTCATGATTTGTCTTTTTTTTGTAAGGGCTTAACCG 200
                      *************************************************** ******* 

consensus_9169#0      GTAGCCAAAAACTGCAGCTTTTGCGCTGCATTAAAAACACCCCTTGCTCTGGCAGACAAA 300
consensus_9169#1      GTAGGCAAAAAATG---------------------------------------------- 214
                      **** ****** **                                              

consensus_9169#0      ACATATATATTATGGCAATAACAGCCTTACTGCCAGGGCATGGGGTGCAATAGCTGCCGG 360
consensus_9169#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9169#0      GCTACGTAGCACGGTGCCCACTTGTAAAAAAGTGTGGCAGCAGCTCAGGTTCCGCTATCG 420
consensus_9169#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9169#0      GCAAGTTCAGATGCGCGTAATCGCTGCGAATTGCAACGACGAAAGTAAGTAAGAAGTTGC 480
consensus_9169#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9169#0      TTGACGCGCTGTAAATGCATGAAGTAAGACATATTCAGTCGTACCTTGCATATAAATGGA 540
consensus_9169#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9169#0      TACCAGCATTACATGCCAATCATAGAACACGTAAATTTTTAAAGCGCAACGCTATAAAAT 600
consensus_9169#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9169#0      GAGTGCGAGAACATAGCACAGTTCAGTTACGCAGCCGGTAACGTAATAGGATTCGAGCAG 660
consensus_9169#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9169#0      TAGCATCGATTAAAAATTGCAGAGGTTTGTTAAAAGATGCTTGATGCGCATTGCTTTCCT 720
consensus_9169#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9169#0      CCAGGATGACGACGAATGGACGAATCTCGATAGAGAAACGCTATCGAGCTACCAAAATAT 780
consensus_9169#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9169#0      CTACTTGACACTTGGAACCTGTGCTACACGAATGACGAGCAGCACAATATCCGATGCAAT 840
consensus_9169#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9169#0      TGTAGCGGTCAGTGATATATTCAATTGGTTGCTTTCTTCCAGGACGAGTCCTATTGATCC 900
consensus_9169#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9169#0      CATTATAATGATGAAAGATCAAACACGAATATATCAAACAGAAATATTAACAGGACAATA 960
consensus_9169#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9169#0      ATAGCTCAACCGCACAGTTTGGCGCTCTCA 990
consensus_9169#1      ------------------------------
                                                    




Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)