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Anopheles gambiae
cluster # 9440 cluster # 9440       Sequences # 17       consensus # 8


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9440#0 length = 846 sequences # 6  
consensus_9440#1 length = 844 sequences # 1  
consensus_9440#2 length = 761 sequences # 2  
consensus_9440#3 length = 702 sequences # 1  
consensus_9440#4 length = 562 sequences # 3  
consensus_9440#5 length = 557 sequences # 1  
consensus_9440#6 length = 484 sequences # 1  
consensus_9440#7 length = 441 sequences # 2  

consensusID : consensus_9440#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 846
fasta sequence
                              [CCGCGGACGCGTGGGGACCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGTAAAATTGTTTACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGTTTTTTCTTTATTTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATTAAGTTATATTCTTTTAATTTAGGTGTTTTGTTTTTTTTTATGTTGTACTAGATTAGGAGTTTATACTGTAATGATTGCAGGTTGATCTTCTAATTCTAATTATGCTTTATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAAACTATTTCTTATGAAGTTAGTTTAGCATTAATTTTATTAAGTTTTATTTTTTTAGTAGGTAATTATAATTTTTTAAGTTTTTATTTTTATCAAGATTATGTTTGATTTATTTTTTTTTGTTTTCCATTAGGTTTAGTTTGGTTAGCTTCTTGTTTAGCTGAAACTAATCGTACTCCTTTTGAAAAAAAAAAAGGGGAATCAGAATTAGTTTCTGGATTTAATGTTGAATACAGAAGTGGGGGATTTGCTTTAATTTTTTTAGCTGAATATTCTAGTATTTTATTTATAAGTATATTATTTGTAGTTATTTTTTTAGGTAGTGATATTTATAGATTTATATTTTTTTTAAAATTATCTTTTATTTCTTTTATTTTTATTTGAGTTCGAGGGACTTTACCTCGATTTCGTTATGATAAACTAATGTATTTAGCTTGAAAAAGTTTTTTACCTTTATCTTTAAATTATTTATTTTTCTTTGTAGGATTAAAGATTTTTTTTATTTCTTTATTATTTTAAAAAAAA]

[+] EMBL BM610807             [CCGCGGACGCGTGGGGACCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGTAAAATTGTTTACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGTTTTTTCTTTATTTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATTAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL AGA281346            [                                                                                       AAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGTTTTTTCTTTATTTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATTAAGTTATATTCTTTTAATTTAGGTGTTTTGTTTTTTTTTATGTTGTACTAGATTAGGAGTTTATACTGTAATGATTGCAGGTTGATCTTCTAATTCTAATTATGCTTTATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAAACTATTTCTTATGAAGTTAGTTTAGCATTAATTTTATTAAGTTTTATTTTTTTAGTAGGTAATTATAATTTTTTAAGTTTTTATTTTTATCAAGATTATGTTTGATTTATTTTTTTTTGTTTTCCATTAGGTTTAGTTTGGTTAGCTTCTTGTTTAGCTGAAACTAATCGTACTCCTTTTGAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL AGA283794            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTTTATTTTTATCAAGATTATGTTTGATTTATTTTTTTTTGTTTTCCATTAGGTTTAGTTTGGTTAGCTTCTTGTTTAGCTGAAACTAATCGTACTCCTTTTGATTTTGCTGAAGGGGAATCAGAATTAGTTTCTGGATTTAATGTTGAATACAGAAGTGGGGGATTTGCTTTAATTTTTTTAGCTGAATATTCTAGTATTTTATTTATAAGTATATTATTTGTAGTTATTTTTTTAGGTAGTGATATTTATAGATTTATATTTTTTTTAAAATTATCTTTTATTTCTTTTATTTTTATTTGAGTTCGAGGGACTTTACCTCGATTTCGTTATGATAAACTAATGTATTTAGCTTGAAAAAGTTTTTTACCTTTATCTTTAAATTATTTATTTTTCTTTGTAGGATTAAAGATCTTTTTTATTTCTTTATTATTTTAAAAAAAA]
[+] EMBL BM657452             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ccgGTGGGGGATTTGCTTTAATTTTTTTAGCTGAATATTCTAGTATTTTATTTATAAGTATATTATTTGTAGTTATTTTTTTAGGTAGTGATATTTATAGATTTATATTTTTTTTAAAATTATCTTTTATTTCTTTTATTTTTATTTGAGTTCGAGGGACTTTACCTCGATTTCGTTATGATAAACTAATGTATTTAGCTTGAAAAAGTTTTTTACCTTTATCTTTAAATTATTTATTTTTCTTTGTAGGATTAAAGATTTTTTTTATTTCTTTATTATTTT        ]
[+] EMBL BM578325             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ccgATTTATAAGTATATTATTTGTAGTTATTTTTTTAGGTAGTGATATTTATAGATTTATATTTTTTTTAAAATTATCTTTTATTTCTTTTATTTTTATTTGAGTTCGAGGGACTTTACCTCGATTTCGTTATGATAAACTAATGTATTTAGCTTGAAAAAGTTTTTTACCTTTATCTTTAAATTATTTATTTTTCTTTGTAGGATTAAAGATTTTTTTTATTTCTTTATTATTTT        ]
[-] EMBL BM649874             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GAGTTCGAGGGACTTTACCTCGATTTCGTTATGATAAACTAATGTATTTAGCTTGAAAAAGTTTTTTACCTTTATCTTTAAATTATTTATTTTTCTTTGTAGGATTAAAGATTTTTTTTATTTCTTTAT              ]


>consensus_9440#0 CCGCGGACGCGTGGGGACCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTG ATGCTGTAAAATTGTTTACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTT ATTATTTTTCTCCTGTTTTTTCTTTATTTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTT ATTTAATTAAGTTATATTCTTTTAATTTAGGTGTTTTGTTTTTTTTTATGTTGTACTAGA TTAGGAGTTTATACTGTAATGATTGCAGGTTGATCTTCTAATTCTAATTATGCTTTATTG GGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAAACTATTTCTTATGAAGTTAGTTTAGCATTAATTTTA TTAAGTTTTATTTTTTTAGTAGGTAATTATAATTTTTTAAGTTTTTATTTTTATCAAGAT TATGTTTGATTTATTTTTTTTTGTTTTCCATTAGGTTTAGTTTGGTTAGCTTCTTGTTTA GCTGAAACTAATCGTACTCCTTTTGAAAAAAAAAAAGGGGAATCAGAATTAGTTTCTGGA TTTAATGTTGAATACAGAAGTGGGGGATTTGCTTTAATTTTTTTAGCTGAATATTCTAGT ATTTTATTTATAAGTATATTATTTGTAGTTATTTTTTTAGGTAGTGATATTTATAGATTT ATATTTTTTTTAAAATTATCTTTTATTTCTTTTATTTTTATTTGAGTTCGAGGGACTTTA CCTCGATTTCGTTATGATAAACTAATGTATTTAGCTTGAAAAAGTTTTTTACCTTTATCT TTAAATTATTTATTTTTCTTTGTAGGATTAAAGATTTTTTTTATTTCTTTATTATTTTAA AAAAAA



consensusID : consensus_9440#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 844
fasta sequence
                              [AGAATCCCCCGAGGTTTAAATTGGAAGTTTATTATTAGCTAATTTGTGTAATAGTTGGTGTAGCTTTTTTGACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTATGTTACATATCAAATTCGTAAAGTGACCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGTAAAATTGTTTACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGTTTTTTTCTTTATTTCTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAACTTAAGCTTATATTCTTTCTAATNTAGCGTGTATNCATCGTAATATCTTATGTATGTACTAGCATTAGANGTTCTATACTTGTAACTGATTTGCACGCGTTTGATCTCTCTAATTCTAATTCACTGGCCTCTTCACTACGGGGCGGCGGGTTTACCGGGGGCCTGTTAAGCGTCCAAACCCTNACTTCTACCTTCNATGGAACGCTCTCCGGTCCACAGCCACTCCAAACNCACTCTACTCNANACGGATATGCTCGAGTTCCTTCACNCTCCACNCTACGCGCGTACACTGCTACTAACCCNTCNCTATTNTCAAACACGGGCTNCACGCGCTACTNTNGAACTNTATAACTCCCACACGAAAATTCTTAAATTTTGCTTTGCTCTGGTAANTGATACTNAAGTACACATATCNAGTACNACACAGTGGAGTGNTGTTGTGCCCCCACCATTAAAGAGGGCGTTCTTGNCACAGCGCTACTACCTGGGGCTGCTTCAAGGCCCTTACTCCCTNTTAGGGTGTCGTAAAGCCGTTGGACAAAACCTTAAAATT]

[+] EMBL AL934464             [AGAATCCCCCGAGGTTTAAATTGGAAGTTTATTATTAGCTAATTTGTGTAATAGTTGGTGTAGCTTTTTTGACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTATGTTACATATCAAATTCGTAAAGTGACCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGTAAAATTGTTTACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGTTTTTTTCTTTATTTCTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAACTTAAGCTTATATTCTTTCTAATNTAGCGTGTATNCATCGTAATATCTTATGTATGTACTAGCATTAGANGTTCTATACTTGTAACTGATTTGCACGCGTTTGATCTCTCTAATTCTAATTCACTGGCCTCTTCACTACGGGGCGGCGGGTTTACCGGGGGCCTGTTAAGCGTCCAAACCCTNACTTCTACCTTCNATGGAACGCTCTCCGGTCCACAGCCACTCCAAACNCACTCTACTCNANACGGATATGCTCGAGTTCCTTCACNCTCCACNCTACGCGCGTACACTGCTACTAACCCNTCNCTATTNTCAAACACGGGCTNCACGCGCTACTNTNGAACTNTATAACTCCCACACGAAAATTCTTAAATTTTGCTTTGCTCTGGTAANTGATACTNAAGTACACATATCNAGTACNACACAGTGGAGTGNTGTTGTGCCCCCACCATTAAAGAGGGCGTTCTTGNCACAGCGCTACTACCTGGGGCTGCTTCAAGGCCCTTACTCCCTNTTAGGGTGTCGTAAAGCCGTTGGACAAAACCTTAAAATT]


>consensus_9440#1 AGAATCCCCCGAGGTTTAAATTGGAAGTTTATTATTAGCTAATTTGTGTAATAGTTGGTG TAGCTTTTTTGACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTATGTTACATATCAAATTCGTAAAGTG ACCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGTAAAATTGTT TACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGT TTTTTTCTTTATTTCTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAACTTAAGCTT ATATTCTTTCTAATNTAGCGTGTATNCATCGTAATATCTTATGTATGTACTAGCATTAGA NGTTCTATACTTGTAACTGATTTGCACGCGTTTGATCTCTCTAATTCTAATTCACTGGCC TCTTCACTACGGGGCGGCGGGTTTACCGGGGGCCTGTTAAGCGTCCAAACCCTNACTTCT ACCTTCNATGGAACGCTCTCCGGTCCACAGCCACTCCAAACNCACTCTACTCNANACGGA TATGCTCGAGTTCCTTCACNCTCCACNCTACGCGCGTACACTGCTACTAACCCNTCNCTA TTNTCAAACACGGGCTNCACGCGCTACTNTNGAACTNTATAACTCCCACACGAAAATTCT TAAATTTTGCTTTGCTCTGGTAANTGATACTNAAGTACACATATCNAGTACNACACAGTG GAGTGNTGTTGTGCCCCCACCATTAAAGAGGGCGTTCTTGNCACAGCGCTACTACCTGGG GCTGCTTCAAGGCCCTTACTCCCTNTTAGGGTGTCGTAAAGCCGTTGGACAAAACCTTAA AATT



consensusID : consensus_9440#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 761
fasta sequence
                              [GAATCGCCCGAGGCTTATTGGAAGTTATTATTAGTAATTGTGTAATAGTTGGTGTAGC-TTTTTGACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTAGGTTACATTCAAATTCGTAAAGGACCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGTAAAATTGTTTACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGTTTTTTCTTTATTTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATTAAGTTATATTCTTTTAATTTA-GTG-TTGTTTTATTTTATGTTGTACTAGATTAGGAGTTTATACTGTAATGATTGCAGGTTGATCTTCTAATTCTAATTATGCTTTATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAAACTATTTCTTATGAAGTTAGTTTAGCATTCAATTATTATTAAGTTTTATTTTTATTCAGTAGGTAATTATAATTTTTATAAGTTNANANATTTTCNATCAAGATTATGTNTNGATTCTATTAATAANAACNNGTGATNCCATTAGGTTTAGTTATAGGTTAGCTTCTGTGTNTAGCTGAAACTAATCGTACTCCTTTTGATTTCGCTGAAGGGGNATCAGAATTAGTTTTCTGGGATTAATGTTGGAATACAGAAGATGGGAGGATNGTTAAATTCTCNTAGCTGNATATTCTAAAATTATATTAATAAGTATATAAATNGGANTATTAAGGAGAGATATTANAG]

[+] EMBL AL693489             [GAATCGCCCGAGGCTTATTGGAAGTTATTATTAGTAATTGTGTAATAGTTGGTGTAGC TTTTTGACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTAGGTTACATTCAAATTCGTAAAGGACCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGTAAAATTGTTTACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGTTTTTTCTTTATTTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATTAAGTTATATTCTTTTAATTTA GTG TTGTTTTATTTTATGTTGTACTAGATTAGGAGTTTATACTGTAATGATTGCAGGTTGATCTTCTAATTCTAATTATGCTTTATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAAACTATTTCTTATGAAGTTAGTTTAGCATTCAATTATTATTAAGTTTTATTTTTATTCAGTAGGTAATTATAATTTTTATAAGTTNANANATTTTCNATCAAGATTATGTNTNGATTCTATTAATAANAACNNGTGATNCCATTAGGTTTAGTTATAGGTTAGCTTCTGTGTNTAGCTGAAACTAATCGTACTCCTTTTGATTTCGCTGAAGGGGNATCAGAATTAGTTTTCTGGGATTAATGTTGGAATACAGAAGATGGGAGGATNGTTAAATTCTCNTAGCTGNATATTCTAAAATTATATTAATAAGTATATAAATNGGANTATTAAGGAGAGATATTANAG]
[+] EMBL AL932494             [   TCCCACGAGGTTAATTGGAAGTTATTATTAGTATTTGTGT ATAGTTGGTGTAGCTTTTTTGACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTAGGTTACATTCAAATTCGTAAAGGACCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGTAAAATTGTTTACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGTTTTTTCTTTATTTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATTAAGTTATATTCTTTTAATTTAGGTGTTTGTTTT TTTTATGTTGTACTAGATTAGGAGTTTATACTGTAATGATTGCAGGTTGATCTTCTAATTCTAATTATGCTTTATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]


>consensus_9440#2 GAATCGCCCGAGGCTTATTGGAAGTTATTATTAGTAATTGTGTAATAGTTGGTGTAGCTT TTTGACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTAGGTTACATTCAAATTCGTAAAGGACCAAATAA AGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGTAAAATTGTTTACTAAGGA ACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGTTTTTTCTTT ATTTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATTAAGTTATATTCTTTTAA TTTAGTGTTGTTTTATTTTATGTTGTACTAGATTAGGAGTTTATACTGTAATGATTGCAG GTTGATCTTCTAATTCTAATTATGCTTTATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAAACTA TTTCTTATGAAGTTAGTTTAGCATTCAATTATTATTAAGTTTTATTTTTATTCAGTAGGT AATTATAATTTTTATAAGTTNANANATTTTCNATCAAGATTATGTNTNGATTCTATTAAT AANAACNNGTGATNCCATTAGGTTTAGTTATAGGTTAGCTTCTGTGTNTAGCTGAAACTA ATCGTACTCCTTTTGATTTCGCTGAAGGGGNATCAGAATTAGTTTTCTGGGATTAATGTT GGAATACAGAAGATGGGAGGATNGTTAAATTCTCNTAGCTGNATATTCTAAAATTATATT AATAAGTATATAAATNGGANTATTAAGGAGAGATATTANAG



consensusID : consensus_9440#3
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 702
fasta sequence
                              [GAATTGCCCGCGGTTTAGTTATTATTAGTAATTGTCGTAATAGTTGGTGTAGCTTTTTTGACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTAGGTTACATTCAAATTCGTAAAGGACCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCATATTAGTGATGCTGTAAAATTGTTTACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGTTTTTTCTTTATTTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATTCAACGTTATATTCTTCTCTAATTTAGGTGTTATNGTACTATTCTTTATGTTCGTACTAGATTAGGAGCTTTATACTGTAACTGATTGCACGGTTNGATCTTCTAATTCTCACANTCTCATGGCTCTCTACTNCGCGNGGCGCGGTCTACCGCGCGCTGTCAGCTCAAAACTCAATCTCCTCCTCTACTCAGCACACGTCTCACGGTATCACAACGCCACTTNCANACTATCTCTAATTTCNCACCGCTTACAAACTTNNCNCACTACTCNAAGCACAACAGGCTTACACCTCGTACCTACACAACTCCCTCCACCACAACAGACTATCCACCCAACCTCACCACCCCACNTTCCACAACGCCACTNCACCTCGCTCTCCGCACCNNCCCCACACCCAAACACCACACACACACGGCCCCANA]

[+] EMBL AL692185             [GAATTGCCCGCGGTTTAGTTATTATTAGTAATTGTCGTAATAGTTGGTGTAGCTTTTTTGACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTAGGTTACATTCAAATTCGTAAAGGACCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCATATTAGTGATGCTGTAAAATTGTTTACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGTTTTTTCTTTATTTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATTCAACGTTATATTCTTCTCTAATTTAGGTGTTATNGTACTATTCTTTATGTTCGTACTAGATTAGGAGCTTTATACTGTAACTGATTGCACGGTTNGATCTTCTAATTCTCACANTCTCATGGCTCTCTACTNCGCGNGGCGCGGTCTACCGCGCGCTGTCAGCTCAAAACTCAATCTCCTCCTCTACTCAGCACACGTCTCACGGTATCACAACGCCACTTNCANACTATCTCTAATTTCNCACCGCTTACAAACTTNNCNCACTACTCNAAGCACAACAGGCTTACACCTCGTACCTACACAACTCCCTCCACCACAACAGACTATCCACCCAACCTCACCACCCCACNTTCCACAACGCCACTNCACCTCGCTCTCCGCACCNNCCCCACACCCAAACACCACACACACACGGCCCCANA]


>consensus_9440#3 GAATTGCCCGCGGTTTAGTTATTATTAGTAATTGTCGTAATAGTTGGTGTAGCTTTTTTG ACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTAGGTTACATTCAAATTCGTAAAGGACCAAATAAAGTT GGATTTAATGGATTATTACAACCATATTAGTGATGCTGTAAAATTGTTTACTAAGGAACA AACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGTTTTTTCTTTATT TTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATTCAACGTTATATTCTTCTCTA ATTTAGGTGTTATNGTACTATTCTTTATGTTCGTACTAGATTAGGAGCTTTATACTGTAA CTGATTGCACGGTTNGATCTTCTAATTCTCACANTCTCATGGCTCTCTACTNCGCGNGGC GCGGTCTACCGCGCGCTGTCAGCTCAAAACTCAATCTCCTCCTCTACTCAGCACACGTCT CACGGTATCACAACGCCACTTNCANACTATCTCTAATTTCNCACCGCTTACAAACTTNNC NCACTACTCNAAGCACAACAGGCTTACACCTCGTACCTACACAACTCCCTCCACCACAAC AGACTATCCACCCAACCTCACCACCCCACNTTCCACAACGCCACTNCACCTCGCTCTCCG CACCNNCCCCACACCCAAACACCACACACACACGGCCCCANA



consensusID : consensus_9440#4
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 562
fasta sequence
                              [CCGAATAAATTTAGAATTTATATATATAATTTTTAATTATAAATAGTATTGTTTATATTTGATGGTATTATACCTTTAATTGGAAGTTTATTATTAGTAATTTGTGTAATAGTTGGTGTAGCTTTTTTGACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTAGGTTACATTCAAATTCGTAAAGGACCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGTAAAATTGTTTACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGTTTTTTCTTTATTTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATTAAGTTATATTCTTTTAATTTAGGTGTTTTGTTTTTTTTATGTTGTACTAGATTAGGAGTTTATACTGTAATGATTGCAGGTTGATCTTCTAATTCTAATTATGCTTTATTGGGGGGGTTACGGGCTGTANCTCAAACTATTTCTTATGAAGTTAGTTTAGCATTAATTTTATTAAGTTTTATTTTTTTAGTAGGTAATTATAATTTTTTAAGTT]

[+] EMBL BM593381             [CCGAATAAATTTAGAATTTATATATATAATTTTTAATTATAAATAGTATTGTTTATATTTGATGGTATTATACCTTTAATTGGAAGTTTATTATTAGTAATTTGTGTAATAGTTGGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AGA285085            [                                            ttttTTGTTTATATTTGATGGTATTATACCTTTAATTGGAAGTTTATTATTAGTAATTTGTGTAATAGTTGGTGTAGCTTTTTTGACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTAGGTTACATTCAAATTCGTAAAGGACCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGTAAAATTGTTTACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGTTTTTTCTTTATTTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATTAAGTTATATTCTTTTAATTTAGGTGTTTTGTTTTTTTTATGTTGTACTAGATTAGGAGTTTATACTGTAATGATTGCAGGTTGATCTTCTAATTCTAATTATGCTTTATTGGGGGGGTTACGGGCTGTANCTCAAACTATTTCTTATGAAGTTAGTTTAGCATTAATTTTATTAAGTTT                                   ]
[+] EMBL BX614159             [                                                                                           TATTAGTAATTTGTGTAATAGTTGGTGTAGCTTTTTTGATTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTAGGTTACATTCAAATTCGTAAAGGACCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGTAAAATTGTTTACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGTTTTTTCTTTATTTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATTAAGTTATATTCTTTTAATTTAGGTGTTTTGTTTTTTTTATGTTGTACTAGATTAGGAGTTTATACTGTAATGATTGCAGGTTGATCTTCTAATTCTAATTATGCTTTATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAAACTATTTCTTATGAAGTTAGTTTAGCATTAATTTTATTAAGTTTTATTTTTTTAGTAGGTAATTATAATTTTTTAAGTT]


>consensus_9440#4 CCGAATAAATTTAGAATTTATATATATAATTTTTAATTATAAATAGTATTGTTTATATTT GATGGTATTATACCTTTAATTGGAAGTTTATTATTAGTAATTTGTGTAATAGTTGGTGTA GCTTTTTTGACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTAGGTTACATTCAAATTCGTAAAGGACCA AATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGTAAAATTGTTTACT AAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGTTTTT TCTTTATTTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATTAAGTTATATTCT TTTAATTTAGGTGTTTTGTTTTTTTTATGTTGTACTAGATTAGGAGTTTATACTGTAATG ATTGCAGGTTGATCTTCTAATTCTAATTATGCTTTATTGGGGGGGTTACGGGCTGTANCT CAAACTATTTCTTATGAAGTTAGTTTAGCATTAATTTTATTAAGTTTTATTTTTTTAGTA GGTAATTATAATTTTTTAAGTT



consensusID : consensus_9440#5
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 557
fasta sequence
                              [GATCGCCGAGGTTTTATTGGAAGTTATATTACTATTGTGTAATATTTGGTGTAGCTTTTTGACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTAGGTTACATTCAAATTCGTAAAGGACCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGTAAAATGTTTACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGTTTTTCTTTATTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATTAAGTTATATTCTTTTAATTTAGGTGTTTCTCGTTCTCTCTNTCATGTTGTACTAGATTAGGAGTTTCATACTGTAATGATTGCAGGTTGATCTTCTAATTCTCAATTATGCTTTATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAAACTATTNTCTTATGAAGTTAGTTTAGCATTAATTTNTACTTAACGTTTCAATTTCTCTNAGTCAGGTCAATTATAATCTCTCTCACCGTTCTCCCATTNTCCNATCAAGCANTATGTTCCGACTCCNNCCCCCCGCCC]

[+] EMBL AL930965             [GATCGCCGAGGTTTTATTGGAAGTTATATTACTATTGTGTAATATTTGGTGTAGCTTTTTGACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTAGGTTACATTCAAATTCGTAAAGGACCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGTAAAATGTTTACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGTTTTTCTTTATTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATTAAGTTATATTCTTTTAATTTAGGTGTTTCTCGTTCTCTCTNTCATGTTGTACTAGATTAGGAGTTTCATACTGTAATGATTGCAGGTTGATCTTCTAATTCTCAATTATGCTTTATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAAACTATTNTCTTATGAAGTTAGTTTAGCATTAATTTNTACTTAACGTTTCAATTTCTCTNAGTCAGGTCAATTATAATCTCTCTCACCGTTCTCCCATTNTCCNATCAAGCANTATGTTCCGACTCCNNCCCCCCGCCC]


>consensus_9440#5 GATCGCCGAGGTTTTATTGGAAGTTATATTACTATTGTGTAATATTTGGTGTAGCTTTTT GACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTAGGTTACATTCAAATTCGTAAAGGACCAAATAAAGT TGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGTAAAATGTTTACTAAGGAACAA ACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGTTTTTCTTTATTTT ATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATTAAGTTATATTCTTTTAATTTAGG TGTTTCTCGTTCTCTCTNTCATGTTGTACTAGATTAGGAGTTTCATACTGTAATGATTGC AGGTTGATCTTCTAATTCTCAATTATGCTTTATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAAA CTATTNTCTTATGAAGTTAGTTTAGCATTAATTTNTACTTAACGTTTCAATTTCTCTNAG TCAGGTCAATTATAATCTCTCTCACCGTTCTCCCATTNTCCNATCAAGCANTATGTTCCG ACTCCNNCCCCCCGCCC



consensusID : consensus_9440#6
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 484
fasta sequence
                              [CCAGAANCCGGCACGTAGGTTAGTATTTGTGTAATAGCTTGGTGTAGCTTTTTTGACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTAGGTTACATTCAAATTCGTAAAGGACCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGTAAAATTGTTTACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGTTTTTTCTTTATTTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATTAAGTTATATTCTTTTAATTTAGGTGTTTTGTTTTTTTTATGTTGTACTAGATTAGGAGTTTATACTGTAATGATTGCAGGTTGATCTTCTAATTCTAATTATGCTTTATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAAGACTATTTCTTATGAAGTTAGTTTAGCATTAATTTNATTAAAGTTTTATTTTTNTTAGTAGGTAATTATAAGTTN]

[+] EMBL BX468362             [CCAGAANCCGGCACGTAGGTTAGTATTTGTGTAATAGCTTGGTGTAGCTTTTTTGACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTAGGTTACATTCAAATTCGTAAAGGACCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGTAAAATTGTTTACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGTTTTTTCTTTATTTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATTAAGTTATATTCTTTTAATTTAGGTGTTTTGTTTTTTTTATGTTGTACTAGATTAGGAGTTTATACTGTAATGATTGCAGGTTGATCTTCTAATTCTAATTATGCTTTATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAAGACTATTTCTTATGAAGTTAGTTTAGCATTAATTTNATTAAAGTTTTATTTTTNTTAGTAGGTAATTATAAGTTN]


>consensus_9440#6 CCAGAANCCGGCACGTAGGTTAGTATTTGTGTAATAGCTTGGTGTAGCTTTTTTGACTTT ATTAGAGCGTAAGGTTTTAGGTTACATTCAAATTCGTAAAGGACCAAATAAAGTTGGATT TAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGTAAAATTGTTTACTAAGGAACAAACATA TCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGTTTTTTCTTTATTTTTATC TTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATTAAGTTATATTCTTTTAATTTAGGTGT TTTGTTTTTTTTATGTTGTACTAGATTAGGAGTTTATACTGTAATGATTGCAGGTTGATC TTCTAATTCTAATTATGCTTTATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAAGACTATTTCTT ATGAAGTTAGTTTAGCATTAATTTNATTAAAGTTTTATTTTTNTTAGTAGGTAATTATAA GTTN



consensusID : consensus_9440#7
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 441
fasta sequence
                              [CCGCCCACGCGTCCGTTATACCTTTAATTGGAAGTTTATTAGTAGTAATTGGTGTAATAGTTGGTGCAGCTTTTTTGACTTTATTA-GACCGTAAGGTTTTAGGTCATATTCGAATTCGTAAAGGACCAAATAAAGGTGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGCAAAAGTGCTTACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTCATGATTTTTCTCCTGTTTTATCTTTATTTTTATCTTTATGAATTCGAATATGTATTCCTTATTAAACTAAGATATATTCTGTTAAGTTAGGTGTATGGTGTTCTATATGATGAACTAAATCAGGAGTGTATACTGGAATGACTGCAGGTTGATCTTCTAATTCTAAGTATGCTTTATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAAACTATTTCTT]

[+] EMBL BM633350             [CCGCCCACGCGTCCGTTATACCTTTAATTGGAAGTTTATTAGTAGTAATTGGTGTAATAGTTGGTGCAGCTTTTTTGACTTTATTA GACCGTAAGGTTTTAGGTCATATTCGAATTCGTAAAGGACCAAATAAAGGTGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGCAAAAGTGCTTACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTCATGATTTTTCTCCTGTTTTATCTTTATTTTTATCTTTATGAATTCGAATATGTATTCCTTATTAAACTAAGATATATTCTGTTAAGTTAGGTGTATGGTGTTCTATATGATGAACTAAATCAGGAGTGTATACTGGAATGACTGCAGGTTGATCTTCTAATTCTAAGTATGCTTTATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAAACTATTTCTT]
[+] EMBL BM589599             [CCGCCCACGCGTCCG TATACCTTTAATTGGAAGTTTATTATTAATAATTTGTGTAATAGTTGGTGTAGCTTTTTTGACTTTATTACGAGCGTAAGGTTTTAGGTTATATTCGAATTCGTAAAGGACCAAATAAAGGAGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGCAAAATTGTTTACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTCATGATTTTTCTCCTGTTTTTTCTTTATTTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATTAAGCTATATTCTGTTAAGTTAGGTGTTTTGTTTTTTTTATGATGAACTAGATTAGGAGTGTATACTGGAATGATTGCAGGTTGATCTTCTAATTCTAAGTATGCTTTATTGGGGGGGGCACGGGCTGTAGCTCAAACTATTT   ]


>consensus_9440#7 CCGCCCACGCGTCCGTTATACCTTTAATTGGAAGTTTATTAGTAGTAATTGGTGTAATAG TTGGTGCAGCTTTTTTGACTTTATTAGACCGTAAGGTTTTAGGTCATATTCGAATTCGTA AAGGACCAAATAAAGGTGGATTTAATGGATTATTACAACCATTTAGTGATGCTGCAAAAG TGCTTACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTCATGATTTTTCTC CTGTTTTATCTTTATTTTTATCTTTATGAATTCGAATATGTATTCCTTATTAAACTAAGA TATATTCTGTTAAGTTAGGTGTATGGTGTTCTATATGATGAACTAAATCAGGAGTGTATA CTGGAATGACTGCAGGTTGATCTTCTAATTCTAAGTATGCTTTATTGGGGGGGTTACGGG CTGTAGCTCAAACTATTTCTT



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9440#0      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#6      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#4      CCGAATAAATTTAGAATTTATATATATAATTTTTAATTATAAATAGTATTGTTTATATTT 60
consensus_9440#5      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#7      ----------------------------------------------------CCGCCCAC 8
consensus_9440#1      -----------------------------------------------------------A 1
consensus_9440#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9440#0      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#2      ---GAATCGCCCGAGGCTTATTGGAAGTTATTATTAG-TAATTGTGTAATAG-TTGGTGT 55
consensus_9440#6      --------------CCAGAANCCGGCACGTAGGTTAG-TATTTGTGTAATAGCTTGGTGT 45
consensus_9440#4      GATGGTATTATACCTTTAATTGGAAGTTTATTATTAG-TAATTTGTGTAATAGTTGGTGT 119
consensus_9440#5      ----GATCGCCGAGGTTTTATTGGAAGTTAT-ATTAC-TA--TTGTGTAATATTTGGTGT 52
consensus_9440#7      GCGTCCGTTATACCTTTAATTGGAAGTTTATTAGTAG-TAATTGGTGTAATAGTTGGTGC 67
consensus_9440#1      GAATCCCCCGAGGTTTAAATTGGAAGTTTATTATTAGCTAATTTGTGTAATAGTTGGTGT 61
consensus_9440#3      GAATTGCCCGCGGTTTAG---------TTATTATTAG-TAATTGTCGTAATAGTTGGTGT 50
                                                                                  

consensus_9440#0      ----------------------------------------CC-GCGGACGCGTGG-G-GA 17
consensus_9440#2      AGCTTTTT-GACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTAGGTTACAT-TCAAATTCGTAAAG-GA 112
consensus_9440#6      AGCTTTTTTGACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTAGGTTACAT-TCAAATTCGTAAAG-GA 103
consensus_9440#4      AGCTTTTTTGACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTAGGTTACAT-TCAAATTCGTAAAG-GA 177
consensus_9440#5      AGCTTTTT-GACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTAGGTTACAT-TCAAATTCGTAAAG-GA 109
consensus_9440#7      AGCTTTTTTGACTTTATTAGACCGTAAGGTTTTAGGTCATAT-TCGAATTCGTAAAG-GA 125
consensus_9440#1      AGCTTTTTTGACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTATGTTACATATCAAATTCGTAAAGTGA 121
consensus_9440#3      AGCTTTTTTGACTTTATTAGAGCGTAAGGTTTTAGGTTACAT-TCAAATTCGTAAAG-GA 108
                                                                  *  *  ***   * **

consensus_9440#0      CCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCAT-TTAGTGATGCTGTAAAATTGTT 76
consensus_9440#2      CCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCAT-TTAGTGATGCTGTAAAATTGTT 171
consensus_9440#6      CCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCAT-TTAGTGATGCTGTAAAATTGTT 162
consensus_9440#4      CCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCAT-TTAGTGATGCTGTAAAATTGTT 236
consensus_9440#5      CCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCAT-TTAGTGATGCTGTAAAAT-GTT 167
consensus_9440#7      CCAAATAAAGGTGGATTTAATGGATTATTACAACCAT-TTAGTGATGCTGCAAAAGTGCT 184
consensus_9440#1      CCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCAT-TTAGTGATGCTGTAAAATTGTT 180
consensus_9440#3      CCAAATAAAGTTGGATTTAATGGATTATTACAACCATATTAGTGATGCTGTAAAATTGTT 168
                      ********** ************************** ************ ****  * *

consensus_9440#0      TACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGT 136
consensus_9440#2      TACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGT 231
consensus_9440#6      TACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGT 222
consensus_9440#4      TACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGT 296
consensus_9440#5      TACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGT 227
consensus_9440#7      TACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTCATGATTTTTCTCCTGT 244
consensus_9440#1      TACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGT 240
consensus_9440#3      TACTAAGGAACAAACATATCCATTATTATCTAATTATATTTCTTATTATTTTTCTCCTGT 228
                      ******************************************* ** *************

consensus_9440#0      TTTTT-CTTTATTTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATT--AAGTT 193
consensus_9440#2      TTTTT-CTTTATTTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATT--AAGTT 288
consensus_9440#6      TTTTT-CTTTATTTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATT--AAGTT 279
consensus_9440#4      TTTTT-CTTTATTTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATT--AAGTT 353
consensus_9440#5      TTTT--CTTTATTTT-ATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATT--AAGTT 282
consensus_9440#7      TTTAT-CTTTATTTTTATCTTTATGAATTCGAATATGTATTCCTTATTAAACT--AAGAT 301
consensus_9440#1      TTTTTTCTTTATTTCTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAACTTAAGCTT 300
consensus_9440#3      TTTTT-CTTTATTTTTATCTTTATTAATTTGAATATGTATTCCTTATTTAATTCAACGTT 287
                      ***   ********  ******** **** ****************** ** *  *   *

consensus_9440#0      ATATTCTT--TTAATTTAG-GTGTTT----TGTTTTTTTTTATGT-TGTACTAG-ATTAG 244
consensus_9440#2      ATATTCTT--TTAATTTAG----TGT----TGTTTTATTTTATGT-TGTACTAG-ATTAG 336
consensus_9440#6      ATATTCTT--TTAATTTAG-GTGTTT----TGTTTT-TTTTATGT-TGTACTAG-ATTAG 329
consensus_9440#4      ATATTCTT--TTAATTTAG-GTGTTT----TGTTTT-TTTTATGT-TGTACTAG-ATTAG 403
consensus_9440#5      ATATTCTT--TTAATTTAG-GTGTTTCTCGTTCTCTCTNTCATGT-TGTACTAG-ATTAG 337
consensus_9440#7      ATATTCTG--TTAAGTTAG-GTGTAT-----GGTGTTCTATATGA-TGAACTAA-ATCAG 351
consensus_9440#1      ATATTCTT-TCTAATNTAGCGTGTATNCATCGTAATATCTTATGTATGTACTAGCATTAG 359
consensus_9440#3      ATATTCTTCTCTAATTTAG-GTGT-TATNGTACTATTCTTTATGTTCGTACTAG-ATTAG 344
                      *******    ***  ***    * *         *     ***   * ****  ** **

consensus_9440#0      GAGTTT-ATACT-GTAA-TGATT-GCAGG---TTGATCT-TCTAATTCT-AATTATGCTT 295
consensus_9440#2      GAGTTT-ATACT-GTAA-TGATT-GCAGG---TTGATCT-TCTAATTCT-AATTATGCTT 387
consensus_9440#6      GAGTTT-ATACT-GTAA-TGATT-GCAGG---TTGATCT-TCTAATTCT-AATTATGCTT 380
consensus_9440#4      GAGTTT-ATACT-GTAA-TGATT-GCAGG---TTGATCT-TCTAATTCT-AATTATGCTT 454
consensus_9440#5      GAGTTTCATACT-GTAA-TGATT-GCAGG---TTGATCT-TCTAATTCTCAATTATGCTT 390
consensus_9440#7      GAGTGT-ATACT-GGAA-TGACT-GCAGG---TTGATCT-TCTAATTCT-AAGTATGCTT 402
consensus_9440#1      ANGTTCTATACTTGTAACTGATTTGCACGCGTTTGATCTCTCTAATTCTAA--TTCACTG 417
consensus_9440#3      GAGCTTTATACT-GTAACTGATT-GCACG-GTTNGATCT-TCTAATTCTCACANTCTCAT 400
                        *    ***** * ** *** * *** *   * ***** ********* *      *  

consensus_9440#0      TATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAA-ACTATTT-CTTATGAAGTTAGTTTAGCATT 353
consensus_9440#2      TATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAA-ACTATTT-CTTATGAAGTTAGTTTAGCATT 445
consensus_9440#6      TATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAAGACTATTT-CTTATGAAGTTAGTTTAGCATT 439
consensus_9440#4      TATTGGGGGGGTTACGGGCTGTANCTCAA-ACTATTT-CTTATGAAGTTAGTTTAGCATT 512
consensus_9440#5      TATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAA-ACTATTNTCTTATGAAGTTAGTTTAGCATT 449
consensus_9440#7      TATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAA-ACTATTT-CTT------------------- 441
consensus_9440#1      GCCTCTTCACTACGGGGCGGCGGGTTT---ACCGGGGGCCTGTTAAGC--GTCCAAACCC 472
consensus_9440#3      GGCTCTCTACTNCGCGNGGCGCGGTCT---ACCGCGCGC-TGTCAGC----TCAAAACTC 452
                         *           *              **      * *                   

consensus_9440#0      -AATT-TTATTAA-GTTTTATTTTT--TTAGT-AGGT-AATTATAATTTTT-TAA--GTT 403
consensus_9440#2      CAATTATTATTAA-GTTTTATTTTTATTCAGT-AGGT-AATTATAATTTTTATAA--GTT 500
consensus_9440#6      -AATTTNATTAAA-GTTTTATTTTTN-TTAGT-AGGT-AATTATAAGTTN---------- 484
consensus_9440#4      -AATT-TTATTAA-GTTTTATTTTT--TTAGT-AGGT-AATTATAATTTTT-TAA--GTT 562
consensus_9440#5      AATTTNTACTTAACGTTTCAATTTCTCTNAGTCAGGTCAATTATAATCTCTCTCACCGTT 509
consensus_9440#7      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#1      TNACTTCTACCTTCNATGGAACGC-TCTC----CGGT-CCACA--GCCACT-CCAAACNC 523
consensus_9440#3      AATCTCCTCCTCTACTCAGCACACGTCTCA---CGGTATCACAACGCCACTTNCANACTA 509
                                                                                  

consensus_9440#0      TTTAT---TTT-TATCAAG-ATTATGTTTGATTTATTTTTTT------TTGTT-TTCCAT 451
consensus_9440#2      NANANATTTTC-NATCAAG-ATTATGTNTNGATTCTATTAATAANAACNNGTGATNCCAT 558
consensus_9440#6      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#4      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#5      CTCCCATTNTCCNATCAAGCANTATGTTCCGACTCCNNCCCCCCGCCC------------ 557
consensus_9440#7      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#1      ACTCTA--CTCNANACGGATATGCTCGAGTTCCTTCACNCTCCACNCTACGCGCGTACAC 581
consensus_9440#3      TCTCTAATTTCNCACCGCTTACAAACTTNNCNCACTACTCNAAGCACAACAGGCTTACAC 569
                                                                                  

consensus_9440#0      TAGGT-TTAGTTT--GGTTAGCTTCT-TGTTTAGCTGAAACTAATCGTACTCCTTTTGAA 507
consensus_9440#2      TAGGT-TTAGTTATAGGTTAGCTTCTGTGTNTAGCTGAAACTAATCGTACTCCTTTTGAT 617
consensus_9440#6      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#4      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#5      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#7      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#1      TGC-TACTAACCCNTCNCTATTNTCAAACACGGGCTNCACGCGCTACTNTNGAACTNTAT 640
consensus_9440#3      CTCGTACCTACACAACTCCCTCCACCACAACAGACTATCCACCCAACCTCACCACCCCAC 629
                                                                                  

consensus_9440#0      AAAAAAAAAGGGGAATCAGAATTAGTTT-CTGGATTTAATGTTG-AATACAGAAGTGGGG 565
consensus_9440#2      TTCGCTGAAGGGGNATCAGAATTAGTTTTCTGGGATTAATGTTGGAATACAGAAGATGGG 677
consensus_9440#6      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#4      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#5      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#7      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#1      AACTCCCACACGAAAATTCTTAAATTTTGCTTTGCTCTGGTAANTGATACTNAAGTAC-A 699
consensus_9440#3      --NTTCCAC---AACGCCACTNCACCTCGCTCTCCGCACCNNCCCCACACCCAAACACCA 684
                                                                                  

consensus_9440#0      GATTTGCTTTAATTTTTT-TAGCTGAATATTCTAGTATTTTATTTATAAGTATATTATTT 624
consensus_9440#2      AGGATNGTTAAATTCTCN-TAGCTGNATATTCTAAAATTATATTAATAAGTATATAAATN 736
consensus_9440#6      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#4      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#5      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#7      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#1      CATATCNAGTACNACACAGTGGAGTGNTGTTGTGCCCCCACCATTAAAGAGGGCGTTCTT 759
consensus_9440#3      CACACACACGGCCCCANA------------------------------------------ 702
                                                                                  

consensus_9440#0      GTAGTTATTTTTTTAGGTAGTGATATTTATAGATTTATATTTTTTTTAAAATTATCTTTT 684
consensus_9440#2      GGAN------TATTAAGGAGAGATATT-ANAG---------------------------- 761
consensus_9440#6      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#4      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#5      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#7      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#1      GNCACAGCGCTACTACCTGGGGCTGCTTCAAGGCCCTTACTCCCTNTTAGGGTGTCGTAA 819
consensus_9440#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9440#0      ATTTCTTTTATTTTTATTTGAGTTCGAGGGACTTTACCTCGATTTCGTTATGATAAACTA 744
consensus_9440#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#6      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#4      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#5      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#7      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#1      AGCCGTTGGACAAAACCTTAAAATT----------------------------------- 844
consensus_9440#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9440#0      ATGTATTTAGCTTGAAAAAGTTTTTTACCTTTATCTTTAAATTATTTATTTTTCTTTGTA 804
consensus_9440#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#6      ------------------------------------------------------------
consensus_9440#4      ------------------------------------------------------------
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consensus_9440#0      GGATTAAAGATTTTTTTTATTTCTTTATTATTTTAAAAAAAA 846
consensus_9440#2      ------------------------------------------
consensus_9440#6      ------------------------------------------
consensus_9440#4      ------------------------------------------
consensus_9440#5      ------------------------------------------
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Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)