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Apis mellifera
cluster # 1082 cluster # 1082       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1082#0 length = 574 sequences # 3  

consensusID : consensus_1082#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 574
fasta sequence
                              [CGACACTCGTTTTATTAGATAATTTAGCTATAAGAGAAACACATTCCATATTTTTTAAGACACTGCAAGATAATGGATATATATTAACTTTTAAATTAGCAGATGATGCTAATCTGCAGCTTTCTAAATATGGAGAATATTTATATCAACATTTAATAATATTTGCTCCTTCTGTAGAAGAATTTGGAGGAGCATTAAGTGTTGAAACAATAACAGATTTCATTGATGGTGGTGGTAATGTCTTAGTTGCTGGTTCATCTCAATCAGGAGATGCTTTACATGAATTAGCATCAGAATGTGGTTTTGAAATTGATGAAGAAGGTTCTGCAGTCATTGATCATTTAAACTATGATGTTTCTGATAATGGTTATCATACAAAAATAGTAGCAGACCCTGCTAATTTGATAGATGCTCCTGCAATTGTTGGAAATAAAAACATAAATTCTTTACTTTACCAAGGAACTGGATTGATTGCAGATACAGAAAATCCTTTAATTTTACGTTTATTAACAGCATCTAGTTCAGCATATTCATATAATCCACAGAATTCTATAAAAGAGTATCCTCATGCAGT]

[+] EMBL BI511083             [CGACACTCGTTTTATTAGATAATTTAGCTATAAGAGAAACACATTCCATATTTTTTAAGACACTGCAAGATAATGGATATATATTAACTTTTAAATTAGCAGATGATGCTAATCTGCAGCTTTCTAAATATGGAGAATATTTATATCAACATTTAATAATATTTGCTCCTTCTGTAGAAGAATTTGGAGGAGCATTAAGTGTTGAAACAATAACAGATTTCATTGATGGTGGTGGTAATGTCTTAGTTGCTGGTTCATCTCAATCAGGAGATGCTTTACATGAATTAGCATCAGAATGTGGTTTTGAAATTGATGAAGAAGGTTCTGCAGTCATTGATCATTTAAACTATGATGTTTCTGATAATGGTTATCATACAAAAATAGTAGCAGACCCTGCTAATTT                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BI511264             [  ACACTCGTTTTATTAGATAATTTAGCTATAAGAGAAACACATTCCATATTTTTTAAGACACTGCAAGATAATGGATATATATTAACTTTTAAATTAGCAGATGATGCTAATCTGCAGCTTTCTAAATATGGAGAATATTTATATCAACATTTAATAATATTTGCTCCTTCTGTAGAAGAATTTGGAGGAGCATTAAGTGTTGAAACAATAACAGATTTCATTGATGGTGGTGGTAATGTCTTAGTTGCTGGTTCATCTCAATCAGGAGATGCTTTACATGAATTAGCATCAGAATGTGGTTTTGAAATTGATGAAGAAGGTTCTGCAGTCATTGATCATTTAAACTATGATGTTTCTGATAATGNNTATCATACAAAAATAGTAGCAGACCCTGCTAATTTGATAGATGCTCCTGCAATTGTTGGAAATAAAAACATA                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI514868             [                                                                                                                   GCAGCTTTCTAAATATGGAGAATATTTATATCAACATTTAATAATATTTGCTCCTTCTGTAGAAGAATTTGGAGGAGCATTAAGTGTTGAAACAATAACAGATTTCATTGATGGTGGTGGTAATGTCTTAGTTGCTGGTTCATCTCAATCAGGAGATGCTTTACATGAATTAGCATCAGAATGTGGTTTTGAAATTGATGAAGAAGGTTCTGCAGTCATTGATCATTTAAACTATGATGTTTCTGATAATGGTTATCATACAAAAATAGTAGCAGACCCTGCTAATTTGATAGATGCTCCTGCAATTGTTGGAAATAAAAACATAAATTCTTTACTTTACCAAGGAACTGGATTGATTGCAGATACAGAAAATCCTTTAATTTTACGTTTATTAACAGCATCTAGTTCAGCATATTCATATAATCCACAGAATTCTATAAAAGAGTATCCTCATGCAGT]


>consensus_1082#0 CGACACTCGTTTTATTAGATAATTTAGCTATAAGAGAAACACATTCCATATTTTTTAAGA CACTGCAAGATAATGGATATATATTAACTTTTAAATTAGCAGATGATGCTAATCTGCAGC TTTCTAAATATGGAGAATATTTATATCAACATTTAATAATATTTGCTCCTTCTGTAGAAG AATTTGGAGGAGCATTAAGTGTTGAAACAATAACAGATTTCATTGATGGTGGTGGTAATG TCTTAGTTGCTGGTTCATCTCAATCAGGAGATGCTTTACATGAATTAGCATCAGAATGTG GTTTTGAAATTGATGAAGAAGGTTCTGCAGTCATTGATCATTTAAACTATGATGTTTCTG ATAATGGTTATCATACAAAAATAGTAGCAGACCCTGCTAATTTGATAGATGCTCCTGCAA TTGTTGGAAATAAAAACATAAATTCTTTACTTTACCAAGGAACTGGATTGATTGCAGATA CAGAAAATCCTTTAATTTTACGTTTATTAACAGCATCTAGTTCAGCATATTCATATAATC CACAGAATTCTATAAAAGAGTATCCTCATGCAGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)