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Apis mellifera
cluster # 1103 cluster # 1103       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1103#0 length = 650 sequences # 3  

consensusID : consensus_1103#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 650
fasta sequence
                              [AAATATTAAGGATTTCGTGATGGCCGACGAAGGATTTGATCTATGTGAGTGTATATGGAACCATGAATTTGCTATGCAACGTCTACTTTCTATTTTGCGGCAGAGCCAAAATTACTGCACAGATAATGAATGTTTTGATATGTCACGATTACCAGGACCACGCGATGTTCCATCGTGGAACTTAAATTTTTTCATGATTTTATTAATTATTNNNTTTATTATCCTTATGTATGCTCTTAGACCACAGTCTCTTCGTCATTTAAATAATGATATTGCTAAAGATCAAAACAACGAACGTGATTCGCATGACGATCCTCCAGTACCACCACCGACAATACAATAAAGAATGAAATATGATAAACGCTTTTATGTAGGTTTTTATAAGAAATCTACTGAATTTATGATAATAGAAGAAGTAAAAAAAAATTAATTAATTTGATTTATATATAATATCTTTATGAATATATTTAATCTAACCTAAAAAGAATTGTAATTTTCTTTTTTTTTTTAATAATTTGAAAATTATTATATTTGTACGTGTTAACATTCGCATTCTTCGATTTTTATTTACTAACATTTGTCACATATCGAAGCTATGTGTAAAACAAAAAAAAAATAATTATAATTCAATGAAACTATTTTCATCAAAT]

[+] EMBL BI517155             [AAATATTAAGGATTTCGTGATGGCCGACGAAGGATTTGATCTATGTGAGTGTATATGGAACCATGAATTTGCTATGCAACGTCTACTTTCTATTTTGCGGCAGAGCCAAAATTACTGCACAGATAATGAATGTTTTGATATGTCACGATTACCAGGACCACGCGATGTTCCATCGTGGAACTTAAATTTTTTCATGATTTTATTAATTATTGTATTTATTATCCTTATGTATGCTCTTAGACCACAGTCTCTTCGTCATTTAAATAATGATATTGCTAAAGATCAAAACAACGAACGTGATTCGCATGACGATCCTCCAGTACCACCACCGACAATACAATAAAGAATGAAATATGATAAACGCTTTTATGTAGGTTTTTATAAGAAATCTACTGAATTTATGATAATAGAAGAAGTAAAAAAAAATTAATTAATTTGATTTATATATAATATCTTTAT                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BI514266             [                                          ATGTGAGTGTATATGGAACCATGAATTTGCTATGCAACGTCTACTTTCTATTTTGCGGCAGAGCCAAAATTACTGCACAGATAATGAATGTTTTGATATGTCACGATTACCAGGACCACGCGATGTTCCATCGTGGAACTTAAATTTTTTCATGATTTTATTAATTATTNNNTTTATTATCCTTATGTATGCTCTTAGACCACAGTCTCTTCGTCATTTAAATAATGATATTGCTAAAGATCAAAACAACGAACGTGATTCGCATGACGATCCTCCAGTACCACCACCGACAATACAATAAAGAATGAAATATGATAAACGCTTTTATGTAGGTTTTTATAAGAAATCTACTGAATTTATGATAATAGAAGAAGTAAAAAAAAATTAATTAATTTGATTTATATATAATATCTTTATGAATATATTTA                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI513059             [                                                                                                                                                                                                                              CCTTATGTATGCTCTTAGACCACAGTCTCTTCGTCATTTAAATAATGATATTGCTAAAGATCAAAACAACGAACGTGATTCGCATGACGATCCTCCAGTACCACCACCGACAATACAATAAAGAATGAAATATGATAAACGCTTTTATGTAGGTTTTTATAAGAAATCTACTGAATTTATGATAATAGAAGAAGTAAAAAAAAATTAATTAATTTGATTTATATATAATATCTTTATGAATATATTTAATCTAACCTAAAAAGAATTGTAATTTTCTTTTTTTTTTTAATAATTTGAAAATTATTATATTTGTACGTGTTAACATTCGCATTCTTCGATTTTTATTTACTAACATTTGTCACATATCGAAGCTATGTGTAAAACAAAAAAAAAATAATTATAATTCAATGAAACTATTTTCATCAAAT]


>consensus_1103#0 AAATATTAAGGATTTCGTGATGGCCGACGAAGGATTTGATCTATGTGAGTGTATATGGAA CCATGAATTTGCTATGCAACGTCTACTTTCTATTTTGCGGCAGAGCCAAAATTACTGCAC AGATAATGAATGTTTTGATATGTCACGATTACCAGGACCACGCGATGTTCCATCGTGGAA CTTAAATTTTTTCATGATTTTATTAATTATTNNNTTTATTATCCTTATGTATGCTCTTAG ACCACAGTCTCTTCGTCATTTAAATAATGATATTGCTAAAGATCAAAACAACGAACGTGA TTCGCATGACGATCCTCCAGTACCACCACCGACAATACAATAAAGAATGAAATATGATAA ACGCTTTTATGTAGGTTTTTATAAGAAATCTACTGAATTTATGATAATAGAAGAAGTAAA AAAAAATTAATTAATTTGATTTATATATAATATCTTTATGAATATATTTAATCTAACCTA AAAAGAATTGTAATTTTCTTTTTTTTTTTAATAATTTGAAAATTATTATATTTGTACGTG TTAACATTCGCATTCTTCGATTTTTATTTACTAACATTTGTCACATATCGAAGCTATGTG TAAAACAAAAAAAAAATAATTATAATTCAATGAAACTATTTTCATCAAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)