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Apis mellifera
cluster # 123 cluster # 123       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_123#0 length = 640 sequences # 7  

consensusID : consensus_123#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 640
fasta sequence
                              [GATCAGCAAAACTAAACTACCGTCAT-TTATTATCAGCCGATCTTTTGCAAGGTCATCGATCCGACAGGATATCAGCGAAGGATGGATAAACAAGCTTTCCGTAAGAAAAATCGAGCCAACAAAAGAGTCTCATTCAAGGATGCTATCAGATAAAGGAGTTATTTACGCTTTGCATACGCACAATATTCGACCTGATTCTATTGATAACTATTTAACTAATTATGAAGAGATTGTTAACATTATAAACTCCAAGAAGTCTGAATTGAAATTGGAACTAGTTGGTTCATGGACTGTCGTAGCTGGTGATATCGATCAAGCTTTACATCTATGGCAATATTCTGGTGGTTATGATAGCGTTGATCATACACAAATTGAATTGTCTAAAGACAAAGCATATCAACAATTATTCAAAGAAAATGGCAATTATTTACGATCACGTTATTTACAGTATTTGTTAGCATTTAGTTATTGGCCTCCTCTTACAAAACGAAATGATTCAAATATATATGAAATACGCAGTTATAGGCTACAACCTGGTACTATGATAGAATGGGGCAACAATTGGGCAAAGGCTATAAATTATAGACGTAACAATAATGAACCTTTTGCTGGTTTTTTTTCACAAATTGGTAGATTATAT]

[+] EMBL BI517053             [GATCAGCAAAACTAAACTACCGTCAT TTATTATCAGCCGATCTTTTGCAAGGTCATCGATCCGACAGGATATCAGCGAAGGATGGATAAACAAGCTTTCCGTAAGAAAAATCGAGCCAACAAAAGAGTCTCATTCAAGGATGCTATCAGATAAAGGAGTTATTTACGCTTTGCATACGCACAATATTCGACCTGATTCTATTGATAACTATTTAACTAATTATGAAGAGATTGTTAACATTATAAACTCCAAGAAGTCTGAATTGAAATTGGAACTAGTTGGTTCATGGACTGTCGTAGCTGGTGATATCGATCAAGCTTTACATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI504200             [            TAAACTACCGTCAT TTATTATCAGCCGATCTTTTGCAAGGTCATCGATCCGACAGGATATCAGCGAAGGATGGATAAACAAGCTTTCCGTAAGAAAAATCGAGCCAACAAAAGAGTCTCATTCAAGGATGCTATCAGATAAAGGAGTTATTTACGCTTTGCATACGCACAATATTCGACCTGATTCTATTGATAACTATTTAACTAATTATGAAGAGATTGTTAACATTATAAACTCCAAGAAGTCTGAATTGAAATTGGAACTAGTTGGTTCATGGACTGTCGTAGCTGGTGATATCGATCAAGCTTTACATCTATGGCAATATTCTGGTGGTTATGATAGCGTTGATCATACACAAATTGAATTGTCTAAAGACAAAGCATATCAACAATTATTCAAAGAAAATGGCAATTATTTACGATCACGTTATTTACAGTATTTGTTAGCATTTAGTTATTGGCCTCCTCTTACAAAACGAAATGATTCAAATATATATGAAATACGCAGTTATAGGCTACAACCTGGTACTATGATAGAATG                                                                                        ]
[+] EMBL BI508008             [            TAAACTACCGTCAT TTATTATCAGCCGATCTTTTGCAAGGTCATCGATCCGACAGGATATCAGCGAAGGATGGATAAACAAGCTTTCCGTAAGAAAAATCGAGCCAACAAAAGAGTCTCATTCAAGGATGCTATCAGATAAAGGAGTTATTTACGCTTTGCATACGCACAATATTCGACCTGATTCTATTGATAACTATTTAACTAATTATGAAGAGATTGTTAACATTATAAACTCCAAGAAGTCTGAATTGAAATTGGAACTAGTTGGTTCATGGACTGTCGTAGNTGGTGATATCGATCAAGCTTTACATCTATGGCAATATTCTGGTGGTTATGATAGCGTTGATCATACACAAATTGAATTGTCTAAAGACAAAGCATATCAACAATTATTCAAAGAAAATGGCAATTATTTACGATCACGTTATTTACAGTATTTGTTAGCATTTAGTTATTGGCCTCCTCTTACAAAAC                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BI509897             [             AAACTACCGTCAT TTATTATCAGCCGATCTTTTGCAAGGTCATCGATCCGACAGGATATCAGCGAAGGATGGATAAACAAGCTTTCCGTAAGAAAAATCGAGCCAACAAAAGAGTCTCATTCAAGGATGCTATCAGATAAAGGAGTTATTTACGCTTTGCATACGCACAATATTCGACCTGATTCTATTGATAACTATTTAACTAATTATGAAGAGATTGTTAACATTATAAACTCCAAGAAGTCTGAATTGAAATTGGAACTAGTTGGTTCATGGACTGTCGTAGCTGGTGATATCGATCAAGCTTTACATCTATGGCAATATTCTGGTGGTTATGATAGCGTTGATCATACACAAATTGAATTGTCTAAAGACAAAGCATATCAACAATTATTCAAAGAAAATGGCAATTATTTACGATCACGTTATTTACAGTATTTGTTAGCATTTAGTTATTGGCCTCCTCTTACAAAACGAAATGATTCAAATATATATGAAATACGCAGTTATAGGCTACAACCTGGTACTATGATAGAATGGGGCAACAATTGGGCAAAGGCTATAAATTATAGACGTAACAATAATGAACCTTTTGCTGGTTTTTTTTCACAAATTGGTAGATTATAT]
[+] EMBL BI503133             [                aTAGCCACATCGTATGTGTTGTAGATCTTTTGCAAGGTCATCGATCCGACAGGATATCAGCGAAGGATGGATAAACAAGCTTTCCGTAAGAAAAATCGAGCCAACAAAAGAGTCTCATTCAAGGATGCTATCAGATAAAGGAGTTATTTACGCTTTGCATACGCACAATATTCGACCTGATTCTATTGATAACTATTTAACTAATTATGAAGAGATTGTTAACATTATAAACTCCAAGAAGTCTGAATTGAAATTGGAACTAGTTGGTTCATGGACTGTCGTAGCTGGTGATATCGATCAAGCTTTACATCTATGGCAATATTCTGGTGGTTATGATAGCGTTGATCATACACAAATTGAATTGTCTAAAGACAAAGCATATCAACAATTATTCAAAGAAAATGGCAATTATTTACGATCACGTTATTTACAGTATTTGTTAGCATTTAGTTATTGGCCTCCTCTTACAAAACGAAATGATTCAAATATATATGAAATACGCAGTTATAGGCTACAACCTGGTACTATGATAGAATGGGGCAACAATTGGGCAAAGGCTATAAATTATAGACGTAACAATAATGAACCTTTTGCTGGTTTTTTTTCACAA               ]
[+] EMBL BI503849             [                  ACCGTCAT TTATTATCAGCCGATCTTTTGCAAGGTCATCGATCCGACAGGATATCAGCGAAGGATGGATAAACAAGCTTTCCGTAAGAAAAATCGAGCCAACAAAAGAGTCTCATTCAAGGATGCTATCAGATAAAGGAGTTATTTACGCTTTGCATACGCACAATATTCGACCTGATTCTATTGATAACTATTTAACTAATTATGAAGAGATTGTTAACATTATAAACTCCAAGAAGTCTGAATTGAAATTGGAACTAGTTGGTTCATGGACTGTCGTAGCTGGTGATATCGATCAAGCTTTACATCTATGGCAATATTCTGGTGGTTATGATAGCGTTGATCATACACAAATTGAATTGTCTAAAGACAAAGCATATCAACAATTATTCAAAGAAAATGGCAATTATTTACGATCACGTTATTTACAGTATTTGTTAGCATTTAGTTATTGGCCTCCTCTTACAAAACGAAATGATTCAAATATATATGAAATACGCAGTTATAGGCTACAACCTGGTACTATGATAGAATGGGGCAACAATTGGGCAAAGGCTATAAATTATAGACGTAACAATAATGAACCTTTTGCTGGTTTTTTTTCACAAA              ]
[+] EMBL BI508163             [                                                       ATCGATCCGACAGGATATCAGCGAAGGATGGATAAACAAGCTTTCCGTAAGAAAAATCGAGCCAACAAAAGAGTCTCATTCAAGGATGCTATCAGATAAAGGAGTTATTTACGCTTTGCATACGCACAATATTCGACCTGATTCTATTGATAACTATTTAACTAATTATGAAGAGATTGTTAACATTATAAACTCCAAGAAGTCTGAATTGAAATTGGAATTAGTTGGTTCATGGACTGTCGTAGCTGGTGATATCGATCAAGCTTTACATCTATGGCAATATTCTGGTGGTTATGATAGCGTTGATCATACACAAATTGAATTGTCTAAAGACAAAGCATATCAACAATTATTCAAAGAAAATGGCAATTATTTACGATCACGTTATTTACAGTATTTGTTAGCATTTAGTTATTGGCCTCCTCTTACAAAACGAAATGATTCAAATATATATGAAATACGCAGTTATAGGCTACAACCTGGTACTATGATAGAATGGGGCAACAATTGGGCAAAGGCTATAAATTATAGACGTAACAATAATGAACCTTTTGCTGGTTTTTTTTCACAAATTGGTAGATTATAT]


>consensus_123#0 GATCAGCAAAACTAAACTACCGTCATTTATTATCAGCCGATCTTTTGCAAGGTCATCGAT CCGACAGGATATCAGCGAAGGATGGATAAACAAGCTTTCCGTAAGAAAAATCGAGCCAAC AAAAGAGTCTCATTCAAGGATGCTATCAGATAAAGGAGTTATTTACGCTTTGCATACGCA CAATATTCGACCTGATTCTATTGATAACTATTTAACTAATTATGAAGAGATTGTTAACAT TATAAACTCCAAGAAGTCTGAATTGAAATTGGAACTAGTTGGTTCATGGACTGTCGTAGC TGGTGATATCGATCAAGCTTTACATCTATGGCAATATTCTGGTGGTTATGATAGCGTTGA TCATACACAAATTGAATTGTCTAAAGACAAAGCATATCAACAATTATTCAAAGAAAATGG CAATTATTTACGATCACGTTATTTACAGTATTTGTTAGCATTTAGTTATTGGCCTCCTCT TACAAAACGAAATGATTCAAATATATATGAAATACGCAGTTATAGGCTACAACCTGGTAC TATGATAGAATGGGGCAACAATTGGGCAAAGGCTATAAATTATAGACGTAACAATAATGA ACCTTTTGCTGGTTTTTTTTCACAAATTGGTAGATTATAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)