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Apis mellifera
cluster # 1239 cluster # 1239       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1239#0 length = 834 sequences # 2  

consensusID : consensus_1239#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 834
fasta sequence
                              [TACCACTACTACTACTACTGAACATGACAAAATACCACACTGCCTGGAGAGAGGCTAGCCCAGTCCCTCGAGGTGAAGGAGTTACTGATGAGTTTTGGACAACTAAGAGCATTCAATCTAGTAAAGGATTCAGCTACAGGTCTATCCAAGGGTTATGCATTCTGCGAATACGTTGATGTATCAATGACTGATCAAGCAATTGCTGGATTAAATGGAATGCAGTTAGGAGACAAGAAACTGATTGTTCAACGAGCTAGTGTTGGTGCCAAGAATCCTATGATTGGTGCACAAGCTCCAGTCCAAATTCAGGTGCCTGGACTATCAATGGTGGGCACAAGTGGACCTGCTACTGAGGTTCTTTGTTTGCTAAATATGGTAACACCAGAAGAATTAATGGAAGAAGAAGAATATGAAGATATTTTAGAAGACATCAAAGAAGAATGTAATAAATATGGCGTGGTTCGATCTGTGGAAATACCCAGACCTATAGAAGGAGTTGATGTACCTGGATGTGGGAAAGTATTTGTCGAATTTAATAGCGTGATTGATTGTCAGAAAGCACAGCAGACTTTAACAGGACGAAAATTCAATAATCGCGTTGTTGTAACATCGTATTTTGATCCTGACAAATATCATCGCAGAGAATTTTAAAAAATAGGTTTTCTTTCTTTCATACTAATTACTAATTGACTCCAGTGTATAATATATATATTAAACGAATAATATATTTAATGAGTCCAAAAATTAATAATTCTCTTTTATCAAAATGTACAAAATGAAATGTAATTGATTTTCAATCATACATGCATTAAATGGTAATTGTAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL BI508614             [TACCACTACTACTACTACTGAACATGACAAAATACCACACTGCCTGGAGAGAGGCTAGCCCAGTCCCTCGAGGTGAAGGAGTTACTGATGAGTTTTGGACAACTAAGAGCATTCAATCTAGTAAAGGATTCAGCTACAGGTCTATCCAAGGGTTATGCATTCTGCGAATACGTTGATGTATCAATGACTGATCAAGCAATTGCTGGATTAAATGGAATGCAGTTAGGAGACAAGAAACTGATTGTTCAACGAGCTAGTGTTGGTGCCAAGAATCCTATGATTGGTGCACAAGCTCCAGTCCAAATTCAGGTGCCTGGACTATCAATGGTGGGCACAAGTGGACCTGCTACTGAGGTTCTTTGTTTGCTAAATATGGTAACACCAGAAGAATTAATGGAAGAAGAAGAATATGAAGATATTTTAGAAGACATCAAAGAAGAATGTAATAAATATGGCGTGGTTCGATCTGTGGAAATACCCAGACCTATAGAAGGAGTTGATGTACCTGGATGTGGGAAAGTATTTGTCGAATTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL BI507913             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTAATAAATATGGCGTGGTTCGATCTGTGGAAATACCCAGACCTATAGAAGGAGTTGATGTACCTGGATGTGGGAAAGTATTTGTCGAATTTAATAGCGTGATTGATTGTCAGAAAGCACAGCAGACTTTAACAGGACGAAAATTCAATAATCGCGTTGTTGTAACATCGTATTTTGATCCTGACAAATATCATCGCAGAGAATTTTAAAAAATAGGTTTTCTTTCTTTCATACTAATTACTAATTGACTCCAGTGTATAATATATATATTAAACGAATAATATATTTAATGAGTCCAAAAATTAATAATTCTCTTTTATCAAAATGTACAAAATGAAATGTAATTGATTTTCAATCATACATGCATTAAATGGTAATTGTAAAAAAAAAAA]


>consensus_1239#0 TACCACTACTACTACTACTGAACATGACAAAATACCACACTGCCTGGAGAGAGGCTAGCC CAGTCCCTCGAGGTGAAGGAGTTACTGATGAGTTTTGGACAACTAAGAGCATTCAATCTA GTAAAGGATTCAGCTACAGGTCTATCCAAGGGTTATGCATTCTGCGAATACGTTGATGTA TCAATGACTGATCAAGCAATTGCTGGATTAAATGGAATGCAGTTAGGAGACAAGAAACTG ATTGTTCAACGAGCTAGTGTTGGTGCCAAGAATCCTATGATTGGTGCACAAGCTCCAGTC CAAATTCAGGTGCCTGGACTATCAATGGTGGGCACAAGTGGACCTGCTACTGAGGTTCTT TGTTTGCTAAATATGGTAACACCAGAAGAATTAATGGAAGAAGAAGAATATGAAGATATT TTAGAAGACATCAAAGAAGAATGTAATAAATATGGCGTGGTTCGATCTGTGGAAATACCC AGACCTATAGAAGGAGTTGATGTACCTGGATGTGGGAAAGTATTTGTCGAATTTAATAGC GTGATTGATTGTCAGAAAGCACAGCAGACTTTAACAGGACGAAAATTCAATAATCGCGTT GTTGTAACATCGTATTTTGATCCTGACAAATATCATCGCAGAGAATTTTAAAAAATAGGT TTTCTTTCTTTCATACTAATTACTAATTGACTCCAGTGTATAATATATATATTAAACGAA TAATATATTTAATGAGTCCAAAAATTAATAATTCTCTTTTATCAAAATGTACAAAATGAA ATGTAATTGATTTTCAATCATACATGCATTAAATGGTAATTGTAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)