Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 1550 cluster # 1550       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1550#0 length = 665 sequences # 2  
consensusID : consensus_1550#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 665
fasta sequence 
                              [TTAAGGTATAATATTTTTTTAACTGGATCCTTCAATTTCCATTATCTATCCATTATTGTGATTATTAACTTGAATATGAATTTTCATTCCATTAAGGTTTAGTGAAAATTTTCCAAGTTTTAGTAATGAATTTTTAATTTAACCTATAATATTTGTTTAACTGGACAAGAAGGCCCCTTCAATTTTCATTATCTGTCCATCATTGTGATTATTAACTTGTATATGAATTTCCATCATTAGGATTTAGTGAAAATTTTCCAAGTTTTAAATTTTTAACTTTTTAAGCTATGTTTGTTTAAGTGGACCAGAAGGCCCCTTCAATTTCCATTATTTGTCCATCATTGTGATTATTAAATTATATATGAATTTCCATCATTAAGGTTTAGTGAAAATCTTCCAAATTTTAGTAATGAATTTTTAACTTTTTAAGGTATAATATTTTTTTAACTGGATCCTTCAATTTCCATTATCTCTCAATCATTGTGATTATTAACTTGCATATGAATTTTCATTCCATTAAGGTTTAATGAAAATTTTCCAAGTTTTAGTAATGAATTTTTAATTTAACCTATAATATTTAACTGAAAGCTTCTTTAATTTCCATTATCTGTCCATCATTGAAATTATTAAATTGTATATGAATTTTCATCATTAGGTTTTAATGA]

[+] EMBL BI510457             [TTAAGGTATAATATTTTTTTAACTGGATCCTTCAATTTCCATTATCTATCCATTATTGTGATTATTAACTTGAATATGAATTTTCATTCCATTAAGGTTTAGTGAAAATTTTCCAAGTTTTAGTAATGAATTTTTAATTTAACCTATAATATTTGTTTAACTGGACAAGAAGGCCCCTTCAATTTTCATTATCTGTCCATCATTGTGATTATTAACTTGTATATGAATTTCCATCATTAGGATTTAGTGAAAATTTTCCAAGTTTTAAATTTTTAACTTTTTAAGCTATGTTTGTTTAAGTGGACCAGAAGGCCCCTTCAATTTCCATTATTTGTCCATCATTGTGATTATTAAATTATATATGAATTTCCATCATTAAGGTTTAGTGAAAATCTTCCAAATTTTAGTAATGAATTTTTAACTTTTTAAGGTATAATATTTTTTTAACTGGATCCTTCAATTTCCATTATCTCTCAATCATTGTGATTATTAACTTGCATATGAATTTTCATTCCATTAAGGTTTAATGAAAATTTTCCAAGTTTTAGTAATGAATTTTTAATTTAACCTATAATATTTAACTGAAAGCTTCTTTAATTTCCATTATCTGTCCATCATTGAAATTATTAAATTGTATATGAATTTTCATCATTAGGTTTTAATGA]
[+] EMBL BI509784             [TTAAGGTATAATATTTTTTTAACTGGATCCTTCAATTTCCATTATCTATCCATTATTGTGATTATTAACTTGAATATGAATTTTCATTCCATTAAGGTTTAGTGAAAATTTTCCAAGTTTTAGTAATGAATTTTTAATTTAACCTATAATATTTGTTTAACTGGACAAGAAGGCCCCTTCAATTTTCATTATCTGTCCATCATTGTGATTATTAACTTGTATATGAATTTCCATCATTAGGATTTAGTGAAAATTTTCCAAGTTTTAAATTTTTAACTTTTTAAGCTATGTTTGTTTAAGTGGACCAGAAGGCCCCTTCAATTTCCATTATTTGTCCATCATTGTGATTATTAAATTATATATGAATTTCCATCATTAAGGTTTAGTGAAAATCTTCCAAATTTTAGTAATGAATTTTTAACTTTTTAAGGTATAATATTTTTTTAACTGGATCCTTCAATTTCCATTATCTCTCAATCATTGTGATTATTAACTTGCATATGAATTTTCATTCCATTAAGGTTTAATGAAAATTTTCCAAGTTTTAGTAATGAATTTTTAATTTAACCTATAATATTTAACTGAAAGCTTCTTTAATTTCCATTATCTGTCCATCATTGAAATTATTAAATTGTA                             ]




>consensus_1550#0
TTAAGGTATAATATTTTTTTAACTGGATCCTTCAATTTCCATTATCTATCCATTATTGTG
ATTATTAACTTGAATATGAATTTTCATTCCATTAAGGTTTAGTGAAAATTTTCCAAGTTT
TAGTAATGAATTTTTAATTTAACCTATAATATTTGTTTAACTGGACAAGAAGGCCCCTTC
AATTTTCATTATCTGTCCATCATTGTGATTATTAACTTGTATATGAATTTCCATCATTAG
GATTTAGTGAAAATTTTCCAAGTTTTAAATTTTTAACTTTTTAAGCTATGTTTGTTTAAG
TGGACCAGAAGGCCCCTTCAATTTCCATTATTTGTCCATCATTGTGATTATTAAATTATA
TATGAATTTCCATCATTAAGGTTTAGTGAAAATCTTCCAAATTTTAGTAATGAATTTTTA
ACTTTTTAAGGTATAATATTTTTTTAACTGGATCCTTCAATTTCCATTATCTCTCAATCA
TTGTGATTATTAACTTGCATATGAATTTTCATTCCATTAAGGTTTAATGAAAATTTTCCA
AGTTTTAGTAATGAATTTTTAATTTAACCTATAATATTTAACTGAAAGCTTCTTTAATTT
CCATTATCTGTCCATCATTGAAATTATTAAATTGTATATGAATTTTCATCATTAGGTTTT
AATGA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)