Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 2708 cluster # 2708       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2708#0 length = 628 sequences # 2  
consensusID : consensus_2708#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 628
fasta sequence 
                              [ATTCTTACAGCCACATGTACAATACCAATTTGGTGAAATATTAATAGTAGCTCTGGAATGAAGTAAAAATTCTTTACGCTTTGACCAAGTGCATACCTTACAAAATCATCACGGTACGAAGATCATAGACGATGATTTTTCATTGTATATAATTATGTATATACAATATGCAAGACTTTTGGTAAAACTATTTATGTTTGTTTGAAGTTAATATATTTGTTAATCTAGGTCGACGGTAATAATTCAGGCGGAATATAAATTGCGCTCAACGTAGCAAAGAGTATACACGTTAATTAATTTATTTCGCGGACGAGGTTCCCGTACACCAAATGTTCAATGGCACGGAGAGTTTCTATGAATTCTTATTGTATGTTATTTTAAATCTCTGAAAATGATGTGGCCACCTATCATGTTAATTNNTAAAATGCAAAATTTACTCTCAAACAGTTTATGCAGAATAATAAAACGGAAAAATTTAGTTTCGNNNTAAATATGTTTTACTGATAGTTTCTATTTGATATATTAATATTATCGATCAAGTATTTGTAAAAAAGATTAGAGTAAATCTTGTTTTTTTTTTTTAATGAGAATATAAGTAAGTACTTAAATTCGGAATACATGTATCTCT]

[+] EMBL BI508818             [ATTCTTACAGCCACATGTACAATACCAATTTGGTGAAATATTAATAGTAGCTCTGGAATGAAGTAAAAATTCTTTACGCTTTGACCAAGTGCATACCTTACAAAATCATCACGGTACGAAGATCATAGACGATGATTTTTCATTGTATATAATTATGTATATACAATATGCAAGACTTTTGGTAAAACTATTTATGTTTGTTTGAAGTTAATATATTTGTTAATCTAGGTCGACGGTAATAATTCAGGCGGAATATAAATTGCGCTCAACGTAGCAAAGAGTATACACGTTAATTAATTTATTTCGCGGACGAGGTTCCCGTACACCAAATGTTCAATGGCACGGAGAGTTTCTATGAATTCTTATTGTATGTTATTTTAAATCTCTGAAAATGATGTGGCCACCTATCATGTTAATTGTTAAAATGCAAAATTTACTCTCAAACAGTTTATGCAGAATAATAAAACGGAAAAATTTAGTTTCGGTGTAAATATGTTTTACTGATAGTTTCTATTTGATATATTAATATTATCGATCAAGTATTTGTAAAAAAGATTAGAGTAAATCTTGTTTTTTTTTTTTAATGAGAATATAAGTAAGTACTTAAATTCGGAATACATGTATCTCT]
[+] EMBL BI514816             [ATTCTTACAGCCACATGTACAATACCAATTTGGTGAAATATTAATAGTAGCTCTGGAATGAAGTAAAAATTCTTTACGCTTTGACCAAGTGCATACCTTACAAAATCATCACGGTACGAAGATCATAGACGATGATTTTTCATTGTATATAATTATGTATATACAATATGCAAGACTTTTGGTAAAACTATTTATGTTTGTTTGAAGTTAATATATTTGTTAATCTAGGTCGACGGTAATAATTCAGGCGGAATATAAATTGCGCTCAACGTAGCAAAGAGTATACACGTTAATTAATTTATTTCGCGGACGAGGTTCCCGTACACTAAATGTTCAATGGCACGGAGAGTTTCTATGAATTCTTATTGTATGTTATTTTAAATCTCTGAAAATGATGTGGCCACCTATCATGTTAATTNNTAAAATGCAAAATTTACTCTCAAACAGTTTATGCAGAATAATAAAACGGAAAAATTTAGTTTCGNNNTAAATATGTTTTACTGATAGTTTCTATTTGATATATTAATATTATCGATCAAGTATTTGTAAAAA                                                                            ]




>consensus_2708#0
ATTCTTACAGCCACATGTACAATACCAATTTGGTGAAATATTAATAGTAGCTCTGGAATG
AAGTAAAAATTCTTTACGCTTTGACCAAGTGCATACCTTACAAAATCATCACGGTACGAA
GATCATAGACGATGATTTTTCATTGTATATAATTATGTATATACAATATGCAAGACTTTT
GGTAAAACTATTTATGTTTGTTTGAAGTTAATATATTTGTTAATCTAGGTCGACGGTAAT
AATTCAGGCGGAATATAAATTGCGCTCAACGTAGCAAAGAGTATACACGTTAATTAATTT
ATTTCGCGGACGAGGTTCCCGTACACCAAATGTTCAATGGCACGGAGAGTTTCTATGAAT
TCTTATTGTATGTTATTTTAAATCTCTGAAAATGATGTGGCCACCTATCATGTTAATTNN
TAAAATGCAAAATTTACTCTCAAACAGTTTATGCAGAATAATAAAACGGAAAAATTTAGT
TTCGNNNTAAATATGTTTTACTGATAGTTTCTATTTGATATATTAATATTATCGATCAAG
TATTTGTAAAAAAGATTAGAGTAAATCTTGTTTTTTTTTTTTAATGAGAATATAAGTAAG
TACTTAAATTCGGAATACATGTATCTCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)