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Apis mellifera
cluster # 33 cluster # 33       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_33#0 length = 1073 sequences # 11  

consensusID : consensus_33#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 1073
fasta sequence
                              [CATATATAATATTTTATTTTTTGTTTTTTTTATGGGAATATAATTAACATAGATAAATATTAATATATTTAATTATAATCGTTCTAATAAATTTATAAGTGAATTATTGCAACGATCATATTTCGAGTGTTTCATTAAATCACGATTTACGAAAATTCAATTTGTGATAAAATTATCGTGTTTTATTTTCATAGTGATAAGTTTATTGTTTCCTGTATTTGAAATGGCCTGGTTTGCGAGATTTAATGGAAGAACTAATCAAGATCTTGTAGAATATCTTAGGACATCAAGAATAATTAAAACTGAAAGAGTTTATGAAGCAATGTCTGCTGTAGATAGGGGACATTATGTTCGTTCTGGATATGCATATTTTGATGCTCCACAACAGATTGGTTATGGTGCAACTATAAGTGCTCCTCATATGCATGCATATGCATTGGAAATACTTGAAGAAAAGTTATTTAATGGTGCAAGAGCATTAGATGTGGGTTCTGGTTCTGGATATTTAACAGCATGTATGGCATTGATGACAGGATCAAATGGATTGGTTGTGGGAATTGAACATATTCCTGAATTAAATTTATTTGCTATAGAAAACATTAAGAAGGATAATCCAGAACTTGTTGAATATGGTCGTGTTCAATTTGTTGATGGAGATGGAAGATTAGGATATCCACAACTAGCACCATATGATGCTATTCATGTAGGAGCTGCTGCTAAAGAATTGCCACATGCGTTAATTGATCAATTAGCTCTTGGAGGACGTATGGTATTACCAGTAGGTTCAGGAATAGCAGATCAAATGTTAATACAGGTTGACAAAACACATGATGGGAGCATTACACAAAAGCCTCTTACAGGTGTAGCTTTTGTTCCACTAACTAGTAGAGATAATCAATATTATATTTCATGAAATAGATGTGTGCTCCAATAAGTGAGTAATTTTTTTCTGAATTAAATTTAAAATAGTAATTTAAAATTTATAGTTTTAGTTATATTTATTCTAATATATGCACAAAATGACAAATTATATTAAATAAAATTTAAATTATATTTATTATGTGTATAAATAA]

[+] EMBL BI514333             [CATATATAATATTTTATTTTTTGTTTTTTTTATGGGAATATAATTAACATAGATAAATATTAATATATTTAATTATAATCGTTCTAATAAATTTATAAGTGAATTATTGCAACGATCATATTTCGAGTGTTTCATTAAATCACGATTTACGAAAATTCAATTTGTGATAAAATTATCGTGTTTTATTTTCATAGTGATAAGTTTATTGTTTCCTGTATTTGAAATGGCCTGGTTTGCGAGATTTAATGGAAGAACTAATCAAGATCTTGTAGAATATCTTAGGACATCAAGAATAATTAAAACTGAAAGAGTTTATGAAGCAATGTCTGCTGTAGATAGGGGACATTATGTTCGTTCTGGATATGCATATTTTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI515161             [                                               CATAGATAAATATTAATATATTTAATTATAATCGTTCTAATAAATTTATAAGTGAATTATTGCAACGATCATATTTCGAGTGTTTCATTAAATCACGATTTACGAAAATTCAATTTGTGATAAAATTATCGTGTTTTATTTTCATAGTGATAAGTTTATTGTTTCCTGTATTTGAAATGGCCTGGTTTGCGAGATTTAATGGAAGAACTAATCAAGATCTTGTAGAATATCTTAGGACATCAAGAATAATTAAAACTGAAAGAGTTTATGAAGCAATGTCTGCTGTAGATAGGGGACATTATGTTCGTTCTGGATATGCATATTTTGATGCTCCACAACAGATTGGTTATGGTGCAACTATAAGTGCTCCTCATATGCATGCATATGCATTGGAAATACTTGAAGAAAAGTTATTTAATGGTGCAAGAGCATTAGATGTGGGTTCTGGTTCTGGTTATTTAACAGCATGTATGGCATTGATGACAGGATCAAATGGATTGGTTGTGGGAATTGAACATATTCCTGAATTAAATTTATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI503938             [                                                                                                                                                                                                     TAAGTTTATTGTTTCCTGTATTTGAAATGGCCTGGTTTGCGAGATTTAATGGAAGAACTAATCAAGATCTTGTAGAATATCTTAGGACATCAAGAATAATTAAAACTGAAAGAGTTTATGAAGCAATGTCTGCTGTAGATAGGGGACATTATGTTCGTTCTGGATATGCATATTTTGATGCTCCACAACAGATTGGTTATGGTGCAACTATAAGTGCTCCTCATATGCATGCATATGCATTGGAAATACTTGAAGAAAAGTTATTTAATGGTGCAAGAGCATTAGATGTGGGTTCTGGTTCTGGATATTTAACAGCATGTATGGCATTGATGACAGGATCAAATGGATTGGTTGTGGGAATTGAACATATTCCTGAATTAAATTTATTTGCTATAGAAAACATTAAGAAGGATAATCCAGAACTTGTTGAATATGGTCGTGTTCAATTTGTTGATGGAGATGGAAGATTAGGATATCCACAACTAGCACCATATGATGCTATTCATGTAGGAGCTGCTGCTAAAGAATTGCCACATGCGTTAATTGATCAATTAGCTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BI516227             [                                                                                                                                                                                                      tttTTTTTTTTTTTTTGGNTTTGAAATGGCCTGGTTTGCGAGATTTAATGGAAGAACTAATCAAGATCTTGTAGAATATCTTAGGACATCAAGAATAATTAAAACTGAAAGAGTTTATGAAGCAATGTCTGCTGTAGATAGGGGACATTATGTTCGTTCTGGATATGCATATTTTGATGCTCCACAACAGATTGGTTATGGTGCAACTATAAGTGCTCCTCATATGCATGCATATGCATTGGAAATACTTGAAGAAAAGTTATTTAATGGTGCAAGAGCATTNNNTGTGGGTTCTGGTTCTGGATATTTAACAGCATGTATGGCATTGATGACAGGATCAAATGGATTGGTTGTGGGAATTGAACATATTCCTGAATTAAATTTATTTGCTATAGAAAACATTAAGAAGGATAATCCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BI502747             [                                                                                                                                                                                                         TTTATTGTTTCCTGTATTTGAAATGGCCTGGTTTGCGAGATTTAATGGAAGAACTAATCAAGATCTTGTAGAATATCTTAGGACATCAAGAATAATTAAAACTGAAAGAGTTTATGAAGCAATGTCTGCTGTAGATAGGGGACATTATGTTCGTTCTGGATATGCATATTTTGATGCTCCACAACAGATTGGTTATGGTGCAACTATAAGTGCTCCTCATATGCATGCATATGCATTGGAAATACTTGAAGAAAAGTTATTTAATGGTGCAAGAGCATTAGATGTGGGTTCTGGTTCTGGATATTTAACAGCATGTATGGCATTGATGACAGGATCAAATGGATTGGTTGTGGGAATTGAACATATTCCTGAATTAAATTTATTTGCTATAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BI514578             [                                                                                                                                                                                                           TTTTTTTTCCTGTATTTGAAATGGCCTGGTTTGCGAGATTTAATGGAAGAACTAATCAAGATCTTGTAGAATATCTTAGGACATCAAGAATAATTAAAACTGAAAGAGTTTATGAAGCAATGTCTGCTGTNNNTAGGGGACATTATGTTCGTTCTGGATATGCATATTTTGATGCTCCACAACAGATTGGTTATGNNNCAACTATAAGTGCTCCTCATATGCATGCATATGCATTGGAAATACTTGAAGAAAAGTTATTTAATGGTGCAAGAGCATTNNNTGTGGGTTCTGGTTCTGGATATTTAACAGCATGTATGGCATTGATGACAGGATCAAATGGATTGGTTGTGGGAATTGAACATATTCCTGAATTAAATTTATTTGCTATAGAAAACATTAAGAAGGATAATCCAGAACTTGTTGAATATGGTCNNNTTCAATTTGTTGATGGAGATGGAAGATTAGGATATCCACAACTAGCACCATATGATGCTATTCATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BI516811             [                                                                                                                                                                                                                                TGGCCTGGTTTGCGAGATTTAATGGAAGAACTAATCAAGATCTTGTAGAATATCTTNNGACATCAAGAATAATTAAAACTGAAAGAGTTTATGAAGCAATGTCTGCTGTAGATAGGGGACATTATGTTCGTTCTGGATATGCATATTTTGATGCTCCACAACAGATTGGTTATGGTGCAACTATAAGTGCTCCTCATATGCATGCATATGCATTGGAAATACTTGAAGAAAAGTTATTTAATGGTGCAAGAGCATTAGATGTGGGTTCTGGTTCTGGATATTTAACAGCATGTATGGCATTGATGACAGGATCAAATGGATTGGTTGTGGGAATTGAACATATTCCTGAATTAAATTTATTTGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI512455             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGAAAGAGTTTATGAAGCAATGTCTGCTGTAGATAGGGGACATTATGTTCGTTCTGGATATGCATATTTTGATGCTCCACAACAGATTGGTTATGGTGCAACTATAAGTGCTCCTCATATGCATGCATATGCATTGGAAATACTTGAAGAAAAGTTATTTAATGGTGCAAGAGCATTAGATGTGGGTTCTGGTTCTGGATATTTAACAGCATGTATGGCATTGATGACAGGATCAAATGGATTGGTTGTGGGAATTGAACATATTCCTGAATTAAATTTATTTGCTATAGAAAACATTAAGAAGGATAATCCAGAACTTGTTGAATATGGTCGTGTTCAATTTGTTGATGGAGATGGAAGATTAGGATATCCACAACTAGCACCATATGATGCTATTCATGTAGGAGCTGCTGCTAAAGAATTGCCACATGCGTTAATTGATCAATTAGCTCTTGGAGGACGTATGGTATTACCAGTAGGTTCAGGAATAGCAGATCAAATGTTAATACAGGTTGACAAAACACATGATGGGAGCATTACA                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BI515917             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AGATAGGGGACATTATGTTCGTTCTGGATATGCATATTTTGATGCTCCACAACAGATTGGTTATGGTGCAACTATAAGTGCTCCTCATATGCATGCATATGCATTGGAAATACTTGAAGAAAAGTTATTTAATGGTGCAAGAGCATTAGATGTGGGTTCTGGTTCTGGATATTTAACAGCATGTATGGCATTGATGACAGGATCAAATGGATTGGTTGTGGGAATTGAACATATTCCTGAATTAAATTTATTTGCTATAGAAAACATTAAGAAGGATAATCCAGAACTTGTTGAATATGGTCGTGTTCAATTTGTTGATGGAGATGGAAGATTAGGATATCCACAACTAGCACCATATGATGCTATTCATGTAGGAGCTGCTGCTAAAGAATTGCCACATGCGTTAATTGATCAATTAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BI516864             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GATGCTCCACAACAGATTGGTNATGGTGCAACTATAAGTGCTCCTCATATGCATGCATATGCATTGGAAATACTTGAAGAAAAGTTATTTAATGGTGCAAGAGCATTAGATGTGGGTTCTGGTTCTGGTTATTTAACAGCATGTATGGCATTGATGACAGGATCAAATGGATTGGTTGTGGGAATTGAACATATTCCTGAATTAAATTTATTTGCTATAGAAAACATTAAGAAGGATAATCCAGAACTTGTTGAATATGGTCGTGTTCAATTTGTTGATGGAGATGGAAGATTAGGATATCCACAACTAGCACCATATGATGCTATTCATGTAGGAGCTGCTGCTAAAGAATTGCCACATGCGTTAATTGATCAATTAGCTCTTGGAGGACGTATGGTATTACCAGTAGGTTCAGGAATAGCAGATCAAATGTTAATACAGGTTGACAAAACACATGATGGGAGCATTACACAAAAGCCTCTTACAGGTGTAGCTTTTGTTCCACTAACTAGTAGAGATAATCAATATTATATTTC                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI506820             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGTTATTTAATGGTGCAAGAGCATTAGATGTGGGTTCTGGTTCTGGATATTTAACAGCATGTATGGCATTGATGACAGGATCAAATGGATTGGTTGTGGGAATTGAACATATTCCTGAATTAAATTTATTTGCTATAGAAAACATTAAGAAGGATAATCCAGAACTTGTTGAATATGGTCGTGTTCAATTTGTTGATGGAGATGGAAGATTAGGATATCCACAACTAGCACCATATGATGCTATTCATGTAGGAGCTGCTGCTAAAGAATTGCCACATGCGTTAATTGATCAATTAGCTCTTGGAGGACGTATGGTATTACCAGTAGGTTCAGGAATAGCAGATCAAATGTTAATACAGGTTGACAAAACACATGATGGGAGCATTACACAAAAGCCTCTTACAGGTGTAGCTTTTGTTCCACTAACTAGTAGAGATAATCAATATTATATTTCATGAAATAGATGTGTGCTCCAATAAGTGAGTAATTTTTTTCTGAATTAAATTTAAAATAGTAATTTAAAATTTATAGTTTTAGTTATATTTATTCTAATATATGCACAAAATGACAAATTATATTAAATAAAATTTAAATTATATTTATTATGTGTATAAATAA]


>consensus_33#0 CATATATAATATTTTATTTTTTGTTTTTTTTATGGGAATATAATTAACATAGATAAATAT TAATATATTTAATTATAATCGTTCTAATAAATTTATAAGTGAATTATTGCAACGATCATA TTTCGAGTGTTTCATTAAATCACGATTTACGAAAATTCAATTTGTGATAAAATTATCGTG TTTTATTTTCATAGTGATAAGTTTATTGTTTCCTGTATTTGAAATGGCCTGGTTTGCGAG ATTTAATGGAAGAACTAATCAAGATCTTGTAGAATATCTTAGGACATCAAGAATAATTAA AACTGAAAGAGTTTATGAAGCAATGTCTGCTGTAGATAGGGGACATTATGTTCGTTCTGG ATATGCATATTTTGATGCTCCACAACAGATTGGTTATGGTGCAACTATAAGTGCTCCTCA TATGCATGCATATGCATTGGAAATACTTGAAGAAAAGTTATTTAATGGTGCAAGAGCATT AGATGTGGGTTCTGGTTCTGGATATTTAACAGCATGTATGGCATTGATGACAGGATCAAA TGGATTGGTTGTGGGAATTGAACATATTCCTGAATTAAATTTATTTGCTATAGAAAACAT TAAGAAGGATAATCCAGAACTTGTTGAATATGGTCGTGTTCAATTTGTTGATGGAGATGG AAGATTAGGATATCCACAACTAGCACCATATGATGCTATTCATGTAGGAGCTGCTGCTAA AGAATTGCCACATGCGTTAATTGATCAATTAGCTCTTGGAGGACGTATGGTATTACCAGT AGGTTCAGGAATAGCAGATCAAATGTTAATACAGGTTGACAAAACACATGATGGGAGCAT TACACAAAAGCCTCTTACAGGTGTAGCTTTTGTTCCACTAACTAGTAGAGATAATCAATA TTATATTTCATGAAATAGATGTGTGCTCCAATAAGTGAGTAATTTTTTTCTGAATTAAAT TTAAAATAGTAATTTAAAATTTATAGTTTTAGTTATATTTATTCTAATATATGCACAAAA TGACAAATTATATTAAATAAAATTTAAATTATATTTATTATGTGTATAAATAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)