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Apis mellifera
cluster # 409 cluster # 409       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_409#0 length = 943 sequences # 4  
consensusID : consensus_409#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 943
fasta sequence 
                              [CAGGATTGCAATTTATTATTGCACTGCCAAGTTTTGATGGCACTGTGTTCGTTACTGAAACTTCGTTTGATGTTGTATTATGATTATTAAAATTTACAGTTTTTTGTTCTTGTTGCGTTAAATTTTCACGCATTTTTTCAATATCTTGTACATATTTAATAACTTGTATATTTTCATTAATAGCTTCTTCTTGAGCTTCGGCTTTTTTTCTTTCTGTTGAATTTTTCATTTTTGTCAAAGTTGGTGAAAGTGGTTTTTCAAAACTTAAGTTCAAAATATGATTCGAATGGGTAAAATTATGTTGTCTTGTTTTTCTATCAGAGTGTTGTAATTCATCTAAGCTAGGATAATAATCTTGAGGAATTTTATCTGGTTCCGAGGGCGTCTTAGGTGGCACACTAGGCCATGAAGATGGATTTAACATATTTGGAACTATTGTAGACATATTTAACACTGAATTGTGAGTCATATTAATAGTTGCCATACGAGCTATATCCGCA-TAACTAGCTTGCGGCGTTCCACCCGATGAGGTAGCTATTTTTGATAAATTATGTTTGGACGTGTTTGATGTAACTGGTAATGAATGGACAGAATCAGAATCACTACTGTCTGATTTATCACTTGGTGGCATACTACTTGCAGATTTTCTTCTAAGTTCAGGAGAAAGTGGTGTTCTATACTCATTAGAGAATCCTCTTGAATTTTGAAGATAAGATCCAGATGTTGTTAAATTCTGTGCTCTACTTCCACTGGAACTTCTTCTCTGTTTTTTACTTTTTTTCTTTTTCGTAACTACCAGGAATTCTGTTTCATGTTCAGGCTCTGGATTGATTTTTTTATTGGAATTTCGACGACTNNCATAATCATCTCCGGTATCATTACAATATATGGACTGACCTTCTTCTGTTCCCCAAGATCGTCTATCACCGCGACTATCGATAGC]

[-] EMBL BI508534             [CAGGATTGCAATTTATTATTGCACTGCCAAGTTTTGATGGCACTGTGTTCGTTACTGAAACTTCGTTTGATGTTGTATTATGATTATTAAAATTTACAGTTTTTTGTTCTTGTTGCGTTAAATTTTCACGCATTTTTTCAATATCTTGTACATATTTAATAACTTGTATATTTTCATTAATAGCTTCTTCTTGAGCTTCGGCTTTTTTTCTTTCTGTTGAATTTTTCATTTTTGTCAAAGTTGGTGAAAGTGGTTTTTCAAAACTTAAGTTCAAAATATGATTCGAATGGGTAAAATTATGTTGTCTTGTTTTTCTATCAGAGTGTTGTAATTCATCTAAGCTAGGATAATAATCTTGAGGAATTTTATCTGGTTCCGAGGGCGTCTTAGGTGGCACACTAGGCCATGAAGATGGATTTAACATATTTGGAACTATTGTAGACATATTTAACACTGAATTGTGAGTCATATTAATAGTTGCCATACGAGCTATATCCGCA TAACTAGCTTGCGGCGTTCCACCCGATGAGGTAGCTATTTTTGATAAATTATGTTTGGACGTGTTTGATGTAACTGGTAATGAATGGACAGAATCAGAATCACTACTGTCTGATTTATCACTTGGTGGCATAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL BI504635             [                                                                               ATGATTATTAAAATTTACAGTTTTTTGTTCTTGTTGCGTTAAATTTTCACGCATTTTTTCAATATCTTGTACATATTTAATAACTTGTATATTTTTATTAATAGCTTCTTCTTGAGCTTCGGCTTTTTTTCTTTCTGTTGAATTTTTCATTTTTGTCAAAGTTGGTGAAAGTGGTTTTTCAAAACTTAAGTTCAAAATATGATTCGAATGGGTAAAATTATGTTGTCTTGTTTTTCTATCAGAGTGTTGTAATTCATCNAANCNAGGATAATAATCTTGAGGAATTTTATCTGGTTCCGAGGGCGTCTTAGGTGGCACACTAGGCCATGAAGATGGATTTAACATATTTGGAACTATTGTAGACATATTTAACACTGAATTGTGAGTCATATTAATAGTTGCCATACGAGCTATATCCGCA TAACTAGCTTGCGGCGTTCCACCCGATGAGGTAGCTATTTTTGATAAATTATGTTTGGACGTGTTTGATGTAACTGGTAATGAATGGACAGAATCAGAATCACTACTGTCTGATTTATCACTTGGTGGCATACTACTTGCAGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI504123             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTTGTCTTGTTTTTCTATCAGAGTGTTGTAATTCATCTAAGCTAGGATAATAATCTTGAGGAATTTTATCTGGTTCCGAGGGCGTCTTAGNTGGCACACTAGGCCATGAAGATGGATTTAACANNNNTGGAACTATTGTAGACATATTTAACACTGAATTGTGAGTCATATTAATAGTTGCCATACGAGCTATATCCGCA TAACTAGCTTGCGGCGTTCCACCCGATGAGGTAGCTATTTTTGATAAATTATGTTTGGACGTGTTTGATGTAACTGGTAATGAATGGACAGAATCAGAATCACTACTGTCTGATTTATCACTTGGTGGCATACTACTTGCAGATTTTCTTCTAAGTTCAGGAGAAAGTGGTGTTCTATATTCATTAGAGAATCCTCTTGAATTTTGAAGATAAGATCCAGATGTTGTTAAATTCTGTGCTCTACTTCCACTGGAACTTCTTCTCTGTTTTTTACTTTTTTTCTTTTTCGTAACTACCAGGAA                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BI504369             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTATCAGAGTGTTGTAATTCATCTAAGCTAGGATAATAATCTTGAGGAATTTTATCTGGTTCCGAGGGCGTCTTAGGTGGCACACTAGGCCATGAAGATGGATTTAACATATTTGGAACTATTGTAGACATATTTAACACTGAATTGTGAGTCATATTAATAGTTGCCATACGAGCTATATCCGCANNNNNNAGCTTGCGGCGTTCCACCCGATGAGGTAGCTATTTTTGATAAATTATGTTTGGACGTGTTTGATGTAACTGGTAATGAATGGACAGAATCAGAATCACTACTGTCTGATTTATCACTTGGTGGCATACTACTTGCAGATTTTCTTCTAAGTTCAGGAGAAAGTGGTGTTCTATACTCATTAGAGAATCCTCTTGAATTTTGAAGATAAGATCCAGATGTTGTTAAATTCTGTGCTCTACTTCCACTGGAACTTCTTCTCTGTTTTTTACTTTTTTTCTTTTTCGTAACTACCAGGAATTCTGTTTCATGTTCAGGCTCTGGATTGATTTTTTTATTGGAATTTCGACGACTNNCATAATCATCTCCGGTATCATTACAATATATGGACTGACCTTCTTCTGTTCCCCAAGATCGTCTATCACCGCGACTATCGATAGC]




>consensus_409#0
CAGGATTGCAATTTATTATTGCACTGCCAAGTTTTGATGGCACTGTGTTCGTTACTGAAA
CTTCGTTTGATGTTGTATTATGATTATTAAAATTTACAGTTTTTTGTTCTTGTTGCGTTA
AATTTTCACGCATTTTTTCAATATCTTGTACATATTTAATAACTTGTATATTTTCATTAA
TAGCTTCTTCTTGAGCTTCGGCTTTTTTTCTTTCTGTTGAATTTTTCATTTTTGTCAAAG
TTGGTGAAAGTGGTTTTTCAAAACTTAAGTTCAAAATATGATTCGAATGGGTAAAATTAT
GTTGTCTTGTTTTTCTATCAGAGTGTTGTAATTCATCTAAGCTAGGATAATAATCTTGAG
GAATTTTATCTGGTTCCGAGGGCGTCTTAGGTGGCACACTAGGCCATGAAGATGGATTTA
ACATATTTGGAACTATTGTAGACATATTTAACACTGAATTGTGAGTCATATTAATAGTTG
CCATACGAGCTATATCCGCATAACTAGCTTGCGGCGTTCCACCCGATGAGGTAGCTATTT
TTGATAAATTATGTTTGGACGTGTTTGATGTAACTGGTAATGAATGGACAGAATCAGAAT
CACTACTGTCTGATTTATCACTTGGTGGCATACTACTTGCAGATTTTCTTCTAAGTTCAG
GAGAAAGTGGTGTTCTATACTCATTAGAGAATCCTCTTGAATTTTGAAGATAAGATCCAG
ATGTTGTTAAATTCTGTGCTCTACTTCCACTGGAACTTCTTCTCTGTTTTTTACTTTTTT
TCTTTTTCGTAACTACCAGGAATTCTGTTTCATGTTCAGGCTCTGGATTGATTTTTTTAT
TGGAATTTCGACGACTNNCATAATCATCTCCGGTATCATTACAATATATGGACTGACCTT
CTTCTGTTCCCCAAGATCGTCTATCACCGCGACTATCGATAGC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)