These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_47#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 636 fasta sequence [TCTAACATCCCTGATACGCAATAACATTGCATTAGCAGGATGTCCTGCATCTTTAGTTTGTCAAACTAAACACATGGCCACAGAGATATCAAAAACAAGTGAAAGTTCTTTGCCAGAAAAAGCAAAGAAGATACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGTAGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATTTGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGATAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGGTACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAAATATATGATCAAATGCCTGAACCTCGTTGGGTTATTTCAATGGGAAGCTGTGCTAATGGTGGTGGTTATTATCATTATAGTTATTCTGTTGTCAGAGGATGCGATAGGATTATACCTGTGGACATATATGTGCCAGGATGTCCCCCAACAGCAGAAGCTTTAATGTATGGTATTCTTCAATTGCAGAAAAAAATTAAACGCATGAAAACATTACAAATATGGTATAGACAATGAATGTA] [+] EMBL BI511323 [TCTAACATCCCTGATACGCAATAACATTGCATTAGCAGGATGTCCTGCATCTTTAGTTTGTCAAACTAAACACATGGCCACAGAGATATCAAAAACAAGTGAAAGTTCTTTGCCAGAAAAAGCAAAGAAGATACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGTAGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATTTGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGATAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGGTACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAA ] [+] EMBL BI513190 [ ACATCCCTGATACGCAATAACATTGCATTAGCAGGATGTCCTGCATCTTTAGTTTGTCAAACTAAACACATGGCCACAGAGATATCAAAAACAAGTGAAAGTTCTTTGCCAGAAAAAGCAAAGAAGATACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGTAGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATTTGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGATAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGGTACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAAATATATGATCAAATGCCTGAACCTCGTTGGGTTATTTCAATGGG ] [+] EMBL BI503023 [ CTGATACGCAATAACATTGCATTAGCAGGATGTCCTGCATCTTTAGTTTGTCAAACTAAACACATGGCCACAGAGATATCAAAAACAAGTGAAAGTTCTTTGCCAGAAAAAGCAAAGAAGATACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGTAGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATTTGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGATAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGGTACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAAATATATGATCAAATGCCTGAACCTCGTTGGGTTATTTCAATGGGAAGCTGTGCTAATGGTGGTGGTNATTATCATTATAGTNATTCTGTTGTCAGAGGATGCGATAGGATTATACCTGTGGACATATATGTGCCAGGATGTCCCCCAACAGCAGAA ] [+] EMBL BI509621 [ CAATAACATTGCATTAGCAGGATGTCCTGCATCTTTAGTTTGTCAAACTAAACACATGGCCACAGAGATATCAAAAACAAGTGAAAGTTCTTTGCCAGAAAAAGCAAAGAAGATACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGTAGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATTTGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGATAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGGTACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAAATATATGATCAAATGCCTGAACCTCGTTGGGTTATTTCAATGGGAAGCTGTGCTAATGGTGGTGGTTATTATCATTATAGTTATTCTGTTGTCAGAGGATGCGATAGGATTATACCTGTGGACATATATGTGCCAGGATGTCCCCCAACAGCAGAAGCTTTAATG ] [+] EMBL BI515414 [ TTAGCAGGATGTCCTGCATCTTTAGTTTGTCAAACAAAACACATGGCCACAGAGATATCAAAAACAAGTGAAAGTTCTTTGCCAGAAAAAGCAAAGAAGATACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGTAGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATTTGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGATAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGGTACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAAATATATGATCAAATGCCTGAACCTCGTTGGGTTATTTCAATGGG ] [+] EMBL BI516872 [ TTAGCAGGATGTCCTGCATCTTTAGTTTGTCAAACTAAACACATGGCCACAGAGATATCAAAAACAAGTGAAAGTTCTTTGCCAGAAAAAGCAAAGAAGATACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGTAGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATTTGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGATAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGGTACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAAATATATGATCAAATGCCTGAACCTCGTTGGGTTATTTCAATGG ] [+] EMBL BI512803 [ TTAGCAGGATGTCCTGCATCTTTAGTTTGTCAAACTAAACACATGGCCACAGAGATATCAAAAACAAGTGAAAGTTCTTTGCCAGAAAAAGCAAAGAAGATACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGTAGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATTTGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGATAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGGTACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAAATATATGATCAAATGCCTGAACCTCGTTGGGT ] [+] EMBL BI515439 [ TCAAACTAAACACATGGCCACAGAGATATCAAAAACAAGTGAAAGTTCTTTGCCAGAAAAAGCAAAGAAGATACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGTAGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATTTGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGATAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGGTACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAAATATATGATCAAATGCCTGAACCTCGTTGGGTTATTTCAAT ] [+] EMBL BI516147 [ cGAGGTCAAAAACAAGTGAAAGTTCTTTGCCAGAAAAAGCAAAGAAGATACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGTAGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATTTGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGATAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGGTACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAAATATATGATCAAATGCCTGAACCTCGTTGGGTTATTTCAATGGGAAGCTGTGCTAATGGTGGTGGTTATTATCATTATAGTTATTCTGTTGTCAGAGGATGCGATAGGATTATACCTGTGGACATATATGTGCCAGGATGTCCCCCAACAGCAGAAGCTTTAATGTATGGTATTCTTCAATTGCAGAAAAAAATTAAACGCATGAAAACATTACAAATATGGTATAGACAATGAATGTA] [+] EMBL BI510738 [ TACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGTAGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATTTGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGATAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGGTACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAAATATATGATCAAATGCCTGAACCTCGTTGGGTTATTTCAATGGG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |