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Apis mellifera
cluster # 47 cluster # 47       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_47#0 length = 636 sequences # 10  

consensusID : consensus_47#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 636
fasta sequence
                              [TCTAACATCCCTGATACGCAATAACATTGCATTAGCAGGATGTCCTGCATCTTTAGTTTGTCAAACTAAACACATGGCCACAGAGATATCAAAAACAAGTGAAAGTTCTTTGCCAGAAAAAGCAAAGAAGATACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGTAGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATTTGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGATAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGGTACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAAATATATGATCAAATGCCTGAACCTCGTTGGGTTATTTCAATGGGAAGCTGTGCTAATGGTGGTGGTTATTATCATTATAGTTATTCTGTTGTCAGAGGATGCGATAGGATTATACCTGTGGACATATATGTGCCAGGATGTCCCCCAACAGCAGAAGCTTTAATGTATGGTATTCTTCAATTGCAGAAAAAAATTAAACGCATGAAAACATTACAAATATGGTATAGACAATGAATGTA]

[+] EMBL BI511323             [TCTAACATCCCTGATACGCAATAACATTGCATTAGCAGGATGTCCTGCATCTTTAGTTTGTCAAACTAAACACATGGCCACAGAGATATCAAAAACAAGTGAAAGTTCTTTGCCAGAAAAAGCAAAGAAGATACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGTAGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATTTGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGATAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGGTACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAA                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BI513190             [    ACATCCCTGATACGCAATAACATTGCATTAGCAGGATGTCCTGCATCTTTAGTTTGTCAAACTAAACACATGGCCACAGAGATATCAAAAACAAGTGAAAGTTCTTTGCCAGAAAAAGCAAAGAAGATACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGTAGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATTTGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGATAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGGTACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAAATATATGATCAAATGCCTGAACCTCGTTGGGTTATTTCAATGGG                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI503023             [          CTGATACGCAATAACATTGCATTAGCAGGATGTCCTGCATCTTTAGTTTGTCAAACTAAACACATGGCCACAGAGATATCAAAAACAAGTGAAAGTTCTTTGCCAGAAAAAGCAAAGAAGATACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGTAGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATTTGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGATAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGGTACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAAATATATGATCAAATGCCTGAACCTCGTTGGGTTATTTCAATGGGAAGCTGTGCTAATGGTGGTGGTNATTATCATTATAGTNATTCTGTTGTCAGAGGATGCGATAGGATTATACCTGTGGACATATATGTGCCAGGATGTCCCCCAACAGCAGAA                                                                                   ]
[+] EMBL BI509621             [                  CAATAACATTGCATTAGCAGGATGTCCTGCATCTTTAGTTTGTCAAACTAAACACATGGCCACAGAGATATCAAAAACAAGTGAAAGTTCTTTGCCAGAAAAAGCAAAGAAGATACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGTAGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATTTGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGATAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGGTACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAAATATATGATCAAATGCCTGAACCTCGTTGGGTTATTTCAATGGGAAGCTGTGCTAATGGTGGTGGTTATTATCATTATAGTTATTCTGTTGTCAGAGGATGCGATAGGATTATACCTGTGGACATATATGTGCCAGGATGTCCCCCAACAGCAGAAGCTTTAATG                                                                          ]
[+] EMBL BI515414             [                               TTAGCAGGATGTCCTGCATCTTTAGTTTGTCAAACAAAACACATGGCCACAGAGATATCAAAAACAAGTGAAAGTTCTTTGCCAGAAAAAGCAAAGAAGATACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGTAGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATTTGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGATAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGGTACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAAATATATGATCAAATGCCTGAACCTCGTTGGGTTATTTCAATGGG                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI516872             [                               TTAGCAGGATGTCCTGCATCTTTAGTTTGTCAAACTAAACACATGGCCACAGAGATATCAAAAACAAGTGAAAGTTCTTTGCCAGAAAAAGCAAAGAAGATACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGTAGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATTTGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGATAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGGTACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAAATATATGATCAAATGCCTGAACCTCGTTGGGTTATTTCAATGG                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI512803             [                               TTAGCAGGATGTCCTGCATCTTTAGTTTGTCAAACTAAACACATGGCCACAGAGATATCAAAAACAAGTGAAAGTTCTTTGCCAGAAAAAGCAAAGAAGATACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGTAGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATTTGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGATAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGGTACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAAATATATGATCAAATGCCTGAACCTCGTTGGGT                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BI515439             [                                                            TCAAACTAAACACATGGCCACAGAGATATCAAAAACAAGTGAAAGTTCTTTGCCAGAAAAAGCAAAGAAGATACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGTAGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATTTGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGATAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGGTACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAAATATATGATCAAATGCCTGAACCTCGTTGGGTTATTTCAAT                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI516147             [                                                                                   cGAGGTCAAAAACAAGTGAAAGTTCTTTGCCAGAAAAAGCAAAGAAGATACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGTAGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATTTGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGATAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGGTACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAAATATATGATCAAATGCCTGAACCTCGTTGGGTTATTTCAATGGGAAGCTGTGCTAATGGTGGTGGTTATTATCATTATAGTTATTCTGTTGTCAGAGGATGCGATAGGATTATACCTGTGGACATATATGTGCCAGGATGTCCCCCAACAGCAGAAGCTTTAATGTATGGTATTCTTCAATTGCAGAAAAAAATTAAACGCATGAAAACATTACAAATATGGTATAGACAATGAATGTA]
[+] EMBL BI510738             [                                                                                                                                   TACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGTAGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATTTGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGATAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGGTACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAAATATATGATCAAATGCCTGAACCTCGTTGGGTTATTTCAATGGG                                                                                                                                                                                                   ]


>consensus_47#0 TCTAACATCCCTGATACGCAATAACATTGCATTAGCAGGATGTCCTGCATCTTTAGTTTG TCAAACTAAACACATGGCCACAGAGATATCAAAAACAAGTGAAAGTTCTTTGCCAGAAAA AGCAAAGAAGATACCTTATAGTCCTTTTCAAAATACCAATAATCTTGCTGAATATGCAGT AGCTCGATTAGATGATATTTTAAATTGGGGTCGTAAAGGATCAATATGGCCACTCACATT TGGTCTAGCTTGTTGTGCCGTTGAAATGATGCACATAGCAGCTCCAAGATATGATATGGA TAGATATGGAGTTGTATTTAGGGCTTCTCCAAGGCAAGCTGATGTTATTATAGTTGCTGG TACTTTAACAAATAAAATGGCTCCAGCATTGAGGAAAATATATGATCAAATGCCTGAACC TCGTTGGGTTATTTCAATGGGAAGCTGTGCTAATGGTGGTGGTTATTATCATTATAGTTA TTCTGTTGTCAGAGGATGCGATAGGATTATACCTGTGGACATATATGTGCCAGGATGTCC CCCAACAGCAGAAGCTTTAATGTATGGTATTCTTCAATTGCAGAAAAAAATTAAACGCAT GAAAACATTACAAATATGGTATAGACAATGAATGTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)