These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_527#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 703 fasta sequence [TAGTCAACGAACTTTCTTAAGCAAGCTTGAGAAACTTGTGATAACCGTTTCATTTTCAATTTCATTTTTTTTTTTTTTAGAAAAATGCGTAGCGATTTTTCGTGCGATTTAAAATTTACCGATCGAATATTCTTCCCTCCCGATTATTATTCGATTTTCGATTTTTGTTAATTTTAAGTCGCACGGTTGATAAATGTCACGGTACGTTTTCTATCAGTCATTCCTAGTGACATTCCCTTCGTGTAAATTGCATGGATACGCATGGAATTGTTAATGAAATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATTGAATTTATACACGAATGTTTTT--NNNTGTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAATTCGTAAGCATGTTAAATGATGTATCCATCCAATTTTATCTTTCACTCAATTATACAATCATATTGAGCGTAACGTGTTGAAGGATCGGTTGTGTCGAGAGAGTCGACAAAATGGCAACCCGAGTGACGAAGCAACCGGTCAAGGGACCCGTCGTAACGCGATTAGCTTGTATTTCGTCGGTACGAAAATTCAAAATGGTCGACCGCGACCACGAACAGCCGACGCTTCGACGAACGAAAACACTGTTCGCGTTTTACAACGTCGTCTTTTTCTACTCTTCCAATTTTGTACTTCCAATAGGTGTGTAAAAAAAACAAATTGTTTCTTCGACTTTTAAAACCATTT] [+] EMBL BI506824 [TAGTCAACGAACTTTCTTAAGCAAGCTTGAGAAACTTGTGATAACCGTTTCATTTTCAATTTCATTTTTTTTTTTTTTAGAAAAATGCGTAGCGATTTTTCGTGCGATTTAAAATTTACCGATCGAATATTCTTCCCTCCTGATTATTATTCGATTTTCGATTTTTGTTAATTTTAAGTCGCACGGTTGATAAATGTCACGGTACGTTTTCTATCAGTCATTCCTAGTGACATTCCCTTCGTGTAAATTGCATGGATACGCATGGAATTGTTAATGAAAT TAATAATAATAATAATAATAATAATTGAATTTATACACGAATGTTTTT CCTTGTTTTTTTTTTTTTTT AAATTTGTAGGCATGTTAAATGATGTATCCATCCAATTTTATCTTTCACTCAATTGTACAATCGCATTGAGCGTAACGTGT ] [-] EMBL BI512119 [ TTCGTGCGATTTAAAATTTACCGATCGAATATTCTTCCCTCCCGATTATTATTCGATTTTCGATTTTTGTTAATTTTAAGTCGCACGGTTGATAAATGTCACGGTACGTTTTCTATCAGTCATTCCTAGTGACATTCCCTTCGTGTAAATTGCATGGATACGCATGGAATTGTTAATGAAATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATTGAATTTATACACGAATGTTTTTNNNNNNTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAATTCGTAAGCATGTTAAATGATGTATCCATCCAATTTTATCTTTCACTCAATTATACAATCATATTGAGCGTAACGTGTTGAAGGATCGGTTGTGTCGAGAGAGTCGACAAAATGGCAACCCGAGTGACGAAGCAACCGGTCAAGGGACCCGTCGTAACGCGATTAGCTTGTATTTCGTCGGTACGAAAATTCAAAATGGTCGACCGCGACCACGAACAGCCGACGCTTCGACGAACGAAAACACTGTTCGCGTTTTACAACGTCGTCTTTTTCTACTCTTCC ] [+] EMBL BI504928 [ CCCTCCCGATTATTATTCGATTTTCGATTTTTGTTAATTTTAAGTCGCACGGTTGATAAATGTCACGGTACGTTTTCTATCAGTCATTCCTAGTGACATTCCCTTCGTGTAAATTGCATGGATACGCATGGAATTGTTAATGAAATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATTGAATTTATACACGAATGTTTTT CCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAATTCGTAAGCATGTTAAATGATGTATCCATCCAATTTTATCTTTCACTCAATTATACAATCATATTGAGCGTAACGTGTTGAAGGATCGGTTGTGTCGAGNGAGTCGACAAAATGGCAACCCGAGTGACGAAGCAACCGGTCAAGGGACCCGTCGTAACGCGATTAGCTTGTATTTCGTCGGTACGAAAATTCAAAATGGTCGACCGCGACCA ] [-] EMBL BI516863 [ GTCATTCCTAGTGACATTCCCTTCGTGTAAATTGCATGGATACGCATGGAATTGTTAATGAAATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATTGAATTTATACACGAATGTTTTTC NNNGGTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAATTCGTAAGCATGTTAAATGATGTATCCATCCAATTTTATCTTTCACTCAATTATACAATCATATTGAGCGTAACGTGTTGAAGGATCGGTTGTGTCGAGAGAGTCGACAAAATGGCAACCCGAGTGACGAAGCAACCGGTCAAGGGACCCGTCGTAACGCGATTAGCTTGTATTTCGTCGGTACGAAAATTCAAAATGGTCGACCGCGACCACGAACAGCCGACGCTTCGACGAACGAAAATACTGTTCGCGTTTTACAACGTCGTCTTTTTCTACTCTTCCAATTTTGTACTTCCAATAGGTGTGTAAAAAAAACAAATTGTTTCTTCGACTTTTAAAACCATTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |