Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 657 cluster # 657       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_657#0 length = 517 sequences # 3  

consensusID : consensus_657#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 517
fasta sequence
                              [TACAGATTCAGATGATACTATTCCAGAATTGGATGATGCAGGTGCTGGTGGTACAGTTGGTTTCCCAGGAACAACTGTCACTGGTCTTCCTATTGATATGGTTTCCAAAGCAAAACAAAGTCGAGGAGAGAAAAAGGCTAGGAAGCTTATGAGCAAATTAGGATTAAAACCTGTTCAAGGAGTTAACAGAGTGACTATTCGTAAATCAAAAAATATTCTTTTTGTAATTAATAAACCTGATGTGTTGAAAAATCCAGCTTCAGATACTTATATAGTATTTGGCGAAGCTAAGATTGAAGATCTCAGTCAACAAGCTCAAGTTGCAGCAGCTGAGAAGTTCAAAGAACCACCAGTTATTCCAGCAACTGAAGCTGGTGGTAGTACAACAGTTGTTGCACCAATACAAGAGGAATCAGAAGNGGAAGTTGATGAAACGGGTGTTGAAGAAAAAGATATTGATTTAGTAATGTGTCAAGCCAATGTGTCTCGAGGGAAAGCTATTAAAGCTCTTAAAAAT]

[+] EMBL BI510713             [TACAGATTCAGATGATACTATTCCAGAATTGGATGATGCAGGTGCTGGTGGTACAGTTGGTTTCCCAGGAACAACTGTCACTGGTCTTCCTATTGATATGGTTTCCAAAGCAAAACAAAGTCGAGGAGAGAAAAAGGCTAGGAAGCTTATGAGCAAATTAGGATTAAAACCTGTTCAAGGAGTTAACAGAGTGACTATTCGTAAATCAAAAAATATTCTTTTTGTAATTAATAAACCTGATGTGTTGAAAAATCCAGCTTCAGATACTTATATAGTATTTGGCGAAGCTAAGATTGAAGATCTCAGTCAACAAGCTCAAGTTGCAGCAGCTGAGAAGTTCAAAGAACCACCAGTTATTCCAGCAATTGAAGCTGGTGGTAGTACAACAGT                                                                                                                               ]
[+] EMBL BI511632             [                                           GCTGGTGGTACAGTTGGTTTCCCAGGAACAACTGTCACTGGTCTTCCTATTGATATGGTTTCCAAAGCAAAACAAAGTCGAGGAGAGAAAAAGGCTAGGAAGCTTATGAGCAAATTAGGATTAAAACCTGTTCAAGGAGTTAACAGAGTGACTATTCGTAAATCAAAAAATATTCTTTTTGTAATTAATAAACCTGATGTGTTGAAAAATCCAGCTTCAGATACTTATATAGTATTTGGCGAAGCTAAGATTGAAGATCTCAGTCAACAAGCTCAAGTTGCAGCAGCTGAGAAGTTCAAAGAACCACCAGTTATTCCAGCAACTGAAGCTGGTGGTAGTACAACAGTTGTTGCACCAATACAAGAGGAATCAGAAGAGGAAGTTGATGAAACGGGTGTTGAAGAAAAAGATATTGATTTAGTAATGTGTCAAGCCAATGTGTCTCGAGGGAAAGCTATTAAAGCTCTTAAAAAT]
[+] EMBL BI513507             [                                                TGGTACAGTTGGTTTCCCAGGAACAACTGTCACTGGTCTTCCTATTGATATGGTTTCCAAAGCAAAACAAAGTCGAGGAGAGAAAAAGGCTAGGAAGCTTATGAGCAAATTAGGATTAAAACCTGTTCAAGGAGTTAACAGAGTGACTATTCGTAAATCAAAAAATATTCTTTTTGTAATTAATAAACCTGATGTGTTGAAAAATCCAGCTTCAGATACTTATATAGTATTTGGCGAAGCTAAGATTGAAGATCTCAGTCAACAAGCTCAAGTTGCAGCAGCTGAGAAGTTCAAAGAACCACCAGTTATTCCAGCAACTGAAGCTGGTGGTAGTACAACAGTTGTTGCACCAATACAAGAGGAATCAGAAGNGGAAGTTGATGAAACGGGTGTTGAAGAAAAAGATATTGATTTAGTAATGTGTCAAGCCAATGTGTCTCGAGGGAAAGCTATTAAA            ]


>consensus_657#0 TACAGATTCAGATGATACTATTCCAGAATTGGATGATGCAGGTGCTGGTGGTACAGTTGG TTTCCCAGGAACAACTGTCACTGGTCTTCCTATTGATATGGTTTCCAAAGCAAAACAAAG TCGAGGAGAGAAAAAGGCTAGGAAGCTTATGAGCAAATTAGGATTAAAACCTGTTCAAGG AGTTAACAGAGTGACTATTCGTAAATCAAAAAATATTCTTTTTGTAATTAATAAACCTGA TGTGTTGAAAAATCCAGCTTCAGATACTTATATAGTATTTGGCGAAGCTAAGATTGAAGA TCTCAGTCAACAAGCTCAAGTTGCAGCAGCTGAGAAGTTCAAAGAACCACCAGTTATTCC AGCAACTGAAGCTGGTGGTAGTACAACAGTTGTTGCACCAATACAAGAGGAATCAGAAGN GGAAGTTGATGAAACGGGTGTTGAAGAAAAAGATATTGATTTAGTAATGTGTCAAGCCAA TGTGTCTCGAGGGAAAGCTATTAAAGCTCTTAAAAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)