Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 775 cluster # 775       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_775#0 length = 702 sequences # 3  

consensusID : consensus_775#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 702
fasta sequence
                              [GTCTCGCATTTAGTCCTGCTTCTATTCCACAAAATTTTCTTGTTGCTGGTTCTTGGGATTGCAATGTTCGTTGCTGGGAAGTTGAACAATCCGGCAAAACGGTTCCTAAATCGATGCAATCCATGGCAGCCCCAGTTCTCGATGTTTGTTGGAGCGATGATGGAACAAAAGTATTCATGGCATCTTGTGACAAAACTGCAAAATGTTGGGACTTAGCTTCAAACCAGGCTATTCAAGTTGCAGCACATGATGCACCTATTAAAACTTGTCATTGGATTAAAGCAAGTACATATTCATGTCTTATGACAGGTTCTTGGGATAAAACATTAAGATTTTGGGATCTACGAAGTCCTAAACCAGCAATGACTATAAATTTAATTGAAAGATGTTACTGTGCAGATGTTGATTATCCAATGGCAGTAGTAGGAACTGCTGGACGTGGATTAATAGTTTATCAGTTGGAAGGTAGTCCTCGAGAATATAAGACAGTAGAATTAAGTCTAAAATATCAATATCGATGTGTTGCAATTTTTAAAGATAAAAAAAAAGTTCCCACTGGTTTTGCAATTGGCAGTACAGAAGNTCGTGTAGCAATACATCATTTGAATTTAAGTTCAAAAGAAAATTTTACTTTTAAATGTCACAGAACAAATGGAACTCCTAATGGATATCAAGATATTTATGCAGTAAATGATATTGCAT]

[+] EMBL BI513610             [GTCTCGCATTTAGTCCTGCTTCTATTCCACAAAATTTTCTTGTTGCTGGTTCTTGGGATTGCAATGTTCGTTGCTGGGAAGTTGAACAATCCGGCAAAACGGTTCCTAAATCGATGCAATCCATGGCAGCCCCAGTTCTCGATGTTTGTTGGAGCGATGATGGAACAAAAGTATTCATGGCATCTTGTGACAAAACTGCAAAATGTTGGGACTTAGCTTCAAACCAGGCTATTCAAGTTGCAGCACATGATGCACCTATTAAAACTTGTCATTGGATTAAAGCAAGTACATATTCATGTCTTATGACAGGTTCTTGGGATAAAACATTAAGATTTTGGGATCTACGAAGTCCTAAACCAGCAATGACTATAAATTTAATTGAAAGATGTTACTGTGCAGATGTTGATTATCCAATGGCAGTAGTAGGAACTGCTGGACGTGGATTAATAGTTTATCAGTTGGAANNTAGTCCTCGAGAATATAAGACAGTAGAATTAAGTCTAAAATATCAATATCGATGTGTTGCAATTTTTA                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BI508411             [                                                                                                          TAAATCGATGCAATCCATGGCAGCCCCAGTTCTCGATGTTTGTTGGAGCGATGATGGAACAAAAGTATTCATGGCATCTTGTGACAAAACTGCAAAATGTTGGGACTTAGCTTCAAACCAGGCTATTCAAGTTGCAGCACATGATGCACCTATTAAAACTTGTCATTGGATTAAAGCAAGTACATATTCATGTCTTATGACAGGTTCTTGGGATAAAACATTAAGATTTTGGGATCTACGAAGTCCTAAACCAGCAATGACTATAAATTTAATTGAAAGATGTTACTGTGCAGATGTTGATTATCCAATGGCAGTAGTAGGAACTGCTGGACGTGGATTAATAGTTTATCAGTTGGAAGGTAGTCCTCGAGAATATAAGACAGTAGAATTAAGTCTAAAATATCAATATCGATGTGTTGCAATTTTTAAAGATAAAAAAAAAGTTCCCACTGGTTTTGCAATTGGCAGTACAGAAGNTCGTGTAGCAATACATCATTTGAATTTAAGTTCAAAAGAAAATTTTACTTTTAAATGTCACAGAACAAATGGAACTCCTAATGGATATCAAGATATTTATGCAGTAAATGATATTGCAT]
[+] EMBL BI504057             [                                                                                                          TAAATCGATGCAATCCATGGCAGCCCCAGTTCTCGATGTTTGTTGGAGCGATGATGGAACAAAAGTATTCATGGCATCTTGTGACAAAACTGCAAAATGTTGGGACTTAGCTTCAAACCAGGCTATTCAAGTTGCAGCACATGATGCACCTATTAAAACTTGTCATTGGATTAAAGCAAGTACATATTCATGTCTTATGACAGGTTCTTGGGATAAAACATTAAGATTTTGGGATCTACGAAGTCCTAAACCAGCAATGACTATAAATTTAATTGAAAGATGTTACTGTGCAGATGTTGATTATCCAATGGCAGTAGTAGGAACTGCTGGACGTGGATTAATAGTTTATCAGTTGGAAGGTAGTCCTCGAGAATATAAGACAGTAGAATTAAGTCTAAAATATCAATATCGATGTGTTGCAATTTTTAAAGATAAAAAAAAAGTTCCCACTGGTTTTGCAATTGGCAGTACAGAAGGTCGTGTAGCAATACATCATTT                                                                                                  ]


>consensus_775#0 GTCTCGCATTTAGTCCTGCTTCTATTCCACAAAATTTTCTTGTTGCTGGTTCTTGGGATT GCAATGTTCGTTGCTGGGAAGTTGAACAATCCGGCAAAACGGTTCCTAAATCGATGCAAT CCATGGCAGCCCCAGTTCTCGATGTTTGTTGGAGCGATGATGGAACAAAAGTATTCATGG CATCTTGTGACAAAACTGCAAAATGTTGGGACTTAGCTTCAAACCAGGCTATTCAAGTTG CAGCACATGATGCACCTATTAAAACTTGTCATTGGATTAAAGCAAGTACATATTCATGTC TTATGACAGGTTCTTGGGATAAAACATTAAGATTTTGGGATCTACGAAGTCCTAAACCAG CAATGACTATAAATTTAATTGAAAGATGTTACTGTGCAGATGTTGATTATCCAATGGCAG TAGTAGGAACTGCTGGACGTGGATTAATAGTTTATCAGTTGGAAGGTAGTCCTCGAGAAT ATAAGACAGTAGAATTAAGTCTAAAATATCAATATCGATGTGTTGCAATTTTTAAAGATA AAAAAAAAGTTCCCACTGGTTTTGCAATTGGCAGTACAGAAGNTCGTGTAGCAATACATC ATTTGAATTTAAGTTCAAAAGAAAATTTTACTTTTAAATGTCACAGAACAAATGGAACTC CTAATGGATATCAAGATATTTATGCAGTAAATGATATTGCAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)