Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 10607 cluster # 10607       Sequences # 7       consensus # 4


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10607#0 length = 667 sequences # 2  
consensus_10607#1 length = 631 sequences # 3  
consensus_10607#2 length = 625 sequences # 1  
consensus_10607#3 length = 518 sequences # 1  

consensusID : consensus_10607#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 667
fasta sequence
                              [TAGCAAGCTCGACTGATCATCTGAAATGGCTCGCAAGAATCTCCTTCTGCTTGGTGTCTTCCTATCTGCTCTGCTTTTCTTCTTCCTGGATGTAGCTCACGCAAGAGAGCTCGCTGAAGCCAGTGAATCTGAGGGGAAGAATGTGAAGCCAACAGGTAGGTCAGGGGTCGAGGATCAGAAGTGGGGCGGTGCTCATGGAGGAGGATATGGATATGGCGGCGGGTATGGTGGAGGAGGATATGGTCATCCTGGGTATGGTGGTGGCTATGGTGGTGGATATGGCCACCCTGGATATGGCGGTGGCTACGGAGGTGGATACGGCCAAGGATATGGCTGTGGGTATGGTCATCCTGGTCACAGTGGAGGATATGGTGGTGGTTACGGAGGTGGTTATGGTGGAGGATACGGTGGTGGGGGTGGCTACGGTGGTGGTGGAGGTTATGGAGGAGGACATGGTGGTGGTTGGCCTTAATAGGTATTCGAGTCATCTAAGTACAACTGTTAAATAAGTCAATTATGACAAACTTGTTTGAGTATGCATGCTGCTAGTAGGAACATTGTATAGTAGCAAGAAACTAGAAGAGCATCATGTTTGGTCTCTTCTTATATATGTATGTTCCTTCCAACATGTATTCTGGCTTTAAGCATAATAATATGGTATATCTGA]

[+] EMBL AK062457             [TAGCAAGCTCGACTGATCATCTGAAATGGCTCGCAAGAATCTCCTTCTGCTTGGTGTCTTCCTATCTGCTCTGCTTTTCTTCTTCCTGGATGTAGCTCACGCAAGAGAGCTCGCTGAAGCCAGTGAATCTGAGGGGAAGAATGTGAAGCCAACAGGTAGGTCAGGGGTCGAGGATCAGAAGTGGGGCGGTGCTCATGGAGGAGGATATGGATATGGCGGCGGGTATGGTGGAGGAGGATATGGTCATCCTGGGTATGGTGGTGGCTATGGTGGTGGATATGGCCACCCTGGATATGGCGGTGGCTACGGAGGTGGATACGGCCAAGGATATGGCTGTGGGTATGGTCATCCTGGTCACAGTGGAGGATATGGTGGTGGTTACGGAGGTGGTTATGGTGGAGGATACGGTGGTGGGGGTGGCTACGGTGGTGGTGGAGGTTATGGAGGAGGACATGGTGGTGGTTGGCCTTAATAGGTATTCGAGTCATCTAAGTACAACTGTTAAATAAGTCAATTATGACAAACTTGTTTGAGTATGCATGCTGCTAGTAGGAACATTGTATAGTAGCAAGAAACTAGAAGAGCATCATGTTTGGTCTCTTCTTATATATGTATGTTCCTTCCAACATGTATTCTGGCTTTAAGCATAATAATATGGTATATCTGA]
[-] EMBL CB683735             [              GATCATCTGAAATGGCTCGCAAGAATCTCCTTCTGCTTGGTGTCTTCCTATCTGCTCTGCTTTTCTTCTTCCTGGATGTAGCTCACGCAAGAGAGCTCGCTGAAGCCAGTGAATCTGAGGGGAAGAATGTGAAGCCAACAGGTAGGTCAGGGGTCGAGGATCAGAAGTGGGGCGGTGCTCATGGAGGAGGATATGGATATGGCGGCGGGTATGGTGGAGGAGGATATGGTCATCCTGGGTATGGTGGTGGCTATGGTGGTGGATATGGCCACCCTGGATATGGCGGTGGCTACGGAGGTGGATACGGCCAAGGATATGGCTGTGGGTATGGTCATCCTGGTCACAGTGGAGGATATGGTGGTGGTTACGGAGGTGGTTATGGTGGAGGATACGGTGGTGGGGGTGGCTACGGTGGTGGTGGAGGTTATGGAGGAGGACATGGTGGTGGTTGGCCTTAATAGGTATTCGAGTCATCTAAGTACAACTGTTAAATAAGTCAATTATGACAAACTTGTTTGAGTATGCATGCTGCTAGTAGGAACATTGTATAGTAGCAAGAAACTAGAAGAGCATCATGTTTGGTCTCTTCTTATATATGTATGTTCCTTCCAACATGTATTCTGGCATGAAGCATAATAATATGGTAT      ]


>consensus_10607#0 TAGCAAGCTCGACTGATCATCTGAAATGGCTCGCAAGAATCTCCTTCTGCTTGGTGTCTT CCTATCTGCTCTGCTTTTCTTCTTCCTGGATGTAGCTCACGCAAGAGAGCTCGCTGAAGC CAGTGAATCTGAGGGGAAGAATGTGAAGCCAACAGGTAGGTCAGGGGTCGAGGATCAGAA GTGGGGCGGTGCTCATGGAGGAGGATATGGATATGGCGGCGGGTATGGTGGAGGAGGATA TGGTCATCCTGGGTATGGTGGTGGCTATGGTGGTGGATATGGCCACCCTGGATATGGCGG TGGCTACGGAGGTGGATACGGCCAAGGATATGGCTGTGGGTATGGTCATCCTGGTCACAG TGGAGGATATGGTGGTGGTTACGGAGGTGGTTATGGTGGAGGATACGGTGGTGGGGGTGG CTACGGTGGTGGTGGAGGTTATGGAGGAGGACATGGTGGTGGTTGGCCTTAATAGGTATT CGAGTCATCTAAGTACAACTGTTAAATAAGTCAATTATGACAAACTTGTTTGAGTATGCA TGCTGCTAGTAGGAACATTGTATAGTAGCAAGAAACTAGAAGAGCATCATGTTTGGTCTC TTCTTATATATGTATGTTCCTTCCAACATGTATTCTGGCTTTAAGCATAATAATATGGTA TATCTGA



consensusID : consensus_10607#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 631
fasta sequence
                              [TAGCAAGCTCGACTGATCATCTGAAATGGCTCGCAAGAATCTCCTTCTGCTTGGTGTCTTCCTATCTGCTCTGCTTTTCTTCTTCCTGGATGTAGCTCACGCAAGAGAGCTCGCTGAAGCCAGTGAATCTGAGGGGAAGAATGTGAAGCCAACAGGTAGGTCAGGGGTCGAGGATCAGAAGTGGGGCGGTGCTCATGGAGGAGGATATGGATATGGCGGCGGGTATGGTGGAGGAGGATATGGTCATCCTGGGTATGGTGGTGGCTATGGTGGTGGATATGGCCACCCTGGATATGGCGGTGGCTACGGAGGTGGATACGGCCAAGGATATGGCTGTGGGTATGGTCATCCTGGTCACAGTGGAGGATACGGTGGTGGGGGTGGCTACGGTGGTGGTGGAGGTTATGGAGGAGGACATGGTGGTGGTTGGCCTTAATAGGTATTCGAGTCATCTAAGTACAACTGTTAAATAAGTCAATTATGACAAACTTGTTTGAGTATGCATGCTGCTAGTAGGAACATTGTATAGTAGCAAGAAACTAGAAGAGCATCATGTTTGGTCTCTTCTTATATATGTATGTTCCTTCCAACATGTATTCTGGCTTTAAGCATAATAATATGGTATATCTGA]

[+] EMBL AK062964             [TAGCAAGCTCGACTGATCATCTGAAATGGCTCGCAAGAATCTCCTTCTGCTTGGTGTCTTCCTATCTGCTCTGCTTTTCTTCTTCCTGGATGTAGCTCACGCAAGAGAGCTCGCTGAAGCCAGTGAATCTGAGGGGAAGAATGTGAAGCCAACAGGTAGGTCAGGGGTCGAGGATCAGAAGTGGGGCGGTGCTCATGGAGGAGGATATGGATATGGCGGCGGGTATGGTGGAGGAGGATATGGTCATCCTGGGTATGGTGGTGGCTATGGTGGTGGATATGGCCACCCTGGATATGGCGGTGGCTACGGAGGTGGATACGGCCAAGGATATGGCTGTGGGTATGGTCATCCTGGTCACAGTGGAGGATACGGTGGTGGGGGTGGCTACGGTGGTGGTGGAGGTTATGGAGGAGGACATGGTGGTGGTTGGCCTTAATAGGTATTCGAGTCATCTAAGTACAACTGTTAAATAAGTCAATTATGACAAACTTGTTTGAGTATGCATGCTGCTAGTAGGAACATTGTATAGTAGCAAGAAACTAGAAGAGCATCATGTTTGGTCTCTTCTTATATATGTATGTTCCTTCCAACATGTATTCTGGCTTTAAGCATAATAATATGGTATATCTGA]
[+] EMBL AK104925             [TAGCAAGCTCGACTGATCATCTGAAATGGCTCGCAAGAATCTCCTTCTGCTTGGTGTCTTCCTATCTGCTCTGCTTTTCTTCTTCCTGGATGTAGCTCACGCAAGAGAGCTCGCTGAAGCCAGTGAATCTGAGGGGAAGAATGTGAAGCCAACAGGTAGGTCAGGGGTCGAGGATCAGAAGTGGGGCGGTGCTCATGGAGGAGGATATGGATATGGCGGCGGGTATGGTGGAGGAGGATATGGTCATCCTGGGTATGGTGGTGGCTATGGTGGTGGATATGGCCACCCTGGATATGGCGGTGGCTACGGAGGTGGATACGGCCAAGGATATGGCTGTGGGTATGGTCATCCTGGTCACAGTGGAGGATACGGTGGTGGGGGTGGCTACGGTGGTGGTGGAGGTTATGGAGGAGGACATGGTGGTGGTTGGCCTTAATAGGTATTCGAGTCATCTAAGTACAACTGTTAAATAAGTCAATTATGACAAACTTGTTTGAGTATGCATGCTGCTAGTAGGAACATTGTATAGTAGCAAGAAACTAGAAGAGCATCATGTTTGGTCTCTTCTTATATATGTATGTTCCTTCCAACATGTATTCTGGCTTTAAGCATAATAATATGGTATATCT  ]
[+] EMBL CA766489             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CCTTAATAGGTATTCGAGTCATCTAAGTACAACTGTTAAATAAGTCAGTTATGACAAACTTGTTTGAGTATGCATGCTGCTAGTAGGAACATTGTATAGTAGCAAGAAACTAGAAGAGCATCATGTTTGGTCTCTTCTTATATATGTATGTTCCTTCCAACATGTATTCTGGCTTTAAGCATAATAATATGGTATATC   ]


>consensus_10607#1 TAGCAAGCTCGACTGATCATCTGAAATGGCTCGCAAGAATCTCCTTCTGCTTGGTGTCTT CCTATCTGCTCTGCTTTTCTTCTTCCTGGATGTAGCTCACGCAAGAGAGCTCGCTGAAGC CAGTGAATCTGAGGGGAAGAATGTGAAGCCAACAGGTAGGTCAGGGGTCGAGGATCAGAA GTGGGGCGGTGCTCATGGAGGAGGATATGGATATGGCGGCGGGTATGGTGGAGGAGGATA TGGTCATCCTGGGTATGGTGGTGGCTATGGTGGTGGATATGGCCACCCTGGATATGGCGG TGGCTACGGAGGTGGATACGGCCAAGGATATGGCTGTGGGTATGGTCATCCTGGTCACAG TGGAGGATACGGTGGTGGGGGTGGCTACGGTGGTGGTGGAGGTTATGGAGGAGGACATGG TGGTGGTTGGCCTTAATAGGTATTCGAGTCATCTAAGTACAACTGTTAAATAAGTCAATT ATGACAAACTTGTTTGAGTATGCATGCTGCTAGTAGGAACATTGTATAGTAGCAAGAAAC TAGAAGAGCATCATGTTTGGTCTCTTCTTATATATGTATGTTCCTTCCAACATGTATTCT GGCTTTAAGCATAATAATATGGTATATCTGA



consensusID : consensus_10607#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 625
fasta sequence
                              [GAAACGTCTCGCAAGAATCTCCTTCTGCTTGGTGTCTTCCTATCTGCTCTGCTTTTCTTCTTCCTGGATGTAGCTCACGCAAGAGAGCTCGCTGAAGCCAGTGAATCTGAGGGGAAGAATGTGAAGCCAACAGGTAGGTCAGGGGTCGAGGATCAGAAGTGGGGCGGTGCTCATGGAGGAGGATATGGATATGGCGGCGGGTATGGTGGAGGAGGATATGGTCATCCTGGGTATGGTGGTGGCTATGGTGGTGGATATGGCCACCCTGGATATGGCGGTGGCTACGGAGGTGGATACGGCCAAGGATATGGCTGTGGGTATGGTCATCCTGGTCACAGTGGAGGATATGGTGGTGGTTACGGAGGTGGTTATGGTGGAGGATACGGTGGTGGGGGTGGCTACCGTGGCGGCGGACGCCATACCCGCCGCCATATCCATATCCTCCTCCATGAGCACCGCCCCACTTCTGATCCTCGACCCCTGACCTACCTGTTGGCTTCACATTCTTCCCCTCAGATTCACTGGCTTCAGCGAGCTCTCTTGCGTGAGCTACATCCAGGAAGAAGAAAAGCAGAGCAGATAGGAAGACACCAAGCAGAAGGAGATTCTTGCGAGCCATTTCAGA]

[+] EMBL CB683337             [GAAACGTCTCGCAAGAATCTCCTTCTGCTTGGTGTCTTCCTATCTGCTCTGCTTTTCTTCTTCCTGGATGTAGCTCACGCAAGAGAGCTCGCTGAAGCCAGTGAATCTGAGGGGAAGAATGTGAAGCCAACAGGTAGGTCAGGGGTCGAGGATCAGAAGTGGGGCGGTGCTCATGGAGGAGGATATGGATATGGCGGCGGGTATGGTGGAGGAGGATATGGTCATCCTGGGTATGGTGGTGGCTATGGTGGTGGATATGGCCACCCTGGATATGGCGGTGGCTACGGAGGTGGATACGGCCAAGGATATGGCTGTGGGTATGGTCATCCTGGTCACAGTGGAGGATATGGTGGTGGTTACGGAGGTGGTTATGGTGGAGGATACGGTGGTGGGGGTGGCTACCGTGGCGGCGGACGCCATACCCGCCGCCATATCCATATCCTCCTCCATGAGCACCGCCCCACTTCTGATCCTCGACCCCTGACCTACCTGTTGGCTTCACATTCTTCCCCTCAGATTCACTGGCTTCAGCGAGCTCTCTTGCGTGAGCTACATCCAGGAAGAAGAAAAGCAGAGCAGATAGGAAGACACCAAGCAGAAGGAGATTCTTGCGAGCCATTTCAGA]


>consensus_10607#2 GAAACGTCTCGCAAGAATCTCCTTCTGCTTGGTGTCTTCCTATCTGCTCTGCTTTTCTTC TTCCTGGATGTAGCTCACGCAAGAGAGCTCGCTGAAGCCAGTGAATCTGAGGGGAAGAAT GTGAAGCCAACAGGTAGGTCAGGGGTCGAGGATCAGAAGTGGGGCGGTGCTCATGGAGGA GGATATGGATATGGCGGCGGGTATGGTGGAGGAGGATATGGTCATCCTGGGTATGGTGGT GGCTATGGTGGTGGATATGGCCACCCTGGATATGGCGGTGGCTACGGAGGTGGATACGGC CAAGGATATGGCTGTGGGTATGGTCATCCTGGTCACAGTGGAGGATATGGTGGTGGTTAC GGAGGTGGTTATGGTGGAGGATACGGTGGTGGGGGTGGCTACCGTGGCGGCGGACGCCAT ACCCGCCGCCATATCCATATCCTCCTCCATGAGCACCGCCCCACTTCTGATCCTCGACCC CTGACCTACCTGTTGGCTTCACATTCTTCCCCTCAGATTCACTGGCTTCAGCGAGCTCTC TTGCGTGAGCTACATCCAGGAAGAAGAAAAGCAGAGCAGATAGGAAGACACCAAGCAGAA GGAGATTCTTGCGAGCCATTTCAGA



consensusID : consensus_10607#3
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 518
fasta sequence
                              [TAGCAAGCTCGACTGATCATCTGAAATGGCTCGCAAGAATCTCCTTCTGCTTGGTGTCTTCCTATCTGCTCTGCTTTTCTTCTTCCTGGATGTAGCTCACGCAAGAGAGCTCGCTGAAGCCAGTGAATCTGAGGGGAAGAATGTGAAGCCAACAGGTAGGTCAGGGGTCGAGGATCAGAAGTGGGGCGGTGCTCATGGAGGAGGATATGGATATGGCGGCGGGTATGGTGGAGGAGGATATGGTCATCCTGGTTATGGTGGAGGATACGGTGGTGGGGGTGGCTACGGTGGTGGTGGAGGTTATGGAGGAGGACATGGTGGTGGTTGGCCTTAATAGGTATTCGAGTCATCTAAGTACAACTGTTAAATAAGTCAATTATGACAAACTTGTTTGAGTATGCATGCTGCTAGTAGGAACATTGTATAGTAGCAAGAAACTAGAAGAGCATCATGTTTGGTCTCTTCTTATATATGTATGTTCCTTCCAACATGTATTCTGGCTTTAAGCATAATAATAT]

[+] EMBL AK063002             [TAGCAAGCTCGACTGATCATCTGAAATGGCTCGCAAGAATCTCCTTCTGCTTGGTGTCTTCCTATCTGCTCTGCTTTTCTTCTTCCTGGATGTAGCTCACGCAAGAGAGCTCGCTGAAGCCAGTGAATCTGAGGGGAAGAATGTGAAGCCAACAGGTAGGTCAGGGGTCGAGGATCAGAAGTGGGGCGGTGCTCATGGAGGAGGATATGGATATGGCGGCGGGTATGGTGGAGGAGGATATGGTCATCCTGGTTATGGTGGAGGATACGGTGGTGGGGGTGGCTACGGTGGTGGTGGAGGTTATGGAGGAGGACATGGTGGTGGTTGGCCTTAATAGGTATTCGAGTCATCTAAGTACAACTGTTAAATAAGTCAATTATGACAAACTTGTTTGAGTATGCATGCTGCTAGTAGGAACATTGTATAGTAGCAAGAAACTAGAAGAGCATCATGTTTGGTCTCTTCTTATATATGTATGTTCCTTCCAACATGTATTCTGGCTTTAAGCATAATAATAT]


>consensus_10607#3 TAGCAAGCTCGACTGATCATCTGAAATGGCTCGCAAGAATCTCCTTCTGCTTGGTGTCTT CCTATCTGCTCTGCTTTTCTTCTTCCTGGATGTAGCTCACGCAAGAGAGCTCGCTGAAGC CAGTGAATCTGAGGGGAAGAATGTGAAGCCAACAGGTAGGTCAGGGGTCGAGGATCAGAA GTGGGGCGGTGCTCATGGAGGAGGATATGGATATGGCGGCGGGTATGGTGGAGGAGGATA TGGTCATCCTGGTTATGGTGGAGGATACGGTGGTGGGGGTGGCTACGGTGGTGGTGGAGG TTATGGAGGAGGACATGGTGGTGGTTGGCCTTAATAGGTATTCGAGTCATCTAAGTACAA CTGTTAAATAAGTCAATTATGACAAACTTGTTTGAGTATGCATGCTGCTAGTAGGAACAT TGTATAGTAGCAAGAAACTAGAAGAGCATCATGTTTGGTCTCTTCTTATATATGTATGTT CCTTCCAACATGTATTCTGGCTTTAAGCATAATAATAT



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10607#1      TAGCAAGCTCGACTGATCATCTGAAATGGCTCGCAAGAATCTCCTTCTGCTTGGTGTCTT 60
consensus_10607#3      TAGCAAGCTCGACTGATCATCTGAAATGGCTCGCAAGAATCTCCTTCTGCTTGGTGTCTT 60
consensus_10607#0      TAGCAAGCTCGACTGATCATCTGAAATGGCTCGCAAGAATCTCCTTCTGCTTGGTGTCTT 60
consensus_10607#2      ----------------------GAAACGTCTCGCAAGAATCTCCTTCTGCTTGGTGTCTT 38
                                             **** * *******************************

consensus_10607#1      CCTATCTGCTCTGCTTTTCTTCTTCCTGGATGTAGCTCACGCAAGAGAGCTCGCTGAAGC 120
consensus_10607#3      CCTATCTGCTCTGCTTTTCTTCTTCCTGGATGTAGCTCACGCAAGAGAGCTCGCTGAAGC 120
consensus_10607#0      CCTATCTGCTCTGCTTTTCTTCTTCCTGGATGTAGCTCACGCAAGAGAGCTCGCTGAAGC 120
consensus_10607#2      CCTATCTGCTCTGCTTTTCTTCTTCCTGGATGTAGCTCACGCAAGAGAGCTCGCTGAAGC 98
                       ************************************************************

consensus_10607#1      CAGTGAATCTGAGGGGAAGAATGTGAAGCCAACAGGTAGGTCAGGGGTCGAGGATCAGAA 180
consensus_10607#3      CAGTGAATCTGAGGGGAAGAATGTGAAGCCAACAGGTAGGTCAGGGGTCGAGGATCAGAA 180
consensus_10607#0      CAGTGAATCTGAGGGGAAGAATGTGAAGCCAACAGGTAGGTCAGGGGTCGAGGATCAGAA 180
consensus_10607#2      CAGTGAATCTGAGGGGAAGAATGTGAAGCCAACAGGTAGGTCAGGGGTCGAGGATCAGAA 158
                       ************************************************************

consensus_10607#1      GTGGGGCGGTGCTCATGGAGGAGGATATGGATATGGCGGCGGGTATGGTGGAGGAGGATA 240
consensus_10607#3      GTGGGGCGGTGCTCATGGAGGAGGATATGGATATGGCGGCGGGTATGGTGGAGGAGGATA 240
consensus_10607#0      GTGGGGCGGTGCTCATGGAGGAGGATATGGATATGGCGGCGGGTATGGTGGAGGAGGATA 240
consensus_10607#2      GTGGGGCGGTGCTCATGGAGGAGGATATGGATATGGCGGCGGGTATGGTGGAGGAGGATA 218
                       ************************************************************

consensus_10607#1      TGGTCATCCTGGGTATGGTGGTGGCTATGGTGGTGGATATGGCCACCCTGGATATGGCGG 300
consensus_10607#3      TGGTCATCCTGGTTATGGTGG--------------------------------------- 261
consensus_10607#0      TGGTCATCCTGGGTATGGTGGTGGCTATGGTGGTGGATATGGCCACCCTGGATATGGCGG 300
consensus_10607#2      TGGTCATCCTGGGTATGGTGGTGGCTATGGTGGTGGATATGGCCACCCTGGATATGGCGG 278
                       ************ ********                                       

consensus_10607#1      TGGCTACGGAGGTGGATACGGCCAAGGATATGGCTGTGGGTATGGTCATCCTGGTCACAG 360
consensus_10607#3      ------------------------------------------------------------
consensus_10607#0      TGGCTACGGAGGTGGATACGGCCAAGGATATGGCTGTGGGTATGGTCATCCTGGTCACAG 360
consensus_10607#2      TGGCTACGGAGGTGGATACGGCCAAGGATATGGCTGTGGGTATGGTCATCCTGGTCACAG 338
                                                                                   

consensus_10607#1      TGG------------------------------------AGGATACGGTGGTGGGGGTGG 384
consensus_10607#3      ---------------------------------------AGGATACGGTGGTGGGGGTGG 282
consensus_10607#0      TGGAGGATATGGTGGTGGTTACGGAGGTGGTTATGGTGGAGGATACGGTGGTGGGGGTGG 420
consensus_10607#2      TGGAGGATATGGTGGTGGTTACGGAGGTGGTTATGGTGGAGGATACGGTGGTGGGGGTGG 398
                                                              *********************

consensus_10607#1      CTACGGTGGTGGTGGAGGTTATGGAGGAGGACATGGTGGTGGTTGGCCTTAATAGGTATT 444
consensus_10607#3      CTACGGTGGTGGTGGAGGTTATGGAGGAGGACATGGTGGTGGTTGGCCTTAATAGGTATT 342
consensus_10607#0      CTACGGTGGTGGTGGAGGTTATGGAGGAGGACATGGTGGTGGTTGGCCTTAATAGGTATT 480
consensus_10607#2      CTACCGTGGCGGCGGACGCCATACCCGCCGCCATATCCATA-TCCTCCTCCATGAGCACC 457
                       **** **** ** *** *  **    *  * ***     *  *   ***  **  * *  

consensus_10607#1      -CGAGTCATCTAAGTA-CAACTGTTAAATAAGTCAATTATGACAAACTTGT----TTGAG 498
consensus_10607#3      -CGAGTCATCTAAGTA-CAACTGTTAAATAAGTCAATTATGACAAACTTGT----TTGAG 396
consensus_10607#0      -CGAGTCATCTAAGTA-CAACTGTTAAATAAGTCAATTATGACAAACTTGT----TTGAG 534
consensus_10607#2      GCCCCACTTCTGATCCTCGACCCCTGACCTACCTGTTGGCTTCACATTCTTCCCCTCAGA 517
                        *    * *** *    * **   * *   *     *     ** * *  *    *    

consensus_10607#1      TATGCATGCTGCTAGTAGGAACATTGTATAG----TAGCAAGAAACTAGAAGAGCAT--C 552
consensus_10607#3      TATGCATGCTGCTAGTAGGAACATTGTATAG----TAGCAAGAAACTAGAAGAGCAT--C 450
consensus_10607#0      TATGCATGCTGCTAGTAGGAACATTGTATAG----TAGCAAGAAACTAGAAGAGCAT--C 588
consensus_10607#2      TTCACTGGCTTCAGCGAGCTCTCTTGCGTGAGCTACATCCAGGAAGAAGAAAAGCAGAGC 577
                       *   *  *** *    **     ***  *       * * ** **  **** ****   *

consensus_10607#1      ATGTTTGGTCTCTTCTTATATATGTATGTTCCTTCCAACATGTATTCTGGCTTTAAGCAT 612
consensus_10607#3      ATGTTTGGTCTCTTCTTATATATGTATGTTCCTTCCAACATGTATTCTGGCTTTAAGCAT 510
consensus_10607#0      ATGTTTGGTCTCTTCTTATATATGTATGTTCCTTCCAACATGTATTCTGGCTTTAAGCAT 648
consensus_10607#2      AGATAGGAAGACACCAAGCAGAAGGAGATTCTTGCGAGC---CATTTCAGA--------- 625
                       *  *  *    *  *    * * * *  *** * * * *    ***   *          

consensus_10607#1      AATAATATGGTATATCTGA 631
consensus_10607#3      AATAATAT----------- 518
consensus_10607#0      AATAATATGGTATATCTGA 667
consensus_10607#2      -------------------
                                          




Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)