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Oryza sativa
cluster # 1069 cluster # 1069       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1069#0 length = 417 sequences # 2  

consensusID : consensus_1069#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 417
fasta sequence
                              [GCAAGCCCCCACGGTTGCGAGGAGTCGTGGTGCGCCACTAAGCTAAGAT-CACAGCATCG-CG-CTGGTGGATTGCTCGCCTATAATAATAGTATCCCAGCTTTGTTTTGGGCTATATTGATGATATACTC-CATATATAATATGCTATATATTTTTATTTTCACCAGATTTGGTTATGTCACC-CTCTCC-ATGCGCCTCTGCTCTTAACA-CA-TATGTAATAATCTCTTCCCTCCCTGCTCCGACCGGTTTTATTGTAAGAGTACTAC-CATTATCG-TTGGGT-GAGGATATGTGAAAACCAAGCTCCGGCTATATACA-CACCCAGATATGTA-TCTAGAGCATATCTGATAAATTCGTCGACCCATAAAAAAAATGGATGGTATTACGTAAAAAAAAAATGTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL BI796373             [GCAAGCCCCCACGGTTGCGAGGAGTCGTGGTGCGCCACTAAGCTAAGAT CACAGCATCG CG CTGGTGGATTGCTCGCCTATAATAATAGTATCCCAGCTTTGTTTTGGGCTATATTGATGATATACTC CATATATAATATGCTATATATTTTTATTTTCACCAGATTTGGTTATGTCACC CTCTCC ATGCGCCTCTGCTCTTAACA CA TATGTAATAATCTCTTCCCTCCCTGCTCCGACCGGTTTTATTGTAAGAGTACTAC CATTATCG TTGGGT GAGGATATGTGAAAACCAAGCTCCGGCTATATACA CACCCAGATATGTA TCTAGAGCATATCTGATAAATTCGTCGACCCATAAAAAAAATGGATGGTATTACGTAAAAAAAAAA                         ]
[+] EMBL BI798164             [                                           TAAGATCCACAGCATCGCCGCCTGGTGGATTGCT GCCTATAATAATAGTAT GCAGCTTTGTTTTGGGCTATATTGATGATATA TCACATATATAATATGCTATATATTTTTATTTT ACCACGTTTGGTTATGT ACCATTCTCCAATG GCCTCTGCTCTTAACACCACTATGTAATAATCTCTTCCCTCCCTTCTCCGACCGGTTTTATTGTAAGAGTACTACACATTATCGCTTGGGTCGAGGATATGTGAAAACCAAGCTCCGGCTATATACACCACCCAGATATGTATTCTAGAGCATATCTGATAAATTCGTCGACCCATAAAAAAAATGGATGGTATTACGTAAttatgctttgtttttaaaaaaaaaaaaaaaaaa]


>consensus_1069#0 GCAAGCCCCCACGGTTGCGAGGAGTCGTGGTGCGCCACTAAGCTAAGATCACAGCATCGC GCTGGTGGATTGCTCGCCTATAATAATAGTATCCCAGCTTTGTTTTGGGCTATATTGATG ATATACTCCATATATAATATGCTATATATTTTTATTTTCACCAGATTTGGTTATGTCACC CTCTCCATGCGCCTCTGCTCTTAACACATATGTAATAATCTCTTCCCTCCCTGCTCCGAC CGGTTTTATTGTAAGAGTACTACCATTATCGTTGGGTGAGGATATGTGAAAACCAAGCTC CGGCTATATACACACCCAGATATGTATCTAGAGCATATCTGATAAATTCGTCGACCCATA AAAAAAATGGATGGTATTACGTAAAAAAAAAATGTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)