cluster # 1097

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Oryza sativa
cluster # 1097 cluster # 1097 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1097#0 length = 515 sequences # 2

consensusID : consensus_1097#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 515
fasta sequence

                              [GATTGCGTGTTTATATGCTTGTAAGCACAGAATCCCAATTTACAACCTATAGGATGGAACACTAATTTCTAACTTGGAATTACTGTATATTTGGTTATTTGGATAATGGAGAGATTTGAGATGTTAAATTCTCTTATTAAAACTTTAAACCTGCTGTGACTGTCATGCTTGAGCTCACCATTTTGGCATTTGGCCTGGAGAACTTTTCAGAACTCTTTCATGGTTTCACCAATGTTCATGGTGCCTTTTGCAAGCAAGTTGGATTATTGTGTAAGCTGCATGTTTCAGAGTAATACGTAGTGTGCATTTCAGAAAGCACTGTCATCTGTTCAGTTGTTCAAATGCGCCTTCAGTGTTGTATTATTATACCCACATAGTACATGCTGCTTTGTGATTTTGCAGAAAAAATATCACCTAAAACCAGAAATGCAGCATCTATTTTGGTTATTGATCCACCAAGTGCAAGTTGTTTACTCCAAAATATTGCAGAATAAGGCTACTGACATTGCTTTGAT]

[+] EMBL CF322868             [GATTGCGTGTTTATATGCTTGTAAGCACAGAATCCCAATTTACAACCTATAGGATGGAACACTAATTTCTAACTTGGAATTACTGTATATTTGGTTATTTGGATAATGGAGAGATTTGAGATGTTAAATTCTCTTATTAAAACTTTAAACCTGCTGTGACTGTCATGCTTGAGCTCACCATTTTGGCATTTGGCCTGGAGAACTTTTCAGAACTCTTTCATGGTTTCACCAATGTTCATGGTGCCTTTTGCAAGCAAGTTGGATTATTGTGTAAGCTGCATGTTTCAGAGTAATACGTAGTGTGCATTTCAGAAAGCACTGTCATCTGTTCAGTTGTTCAAATGCGCCTTCAGTGTTGTATTATTATACCCACATAGTACATGCTGCTTTGTGATTTTGCAGAAAAAATATCACCTAAAACCAGAAATGCAGCATCTATTTTGGTTATTGATCCACCAAGTGCAAGTTGTTTACTCCAAAATATTGCAGAATAAGGCTACTGACATTGCTTTGAT]
[+] EMBL CF323697             [GATTGCGTGTTTATATGCTTGTAAGCACAGAATCCCAATTTACAACCTATAGGATGGAACACTAATTTCTAACTTGGAATTACTGTATATTTGGTTATTTGGATAATGGAGAGATTTGAGATGTTAAATTCTCTTATTAAAACTTTAAACCTGCTGTGACTGTCATGCTTGAGCTCACCATTTTGGCATTTGGCCTGGAGAACTTTTCAGAACTCTTTCATGGTTTCACCAATGTTCATGGTGCCTTTTGCAAGCAAGTTGGATTATTGTGTAAGCTGCATGTTTCAGAGTAATACGTAGTGTGCATTTCAGAAAGCACTGTCATCTGTTCAGTTGTTCAAATGCGCCTTCAGTGTTGTATTATTATACCCACATAGTACATGCTGCTTTGTGATTTTGCAGAAAAAATATCACCTAAAACCAGAAATGCAGCATCTATTTTGGTTATTGATCCACCAAGTGCAAGTTGTTTACTCCAAAATATTTCAGAATAAGGCTACTGACATTGCTTTG  ]




>consensus_1097#0
GATTGCGTGTTTATATGCTTGTAAGCACAGAATCCCAATTTACAACCTATAGGATGGAAC
ACTAATTTCTAACTTGGAATTACTGTATATTTGGTTATTTGGATAATGGAGAGATTTGAG
ATGTTAAATTCTCTTATTAAAACTTTAAACCTGCTGTGACTGTCATGCTTGAGCTCACCA
TTTTGGCATTTGGCCTGGAGAACTTTTCAGAACTCTTTCATGGTTTCACCAATGTTCATG
GTGCCTTTTGCAAGCAAGTTGGATTATTGTGTAAGCTGCATGTTTCAGAGTAATACGTAG
TGTGCATTTCAGAAAGCACTGTCATCTGTTCAGTTGTTCAAATGCGCCTTCAGTGTTGTA
TTATTATACCCACATAGTACATGCTGCTTTGTGATTTTGCAGAAAAAATATCACCTAAAA
CCAGAAATGCAGCATCTATTTTGGTTATTGATCCACCAAGTGCAAGTTGTTTACTCCAAA
ATATTGCAGAATAAGGCTACTGACATTGCTTTGAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case