These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11360#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1440 fasta sequence [TTCCACAGCCGCGACGCGACACCGG-AAACAAACGCA-GGTAGCAACTGCAAGGGGCAGTTGGCTGGAGCTCGGTGATCTGTGGGTCTGATCGCGATGGGACGCTCACCGGAGATGGAGGTGGACGCGCGCAGCGGCT-ACTGCGCCGCCACCCGCACGTTCCGGAGCAGGCGCGCCGACGTGCCGCTGCCCGCCGACCCGGAGGTCGACGTGGTCAGCTTCCTCGCCTCGCGCCGCCACTCGGGCGTTGTGGCCCTCGTCGACGCCGCGACTGGGCGCCGGATCACCTTCACCGAGCTCTGGCGCGCCGTGGCCGGGGCGGCATCCGCCC-TCGCCGCGCACCCCGTCTCCCTCCGCAAGGGCCACGTCGCGCTCATCCTCTCCCCTAACTCCGTCCACTTCCCCGTCGCCGCCCTCGCCGCCATGTCGCTTGGCGCCGTCCTCACCACCGCCAACCCGCTCAATACCCCCGCCGAGATCGCCAAGCAGGTCGCCGACGCCCGCCCCGTCCTCGCCTTCACCACCCGCGAGCTCCTCCCCAAGCTCCCGCGTGCCCACGACCTCCGCGTCGTCCTCCTGGAATCCGCCCGCCTCCCCGGCGACAGCTCCGACCCGCGGATCGTCGCCACCATCGAGGAGATCTCCGCCACGACGCCCGACCCGGCGCGCCGCAAGGACCGCGTCACGCAGGACGATCCGGCCACCCTGCTCTACTCCTCGGGGACGACGGGGCCAAGCAAGGGCGTCGTCGCCACGCACCGGAGCCTCATCTCCATGGTCCAGATCATCATGACGCGATTCCGCCTCGAGGGCTCGGACAAGACAGAGACATTCCTCTGCACGGTGCCCATGTTCCACGTCTACGGCCTCGTCGCCTTCGCCACGGGGCTGCTCGGTTGCGGCGCCACGGTGGTCGTGCTCTCCAAGTACGAGCTCCCGGAGATGCTGCGCTCGATCAACGCCTACGGGGTGACCTACCTTCCGCTCGTGCCGCCGATCCTGGTCGCCATGGTGGCGCACCCGAAGCCGCTCCCGCTCGGGCAGATGCGCAAGGTGCTATCCGGCGGCGCGCCGCTGGGCAAGGAGCTGATCGAAGGGTTCAGGGAGAAGTATCCGCAGGTGGAGATCCTGCAGGGGTACGGGCTGACAGAGAGCACCGCCATCGGCGCGTCCACGGACTCCGCCGAGGAGAGCCGCCGGTACGGGACGGCCGGGCTTCTGTCTCCCAATACCGAGGCTAAGATTGTCGACCCAGATTCCGGCGAGGCGCTGCCGGTAAACCGCACCGGCGAGCTCTGGATCCGTGGACCGTACGTCATGAAAGGCTACTTCAAGAACGCAGAGGCAACACAGTCAACGCTGACACCAGATGGATGGCTAAAGACCGGTGATCTCTGCTACATAGATGAGGATGGATATCTCTTCGTAGTGGACCGCCTCAAG] [+] EMBL AK105769 [TTCCACAGCCGCGACGCGACACCGG AAACAAACGCA GGTAGCAACTGCAAGGGGCAGTTGGCTGGAGCTCGGTGATCTGTGGGTCTGATCGCGATGGGACGCTCACCGGAGATGGAGGTGGACGCGCGCAGCGGCT ACTGCGCCGCCACCCGCACGTTCCGGAGCAGGCGCGCCGACGTGCCGCTGCCCGCCGACCCGGAGGTCGACGTGGTCAGCTTCCTCGCCTCGCGCCGCCACTCGGGCGTTGTGGCCCTCGTCGACGCCGCGACTGGGCGCCGGATCACCTTCACCGAGCTCTGGCGCGCCGTGGCCGGGGCGGCATCCGCCC TCGCCGCGCACCCCGTCTCCCTCCGCAAGGGCCACGTCGCGCTCATCCTCTCCCCTAACTCCGTCCACTTCCCCGTCGCCGCCCTCGCCGCCATGTCGCTTGGCGCCGTCCTCACCACCGCCAACCCGCTCAATACCCCCGCCGAGATCGCCAAGCAGGTCGCCGACGCCCGCCCCGTCCTCGCCTTCACCACCCGCGAGCTCCTCCCCAAGCTCCCGCGTGCCCACGACCTCCGCGTCGTCCTCCTGGAATCCGCCCGCCTCCCCGGCGACAGCTCCGACCCGCGGATCGTCGCCACCATCGAGGAGATCTCCGCCACGACGCCCGACCCGGCGCGCCGCAAGGACCGCGTCACGCAGGACGATCCGGCCACCCTGCTCTACTCCTCGGGGACGACGGGGCCAAGCAAGGGCGTCGTCGCCACGCACCGGAGCCTCATCTCCATGGTCCAGATCATCATGACGCGATTCCGCCTCGAGGGCTCGGACAAGACAGAGACATTCCTCTGCACGGTGCCCATGTTCCACGTCTACGGCCTCGTCGCCTTCGCCACGGGGCTGCTCGGTTGCGGCGCCACGGTGGTCGTGCTCTCCAAGTACGAGCTCCCGGAGATGCTGCGCTCGATCAACGCCTACGGGGTGACCTACCTTCCGCTCGTGCCGCCGATCCTGGTCGCCATGGTGGCGCACCCGAAGCCGCTCCCGCTCGGGCAGATGCGCAAGGTGCTATCCGGCGGCGCGCCGCTGGGCAAGGAGCTGATCGAAGGGTTCAGGGAGAAGTATCCGCAGGTGGAGATCCTGCAGGGGTACGGGCTGACAGAGAGCACCGCCATCGGCGCGTCCACGGACTCCGCCGAGGAGAGCCGCCGGTACGGGACGGCCGGGCTTCTGTCTCCCAATACCGAGGCTAAGATTGTCGACCCAGATTCCGGCGAGGCGCTGCCGGTAAACCGCACCGGCGAGCTCTGGATCCGTGGACCGTACGTCATGAAAGGCTACTTCAAGAACGCAGAGGCAACACAGTCAACGCTGACACCAGATGGATGGCTAAAGACCGGTGATCTCTGCTACATAGATGAGGATGGATATCTCTTCGTAGTGGACCGCCTCAAG] [+] EMBL AK121384 [ CAGCCGCGACGCGACACCGG AAACAAACGCA GGTAGCAACTGCAAGGGGCAGTTGGCTGGAGCTCGGTGATCTGTGGGTCTGATCGCGATGGGACGCTCACCGGAGATGGAGGTGGACGCGCGCAGCGGCT ACTGCGCCGCCACCCGCACGTTCCGGAGCAGGCGCGCCGACGTGCCGCTGCCCGCCGACCCGGAGGTCGACGTGGTCAGCTTCCTCGCCTCGCGCCGCCACTCGGGCGTTGTGGCCCTCGTCGACGCCGCGACTGGGCGCCGGATCACCTTCACCGAGCTCTGGCGCGCCGTGGCCGGGGCGGCATCCGCCC TCGCCGCGCACCCCGTCTCCCTCCGCAAGGGCCACGTCGCGCTCATCCTCTCCCCTAACTCCGTCCACTTCCCCGTCGCCGCCCTCGCCGCCATGTCGCTTGGCGCCGTCCTCACCACCGCCAACCCGCTCAATACCCCCGCCGAGATCGCCAAGCAGGTCGCCGACGCCCGCCCCGTCCTCGCCTTCACCACCCGCGAGCTCCTCCCCAAGCTCCCGCGTGCCCACGACCTCCGCGTCGTCCTCCTGGAATCCGCCCGCCTCCCCGGCGACAGCTCCGACCCGCGGATCGTCGCCACCATCGAGGAGATCTCCGCCACGACGCCCGACCCGGCGCGCCGCAAGGACCGCGTCACGCAGGACGATCCGGCCACCCTGCTCTACTCCTCGGGGACGACGGGGCCAAGCAAGGGCGTCGTCGCCACGCACCGGAGCCTCATCTCCATGGTCCAGATCATCATGACGCGATTCCGCCTCGAGGGCTCGGACAAGACAGAGACATTCCTCTGCACGGTGCCCATGTTCCACGTCTACGGCCTCGTCGCCTTCGCCACGGGGCTGCTCGGTTGCGGCGCCACGGTGGTCGTGCTCTCCAAGTACGAGCTCCCGGAGATGCTGCGCTCGATCAACGCCTACGGGGTGACCTACCTTCCGCTCGTGCCGCCGATCCTGGTCGCCATGGTGGCGCACCCGAAGCCGCTCCCGCTCGGGCAGATGCGCAAGGTGCTATCCGGCGGCGCGCCGCTGGGCAAGGAGCTGATCGAAGGGTTCAGGGAGAAGTATCCGCAGGTGGAGATCCTGCAGGGGTACGGGCTGACAGAGAGCACCGCCATCGGCGCGTCCACGGACTCCGCCGAGGAGAGCCGCCGGTACGGGACGGCCGGGCTTCTGTCTCCCAATACCGAGGCTAAGATTGTCGACCCAGATTCCGGCGAGGCGCTGCCGGTAAACCGCACCGGCGAGCTCTGGATCCGTGGACCGTACGTCATGAAAGGCTACTTCAAGAACGCAGAGGCAACACAGTCAACGCTGACACCAGATGGATGGCTAAAGACCGGTGATCTCTGCTACATAGATGAGGATGGATATCTCTTCGTAGTGGACCGCCTCAAG] [+] EMBL OSC487 [ ACGCGACACCGG AAACAAACGCA GGTAGCAACTGCAAGGGGCAGTTGGCTGGAGCTCGGTGATCTGTGGGTCTGATCGCGATGGGACGCTCACCGGAGATGGAGGTGGACGCGCGCA GGCTGACTGCGCCGCCACCCGCACGTTCCGGAGCAGGCGCGCCGACGTGCCGCTGCCCGCCGACCCGGAGGTCGACGTGGTCAGCTTCCTCGCCTCGCGCCGCCACTCGGGCGTTGTGGCCCTCGTCGACGCCGCGACTGGGCGCCGGATCACCTTNACCGAGCTCTGGCGCGCCGTGGCCGGGGCGGCATCCGCCCTTCGCCGCGCACCCCGTCTCCCTCCGCAAGGGCCACGTCGCGNTCATCCTCTCCCCTAACTCCGTCCACTTCCCCGTCGACGTCCTCGACGCCATGTCGCTTGGCGCCGTn ] [+] EMBL CB638383 [ ACACCGGTAAACAAACGCA GGTAGCAACTGCAAGGGGCAGTTGGCTGGAGCTCGGTGATCTGTGGGTCTGATCGCGATGGGACGCTCACCGGAGATGGAGGTGGACGCGCGCAGCGGCT ACTGCGCCGCCACCCGCACGTTCCGGAGCAGGCGCGCCGACGTGCCGCTGCCCGCCGACCCGGAGGTCGACGTGGTCAGCTTCCTCGCCTCGCGCCGCCACTCGGGCGTTGTGGCCCTCGTCGACGCCGCGACTGGGCGCCGGATCACCTTCACCGAGCTCTGGCGCGCCGTGGCCGGGGCGGCATCCGCCC TCGCCGCGCACCCCGTCTCCCTCCGCAAGGGCCACGTCGCGCTCATCCTCTCCCCTAACTCCGTCCACTTCCCCGTCGCCGCCCTCGCCGCCATGTCGCTTGGCGCCGTCCTCACCACCGCCAACCCGCTCAATACCCCCGCCGAGATCGCCAAGCAGGTCGCCGACGCCCGCCCCGTCCTCGCCTTCACCACCCGCGAGCTCCTCCCCAAGCTCCCGCGTGCCCACGACCTCCGCGTCGTTCTCCTGGAATCCGCCCGCCTCCC ] [+] EMBL CB641159 [ ACACCGGNAAACAAACGCA GGTAGCAACTGCAAGGGGCAGTTGGCTGGAGCTCGGTGATCTGTGGGTCTGATCGCGATGGGACGCTCACCGGAGATGGAGGTGGACGCGCGCAGCGGCT ACTGCGCCGCCACCCGCACGTTCCGGAGCAGGCGCGCCGACGTGCCGCTGCCCGCCGACCCGGAGGTCGACGTGGTCAGCTTCCTCGCCTCGCGCCGCCACTCGGGCGTTGTGGCCCTCGTCGACGCCGCGACTGGGCGCCGGATCACCTTCACCGAGCTCTGGCGCGCCGTGGCCGGGGCGGCATCCGCCC TCGCCGCGCACCCCGTCTCCCTCCGCAAGGGCCACGTCGCGCTCATCCTCTCCCCTAACTCCGTCCACTTCCCCGTCGCCGCCCTCGCCGCCATGTCGCTTGGCGCCGTCCTCACCACCGCCAACCCGCTCAATACCCCCGCCGAGATCGCCAAGCAAGTCGCCGACGCCCGCCCCGTCCTCGCCTTCACCACCCGCGAGCTCCTCCCCAAGCTCCCGCGTGCCC ] [+] EMBL CB640924 [ gcACACCGGTAAACAAACGCACGCTGGCAACTGCAAGGGGCAGTTGGCTGGAGCTCGGTGATCTGTGGGTCTGATCGCGATGGGACGCTCACCGGAGATGGAGGTGGACGCGCGCAGCGGCT ACTGCGCCGCCACCCGCACGTTCCGGAGCAGGCGCGCCGACGTGCCGCTGCCCGCCGACCCGGAGGTCGACGTGGTCAGCTTCCTCGCCTCGCGCCGGCACTCAGGCGTTGTGGCCCTCTTCGACACCGCGACTGGGCGCCGGATCACCTTCACCGA ] [+] EMBL CB626021 [ CACCGGCAAACAAACGCA GGTAGCAACTGCAAGGGGCGGTTGGCTGGAGCTCGGTGATCTGTGGGTCTGATCGCGATGGGACGCTCACCGGAGATGGAGGTGGACGCGCGCAGCGGCT ACTGCGCCGCCACCCGCACGTTCCGGAGCAGGCGCGCCGACGTGCCGCTGCCCGCCGACCCGGAGGTCGACGTGGTCAGCTTCCTCGCCTCGCGCCGCCACTCGGGCGTTGTGGCCCTCGTCGACGCCGCGACTGGGCGCCGGATCACCTTCACCGAGCTCTGGCGCGCCGTGGCCGGGGCGGCATCCGCCC TCGCCGCGCACCCCGTCTCCCTCCGCAAGGGCCACGTCGCGCTCATCCTCTCCCCTAACTCCGTCCACTTCCCCGTCGCCGCCCTCGCCGCCATGTCGCTTGGCGCCGTCCTCACCACCGCCAACCCGCTCAATACCCCCGCCGAGATCGCCAAGCAGGTCGCCGACGCCCGCCCCGTCCTCGCCTTCACCACCCGCGAGCTCCTCCCCAAGCTCCCGCGTGCCCACGACCTGCGCGTCGTCCTCCTGGAATCCGCCCGCCTCCCCGGCGACAGCTCCGACCCGCGGATCGTCGCCACCATCGAGGAGATCTCCGCCACGACGCCCGACCCGGCGCGCCGCAAGGACCGCGTCACGCAGGACGATCCGGCCACCCTGCTCTACTCCTCGGGGACGACGGGGCCAAGCAAGGGCGTCGTCGCCACGCACCGGAGC ] [+] EMBL CB676698 [ CCCCGGCGACAGCTCCGACCCGCGGATCGTCGCCACCATCGAGGAGATCTCCGCCACGACGCCCGACCCGGCGCGCCGCAAGGACCGCGTCACGCAGGACGATCCGGCCACCCTGCTCTACTCCTCGGGGACGACGGGGCCAAGCAAGGGCGTCGTCGCCACGCACCGGAGCCTCATCTCCATGGTCCAGATCATCATGACGCGATTCCGCCTCGAGGGCTCGGACAAGACAGAGACATTCCTCTGCACGGTGCCCATGTTCCACGTCTACGGCCTCGTCGCCTTCGCCACGGGGCTGCTCGGTTGCGGCGCCACGGTGGTCGTGCTCTCCAAGTACGAGCTCCCGGAGATGCTGCGCTCGATCAACGCCTACGGGGTGACCTACCTTCCGCTCGTGCCGCCGATCCTGGTCGCCATGGTGGCGCACCCGAAGCCGCTCCCGCTCGGGCAGATGCGCAAGGTGCTATCCGGCGGCGCGCCGCTGGGCAAGGAGCTGATCGAAGGGTTCAGGGAGAAGTATCCGCAGGTGGAGATCCTGCAGGGGTACGGGCTGACAGAGAGCACCGCCATCGGCGCGTCCACGGACTCCGCCGAGGAGAGCCGCCGGTACGGGACGGCCGGGCTTCTGTCTCCCAATACCGAGGCTAAGATTGTCGACCCAGATTCCGGCGAGGCGCTGCCGGTAAACCGCACCGGCGAGCTCTGGATCCGTGGACCGTACGTCATGAAAGGCTACTTCAAGAACGCAGAGGGCACACAGTCAACGCTGACACCAGATGGATGGCTAAAGACCGGTGATCTCTGCTACATAGATGAGGATGGATATCTCTTCGTA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||