These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11978#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1520 fasta sequence [TGGTTTTGTTCAGTCTGTTGTAGACCATGACCACCTTGTTGTGTCATTTTGTTCTGGAGAAGCCCGCGTTTTGACGAGTGAAGTTATCAAAGTCATTCCATTAAATAGGGGCCAACATGTGCAGCTCAAACCTGATGTTTTGGAGCCTAGATTTGGATGGCGTGGTCAGTCACGAGATAGCATTGGGACAGTTCTCTGTGTTGATGATGATGGAATCTTGAGGGTTGGTTTTCCAGGAGCTTCTAGGGGATGGAGAGCTGATCCTGCTGAAATTGTAAGGGTTGAAGAATATAAGGTTGGTAACTGGGTTCGGATTCGTCCCTCATTAACGGTTGCTGTACATGGCATGGAATCTATTACTCCTGGAAGTGTTGGTATTGTCTACTCAATCAGGCCAGACAGCAGTCTTCTATTGGGACTTTGCTATTTGTCAAGTCCATGGCTTTGTGAACCAGAGGAGGTTGAACATGTTGATCCCTTCAAGATTGGTGACCAAGTATGCGTAAAAAGGTCTGTTGCAGAGCCTAGATATGCCTGGGGTGGTGAAACCCATCACAGCGTGGGAAAAATAATTGACATCGAGACTGTTGGGCTACTCATAATTGATATTCCTAACCGGGCTATACATTGGCAGGCAGATCCATCAGACATGGAAAAGATAGAAAAGTTTAAGGTCGGTGATTGGGTTAGAGTGAAGGCAACAGTACCATCCCCTAAATATGGCTGGGAGGATGTGACTCGTAGCAGTATTGGGGTGGTTCATAGTCTAGAAGAAGATGGAGATATGGGTGTTGCTTTCTGCTTCAG-AAGCAAGCCTTTTTCTTGCTCAGTTGCAGATGTGGAGAAGGCACAGCCTTTTGAGGTAGGAGAAAAAATTCATGTGTTACCTTCAATATCTCAGCCTCGCCTTGGATGGTCAAATGAAACTGCAGCAACCATCGGGGCTATCTCAAGGATAGACATGGATGGGACTCTAAATGTCAAGGTGTCTGGCAGAAATAGCTTGTGGAAGGTAGCTCCAGGTGATGCTGAGAGGCTTTCGGCTTTTGAGGTTGGAGACTGGGTGCGGTTGAAATCTAGTATTGGGAGCAGGCCTACTTATGACTGGAGTGTTGGGAAAATAAGTATTGCAGTAGTTCATAGCATTCAAGACTCTGGTTACCTGGAGTTGGCTGGTTGTTTCAGGAAAGGGAAATGGTTAACTCATAACACAGAAATTGATAAAGTAGAGCCTCTCAAGATTGGTCATCATGTTCGGTTCCGTGCTGGAATTACAGAGCCCAGATGGGGATGGAGAGATGCAAAGCCTGATTCCAGAGGCATAATTGCTGGTGTCCATGCTGATGGAGAAGTAAGAGTAGCCTTCTTTGGTGTGCCTGGGCTGTGGAAAGGTGATCCTGCAGATCTTGAGATTGAGCAAGTTTATGAGGTGGGTGAATGGGTTAGGCTGAGAAATAATGCAGATGATTGGAAGTCGCTCAAACCAGGTAGCATTGGCGTGGTACATGGGATTGGATATG] [+] EMBL CB634202 [TGGTTTTGTTCAGTCTGTTGTAGACCATGACCACCTTGTTGTGTCATTTTGTTCTGGAGAAGCCCGCGTTTTGACGAGTGAAGTTATCAAAGTCATTCCATTAAATAGGGGCCAACATGTGCAGCTCAAACCTGATGTTTTGGAGCCTAGATTTGGATGGCGTGGTCAGTCACGAGATAGCATTGGGACAGTTCTCTGTGTTGATGATGATGGAATCTTGAGGGTTGGTTTTCCAGGAGCTTCTAGGGGATGGAGAGCTGATCCTGCTGAAATTGTAAGGGTTGAAGAATATAAGGTTGGTAACTGGGTTCGGATTCGTCCCTCATTAACGGTTGCTGTACATGGCATGGAATCTATTACTCCTGGAAGTGTTGGTATTGTCTACTCAATCAGGCCAGACAGCAGTCTTCTATTGGGACTTTGCTATTTGTCAAGTCCATGGCTTTGTGAACCAGAGGAGGTTGAACATGTTGATCCCTTCAAGATTGGTGACCAAGTATGCGTAAAAAGGTCTGTTGCAGAGCCTAGATATGCCTGGGGTGGTGAAACCCATCACAGCGTGGGAAAAATAATTGACATCGAGAGTGATGGGCTACTCATAATTGATATTCCTAACCGGGCTGTACATTGGCAGGCAGATCCATCAGACATGGAAAAGATAGAAAAGTTTAAGGTCGGTGATTGGGTTAGAGTGAAGGCAACAGTACCATCCCCTANATATGGCTGGGAGGATGTGACTCGTAGCAGTATTGGGGTGGTTCATAGTCTAGAAGAAGATGGAGATATGGGTGTTGCTTTCTGCTTCAGAAAGC AGCCT ] [+] EMBL CB620894 [ AGACTTATGGGCTACTCATAATTGATATTCCTAACCGGGCTATACATTGGCAGGCAGATCCATCAGACATGGAAAACATAGAAAAGTTTAAGGTCGGTGATTGGGTTAGAGTGAAGGCAACAGTACCATCCCCTAAATATGGCTGGGAGGATGTGACTCGTAGCAGTATTGGGGTGGTTCATAGTCTAGAAGAAGATGGAGATATGGGTGTTGCTTTCTGCTTCAG AAGCAAGCCTTTTTCTTGCTCAGTTGCAGATGTGGAGAAGGCACAGCCTTTTGAGGTAGGAGAAAAAATTCATGTGTTACCTTCAATATCTCAGCCTCGCCTTGGATGGTCAAATGAAACTGCAGCAACCATCGGGGCTATCTCAAGGATAGACATGGATGGGACTCTAAATGTCAAGGTGTCTGGCAGAAATAGCTTGTGGAAGGTAGCTCCAGGTGATGCTGAGAGGCTTTCGGCTTTTGAGGTTGGAGACTGGGTGCGGTTGAAATCTAGTATTGGGAGCAGGCCTACTTATGACTGGAGTGTTGGGAAAATAAGTATTGCAGTAGTTCATAGCATTCAAGACTCTGGTTACCTGGAGTTGGCTGGTTGTTTCAGGAAAGGGAAATGGTTAACTCATAACACAGAAATTGATAAAGTAGAGCCTCTCAAGATTGGTCATCATGTTCGGTTCCGTGCTGGAATTACAGAGCCCAGATGGGGATGGAGAGATGCAAAGCCTGATTCCAGAGGCATAATTGCTGGTGTCCATGCTGATGGAGAAGTAAGAGTAGCCTTC ] [+] EMBL CB620864 [ AGACTTATGGGCTACTCATAATTGATATTCCTAACCGGGCTATACATTGGCAGGCAGATCCATCAGACATGGAAAAGATAGAAAAGTTTAAGGTCGGTGATTGGGTTAGAGTGAAGGCAACAGTACCATCCCCTAAATATGGCTGGGAGGATGTGACTCGTAGCAGTATTGGGGTGGTTCATAGTCTAGAAGAAGATGGAGATATGGGTGTTGCTTTCTGCTTCAG AAGCAAGCCTTTTTCTTGCTCAGTTGCAGATGTGGAGAAGGCACAGCCTTTTGAGGTAGGAGAAAAAATTCATGTGTTACCTTCAATATCTCAGCCTCGCCTTGGATGGTCAAATGAAACTGCAGCAACCATCGGGGCTATCTCAAGGATAGACATGGATGGGACTCTAAATGTCAAGGTGTCTGGCAGAAATAGCTTGTGGAAGGTAGCTCCAGGTGATGCTGAGAGGCTTTCGGCTTTTGAGGTTGGAGACTGGGTGCGGTTGAAATCTAGTATTGGGAGCAGGCCTACTTATGACTGGAGTGTTGGGAAAATAAGTATTGCAGTAGTTCATAGCATTCAAGACTCTGGTTACCTGGAGTTGGCTGGTTGTTTCAGGAAAGGGAAATGGTTAACTCATAACACAGAAATTGATAAAGTAGAGCCTCTCAAGATTGGTCATCATGTTCGGTTCCGTGCTGGAATTACAGAGCCCAGATGGGGATGGAGAGATGCAAAGCCTGATTCCAGAGGCATAATTGCTGGTGTCCATGCTGATGGAGAAGTAAGAG ] [+] EMBL CB621002 [ AGAGTCTTGGGCTACTCATAATTGATATTCCTAACCGGGCTATACATTGGCAGGCAGATCCATCAGACATGGAAAAGATAGAAAAGTTTAAGGTCGGTGATTGGGTTAGAGTGAAGGCAACAGTACCATCCCCTAAATATGGCTGGGAGGATGTGACTCGTAGCAGTATTGGGGTGGTTCATAGTCTAGAAGAAGATGGAGATATGGGTGTTGCTTTCTGCTTCAG AAGCAAGCCTTTTTCTTGCTCAGTTGCAAATGTGGAGAAGGCACAGCCTTTTGAGGTAGGAGAAAAAATTCATGTGTTACCTTCGATATCTCAGCCTCGCCTTGGATGGTCAAATGAAACTGCAGCAACCATCGGGGCTATCTCAAGGATAGACATGGATGGGACTCTAAATGTCAAGGTGTCTGGCAGAAATAGCTTGTGGAAGGTAGCTCCAGGTGATGCTGAGAGGCTTTCGGCTTTTGAGGTTGGAGACTGGGTGCGGTTGAAATCTAGTATTGGGAGCAGGCCTACTTATGACTGGAGTGTTGGGAAAATAAGTATTGCAGTAGTTCATAGCATTCAAGACTCTGGTTACCTGGAGTTGGCTGGTTGTTTCAGGAAAGGGAAATGGTTAACTCATAACACAGAAATTGATAAAGTAGAGCCTCTCAAGATTGGTCATCATGTTCGGTTCCGTGCTGGAATTACACAGCCCAGATGGGGATGGAGACATGCAAAGCCTGATTCCAGAGGCATAATTGCTGGTGTCCAT ] [+] EMBL CB620782 [ AGAGTCTTGGGCTACTCATAATTGATATTCCTAACCGGGCTATACATTGGCAGGCAGATCCATCAGACATGGAAAAGATAGAAAAGTTTAAGGTCGGTGATTGGGTTAGAGTGAAGGCAACAGTACCATCCCCTAAATATGGCTGGGAGGATGTGACTCGTAGCAGTATTGGGGTGGTTCATAGTCTAGAAGAAGATGGAGATATGGGTGTTGCTTTCTGCTTCAG AAGCAAGCCTTTTTCTTGCTCAGTTGCAGATGTGGAGAAGGCACAGCCTTTTGAGGTAGGAGAAAAAATTCATGTGTTACCTTCAATATCTCAGCCTCGCCTTGGATGGTCAAATGAAACTGCAGCAACCATCGGGGCTATCTCAAGGATAGACATGGATGGGACTCTAAATGTCAAGGTGTCTGGCAGAAATAGCTTGTGGAAGGTAGCTCCAGGTGATGCTGAGAGGCTTTCGGCTTTTGAGGTTGGAGACTGGGTGCGGTTGAAATCTAGTATTGGGAGCAGGCCTACTTATGACTGGAGTGTTGGGAAAATAAGTATTGCAGTAGTTCATAGCATTCAAGACTCTGGTTACCTGGAGTTGGCTGGTTGTTTCAGGAAAGGGAAATGGTTAACTCATAACACAGAAATTGATAAAGTAGAGCCTCTCAAGATTGGTCATCATGTTCGGTTCCGTGCTGGAATTACAGAGCCCAGATGGGGATGGAGAGATGCAAAGCCTGATTCCAGAGGCATAATTGCTGGTGTCC ] [+] EMBL CB620967 [ AGACCGTTGGGCTACTCATAATTGATATTCCTAACCGGGCTATACATTGGCAGGCAGATCCATCAGACATGGAAAAGATAGAAAAGTTTAAGGTCGGTGATTGGGTTAGAGTGAAGGCAACAGTACCATCCCCTAAATATGGCTGGGAGGATGTGACTCGTAGCAGTATTGGGGTGGTTCATAGTCTAGAAGAAGATGGAGATATGGGTGTTGCTTTCTGCTTCAG AAGCAAGCCTTTTTCTTGCTCAGTTGCAGATGTGGAGAAGGCACAGCCTTTTGAGGTAGGAGAAAAAATTCATGTGTTACCTTCAATATCTCAGCCTCGCCTTGGATGGTCAAATGAAACTGCAGCAACCATCGGGGCTATCTCAAGGATAGACATGGATGGGACTCTAAATGTCAAGGTGTCTGGCAGAAATAGCTTGTGGAAGGTAGCTCCAGGTGATGCTGAGAGGCTTTCGGCTTTTGAGGTTGGAGACTGGGTGCGGATGAAATCTAGTATTGGGAGCAGGCCTACTTATGACTGGAGTGTTGGGAAAATAAGTATTGCAGTAGTTCATAGCATTCAAGACTCTGGTTACCTGGAGTTGGCTGGTTGTTTCAGGAAAGGGAAATGGTTAACTCATAACACAGAAATTGATAAAGTAGAGCCTCTCAAGATTGGTCATCATGTTCGGTTCCGTGCTGGAATTACAGAGCCCACATGGGGATGGAGAGATGCAAAACCTGATTCCAGAGGCATAATTGCTGGTGTCC ] [+] EMBL CB620780 [ AGACCGTTGGGCTACTCATAATTGATATTCCTAACCGGGCTATACATTGGCAGGCAGATCCATCAGACATGGAAAAGATAGAAAAGTTTAAGGTCCGTGATTGGGTTAAAGTGAAGGCAACAGTACCATCCCCTAAATATGGCTGGGAGGATGTGACTCGTAGCAGTATTGGGGTGGTTCATAGTCTAGAAGAAGATGGAGATATGGGTGTTGCTTTCTGCTTCAG AATCAAGCCTTTTTCTTGCTCAGTTGCAGATGTGGAGAAGGCACAGCCTTTTGAGGTAGGAGAAAAAATTCATGTGTTACCTTCAATATCTCAGCCTCGCCTTGGATGGTCAAATGAAACTGCAGCAACCATCGGGGCTATCTCAAGGATAGACATGGATGGGACTCTAAATGTCAAGGTGTCTGGCAGAAATATCTTGCGGAAGGTAGCTCCAGGTGATGCTGAGAGGCTTTCGGCTTTTGAGGTTGGAGACTGGGTGCGGTTGAAATCTACTATTGGGAGCAGGCCTACTTATGACTGGAGTGTTGGGAAAATAAGTATTGCAGTAGTTCATAGCATTCAAGACTCTGGTTACCTGGAGTTGGCTGGTTGTTTCAGGAAAGGGAAATGGTTAACTCATAACACAGAAATTGATAAAGTAGAGCCTCTCAAGATTGGTCATCATGTTCGGTTCCGTGCTGGAATTACACAGCCCACATGGGGATGGAGAGATGCAAAGCCTGATTCCAGAGGCATAATTGCTGGTGT ] [+] EMBL CB620932 [ TGGGTGTTGCTTTCTGCTTCAG AAGCAACCCTTTTTCTTGCTCAGATGCACATGTGGAGAAGGCACATCCTTTTGACGTACGAGAAAAAATTCATGTGTTACCTTCAATATCTCAGCCTCGCCTTGGATGGTCGAATGAAACTGCAGCTACCATCGGGGCTATCTCAAGGATAGACATGGATGGGACTCTAAATGTCAAGGTGTCTGGCAGAAATAGCTTGTGGAACGTAGCTCCACGTGATGCTGAGAGGCTTTCGGCTTTTGAGGTTGGAGACTGGGTGCGGTTGAAGTCTAGTATTGGGAGCAGGCCTACTTATGACTGGAGTGTTGGGAAAATAAGTATTGCAGTAGTTCATAGCATTCAAGACTCTGG ] [+] EMBL CB664258 [ ATAGACATGGATGGGACTCTAAATGTCAAGGTGTCTGGCAGAAATAGCTTGTGGAAGGTAGCTCCAGGTGATGCTGAGAGGCTTTCGGCTTTTGAGGTTGGAGACTGGGTGCGGTTGAAATCTAGTATTGGGAGCAGGCCTACTTATGACTGGAGTGTTGGGAAAATAAGTATTGCAGTAGTTCATAGCATTCAAGACTCTGGTTACCTGGAGTTGGCTGGTTGTTTCAGGAAAGGGAAATGGTTAACTCATAACACAGAAATTGATAAAGTAGAGCCTCTCAAGATTGGTCATCATGTTCGGTTCCGTGCTGGAATTACAGAGCCCAGATGGGGATGGAGAGATGCAAAGCCTGATTCCAGAGGCATAATTGCTGGTGTCCATGCTGATGGAGAAGTAAGAGTAGCCTTCTTTGGTGTGCCTGGGCTGTGGAAAGGTGATCCTGCAGATCTTGAGATTGAGCAAGTTTATGAGGTGGGTGAATGGGTTAGGCTGAGAAATAATGCAGATGATTGGAAGTCGCTCAAACCAGGTAGCATTGGCGTGGTACATGGGATTGGATATG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||