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Oryza sativa
cluster # 11978 cluster # 11978       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_11978#0 length = 1520 sequences # 9  

consensusID : consensus_11978#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1520
fasta sequence
                              [TGGTTTTGTTCAGTCTGTTGTAGACCATGACCACCTTGTTGTGTCATTTTGTTCTGGAGAAGCCCGCGTTTTGACGAGTGAAGTTATCAAAGTCATTCCATTAAATAGGGGCCAACATGTGCAGCTCAAACCTGATGTTTTGGAGCCTAGATTTGGATGGCGTGGTCAGTCACGAGATAGCATTGGGACAGTTCTCTGTGTTGATGATGATGGAATCTTGAGGGTTGGTTTTCCAGGAGCTTCTAGGGGATGGAGAGCTGATCCTGCTGAAATTGTAAGGGTTGAAGAATATAAGGTTGGTAACTGGGTTCGGATTCGTCCCTCATTAACGGTTGCTGTACATGGCATGGAATCTATTACTCCTGGAAGTGTTGGTATTGTCTACTCAATCAGGCCAGACAGCAGTCTTCTATTGGGACTTTGCTATTTGTCAAGTCCATGGCTTTGTGAACCAGAGGAGGTTGAACATGTTGATCCCTTCAAGATTGGTGACCAAGTATGCGTAAAAAGGTCTGTTGCAGAGCCTAGATATGCCTGGGGTGGTGAAACCCATCACAGCGTGGGAAAAATAATTGACATCGAGACTGTTGGGCTACTCATAATTGATATTCCTAACCGGGCTATACATTGGCAGGCAGATCCATCAGACATGGAAAAGATAGAAAAGTTTAAGGTCGGTGATTGGGTTAGAGTGAAGGCAACAGTACCATCCCCTAAATATGGCTGGGAGGATGTGACTCGTAGCAGTATTGGGGTGGTTCATAGTCTAGAAGAAGATGGAGATATGGGTGTTGCTTTCTGCTTCAG-AAGCAAGCCTTTTTCTTGCTCAGTTGCAGATGTGGAGAAGGCACAGCCTTTTGAGGTAGGAGAAAAAATTCATGTGTTACCTTCAATATCTCAGCCTCGCCTTGGATGGTCAAATGAAACTGCAGCAACCATCGGGGCTATCTCAAGGATAGACATGGATGGGACTCTAAATGTCAAGGTGTCTGGCAGAAATAGCTTGTGGAAGGTAGCTCCAGGTGATGCTGAGAGGCTTTCGGCTTTTGAGGTTGGAGACTGGGTGCGGTTGAAATCTAGTATTGGGAGCAGGCCTACTTATGACTGGAGTGTTGGGAAAATAAGTATTGCAGTAGTTCATAGCATTCAAGACTCTGGTTACCTGGAGTTGGCTGGTTGTTTCAGGAAAGGGAAATGGTTAACTCATAACACAGAAATTGATAAAGTAGAGCCTCTCAAGATTGGTCATCATGTTCGGTTCCGTGCTGGAATTACAGAGCCCAGATGGGGATGGAGAGATGCAAAGCCTGATTCCAGAGGCATAATTGCTGGTGTCCATGCTGATGGAGAAGTAAGAGTAGCCTTCTTTGGTGTGCCTGGGCTGTGGAAAGGTGATCCTGCAGATCTTGAGATTGAGCAAGTTTATGAGGTGGGTGAATGGGTTAGGCTGAGAAATAATGCAGATGATTGGAAGTCGCTCAAACCAGGTAGCATTGGCGTGGTACATGGGATTGGATATG]

[+] EMBL CB634202             [TGGTTTTGTTCAGTCTGTTGTAGACCATGACCACCTTGTTGTGTCATTTTGTTCTGGAGAAGCCCGCGTTTTGACGAGTGAAGTTATCAAAGTCATTCCATTAAATAGGGGCCAACATGTGCAGCTCAAACCTGATGTTTTGGAGCCTAGATTTGGATGGCGTGGTCAGTCACGAGATAGCATTGGGACAGTTCTCTGTGTTGATGATGATGGAATCTTGAGGGTTGGTTTTCCAGGAGCTTCTAGGGGATGGAGAGCTGATCCTGCTGAAATTGTAAGGGTTGAAGAATATAAGGTTGGTAACTGGGTTCGGATTCGTCCCTCATTAACGGTTGCTGTACATGGCATGGAATCTATTACTCCTGGAAGTGTTGGTATTGTCTACTCAATCAGGCCAGACAGCAGTCTTCTATTGGGACTTTGCTATTTGTCAAGTCCATGGCTTTGTGAACCAGAGGAGGTTGAACATGTTGATCCCTTCAAGATTGGTGACCAAGTATGCGTAAAAAGGTCTGTTGCAGAGCCTAGATATGCCTGGGGTGGTGAAACCCATCACAGCGTGGGAAAAATAATTGACATCGAGAGTGATGGGCTACTCATAATTGATATTCCTAACCGGGCTGTACATTGGCAGGCAGATCCATCAGACATGGAAAAGATAGAAAAGTTTAAGGTCGGTGATTGGGTTAGAGTGAAGGCAACAGTACCATCCCCTANATATGGCTGGGAGGATGTGACTCGTAGCAGTATTGGGGTGGTTCATAGTCTAGAAGAAGATGGAGATATGGGTGTTGCTTTCTGCTTCAGAAAGC AGCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CB620894             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGACTTATGGGCTACTCATAATTGATATTCCTAACCGGGCTATACATTGGCAGGCAGATCCATCAGACATGGAAAACATAGAAAAGTTTAAGGTCGGTGATTGGGTTAGAGTGAAGGCAACAGTACCATCCCCTAAATATGGCTGGGAGGATGTGACTCGTAGCAGTATTGGGGTGGTTCATAGTCTAGAAGAAGATGGAGATATGGGTGTTGCTTTCTGCTTCAG AAGCAAGCCTTTTTCTTGCTCAGTTGCAGATGTGGAGAAGGCACAGCCTTTTGAGGTAGGAGAAAAAATTCATGTGTTACCTTCAATATCTCAGCCTCGCCTTGGATGGTCAAATGAAACTGCAGCAACCATCGGGGCTATCTCAAGGATAGACATGGATGGGACTCTAAATGTCAAGGTGTCTGGCAGAAATAGCTTGTGGAAGGTAGCTCCAGGTGATGCTGAGAGGCTTTCGGCTTTTGAGGTTGGAGACTGGGTGCGGTTGAAATCTAGTATTGGGAGCAGGCCTACTTATGACTGGAGTGTTGGGAAAATAAGTATTGCAGTAGTTCATAGCATTCAAGACTCTGGTTACCTGGAGTTGGCTGGTTGTTTCAGGAAAGGGAAATGGTTAACTCATAACACAGAAATTGATAAAGTAGAGCCTCTCAAGATTGGTCATCATGTTCGGTTCCGTGCTGGAATTACAGAGCCCAGATGGGGATGGAGAGATGCAAAGCCTGATTCCAGAGGCATAATTGCTGGTGTCCATGCTGATGGAGAAGTAAGAGTAGCCTTC                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CB620864             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGACTTATGGGCTACTCATAATTGATATTCCTAACCGGGCTATACATTGGCAGGCAGATCCATCAGACATGGAAAAGATAGAAAAGTTTAAGGTCGGTGATTGGGTTAGAGTGAAGGCAACAGTACCATCCCCTAAATATGGCTGGGAGGATGTGACTCGTAGCAGTATTGGGGTGGTTCATAGTCTAGAAGAAGATGGAGATATGGGTGTTGCTTTCTGCTTCAG AAGCAAGCCTTTTTCTTGCTCAGTTGCAGATGTGGAGAAGGCACAGCCTTTTGAGGTAGGAGAAAAAATTCATGTGTTACCTTCAATATCTCAGCCTCGCCTTGGATGGTCAAATGAAACTGCAGCAACCATCGGGGCTATCTCAAGGATAGACATGGATGGGACTCTAAATGTCAAGGTGTCTGGCAGAAATAGCTTGTGGAAGGTAGCTCCAGGTGATGCTGAGAGGCTTTCGGCTTTTGAGGTTGGAGACTGGGTGCGGTTGAAATCTAGTATTGGGAGCAGGCCTACTTATGACTGGAGTGTTGGGAAAATAAGTATTGCAGTAGTTCATAGCATTCAAGACTCTGGTTACCTGGAGTTGGCTGGTTGTTTCAGGAAAGGGAAATGGTTAACTCATAACACAGAAATTGATAAAGTAGAGCCTCTCAAGATTGGTCATCATGTTCGGTTCCGTGCTGGAATTACAGAGCCCAGATGGGGATGGAGAGATGCAAAGCCTGATTCCAGAGGCATAATTGCTGGTGTCCATGCTGATGGAGAAGTAAGAG                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CB621002             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGAGTCTTGGGCTACTCATAATTGATATTCCTAACCGGGCTATACATTGGCAGGCAGATCCATCAGACATGGAAAAGATAGAAAAGTTTAAGGTCGGTGATTGGGTTAGAGTGAAGGCAACAGTACCATCCCCTAAATATGGCTGGGAGGATGTGACTCGTAGCAGTATTGGGGTGGTTCATAGTCTAGAAGAAGATGGAGATATGGGTGTTGCTTTCTGCTTCAG AAGCAAGCCTTTTTCTTGCTCAGTTGCAAATGTGGAGAAGGCACAGCCTTTTGAGGTAGGAGAAAAAATTCATGTGTTACCTTCGATATCTCAGCCTCGCCTTGGATGGTCAAATGAAACTGCAGCAACCATCGGGGCTATCTCAAGGATAGACATGGATGGGACTCTAAATGTCAAGGTGTCTGGCAGAAATAGCTTGTGGAAGGTAGCTCCAGGTGATGCTGAGAGGCTTTCGGCTTTTGAGGTTGGAGACTGGGTGCGGTTGAAATCTAGTATTGGGAGCAGGCCTACTTATGACTGGAGTGTTGGGAAAATAAGTATTGCAGTAGTTCATAGCATTCAAGACTCTGGTTACCTGGAGTTGGCTGGTTGTTTCAGGAAAGGGAAATGGTTAACTCATAACACAGAAATTGATAAAGTAGAGCCTCTCAAGATTGGTCATCATGTTCGGTTCCGTGCTGGAATTACACAGCCCAGATGGGGATGGAGACATGCAAAGCCTGATTCCAGAGGCATAATTGCTGGTGTCCAT                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CB620782             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGAGTCTTGGGCTACTCATAATTGATATTCCTAACCGGGCTATACATTGGCAGGCAGATCCATCAGACATGGAAAAGATAGAAAAGTTTAAGGTCGGTGATTGGGTTAGAGTGAAGGCAACAGTACCATCCCCTAAATATGGCTGGGAGGATGTGACTCGTAGCAGTATTGGGGTGGTTCATAGTCTAGAAGAAGATGGAGATATGGGTGTTGCTTTCTGCTTCAG AAGCAAGCCTTTTTCTTGCTCAGTTGCAGATGTGGAGAAGGCACAGCCTTTTGAGGTAGGAGAAAAAATTCATGTGTTACCTTCAATATCTCAGCCTCGCCTTGGATGGTCAAATGAAACTGCAGCAACCATCGGGGCTATCTCAAGGATAGACATGGATGGGACTCTAAATGTCAAGGTGTCTGGCAGAAATAGCTTGTGGAAGGTAGCTCCAGGTGATGCTGAGAGGCTTTCGGCTTTTGAGGTTGGAGACTGGGTGCGGTTGAAATCTAGTATTGGGAGCAGGCCTACTTATGACTGGAGTGTTGGGAAAATAAGTATTGCAGTAGTTCATAGCATTCAAGACTCTGGTTACCTGGAGTTGGCTGGTTGTTTCAGGAAAGGGAAATGGTTAACTCATAACACAGAAATTGATAAAGTAGAGCCTCTCAAGATTGGTCATCATGTTCGGTTCCGTGCTGGAATTACAGAGCCCAGATGGGGATGGAGAGATGCAAAGCCTGATTCCAGAGGCATAATTGCTGGTGTCC                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CB620967             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGACCGTTGGGCTACTCATAATTGATATTCCTAACCGGGCTATACATTGGCAGGCAGATCCATCAGACATGGAAAAGATAGAAAAGTTTAAGGTCGGTGATTGGGTTAGAGTGAAGGCAACAGTACCATCCCCTAAATATGGCTGGGAGGATGTGACTCGTAGCAGTATTGGGGTGGTTCATAGTCTAGAAGAAGATGGAGATATGGGTGTTGCTTTCTGCTTCAG AAGCAAGCCTTTTTCTTGCTCAGTTGCAGATGTGGAGAAGGCACAGCCTTTTGAGGTAGGAGAAAAAATTCATGTGTTACCTTCAATATCTCAGCCTCGCCTTGGATGGTCAAATGAAACTGCAGCAACCATCGGGGCTATCTCAAGGATAGACATGGATGGGACTCTAAATGTCAAGGTGTCTGGCAGAAATAGCTTGTGGAAGGTAGCTCCAGGTGATGCTGAGAGGCTTTCGGCTTTTGAGGTTGGAGACTGGGTGCGGATGAAATCTAGTATTGGGAGCAGGCCTACTTATGACTGGAGTGTTGGGAAAATAAGTATTGCAGTAGTTCATAGCATTCAAGACTCTGGTTACCTGGAGTTGGCTGGTTGTTTCAGGAAAGGGAAATGGTTAACTCATAACACAGAAATTGATAAAGTAGAGCCTCTCAAGATTGGTCATCATGTTCGGTTCCGTGCTGGAATTACAGAGCCCACATGGGGATGGAGAGATGCAAAACCTGATTCCAGAGGCATAATTGCTGGTGTCC                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CB620780             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGACCGTTGGGCTACTCATAATTGATATTCCTAACCGGGCTATACATTGGCAGGCAGATCCATCAGACATGGAAAAGATAGAAAAGTTTAAGGTCCGTGATTGGGTTAAAGTGAAGGCAACAGTACCATCCCCTAAATATGGCTGGGAGGATGTGACTCGTAGCAGTATTGGGGTGGTTCATAGTCTAGAAGAAGATGGAGATATGGGTGTTGCTTTCTGCTTCAG AATCAAGCCTTTTTCTTGCTCAGTTGCAGATGTGGAGAAGGCACAGCCTTTTGAGGTAGGAGAAAAAATTCATGTGTTACCTTCAATATCTCAGCCTCGCCTTGGATGGTCAAATGAAACTGCAGCAACCATCGGGGCTATCTCAAGGATAGACATGGATGGGACTCTAAATGTCAAGGTGTCTGGCAGAAATATCTTGCGGAAGGTAGCTCCAGGTGATGCTGAGAGGCTTTCGGCTTTTGAGGTTGGAGACTGGGTGCGGTTGAAATCTACTATTGGGAGCAGGCCTACTTATGACTGGAGTGTTGGGAAAATAAGTATTGCAGTAGTTCATAGCATTCAAGACTCTGGTTACCTGGAGTTGGCTGGTTGTTTCAGGAAAGGGAAATGGTTAACTCATAACACAGAAATTGATAAAGTAGAGCCTCTCAAGATTGGTCATCATGTTCGGTTCCGTGCTGGAATTACACAGCCCACATGGGGATGGAGAGATGCAAAGCCTGATTCCAGAGGCATAATTGCTGGTGT                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CB620932             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGGGTGTTGCTTTCTGCTTCAG AAGCAACCCTTTTTCTTGCTCAGATGCACATGTGGAGAAGGCACATCCTTTTGACGTACGAGAAAAAATTCATGTGTTACCTTCAATATCTCAGCCTCGCCTTGGATGGTCGAATGAAACTGCAGCTACCATCGGGGCTATCTCAAGGATAGACATGGATGGGACTCTAAATGTCAAGGTGTCTGGCAGAAATAGCTTGTGGAACGTAGCTCCACGTGATGCTGAGAGGCTTTCGGCTTTTGAGGTTGGAGACTGGGTGCGGTTGAAGTCTAGTATTGGGAGCAGGCCTACTTATGACTGGAGTGTTGGGAAAATAAGTATTGCAGTAGTTCATAGCATTCAAGACTCTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CB664258             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATAGACATGGATGGGACTCTAAATGTCAAGGTGTCTGGCAGAAATAGCTTGTGGAAGGTAGCTCCAGGTGATGCTGAGAGGCTTTCGGCTTTTGAGGTTGGAGACTGGGTGCGGTTGAAATCTAGTATTGGGAGCAGGCCTACTTATGACTGGAGTGTTGGGAAAATAAGTATTGCAGTAGTTCATAGCATTCAAGACTCTGGTTACCTGGAGTTGGCTGGTTGTTTCAGGAAAGGGAAATGGTTAACTCATAACACAGAAATTGATAAAGTAGAGCCTCTCAAGATTGGTCATCATGTTCGGTTCCGTGCTGGAATTACAGAGCCCAGATGGGGATGGAGAGATGCAAAGCCTGATTCCAGAGGCATAATTGCTGGTGTCCATGCTGATGGAGAAGTAAGAGTAGCCTTCTTTGGTGTGCCTGGGCTGTGGAAAGGTGATCCTGCAGATCTTGAGATTGAGCAAGTTTATGAGGTGGGTGAATGGGTTAGGCTGAGAAATAATGCAGATGATTGGAAGTCGCTCAAACCAGGTAGCATTGGCGTGGTACATGGGATTGGATATG]


>consensus_11978#0 TGGTTTTGTTCAGTCTGTTGTAGACCATGACCACCTTGTTGTGTCATTTTGTTCTGGAGA AGCCCGCGTTTTGACGAGTGAAGTTATCAAAGTCATTCCATTAAATAGGGGCCAACATGT GCAGCTCAAACCTGATGTTTTGGAGCCTAGATTTGGATGGCGTGGTCAGTCACGAGATAG CATTGGGACAGTTCTCTGTGTTGATGATGATGGAATCTTGAGGGTTGGTTTTCCAGGAGC TTCTAGGGGATGGAGAGCTGATCCTGCTGAAATTGTAAGGGTTGAAGAATATAAGGTTGG TAACTGGGTTCGGATTCGTCCCTCATTAACGGTTGCTGTACATGGCATGGAATCTATTAC TCCTGGAAGTGTTGGTATTGTCTACTCAATCAGGCCAGACAGCAGTCTTCTATTGGGACT TTGCTATTTGTCAAGTCCATGGCTTTGTGAACCAGAGGAGGTTGAACATGTTGATCCCTT CAAGATTGGTGACCAAGTATGCGTAAAAAGGTCTGTTGCAGAGCCTAGATATGCCTGGGG TGGTGAAACCCATCACAGCGTGGGAAAAATAATTGACATCGAGACTGTTGGGCTACTCAT AATTGATATTCCTAACCGGGCTATACATTGGCAGGCAGATCCATCAGACATGGAAAAGAT AGAAAAGTTTAAGGTCGGTGATTGGGTTAGAGTGAAGGCAACAGTACCATCCCCTAAATA TGGCTGGGAGGATGTGACTCGTAGCAGTATTGGGGTGGTTCATAGTCTAGAAGAAGATGG AGATATGGGTGTTGCTTTCTGCTTCAGAAGCAAGCCTTTTTCTTGCTCAGTTGCAGATGT GGAGAAGGCACAGCCTTTTGAGGTAGGAGAAAAAATTCATGTGTTACCTTCAATATCTCA GCCTCGCCTTGGATGGTCAAATGAAACTGCAGCAACCATCGGGGCTATCTCAAGGATAGA CATGGATGGGACTCTAAATGTCAAGGTGTCTGGCAGAAATAGCTTGTGGAAGGTAGCTCC AGGTGATGCTGAGAGGCTTTCGGCTTTTGAGGTTGGAGACTGGGTGCGGTTGAAATCTAG TATTGGGAGCAGGCCTACTTATGACTGGAGTGTTGGGAAAATAAGTATTGCAGTAGTTCA TAGCATTCAAGACTCTGGTTACCTGGAGTTGGCTGGTTGTTTCAGGAAAGGGAAATGGTT AACTCATAACACAGAAATTGATAAAGTAGAGCCTCTCAAGATTGGTCATCATGTTCGGTT CCGTGCTGGAATTACAGAGCCCAGATGGGGATGGAGAGATGCAAAGCCTGATTCCAGAGG CATAATTGCTGGTGTCCATGCTGATGGAGAAGTAAGAGTAGCCTTCTTTGGTGTGCCTGG GCTGTGGAAAGGTGATCCTGCAGATCTTGAGATTGAGCAAGTTTATGAGGTGGGTGAATG GGTTAGGCTGAGAAATAATGCAGATGATTGGAAGTCGCTCAAACCAGGTAGCATTGGCGT GGTACATGGGATTGGATATG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)