cluster # 1245

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Oryza sativa
cluster # 1245 cluster # 1245 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1245#0 length = 637 sequences # 2

consensusID : consensus_1245#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 637
fasta sequence

                              [TTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGTTAAGAGTGTGACGAATTTTTGTCAGCCATTGAATGAGATAAATTCGTGCGTCACGAAAAACAACCCGCGCCAATTTATATCTACCCGACGTTATGCTTTGACTATTTCACAGGTGGTACGATCCAGTTTCCGCTGATACTGGTTACCTGTACGTGTATCATTAATCGTTATGCTGTAATTAATTCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCAGATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCATTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTCAACAATAGCGATATTAATACCCTCCCTGGCATTTGTTTTATCGACATGGTAAATAATCTCTAAGGTTATTAATAAGAGTTAAAATGTCACTTTGATAATGACGTGGTTATCATTAAAACAATGCCTGTAGATAAAGTGTT]

[+] EMBL CF307202             [TTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGTTAAGAGTGTGACGAATTTTTGTCAGCCATTGAATGAGATAAATTCGTGCGTCACGAAAAACAACCCGCGCCAATTTATATCTACCCGACGTTATGCTTTGACTATTTCACAGGTGGTACGATCCAGTTTCCGCTGATACTGGTTACCTGTACGTGTATCATTAATCGTTATGCTGTAATTAATTCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCAGATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCATTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTCAACAATAGCGATATTAATACCCTCCCTGGCATTTGTTTTATCGACATGGTAAATAATCTCTAAGGTTATTAATAAGAGTTAAAATGTCACTTTGATAATGACGTGGTTATCATTAAAACAATGCCTGTAGATAAAGTGTT]
[+] EMBL CF307530             [TTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGTTAAGAGTGTGACGAATTTTTGTCAGCCATTGAATGAGATAAATTCGTGCGTCACGAAAAACAACCCGCGCCAATTTATATCTACCCGACGTTATGCTTTGACTATTCCACAGGTGGTACGATCCAGTTTCCGCTGATACTGGTTACCTGTACGTGTATCATTAATCGTTATGCTGTAATTAATTCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCAGATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCATTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTCAACAATAGCGATATTAATACCCTCCCTGGCATTTGTTTTATCGACATGGTAAATAATCTCTAAGGTTATTAATAAGAGTTAAAATGTCACTTTGATAATGACGTGGTTATCATTAAAACAATGCCTGTAGATAAAGTG  ]




>consensus_1245#0
TTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGTTAAGAGTGTGACGAATT
TTTGTCAGCCATTGAATGAGATAAATTCGTGCGTCACGAAAAACAACCCGCGCCAATTTA
TATCTACCCGACGTTATGCTTTGACTATTTCACAGGTGGTACGATCCAGTTTCCGCTGAT
ACTGGTTACCTGTACGTGTATCATTAATCGTTATGCTGTAATTAATTCCCTCAGTGATCA
TTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAG
GCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGC
TACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCAGATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATAT
TTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCATTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTA
ATAATCCTGTAACGCTCAACAATAGCGATATTAATACCCTCCCTGGCATTTGTTTTATCG
ACATGGTAAATAATCTCTAAGGTTATTAATAAGAGTTAAAATGTCACTTTGATAATGACG
TGGTTATCATTAAAACAATGCCTGTAGATAAAGTGTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case