cluster # 1414

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Oryza sativa
cluster # 1414 cluster # 1414 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_1414#0 length = 1858 sequences # 2
consensusID : consensus_1414#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1858
fasta sequence
                              [CGCCGGCTAAACCCGCGGAAATCCCCTTCCGCTTTGTCTCGTTTCCTCCTCCTGCCCCCTCGGCACTGCACCGCCGCAGCTTCCACCATGGCCGTCGCCAGCGAGGCCGCTTGTCGTCGGGCGGCTAGCTGCTTCTTTGAGGTCGGCAGGCAAGAGATCGGCTCCTCCACCCCGCGCGCCTCCTCGCGCCGAATCAGCGGCTCCGAGGGCCTAGTGATGCGGATGCATCAGTATGGAAAGTTGCGAGGCCATGATGGTTGTGTTAATACTGTCAGCTTCAATCCTGCTGGTAACCTCCTTGTGTCTGGTTCGGACGACATGGACATCATATTATGGGATTGGCTTGCTAAAACACAAAGGCTCATTTACCCTTCTGGCCATCAAGAAAATGTTTTCCATGCTCGTGTAATGCCATTTACAGATGATAGCGCCATTGTAACTGTTGCTGCTGATGGTCAGGTTAGAGTGGGACAACTGAACGAGGGTGGTGAAGTCACAACCAAACAAATTGGGGTGCACGATGATCGTGCACATAAGTTGGCCATTGAACCAGGAAGTCCTTACATATTTTACAGTTGCGGGGAAGATGGTTTGGTACAACATTTTGACTTGCGGAATGATTCACCAATGAAGCTCTTCAGCTGCTATTCATTCTCAAATAGCAGGCGTCGTGTAAGGCTTAATACCATTGCCATTGACCCTTGGAACCCTAATTATCTTTCAATTGGTGGTTCTGATGAGTATGTGCGGGTATATGATTTGAGGAGAATCCAGTTGGGTGCTTCAAATGACATGAACCAACCTGTAGATACCTTCTGCCCTAAGCACCTTATGGGTGGGAAGGTCCACATAACTGGTATTGCATACTCCTACGCAAGGGAGATACTTGTCTCTTACAATGATGAACATATCTATTTATTCCAAAACAATATGGGTCTTGGTCCAAATCCTGAATCAGCGCAAGCAGAGTTCTTGGACAGGCTTGAGCAGCCACAGGCATACACAGGCCACAGAAATTTCCGAACTGTTAAGGGAGTCAGTTTTTTTGGACCGAACGATGAATATGTCTTGAGTGGATCGGATTGTGGGAATGTATTTGTATGGAGAAAGAAGGGAGGTGAACTATTGAGGATGATGCATGGTGACAAAAGTGTAGTTAATTGCATTGAACCCCATCCACATTTTCCGTTCCTAGCTACTAGTGGGATTGACAAAACTGTCAAGATTTGGACACCTTCAGCAAATAAAGTGATGTCGCTGCCTAAAAACGCAAAGCAAATAATAGCTTCCAACAAGCGGGCGAGAGAAATTGATGCATCTCGACCGGAGCTGACGCTTTCATCCGACCTCATCATGCATGTTTTGAGGTTGCAGAGGAGACAGTCTGAATTGTACAGGGAGCATGAACCAGCTACTGCAGATTTGGCAAGTGATGATGATGAGTCTTTCTTCGCTGGGTTTGATGATGCCAATAGGAATGTAAGATCTAACTCTGATCCAAGGGAATGCATTGTGACATGAAAGGAACTGAAGATTTACAGCCTGCCCCTTATACTTTTAGCCTGCAGCCTGATGCCCTGATATACCATGCTATGCTGCATATGCAGGGCTTAGCAAACGATGCAACAAGAGGAACACAGATACTCATGATACGTGCCGGCAAGATTAAACGGTTAGGACTTAAAAGTGTGACGACCTACCTTGATAGTGTTGTAAACCAGGAGTGTTACTGGGTGTTTTCATCTCATGTACTTAGTCTAGTATTAGTAAAAAATAATCACTTTGCTGGCAAGGAAATGCGCATGTAATTATGGAGTACTCCGTATATTTGAGAATTTCTATGGCGATGCTAAGCGAA]

[+] EMBL AK111707             [CGCCGGCTAAACCCGCGGAAATCCCCTTCCGCTTTGTCTCGTTTCCTCCTCCTGCCCCCTCGGCACTGCACCGCCGCAGCTTCCACCATGGCCGTCGCCAGCGAGGCCGCTTGTCGTCGGGCGGCTAGCTGCTTCTTTGAGGTCGGCAGGCAAGAGATCGGCTCCTCCACCCCGCGCGCCTCCTCGCGCCGAATCAGCGGCTCCGAGGGCCTAGTGATGCGGATGCATCAGTATGGAAAGTTGCGAGGCCATGATGGTTGTGTTAATACTGTCAGCTTCAATCCTGCTGGTAACCTCCTTGTGTCTGGTTCGGACGACATGGACATCATATTATGGGATTGGCTTGCTAAAACACAAAGGCTCATTTACCCTTCTGGCCATCAAGAAAATGTTTTCCATGCTCGTGTAATGCCATTTACAGATGATAGCGCCATTGTAACTGTTGCTGCTGATGGTCAGGTTAGAGTGGGACAACTGAACGAGGGTGGTGAAGTCACAACCAAACAAATTGGGGTGCACGATGATCGTGCACATAAGTTGGCCATTGAACCAGGAAGTCCTTACATATTTTACAGTTGCGGGGAAGATGGTTTGGTACAACATTTTGACTTGCGGAATGATTCACCAATGAAGCTCTTCAGCTGCTATTCATTCTCAAATAGCAGGCGTCGTGTAAGGCTTAATACCATTGCCATTGACCCTTGGAACCCTAATTATCTTTCAATTGGTGGTTCTGATGAGTATGTGCGGGTATATGATTTGAGGAGAATCCAGTTGGGTGCTTCAAATGACATGAACCAACCTGTAGATACCTTCTGCCCTAAGCACCTTATGGGTGGGAAGGTCCACATAACTGGTATTGCATACTCCTACGCAAGGGAGATACTTGTCTCTTACAATGATGAACATATCTATTTATTCCAAAACAATATGGGTCTTGGTCCAAATCCTGAATCAGCGCAAGCAGAGTTCTTGGACAGGCTTGAGCAGCCACAGGCATACACAGGCCACAGAAATTTCCGAACTGTTAAGGGAGTCAGTTTTTTTGGACCGAACGATGAATATGTCTTGAGTGGATCGGATTGTGGGAATGTATTTGTATGGAGAAAGAAGGGAGGTGAACTATTGAGGATGATGCATGGTGACAAAAGTGTAGTTAATTGCATTGAACCCCATCCACATTTTCCGTTCCTAGCTACTAGTGGGATTGACAAAACTGTCAAGATTTGGACACCTTCAGCAAATAAAGTGATGTCGCTGCCTAAAAACGCAAAGCAAATAATAGCTTCCAACAAGCGGGCGAGAGAAATTGATGCATCTCGACCGGAGCTGACGCTTTCATCCGACCTCATCATGCATGTTTTGAGGTTGCAGAGGAGACAGTCTGAATTGTACAGGGAGCATGAACCAGCTACTGCAGATTTGGCAAGTGATGATGATGAGTCTTTCTTCGCTGGGTTTGATGATGCCAATAGGAATGTAAGATCTAACTCTGATCCAAGGGAATGCATTGTGACATGAAAGGAACTGAAGATTTACAGCCTGCCCCTTATACTTTTAGCCTGCAGCCTGATGCCCTGATATACCATGCTATGCTGCATATGCAGGGCTTAGCAAACGATGCAACAAGAGGAACACAGATACTCATGATACGTGCCGGCAAGATTAAACGGTTAGGACTTAAAAGTGTGACGACCTACCTTGATAGTGTTGTAAACCAGGAGTGTTACTGGGTGTTTTCATCTCATGTACTTAGTCTAGTATTAGTAAAAAATAATCACTTTGCTGGCAAGGAAATGCGCATGTAATTATGGAGTACTCCGTATATTTGAGAATTTCTATGGCGATGCTAAGCG  ]
[-] EMBL CA763313             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATTGAACCCCATCCACA TTTCCGTTCCTAGCTACTAGTGGGATTGACAAAACTGTCAAGATTTGGACACCTTCAGCAAATAAAGTGATGTCGCTGCCTAAAAACGCAAAGCAAATAATAGCTTCCAACAAGCGGGCGAGAGAAATTGATGCATCTCGACCGGAGCTGACGCTTTCATCCGACCTCATCATGCATGTTTTGAGGTTGCAGAGGAGACAGTTTGAATTGTACAGGGAGCATGAACCAGCTACTGCAGATTTGGCAAGTGATGATGATGAGTCTTTCTTCGCTGGGTTTGATGATGCCAATAGGAATGTAAGATCTAACTCTGATCCAAGGGAATGCATTGTGACATGAAAGGAACTGAAGATTTACAGCCTGCCCCTTATACTTTTAGCCTGCAGCCTGATGCCCTGATATACCATGCTATGCTGCATATGCAGGGCTTAGCAAACGATGCAACCCGAGGAACACAGATACTCCTGATACGTGCCGGCAAGATTAAACGGTTAGGACTTGAGAGTGTGACGACCTACCTTGATAGTATTGTAAACCAGGAGTGTTACTGGGTGTTTTCATCTCATGTACTTAGTCTAGTATTAGTAAAAAATAATCCCTTTGCTGGCAAGGAAATGCACATGTAATTATGGAGTACTCCGTATATTTGAGAATTTCTATGGCGAaaaaaaaaaaa]




>consensus_1414#0
CGCCGGCTAAACCCGCGGAAATCCCCTTCCGCTTTGTCTCGTTTCCTCCTCCTGCCCCCT
CGGCACTGCACCGCCGCAGCTTCCACCATGGCCGTCGCCAGCGAGGCCGCTTGTCGTCGG
GCGGCTAGCTGCTTCTTTGAGGTCGGCAGGCAAGAGATCGGCTCCTCCACCCCGCGCGCC
TCCTCGCGCCGAATCAGCGGCTCCGAGGGCCTAGTGATGCGGATGCATCAGTATGGAAAG
TTGCGAGGCCATGATGGTTGTGTTAATACTGTCAGCTTCAATCCTGCTGGTAACCTCCTT
GTGTCTGGTTCGGACGACATGGACATCATATTATGGGATTGGCTTGCTAAAACACAAAGG
CTCATTTACCCTTCTGGCCATCAAGAAAATGTTTTCCATGCTCGTGTAATGCCATTTACA
GATGATAGCGCCATTGTAACTGTTGCTGCTGATGGTCAGGTTAGAGTGGGACAACTGAAC
GAGGGTGGTGAAGTCACAACCAAACAAATTGGGGTGCACGATGATCGTGCACATAAGTTG
GCCATTGAACCAGGAAGTCCTTACATATTTTACAGTTGCGGGGAAGATGGTTTGGTACAA
CATTTTGACTTGCGGAATGATTCACCAATGAAGCTCTTCAGCTGCTATTCATTCTCAAAT
AGCAGGCGTCGTGTAAGGCTTAATACCATTGCCATTGACCCTTGGAACCCTAATTATCTT
TCAATTGGTGGTTCTGATGAGTATGTGCGGGTATATGATTTGAGGAGAATCCAGTTGGGT
GCTTCAAATGACATGAACCAACCTGTAGATACCTTCTGCCCTAAGCACCTTATGGGTGGG
AAGGTCCACATAACTGGTATTGCATACTCCTACGCAAGGGAGATACTTGTCTCTTACAAT
GATGAACATATCTATTTATTCCAAAACAATATGGGTCTTGGTCCAAATCCTGAATCAGCG
CAAGCAGAGTTCTTGGACAGGCTTGAGCAGCCACAGGCATACACAGGCCACAGAAATTTC
CGAACTGTTAAGGGAGTCAGTTTTTTTGGACCGAACGATGAATATGTCTTGAGTGGATCG
GATTGTGGGAATGTATTTGTATGGAGAAAGAAGGGAGGTGAACTATTGAGGATGATGCAT
GGTGACAAAAGTGTAGTTAATTGCATTGAACCCCATCCACATTTTCCGTTCCTAGCTACT
AGTGGGATTGACAAAACTGTCAAGATTTGGACACCTTCAGCAAATAAAGTGATGTCGCTG
CCTAAAAACGCAAAGCAAATAATAGCTTCCAACAAGCGGGCGAGAGAAATTGATGCATCT
CGACCGGAGCTGACGCTTTCATCCGACCTCATCATGCATGTTTTGAGGTTGCAGAGGAGA
CAGTCTGAATTGTACAGGGAGCATGAACCAGCTACTGCAGATTTGGCAAGTGATGATGAT
GAGTCTTTCTTCGCTGGGTTTGATGATGCCAATAGGAATGTAAGATCTAACTCTGATCCA
AGGGAATGCATTGTGACATGAAAGGAACTGAAGATTTACAGCCTGCCCCTTATACTTTTA
GCCTGCAGCCTGATGCCCTGATATACCATGCTATGCTGCATATGCAGGGCTTAGCAAACG
ATGCAACAAGAGGAACACAGATACTCATGATACGTGCCGGCAAGATTAAACGGTTAGGAC
TTAAAAGTGTGACGACCTACCTTGATAGTGTTGTAAACCAGGAGTGTTACTGGGTGTTTT
CATCTCATGTACTTAGTCTAGTATTAGTAAAAAATAATCACTTTGCTGGCAAGGAAATGC
GCATGTAATTATGGAGTACTCCGTATATTTGAGAATTTCTATGGCGATGCTAAGCGAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case