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Oryza sativa
cluster # 1419 cluster # 1419       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1419#0 length = 1441 sequences # 2  

consensusID : consensus_1419#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1441
fasta sequence
                              [CTGTAGCCATACCCACCTGCTGCCGATCCCCACCTGCTACCGATCCGCCGCCGCCGCCAATGGCCGGGCTGCCAGCTCTCACCGACGACGTCCTCGCCGAGATCCTCGTCCGCGTGCCCTCGTCGTGCGACCTCGCGCGGGCCTCCGCGGCGTGCAGCTCCTTCTGCCGCATCGCCACCTCCCCGCGGTTCCTCCGCCGCTTCCGCTCGCTCCACGCGCCGCTGCCGCTCGGCGTCCTGTGCCCCGACGGCGCCGCCGCCTTCCACCCCGCCATGCCCCCGCACCCGTCGGCCCCCGCCGCCCGCGCCCTCGCCCTCGCCGCGGACTTCGCCTTCTCCTTCCTCCCTCCGCCCGCCCGCGCCTGGCTCCTCCGCGACCACCGCGACGGCCGGTTCCTCCTCGACCGCGCGCTCGCCGGCGGCTCCACCGCCTTCACCGATGTCGCTGTCTGCGACCCCCTCTTCCGGCGGTACGTTCTGCTCCCGCCCATACCCGACGACCTTGCCGCCTCCGTCCAAAATCCATACCTCCAGTGCGGCGGCGATGGTGGTCTGCAATCCCGCAGTAGCGAGATCTTCCTGGCATCTTGCGGCAGTGACGCAGGAGGCGAGGAGCCATTGTTCGCTGTGATCTGGATGGCGTGCTGCCGAGGGAAGCTGGTCGCGTTCTTCTTTTCATCTGAATCCCAACAGTGGCGTGCTCTTTCACCTCCCGAACACTATGCTTTGAGTACGAGGAGAGTCATGGGCGTTCGACTCGGACAGCGCAACCATGCTCATGGGTGCTTCTACTGGATGATAACCCTCACCCATAGGTGGCTTGTATTAGACACTCGCCGAATGGAGTTCTTGGTTGTGGATATCTCTCCTGTCCTTTCAGGCCGCGCAATGATGTTCAGTAATCAGATTATCACTCTGGAATCAATGGATGGATGGACTATCGTTGTTGTCGCAGATGTTTTCCGGTCAGATAAACGATGTGTCCTGTATTTTTATAAGTTCATGTATTTCAGTGACCGGTGGCAACTGCAGAGCAAAATTAACTTGCCTGAGGAATGGGGCTATCGATTTAGAGGCATCATAGGTGCATCTGAATGTTACTTATTTATAAAGCTTGATCACCCCAAGCAGAACTTGGGAGATCCAGTTCAGCAGAATGCTATGTATTTCATGTTTGATATCAAGACCATGCAGCTTGGGAGGTTCTCTGAGATATGTTCTGGTACTGTCAGCGAAGCCTATCTTTACACTGGTTTTCCACCATCACAGTCGCTACCCAGTGTTTGATGCAGTAAGCTTGTTCTTTTTGCTTGCAGCTATCAATTTACATCGTTCTATTATTTCATGTTACTTTTTGATTATCTTGTTTAGGGGAATATTTTATTGTAATATCCGCTACTTCTTGTATTTTATTTGAATAAATATGCAGATAACACATGTAG]

[+] EMBL AK062983             [CTGTAGCCATACCCACCTGCTGCCGATCCCCACCTGCTACCGATCCGCCGCCGCCGCCAATGGCCGGGCTGCCAGCTCTCACCGACGACGTCCTCGCCGAGATCCTCGTCCGCGTGCCCTCGTCGTGCGACCTCGCGCGGGCCTCCGCGGCGTGCAGCTCCTTCTGCCGCATCGCCACCTCCCCGCGGTTCCTCCGCCGCTTCCGCTCGCTCCACGCGCCGCTGCCGCTCGGCGTCCTGTGCCCCGACGGCGCCGCCGCCTTCCACCCCGCCATGCCCCCGCACCCGTCGGCCCCCGCCGCCCGCGCCCTCGCCCTCGCCGCGGACTTCGCCTTCTCCTTCCTCCCTCCGCCCGCCCGCGCCTGGCTCCTCCGCGACCACCGCGACGGCCGGTTCCTCCTCGACCGCGCGCTCGCCGGCGGCTCCACCGCCTTCACCGATGTCGCTGTCTGCGACCCCCTCTTCCGGCGGTACGTTCTGCTCCCGCCCATACCCGACGACCTTGCCGCCTCCGTCCAAAATCCATACCTCCAGTGCGGCGGCGATGGTGGTCTGCAATCCCGCAGTAGCGAGATCTTCCTGGCATCTTGCGGCAGTGACGCAGGAGGCGAGGAGCCATTGTTCGCTGTGATCTGGATGGCGTGCTGCCGAGGGAAGCTGGTCGCGTTCTTCTTTTCATCTGAATCCCAACAGTGGCGTGCTCTTTCACCTCCCGAACACTATGCTTTGAGTACGAGGAGAGTCATGGGCGTTCGACTCGGACAGCGCAACCATGCTCATGGGTGCTTCTACTGGATGATAACCCTCACCCATAGGTGGCTTGTATTAGACACTCGCCGAATGGAGTTCTTGGTTGTGGATATCTCTCCTGTCCTTTCAGGCCGCGCAATGATGTTCAGTAATCAGATTATCACTCTGGAATCAATGGATGGATGGACTATCGTTGTTGTCGCAGATGTTTTCCGGTCAGATAAACGATGTGTCCTGTATTTTTATAAGTTCATGTATTTCAGTGACCGGTGGCAACTGCAGAGCAAAATTAACTTGCCTGAGGAATGGGGCTATCGATTTAGAGGCATCATAGGTGCATCTGAATGTTACTTATTTATAAAGCTTGATCACCCCAAGCAGAACTTGGGAGATCCAGTTCAGCAGAATGCTATGTATTTCATGTTTGATATCAAGACCATGCAGCTTGGGAGGTTCTCTGAGATATGTTCTGGTACTGTCAGCGAAGCCTATCTTTACACTGGTTTTCCACCATCACAGTCGCTACCCAGTGTTTGATGCAGTAAGCTTGTTCTTTTTGCTTGCAGCTATCAATTTACATCGTTCTATTATTTCATGTTACTTTTTGATTATCTTGTTTAGGGGAATATTTTATTGTAATATCCGCTACTTCTTGTATTTTATTTGAATAAATATGCAGATAACACATGTAG]
[+] EMBL CB643940             [              ACCTGCTGCCGATCCCCACCTGCTACCGATCCGCCGCCGCCGCCAATGGCCGGGCTGCCAGCTCTCACCGACGACGTCCTCGCCGAGATCCTCGTCCGCGTGCCCTCGTCGTGCGACCTCGCGCGGGCCTCCGCGGCGTGCAGCTCCTTCTGCCGCATCGCCACCTCCCCGCGGTTCCTCCGCCGCTTCCGCTCGCTCCACGCGCCGCTGCCGCTCGGCGTCCTGTGCCCCGACGGCGCCGCCGCCTTCCACCCCGCCATGCCCCCGCACCCGTCGGCCCCCGCCGCCCGCGCCCTCGCCCTCGCCGCGGACTTCGCCTTCTCCTTCCTCCCTCCGCCCGCCCGCGCCTGGCTCCTCCGCGACCACCGCGACGGCCGGTTCCTCCTCGACCGCGCGCTCGCCGGCGGCTCCACCGCCTTCACCGATGTCGCTGTCTGCGACCCCCTCTTCCGGCGGTACGTTCTGCTCCCGCCCATACCCGACGACCTTGCCGCCTCCGTCCAAAATCCATACCTCCAGTGCGGCGGCGATGGTGGTCTGCAATCCCGCAGTAGCGAGATCTTCCTGGCATCTTGCGGCAGTGACGCAGGAGGCGAGGAGCCATTGTTCGCTGTGATCTGGATGGCGTGCTGCCGAGGGAAGCTGGTCGCGTTCTTCTTTTCATCTGAATCCCAACAGTGGCGTGCTCTTTCACCTCCCGAACACTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]


>consensus_1419#0 CTGTAGCCATACCCACCTGCTGCCGATCCCCACCTGCTACCGATCCGCCGCCGCCGCCAA TGGCCGGGCTGCCAGCTCTCACCGACGACGTCCTCGCCGAGATCCTCGTCCGCGTGCCCT CGTCGTGCGACCTCGCGCGGGCCTCCGCGGCGTGCAGCTCCTTCTGCCGCATCGCCACCT CCCCGCGGTTCCTCCGCCGCTTCCGCTCGCTCCACGCGCCGCTGCCGCTCGGCGTCCTGT GCCCCGACGGCGCCGCCGCCTTCCACCCCGCCATGCCCCCGCACCCGTCGGCCCCCGCCG CCCGCGCCCTCGCCCTCGCCGCGGACTTCGCCTTCTCCTTCCTCCCTCCGCCCGCCCGCG CCTGGCTCCTCCGCGACCACCGCGACGGCCGGTTCCTCCTCGACCGCGCGCTCGCCGGCG GCTCCACCGCCTTCACCGATGTCGCTGTCTGCGACCCCCTCTTCCGGCGGTACGTTCTGC TCCCGCCCATACCCGACGACCTTGCCGCCTCCGTCCAAAATCCATACCTCCAGTGCGGCG GCGATGGTGGTCTGCAATCCCGCAGTAGCGAGATCTTCCTGGCATCTTGCGGCAGTGACG CAGGAGGCGAGGAGCCATTGTTCGCTGTGATCTGGATGGCGTGCTGCCGAGGGAAGCTGG TCGCGTTCTTCTTTTCATCTGAATCCCAACAGTGGCGTGCTCTTTCACCTCCCGAACACT ATGCTTTGAGTACGAGGAGAGTCATGGGCGTTCGACTCGGACAGCGCAACCATGCTCATG GGTGCTTCTACTGGATGATAACCCTCACCCATAGGTGGCTTGTATTAGACACTCGCCGAA TGGAGTTCTTGGTTGTGGATATCTCTCCTGTCCTTTCAGGCCGCGCAATGATGTTCAGTA ATCAGATTATCACTCTGGAATCAATGGATGGATGGACTATCGTTGTTGTCGCAGATGTTT TCCGGTCAGATAAACGATGTGTCCTGTATTTTTATAAGTTCATGTATTTCAGTGACCGGT GGCAACTGCAGAGCAAAATTAACTTGCCTGAGGAATGGGGCTATCGATTTAGAGGCATCA TAGGTGCATCTGAATGTTACTTATTTATAAAGCTTGATCACCCCAAGCAGAACTTGGGAG ATCCAGTTCAGCAGAATGCTATGTATTTCATGTTTGATATCAAGACCATGCAGCTTGGGA GGTTCTCTGAGATATGTTCTGGTACTGTCAGCGAAGCCTATCTTTACACTGGTTTTCCAC CATCACAGTCGCTACCCAGTGTTTGATGCAGTAAGCTTGTTCTTTTTGCTTGCAGCTATC AATTTACATCGTTCTATTATTTCATGTTACTTTTTGATTATCTTGTTTAGGGGAATATTT TATTGTAATATCCGCTACTTCTTGTATTTTATTTGAATAAATATGCAGATAACACATGTA G



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)