cluster # 1428

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Oryza sativa
cluster # 1428 cluster # 1428 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1428#0 length = 828 sequences # 2

consensusID : consensus_1428#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 828
fasta sequence

                              [CTTCACGCTTGGTTGTCTTCCAAGACGCAGAAGACGNTGCCGCGATGCTGTCCGACGAAGCGTTCGCCGGGGGATACATCCGCACCAACCGCCGCCGGCTCCCGGGACCGGCACGAGCACGTGTTGGCCGGGGCTGGCGCGCGCCGGCGTGCCGTGCCTGCGCGGCAATGCTGGGCTGTTCGTGTGGATGGACATGCGGCGGCTGCTGCTCGGCGGCGGCGGCGTCGGCGGCGAGCTGAGGCTGTGGGAGAAGCTNTGCGCCAGGCGAAGCTGAACATCTCGCCGGGGTCGTCGTGCCATTGCTCGGAGGCCGGCTGGTTCAGGGTGTNTTCGCCAACATGAGCTTGGACACGCTGGATCTTGCACTCCACAGGATAAGCCGCTTCATGGACACGTGGAATGGAACAAAGCAACAAGCTAGCTGCCAGCAGCAAGAACAGCAATAATTTTTAGTTAATTTGGTTAATTAGTTAGTTAATTGATTAAAGGAAGTATAAGTAATTTTTTTGGTAAATTATTAAAAAAAACATATTTATCAGTTGCAAAGGTAGTTATATTATGGGGATTAAGTGGTGACATACACTTGTTTCATTTATCTATTGTACCATTAGTTTTGTAACCAAATTTGTCTCTCTCACATGTTGGAGAGACGACAAATTAATACAGATAAGACTGGTCTAGCTCATTCAAGGTTAAAAATCTCCTTATGCTCCAGTTAGATGATCATGAGATCAAATCGTCTNTCAGCTCCTAGGGAATTCATGTAAAATTCCTACAAAAAAATTACATAACTCCTTTGTTAATAATGGATACTTTTTCTTGCAAAAA]

[+] EMBL AU095958             [CTTCACGCTTGGTTGTCTTCCAAGACGCAGAAGACGNTGCCGCGATGCTGTCCGACGAAGCGTTCGCCGGGGGATACATCCGCACCAACCGCCGCCGGCTCCCGGGACCGGCACGAGCACGTGTTGGCCGGGGCTGGCGCGCGCCGGCGTGCCGTGCCTGCGCGGCAATGCTGGGCTGTTCGTGTGGATGGACATGCGGCGGCTGCTGCTCGGCGGCGGCGGCGTCGGCGGCGAGCTGAGGCTGTGGGAGAAGCTNTGCGCCAGGCGAAGCTGAACATCTCGCCGGGGTCGTCGTGCCATTGCTCGGAGGCCGGCTGGTTCAGGGTGTNTTCGCCAACATGAGCTTGGACACGCTGGATCTTGCACTCCACAGGATAAGCCGCTTCATGGACACGTGGAATGGAACAAAGCAACAAGCTAGCTGCCAGCAGCAAGAACAGCAATAATTTTTAGTTAATTTGGTTAATTAGTTAGTTAATTGATTAAAGGAAGTATAAGTAATTTTTTTGGTAAATTATTAAAAAAAACATATTTATCAGTTGCAAAGGTAGTTATATTATGGGGATTAAGTGGTGACATACACTTGTTTCATTTATCTATTGTACCATTAGTTTTGTAACCAAATTTGTCTCTCTCACATGTTGGAGAGACGACAAATTAATACAGATAAGACTGGTCTAGCTCATTCAAGGTTAAAAA                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AU173534             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AATGGAACAAAGCAACAAGCTAGCTGCCAGCAGCAAGAACAGCAATAATTTTTAGTTAATTTGGTTAATTAGTTAGTTAATTGATTAAAGGAAGTATAAGTAATTTTTTTGGTAAATTATTAAAAAAAACATATTTATCAGTTGCAAAGGTAGTTATATTATGGGGATTAAGTGGTGACATACACTTGTTTCATTTATCTATTGTACCATTAGTTTTGTAACCAAATTTGTCTCTCTCACATGTTGGAGAGACGACAAATTAATACAGATAAGACTGGTCTAGCTCATTCAAGGTTAATTCTCTCCTTATGCTCCAGTTAGATGATCATGAGATCAAATCGTCTNTCAGCTCCTAGGGAATTCATGTAAAATTCCTACAAAAAAATTACATAACTCCTTTGTTAATAATGGATACTTTTTCTTGCAAAAA]




>consensus_1428#0
CTTCACGCTTGGTTGTCTTCCAAGACGCAGAAGACGNTGCCGCGATGCTGTCCGACGAAG
CGTTCGCCGGGGGATACATCCGCACCAACCGCCGCCGGCTCCCGGGACCGGCACGAGCAC
GTGTTGGCCGGGGCTGGCGCGCGCCGGCGTGCCGTGCCTGCGCGGCAATGCTGGGCTGTT
CGTGTGGATGGACATGCGGCGGCTGCTGCTCGGCGGCGGCGGCGTCGGCGGCGAGCTGAG
GCTGTGGGAGAAGCTNTGCGCCAGGCGAAGCTGAACATCTCGCCGGGGTCGTCGTGCCAT
TGCTCGGAGGCCGGCTGGTTCAGGGTGTNTTCGCCAACATGAGCTTGGACACGCTGGATC
TTGCACTCCACAGGATAAGCCGCTTCATGGACACGTGGAATGGAACAAAGCAACAAGCTA
GCTGCCAGCAGCAAGAACAGCAATAATTTTTAGTTAATTTGGTTAATTAGTTAGTTAATT
GATTAAAGGAAGTATAAGTAATTTTTTTGGTAAATTATTAAAAAAAACATATTTATCAGT
TGCAAAGGTAGTTATATTATGGGGATTAAGTGGTGACATACACTTGTTTCATTTATCTAT
TGTACCATTAGTTTTGTAACCAAATTTGTCTCTCTCACATGTTGGAGAGACGACAAATTA
ATACAGATAAGACTGGTCTAGCTCATTCAAGGTTAAAAATCTCCTTATGCTCCAGTTAGA
TGATCATGAGATCAAATCGTCTNTCAGCTCCTAGGGAATTCATGTAAAATTCCTACAAAA
AAATTACATAACTCCTTTGTTAATAATGGATACTTTTTCTTGCAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case