cluster # 1553

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Oryza sativa
cluster # 1553 cluster # 1553 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_1553#0 length = 2050 sequences # 2
consensusID : consensus_1553#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2050
fasta sequence
                              [AGATCCCGCGAATTACCCACCGAGATCTCGGCGATCCCCGGCGCCGCGGCTGGCCGGCATGGCTGTGGCGTCCTACCCCTTGCCCATCCCGCGCTCCCCACGCCCCGATGCCGCGCTGCCCCCCGACGCCTCCACCGACACCGCCCCGTCCCTCGACTTCGGCGACCCGGCCTCCCTCGTCGCCCTCCGCGCCCTCACCGACGCCGGCGCCGCCACCCGCCTCCTCCACGAGTGCGTCGCCTACCAGCGCGCCCTCGACGCCCGCCTCGACGCGCTCCTCGCCCGCCGCCCCGACCTCGACCGCGCCGCCGCCTCCCTTCTCCGCTCCGCCCCGCCGCTCCTCTCGCTCGCCGCCTCCGACGCCGCCGCGCTCAGGGACTCCTCCTCCTCCACCGCCGCGCTGGCCGAGGCGCTCTCCTCCCGCGTGCGCCACCTCGACGCCGCGCACTCCAGGGCGGAGGCCGCCCTCGCGCGCGCCGAGGCGGCGCTCGATAGGTCCCGCGCGCTCGACGCCGCACGCCGTGCTCTGGCGGCGGATGATCTCACGGCCGCTGCCACCGCCGCGCACGACTTCCTCGCCATCGACGCCCGGTTCCCCACCGATGACGACCTCCGCCGCGACCTTCTGGACATCAAGCGCAGGCTGGAGGGGCTCGCGCGCCGAAGGCTGGCGGATGCTGTGGACGCGCTGGACCATCCCGCCGTTCTCCGCCTCGTCCGCCTCTTCCCTCTCCTCGCTCTCGCTGATGAGGGATTGCAGGTCTATGTCGCCTACCTCAAGAAAGTCGTCGCCCTGCGCGCTCGTGCCGACTTCGAGCACCTAGCTGAGTTAACCTCTGCAACACAGCCTACTTCAGAGCGGCCTGATTTTGTTGGCTGCCTTACCCGTCTCTTCAAGGACATTGTCCTGGCCGTTGAGGAGAATGATGCTGTGCTTCGTGAACTCAGAGGTGAGGATGGTGTTGCCTATGCCATCATTGAGCTGCAGGAGGAGTGTGATTCCCGGGGCACACAGATACTGCGCCGATATGCTGATTACAGGAAACTTGCACGTCTTGCCTCGGATATAAACTCATATACCAAGAACCTCCTCTCTGTGGTGAGTTCTGTGGCCAATGCTGCAGGGGGCAATGAAGGGCCTGACCCCAGGGAGGTCGAGCTCTATCTTGAGGAGATTCTGTCACTGACACGGCTTGGTGAAGACTATACTGAATTTATGGTGAATAAGATTCGTGGATTGCGAGATGTCAAACCTGAGCTGGGACCACAAGCGATGAAGTCCTTCCGGAATGGTAGCTTCAATAAAATGGTGCAGGATTTAACTGGGTTTTATGTGATCCTGGAAGAATTCTTCATGGTTGAGAATGTAAGGAAAGCCATCCGGATTGATGAACCAGTGCCTGATGGTCTCACAACATCAATGGTGGATGATGTGTTCTTCGTACTGCAGAGTTGCTGCCGAAGAGCAGCATCCACTGCAAGTATAAACTCAATTTTTGCAGTGCTTGGTGGGGCGGCGAGCCTACTGAGCAATGAGTACCAGGAAGCACTGCAATGGAGGATGAGGGAACCAAACTTGGGTGCAAAGCTCTTTCTTGGTGGTGTTGGTGTTCAGAAGACTGGTGAGGAGATTGCAACTGCGCTGAACAACATGGATGTTAGCTCAGAGTATGTCCTGAAGCTCCGTCATGAGATTGAGGAGCTCTGTTCAGAGGTCAGTGTTAACCTTTTCTTCTCTTCATAACTTGCATTCATTTGGGATTTAAGATATCATGATTAATCAAGTAGTCTCTCAGTTATTACAATTTAAGATATCGGTGCTTTTGTCCAGTTCTTGTAATTTGTTTAGTGAAAGAAGCCTCTAGAAAGTAGTTGATAATATCATGTTGTCACACCTTATGAGTGGCACCAAAACAGCATCACATATGTAAAAGGGTTATATGTGTCTTCCTTGAATAAATAGTCTCTTAGTTAGGATATATTTAGCTATGCTGTAACCTGTAGATAAATCTTTAGGAACTTCCTACAATTATGGTGCAATTTGTTTTCA]

[+] EMBL CB633132             [AGATCCCGCGAATTACCCACCGAGATCTCGGCGATCCCCGGCGCCGCGGCTGGCCGGCATGGCTGTGGCGTCCTACCCCTTGCCCATCCCGCGCTCCCCACGCCCCGATGCCGCGCTGCCCCCCGACGCCTCCACCGACACCGCCCCGTCCCTCGACTTCGGCGACCCGGCCTCCCTCGTCGCCCTCCGCGCCCTCACCGACGCCGGCGCCGCCACCCGCCTCCTCCACGAGTGCGTCGCCTACCAGCGCGCCCTCGACGCCCGCCTCGACGCGCTCCTCGCCCGCCGCCCCGACCTCGACCGCGCCGCCGCCTCCCTTCTCCGCTCCGCCCCGCCGCTCCTCTCGCTCGCCGCCTCCGACGCCGCCGCGCTCAGGGACTCCTCCTCCTCCACCGCCGCGCTGGCCGAGGCGCTCTCCTCCCGCGTGCGCCACCTCGACGCCGCGCACTCCAGGGCGGAGGCCGCCCTCGCGCGCGCCGAGGCGGCGCTCGATAGGTCCCGCGCGCTCGACGCCGCACGCCGTGCTCTGGCGGCGGATGATCTCACGGCCGCTGCCACCGCCGCGCACGACTTCCTCGCCATCGACGCCCGGTTCCCCACCGATGACGACCTCCGCCGCGACCTTCTGGACATCAAGCGCAGGCTGGAGGGGCTCGCGCGCCGAAGGCTGGCGGATGCTGTGGACGCGCTGGACCATCCCGCCGTTCTCCGCCTCGTCCGCCTCTTCCCTCTCCTCGCTCTCGCTGATGAGGGATTGCAGGTCTATGTCGCCTACCTCAAGAAAGTCGTCGCCCTGCGCGCTCGTGCCGACTTCGAGCACCTAGCTGAGTTAACCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL AK119496             [          AATTACCCACCGAGATCTCGGCGATCCCCGGCGCCGCGGCTGGCCGGCATGGCTGTGGCGTCCTACCCCTTGCCCATCCCGCGCTCCCCACGCCCCGATGCCGCGCTGCCCCCCGACGCCTCCACCGACACCGCCCCGTCCCTCGACTTCGGCGACCCGGCCTCCGTCGTCGCCCTCCGCGCCCTCACCGACGCCGGCGCCGCCACCCGCCTCCTCCACGAGTGCGTCACCTACCAGCGCGCCCTCGACGCCCGCCTCGACGCGCTCCTCGCCCGCCGCCCCGACCTCGACCGCGCCGCCGCCTCCCTTCTCCGCTCCGCCCCGCCGCTCCTCTCGCTCGCCGCCTCCGACGCCGCCGCGCTCAGGGACTCCTCCTCCTCCACCGCCGCGCTGGCCGAGGCGCTCTCCTCCCGCGTGCGCCACCTCGACGCCGCGCACTCCAGGGCGGAGGCCGCCCTCGCGCGCGCCGAGGCGGCGCTCGATAGGTCCCGCGCGCTCGACGCCGCACGCCGTGCTCTGGCGGTGGATGATCTCACGGCCGCTGCCACCGCCGCGCACGACTTCCTCGCCATCGACGCCCGGTTCCCCACCGATGACGACCTCCGCCGCGACCTTCTGGACATCAAGCGCAGGCTGGAGGGGCTCGCGCGCCGAAGGCTGGCGGATGCTGTGGACGCGCTGAACCATCCCGCCGTTCTCCGCCTCGTCCGCCTCTTCCCTCTCCTCGCTCTCGCTGATGAGGGATTGCAGGTCTATGTCGCCTACCTCAAGAAGGTCGTCGCCCTGCGCGCTCGTGCCGACTTCGAGCACCTAGCTGAGTTAACCTCTGCAACACAGCCTACTTCAGAGCGGCCTGATTTTGTTGGCTGCCTTACCCGTCTCTTCAAGGACATTGTCCTGGCCGTTGAGGAGAATGATGCTGTGCTTCGTGAACTCAGAGGTGAGGATGGTGTTGCCTATGCCATCATTGAGCTGCAGGAGGAGTGTGATTCCCGGGGCACACAGATACTGCGCCGATATGCTGATTACAGGAAACTTGCACGTCTTGCCTCGGATATAAACTCATATACCAAGAACCTCCTCTCTGTGGTGAGTTCTGTGGCCAATGCTGCAGGGGGCAATGAAGGGCCTGACCCCAGGGAGGTCGAGCTCTATCTTGAGGAGATTCTGTCACTGACACGGCTTGGTGAAGACTATACTGAATTTATGGTGAATAAGATTCGTGGATTGCGAGATGTCAAACCTGAGCTGGGACCACAAGCGATGAAGTCCTTCCGGAATGGTAGCTTCAATAAAATGGTGCAGGATTTAACTGGGTTTTATGTGATCCTGGAAGAATTCTTCATGGTTGAGAATGTAAGGAAAGCCATCCGGATTGATGAACCAGTGCCTGATGGTCTCACAACATCAATGGTGGATGATGTGTTCTTCGTACTGCAGAGTTGCTGCCGAAGAGCAGCATCCACTGCAAGTATAAACTCAATTTTTGCAGTGCTTGGTGGGGCGGCGAGCCTACTGAGCAATGAGTACCAGGAAGCACTGCAATGGAGGATGAGGGAACCAAACTTGGGTGCAAAGCTCTTTCTTGGTGGTGTTGGTGTTCAGAAGACTGGTGAGGAGATTGCAACTGCGCTGAACAACATGGATGTTAGCTCAGAGTATGTCCTGAAGCTCCGTCATGAGATTGAGGAGCTCTGTTCAGAGGTCAGTGTTAACCTTTTCTTCTCTTCATAACTTGCATTCATTTGGGATTTAAGATATCATGATTAATCAAGTAGTCTCTCAGTTATTACAATTTAAGATATCGGTGCTTTTGTCCAGTTCTTGTAATTTGTTTAGTGAAAGAAGCCTCTAGAAAGTAGTTGATAATATCATGTTGTCACACCTTATGAGTGGCACCAAAACAGCATCACATATGTAAAAGGGTTATATGTGTCTTCCTTGAATAAATAGTCTCTTAGTTAGGATATATTTAGCTATGCTGTAACCTGTAGATAAATCTTTAGGAACTTCCTACAATTATGGTGCAATTTGTTTTCA]




>consensus_1553#0
AGATCCCGCGAATTACCCACCGAGATCTCGGCGATCCCCGGCGCCGCGGCTGGCCGGCAT
GGCTGTGGCGTCCTACCCCTTGCCCATCCCGCGCTCCCCACGCCCCGATGCCGCGCTGCC
CCCCGACGCCTCCACCGACACCGCCCCGTCCCTCGACTTCGGCGACCCGGCCTCCCTCGT
CGCCCTCCGCGCCCTCACCGACGCCGGCGCCGCCACCCGCCTCCTCCACGAGTGCGTCGC
CTACCAGCGCGCCCTCGACGCCCGCCTCGACGCGCTCCTCGCCCGCCGCCCCGACCTCGA
CCGCGCCGCCGCCTCCCTTCTCCGCTCCGCCCCGCCGCTCCTCTCGCTCGCCGCCTCCGA
CGCCGCCGCGCTCAGGGACTCCTCCTCCTCCACCGCCGCGCTGGCCGAGGCGCTCTCCTC
CCGCGTGCGCCACCTCGACGCCGCGCACTCCAGGGCGGAGGCCGCCCTCGCGCGCGCCGA
GGCGGCGCTCGATAGGTCCCGCGCGCTCGACGCCGCACGCCGTGCTCTGGCGGCGGATGA
TCTCACGGCCGCTGCCACCGCCGCGCACGACTTCCTCGCCATCGACGCCCGGTTCCCCAC
CGATGACGACCTCCGCCGCGACCTTCTGGACATCAAGCGCAGGCTGGAGGGGCTCGCGCG
CCGAAGGCTGGCGGATGCTGTGGACGCGCTGGACCATCCCGCCGTTCTCCGCCTCGTCCG
CCTCTTCCCTCTCCTCGCTCTCGCTGATGAGGGATTGCAGGTCTATGTCGCCTACCTCAA
GAAAGTCGTCGCCCTGCGCGCTCGTGCCGACTTCGAGCACCTAGCTGAGTTAACCTCTGC
AACACAGCCTACTTCAGAGCGGCCTGATTTTGTTGGCTGCCTTACCCGTCTCTTCAAGGA
CATTGTCCTGGCCGTTGAGGAGAATGATGCTGTGCTTCGTGAACTCAGAGGTGAGGATGG
TGTTGCCTATGCCATCATTGAGCTGCAGGAGGAGTGTGATTCCCGGGGCACACAGATACT
GCGCCGATATGCTGATTACAGGAAACTTGCACGTCTTGCCTCGGATATAAACTCATATAC
CAAGAACCTCCTCTCTGTGGTGAGTTCTGTGGCCAATGCTGCAGGGGGCAATGAAGGGCC
TGACCCCAGGGAGGTCGAGCTCTATCTTGAGGAGATTCTGTCACTGACACGGCTTGGTGA
AGACTATACTGAATTTATGGTGAATAAGATTCGTGGATTGCGAGATGTCAAACCTGAGCT
GGGACCACAAGCGATGAAGTCCTTCCGGAATGGTAGCTTCAATAAAATGGTGCAGGATTT
AACTGGGTTTTATGTGATCCTGGAAGAATTCTTCATGGTTGAGAATGTAAGGAAAGCCAT
CCGGATTGATGAACCAGTGCCTGATGGTCTCACAACATCAATGGTGGATGATGTGTTCTT
CGTACTGCAGAGTTGCTGCCGAAGAGCAGCATCCACTGCAAGTATAAACTCAATTTTTGC
AGTGCTTGGTGGGGCGGCGAGCCTACTGAGCAATGAGTACCAGGAAGCACTGCAATGGAG
GATGAGGGAACCAAACTTGGGTGCAAAGCTCTTTCTTGGTGGTGTTGGTGTTCAGAAGAC
TGGTGAGGAGATTGCAACTGCGCTGAACAACATGGATGTTAGCTCAGAGTATGTCCTGAA
GCTCCGTCATGAGATTGAGGAGCTCTGTTCAGAGGTCAGTGTTAACCTTTTCTTCTCTTC
ATAACTTGCATTCATTTGGGATTTAAGATATCATGATTAATCAAGTAGTCTCTCAGTTAT
TACAATTTAAGATATCGGTGCTTTTGTCCAGTTCTTGTAATTTGTTTAGTGAAAGAAGCC
TCTAGAAAGTAGTTGATAATATCATGTTGTCACACCTTATGAGTGGCACCAAAACAGCAT
CACATATGTAAAAGGGTTATATGTGTCTTCCTTGAATAAATAGTCTCTTAGTTAGGATAT
ATTTAGCTATGCTGTAACCTGTAGATAAATCTTTAGGAACTTCCTACAATTATGGTGCAA
TTTGTTTTCA
clustalw multiple alignements is not computed in this case