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Oryza sativa
cluster # 1554 cluster # 1554       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1554#0 length = 2166 sequences # 2  

consensusID : consensus_1554#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2166
fasta sequence
                              [ATTTTCTTGTGAAAAGAGAAGTTGTGGTCTGTAATAAAACGGGGCATGTGATTTCTGACGTGGACAGATACAGTCTCTTGGATGATGAGACTGGTATACAAGTGTCTACTGAACCTGCCACCATAGATCAATTCATCTCTGCTTGCGCTTTGTTGGCTTCGATATGTGTTAAAGTGGAGAGAATGGACATTGTTTTAGAGGTTTCATACAAAGTTCTTCTGATGGGTAAAAGTAATCTTTCGTGGACTCTGCTGGCTATTCATATCATTGGTTCCATGTGTGGTGACAAGTTTCTCTCAAAGAGTAGCAACTTTCTCATGACAACTATACGGTTGGTTGTCCTGCTTCTTGAGGCAAAAAACAATTCTTTGTGCCTTTTGTCATCATATGTTCAGTCAAACAGGCCAGCCGTTTTTCCAACTTGTGCACATTGCCTATTTGATGTGGTGGATTCAGTTTCAGTTGACGGTTTTATCTCTTCTCTGTTGGATGAGCTGCATTTGTGTTCTCAGCAATGGAACAGTTGTTCTAACACAAATAAAATAATTGCAAGATGCAGTCCACATTTGGGATCAAGTGGATTGGAGGTCAACTGTGGTGAACCTTGCTATATCTCCAAGCAAGTAAAACTTTCTGAGGATGGTCATAACCATACTGCAGGAAGGGACTTATGCTATTTTGCGGAGATAACTTCATTGTTGGAGTTGTTCGGGAATTACATGAGCTGCGAATGGACATACAATAATGTTGTTGTCCGCCTCCTGAAGATTTTGGAGTCATGCACATGTGAGGAGTATTCAGCTGCTCTCTTAATACTTCTCAGCCAACTTGGAAGGTTCTTTGTTGACGATGTTGGTTATGAGCAAAGAGCAGTTAGTGACCTGAGGAATCACTTATCAGTGCTAATGAGAACAAAAGTTTCAAACTCAAGGAACATGCCTGTTCAGCTTTCTGCTATTGGGGCATTGCTTAGCCTCCTCCCATTGGCATTCGATAAAATAGTTGCACATTCTGGGCAATTACCAGATCTATATGTTTTGCAAGGAAGACAGATCTCTGAATGGTTTTGTCAGTTAAGCAAGGAGCATCAATCTATAGCTTGTTCGTTCTTTAGTTGACTTCATATATATTGGTGAATTCAGGCAGTCAGTTTTAACCACT-GTGTTGGAGTTACCTCTTGATTTGGCCTTTTATGGACTGGCGAAGAAATTCCTAGTGGTTTTCTGGGTGTTCCTTGCTGGTATGATCTTGATATAACAAGACACACTTAAGATAACCCATATAGAGGAGAATGCTCATTCGCTTTGAATGCTCACCTGCTTTGAAGACTGGATTGTTCTGCAGACTAGATGTCCTGTTGCTGGAATGTTTCTGCAGAAGAGGCCAATGTTCTTGATTTGATGTGTGAAGATTCAAATGCAGAACCGTGAAATGCTGGAAAG-AATTGTGTTCCTTGCACAACCATTTCAGCTGATATACAAGCAGAACTGGGCAGCTGGAAAGATCATGTTTACACAGCTGGATTTCAAATTGCTGAGTAACATCAGAGTGTGTCGAAGCAAGGAGTTCAAGTATTGTCAGTCATTCAGTTAACCGGACTTATTTGGTCTTCACGTGAACTAACATTGCCATGAGTGTCTGATATGCCCTGGTATTATAGTCGAGTATTCTTATTTGGTCTTCACGTGAACTAAGATTGCCACGAGTGTCTGATATGCCCTGGTATTATAGGTGAGTATTCTTTCAAGTAGCCCCAATCAAGTGAAACTTGGTTGTACCAAGATCAATGTGCTTGGTGAACCAAGAGCATGCATGCATGGCGTACTGTTTTTTGAGAAGTGTACACTGACTCGGGGGTTTACTTCACACCTGTGGACCTGTGGTCGCTGGGTTGGGCGAGGTTTTCTGTGCAAATGATTTTTGCAGGAAGGTGGTTCAAATTTTTGTGACATCACCTTCGTACGTTCTCATTTTGTTTCCGACTGTAGAGGTAGATTTACCAAAGAATCAAGAGAAGTGTTTGCCCAGTGCGCTGGGCGTGTAACTTGTCATGTAACTCACAATTTATAGGCTAAAAAAACTCCCAAGTTATGAAGGCAAGTGATTTTAACGGCAACATCTTTACAAATTTGAGTCTCAACAGCCCATATTACTATAACAACAATC]

[+] EMBL AK119498             [ATTTTCTTGTGAAAAGAGAAGTTGTGGTCTGTAATAAAACGGGGCATGTGATTTCTGACGTGGACAGATACAGTCTCTTGGATGATGAGACTGGTATACAAGTGTCTACTGAACCTGCCACCATAGATCAATTCATCTCTGCTTGCGCTTTGTTGGCTTCGATATGTGTTAAAGTGGAGAGAATGGACATTGTTTTAGAGGTTTCATACAAAGTTCTTCTGATGGGTAAAAGTAATCTTTCGTGGACTCTGCTGGCTATTCATATCATTGGTTCCATGTGTGGTGACAAGTTTCTCTCAAAGAGTAGCAACTTTCTCATGACAACTATACGGTTGGTTGTCCTGCTTCTTGAGGCAAAAAACAATTCTTTGTGCCTTTTGTCATCATATGTTCAGTCAAACAGGCCAGCCGTTTTTCCAACTTGTGCACATTGCCTATTTGATGTGGTGGATTCAGTTTCAGTTGACGGTTTTATCTCTTCTCTGTTGGATGAGCTGCATTTGTGTTCTCAGCAATGGAACAGTTGTTCTAACACAAATAAAATAATTGCAAGATGCAGTCCACATTTGGGATCAAGTGGATTGGAGGTCAACTGTGGTGAACCTTGCTATATCTCCAAGCAAGTAAAACTTTCTGAGGATGGTCATAACCATACTGCAGGAAGGGACTTATGCTATTTTGCGGAGATAACTTCATTGTTGGAGTTGTTCGGGAATTACATGAGCTGCGAATGGACATACAATAATGTTGTTGTCCGCCTCCTGAAGATTTTGGAGTCATGCACATGTGAGGAGTATTCAGCTGCTCTCTTAATACTTCTCAGCCAACTTGGAAGGTTCTTTGTTGACGATGTTGGTTATGAGCAAAGAGCAGTTAGTGACCTGAGGAATCACTTATCAGTGCTAATGAGAACAAAAGTTTCAAACTCAAGGAACATGCCTGTTCAGCTTTCTGCTATTGGGGCATTGCTTAGCCTCCTCCCATTGGCATTCGATAAAATAGTTGCACATTCTGGGCAATTACCAGATCTATATGTTTTGCAAGGAAGACAGATCTCTGAATGGTTTTGTCAGTTAAGCAAGGAGCATCAATCTATAGCTTGTTCGTTCTTTAGTTGACTTCATATATATTGGTGAATTCAGGCAGTCAGTTTTAACCACT GTGTTGGAGTTACCTCTTGATTTGGCCTTTTATGGACTGGCGAAGAAATTCCTAGTGGTTTTCTGGGTGTTCCTTGCTGGTATGATCTTGATATAACAAGACACACTTAAGATAACCCATATAGAGGAGAATGCTCATTCGCTTTGAATGCTCACCTGCTTTGAAGACTGGATTGTTCTGCAGACTAGATGTCCTGTTGCTGGAATGTTTCTGCAGAAGAGGCCAATGTTCTTGATTTGATGTGTGAAGATTCAAATGCAGAACCGTGAAATGCTGGAAAG AATTGTGTTCCTTGCACAACCATTTCAGCTGATATACAAGCAGAACTGGGCAGCTGGAAAGATCATGTTTACACAGCTGGATTTCAAATTGCTGAGTAACATCAGAGTGTGTCGAAGCAAGGAGTTCAAGTATTGTCAGTCATTCAGTTAACCGGACTTATTTGGTCTTCACGTGAACTAACATTGCCATGAGTGTCTGATATGCCCTGGTATTATAGTCGAGTATTCTTATTTGGTCTTCACGTGAACTAAGATTGCCACGAGTGTCTGATATGCCCTGGTATTATAGGTGAGTATTCTTTCAAGTAGCCCCAATCAAGTGAAACTTGGTTGTACCAAGATCAATGTGCTTGGTGAACCAAGAGCATGCATGCATGGCGTACTGTTTTTTGAGAAGTGTACACTGACTCGGGGGTTTACTTCACACCTGTGGACCTGTGGTCGCTGGGTTGGGCGAGGTTTTCTGTGCAAATGATTTTTGCAGGAAGGTGGTTCAAATTTTTGTGACATCACCTTCGTACGTTCTCATTTTGTTTCCGACTGTAGAGGTAGATTTACCAAAGAATCAAGAGAAGTGTTTGCCCAGTGCGCTGGGCGTGTAACTTGTCATGTAACTCACAATTTATAGGCTAAAAAAACTCCCAAGTTATGAAGGCAAGTGATTTTAACGGCAACATCTTTACAAATTTGAGTCTCAACAGCCCATATTACTATAACAACAATC]
[+] EMBL CF324181             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTCAAACTCAAGGAACATGCCTGTTCAGCTTTCTGCTATTGGGGCATTGCTTAGCCTCCTCCCATTGGCATTCGATAAAATAGTTGCACATTCTGGGCAATTACCAGATCTATATGTTTTGCAAGGAAGACAGATCTCTGAATGGTTTTGTCAGTTAAGCAAGGAGCATCAATCTATAGCTTGTTCGTTCTTTAGTTGACTTCATATATATTGGTGAATTCAGGCAGTCAGTTTTAACCACTGGTGTTGGAGTTACCTCTTGATTTGGCCTTTTATGGACTGGCGAAGAAATTCCTAGTGGTTTTCTGGGTGTTCCTTGCTGGTATGATCTTGATATAACAAGACACACTTAAGATAACCCATATAGAGGAGAATGCTCATTCGCTTTGAATGCTCACCTGCTTTGAAGACTGGATTGTTCTGCAGACTAGATGTCCTGTTGCTGGAATGTTTCTGCAGAAGAGGCCAATGTTCTTGATTTGATGTGTGAAGATTCAAATGCAGAACCGTGAAATGCTGGAAAGAAATTGTGTTCCTTGCACAACCATTTCAGCTGATATACAAGCAGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]


>consensus_1554#0 ATTTTCTTGTGAAAAGAGAAGTTGTGGTCTGTAATAAAACGGGGCATGTGATTTCTGACG TGGACAGATACAGTCTCTTGGATGATGAGACTGGTATACAAGTGTCTACTGAACCTGCCA CCATAGATCAATTCATCTCTGCTTGCGCTTTGTTGGCTTCGATATGTGTTAAAGTGGAGA GAATGGACATTGTTTTAGAGGTTTCATACAAAGTTCTTCTGATGGGTAAAAGTAATCTTT CGTGGACTCTGCTGGCTATTCATATCATTGGTTCCATGTGTGGTGACAAGTTTCTCTCAA AGAGTAGCAACTTTCTCATGACAACTATACGGTTGGTTGTCCTGCTTCTTGAGGCAAAAA ACAATTCTTTGTGCCTTTTGTCATCATATGTTCAGTCAAACAGGCCAGCCGTTTTTCCAA CTTGTGCACATTGCCTATTTGATGTGGTGGATTCAGTTTCAGTTGACGGTTTTATCTCTT CTCTGTTGGATGAGCTGCATTTGTGTTCTCAGCAATGGAACAGTTGTTCTAACACAAATA AAATAATTGCAAGATGCAGTCCACATTTGGGATCAAGTGGATTGGAGGTCAACTGTGGTG AACCTTGCTATATCTCCAAGCAAGTAAAACTTTCTGAGGATGGTCATAACCATACTGCAG GAAGGGACTTATGCTATTTTGCGGAGATAACTTCATTGTTGGAGTTGTTCGGGAATTACA TGAGCTGCGAATGGACATACAATAATGTTGTTGTCCGCCTCCTGAAGATTTTGGAGTCAT GCACATGTGAGGAGTATTCAGCTGCTCTCTTAATACTTCTCAGCCAACTTGGAAGGTTCT TTGTTGACGATGTTGGTTATGAGCAAAGAGCAGTTAGTGACCTGAGGAATCACTTATCAG TGCTAATGAGAACAAAAGTTTCAAACTCAAGGAACATGCCTGTTCAGCTTTCTGCTATTG GGGCATTGCTTAGCCTCCTCCCATTGGCATTCGATAAAATAGTTGCACATTCTGGGCAAT TACCAGATCTATATGTTTTGCAAGGAAGACAGATCTCTGAATGGTTTTGTCAGTTAAGCA AGGAGCATCAATCTATAGCTTGTTCGTTCTTTAGTTGACTTCATATATATTGGTGAATTC AGGCAGTCAGTTTTAACCACTGTGTTGGAGTTACCTCTTGATTTGGCCTTTTATGGACTG GCGAAGAAATTCCTAGTGGTTTTCTGGGTGTTCCTTGCTGGTATGATCTTGATATAACAA GACACACTTAAGATAACCCATATAGAGGAGAATGCTCATTCGCTTTGAATGCTCACCTGC TTTGAAGACTGGATTGTTCTGCAGACTAGATGTCCTGTTGCTGGAATGTTTCTGCAGAAG AGGCCAATGTTCTTGATTTGATGTGTGAAGATTCAAATGCAGAACCGTGAAATGCTGGAA AGAATTGTGTTCCTTGCACAACCATTTCAGCTGATATACAAGCAGAACTGGGCAGCTGGA AAGATCATGTTTACACAGCTGGATTTCAAATTGCTGAGTAACATCAGAGTGTGTCGAAGC AAGGAGTTCAAGTATTGTCAGTCATTCAGTTAACCGGACTTATTTGGTCTTCACGTGAAC TAACATTGCCATGAGTGTCTGATATGCCCTGGTATTATAGTCGAGTATTCTTATTTGGTC TTCACGTGAACTAAGATTGCCACGAGTGTCTGATATGCCCTGGTATTATAGGTGAGTATT CTTTCAAGTAGCCCCAATCAAGTGAAACTTGGTTGTACCAAGATCAATGTGCTTGGTGAA CCAAGAGCATGCATGCATGGCGTACTGTTTTTTGAGAAGTGTACACTGACTCGGGGGTTT ACTTCACACCTGTGGACCTGTGGTCGCTGGGTTGGGCGAGGTTTTCTGTGCAAATGATTT TTGCAGGAAGGTGGTTCAAATTTTTGTGACATCACCTTCGTACGTTCTCATTTTGTTTCC GACTGTAGAGGTAGATTTACCAAAGAATCAAGAGAAGTGTTTGCCCAGTGCGCTGGGCGT GTAACTTGTCATGTAACTCACAATTTATAGGCTAAAAAAACTCCCAAGTTATGAAGGCAA GTGATTTTAACGGCAACATCTTTACAAATTTGAGTCTCAACAGCCCATATTACTATAACA ACAATC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)