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Oryza sativa
cluster # 1581 cluster # 1581       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1581#0 length = 3303 sequences # 2  

consensusID : consensus_1581#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 3303
fasta sequence
                              [ATGTGCTGAAAATGAGCTTCGCGAAAGCTCACGCGGTCTTCTTCAGAGAGAGGGGTCCCTACTCCGTGTCGAGCTGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCCGCGAGCCCAAAGATTTCCTCTTTCGTGGGGGAGACACGCCAAATCCAATCCGAGTTCTCCAACTCATCAATAATCTGCAAGATGTGAATAAGTCTCAAGTAGACTTTGCACCATTTGAGACACAATGAAGATAGGTCTGCTCATGTTGCTTGTTCTCTTCCTGGTCATGTCCCCTGATGGGATCCGCAGGAGCTTAGCCGCGAGGCCTTCTATTGTGAATATTGGGGCCATTCTTCGATTTAACTCCACCATTGGAGGTGTTTCGATGATTGCTATCCAGGCAGCCTTGGAGGATATTAATTCTGATTCAACAATTCTAAATGGAACAACTTTAAAAGTTGACATGAGGGATACAAATTGTGATGATGGTTTCCTTGGGATGGTTGAAGCTTTGCAGTTCATGGAGACTGATGTGATTGCAATTATTGGCCCACAGTGCTCAACAATTGCACATATCGTTTCATATGTAGCAAATGAGCTCCGAGTCCCTCTTATGTCCTTTGCATCTGATGCAACTTTGTCATCAATTCAGTTCCCATTCTTTGTTCGAACTGCTCCCAGTGATCTCTATCAAATGGATGCTGTACCTGCAATAGTTGACTACTACCGTTGGAAGATAGTGACTGCTATATATATTGATGATGATTATGGCCGAAATGGAATAGCCACATTGGATGATGCACTTACTCAAAGGCGCTGCAAAATCTCCTACAAGATTGCATTTCCTGCAAATGCTAGAAAGAGCGACCTCATAAATTTATTGGTCAGCGTTAGTTATATGGAGTCTCGTGTTATCATCCTCCATACTGGTGCTGGACCTGGACTCAAGATTTTCTCTCTGGCGAACCAACTAAGCATGATGGGCAATGGCTATGTATGGATTGCAACTGATTGGCTTTCTGCTTATCTCGATGCTAATTCATCGGTTCCTGATGAGACTATGTATGGCATGCAAGGAGTTCTCACTTTACGCCCACACATTCCTGAATCAAAGATGAAGAGTAATTTGATCTCCAAGTGGAGCAGGTTAAGCAAGAAGTACAGTTATAGTTATCTCCGCACAAGTTCATATGCTTTTTATGTTTATGATAGTGTATGGGCAGTAGCTCGGGCTTTGGATGCTTTCTTTGATGATGGTGGGAAGATTTCCTTTTCAAATGATTCAAGGCTGCGTGATGAAACTGGAGGTACTCTTCACCTTGAAGCAATGAGTATTTTTGATATGGGAAATAACTTGTTGGAGAAGATTAGAAAGGCAAACTTCACTGGGGTGTCTGGGCAAGTGCAATTTGATGCTACTGGTGACCTCATTCATCCTGCTTATGATGTCATAAATATAATTGGAAATGGCATGCGGACAGTTGGCTATTGGTCAAATTATTCTAGCTTGCTGTCGACTGTCCTTCCGGAGGTTCTCTATTCAGAGCCTCCTAACAATTCTCTAGCTAATCAACATCTATATGATGTTATTTGGCCTGGGCAGACTGCACAAACGCCTCGAGGCTGGGTTTTTCCTTCTAATGCTAAGGAGTTGAAAATTGGTGTCCCCAACAGATTTAGCTTCAGAGAATTTGTCACAAAAGATAATGTTACTGGATCAATGAAGGGCTATTGCATTGATGTCTTTACTCAGGCATTGGCTTTGCTTCCTTATCCTGTTACATACAAGTTTATACCATTTGGGGGTGGTAATGAAAATCCACATTATGACAAACTCGTACAAATGGTTGAGGATAACGAGTTTGACGCAGCAATAGGGGATATTGCAATTACAATGAGCAGGACTGTAACTACTGATTTCACCCAGCCCTTCATTGAATCTGGCTTGGTTATCTTGGCTCCAGTTAAAAAACATATTGTTAATTCCTGGGCATTCTTGCAGCCATTCACTCTTCAGATGTGGTGTGTTACTGGATTATTCTTTCTTGTTGTGGGTGCAGTTGTTTGGGTTCTTGGACATCGAATAAATGACGAATTCCGTGGCTCACCGCGAGAACAAATAATTACTATTTTCTGGTTCAGCTTTTCAACCTTGTTTTTTGCACACAGAGAAAATACCATGAGTACCTTAGGACGTGGTGTCTTGATCATATGGCTATTTGTTGTTTTAATCATTCAATCCAGCTATACTGCAAGTCTTACTTCCATCCTGACTGTTCAACAACTCGATACTTCTATAAGAGGAATTGATGACCTGAAAAATAGTGATGGTCCTATTGGTTTCCAAGTTGGTTCTTTTGCAGAAGAATACATGGTCAGGGAGCTGAACATCTCACGGTCGAGGCTGAGAGCTCTTGGTTCTCCAGAAGAATACGCTGAAGCGCTTAAGCATGGCCCTAAGAGAGGAGGTGTCATGGCCATTGTAGATGAGCGCCCCTACGTTGAACTGTTTTTGTCAACTTATTGCAAGATTGCAGTTGCTGGTTCGGATTTCACCAGCAGAGGATGGGGCTTTGCATTTCCAAGAGACTCCCCTTTGCAAATTGACCTATCGACTGCGATCCTGTCACTGTCGGAGAACGGGGAACTGCAGAGGATCCATGACAAATGGCTCAAGACTAGCGAGTGCTCAGCCGACAACACCGAGTTTGTCGACTCGGATCAGCTCCGCCTTGAGAGCTTCTGGGGCCTGTTCCTCATTTGTGGTATCGCATGTGTCATCGCGCTGCTCATCTACTTTTTCACCACCGTACGCAAATTCCTCAGGCATGAACCTCCAGAAGATCCAACACCTCGTCCAGGCGGATCAACAACTCTTCCAGACGAACGAACACCCCCAAAGAACGGACAAGAGAAATGCAACTGCAGAAATTTCATCTCATTTCTTGATCACAAGGAGCCACCAAAGAAGAAGCGGTCCTTGAGTTTGACGCCGACAACGCCATTGAGCAACTTTACTGCCCTTGAAATAGAAGGACCTGTGAGGACAGTCAGGAATGGTAGTGTCGTTGACATATAGAACTAGTGTGTGTAAAAAGCTGAGATGTTATATATTTTGGATCTGAGATATGCCATCTTTCGGTCAATCTCCTCAATTTTAGTTGAGAGAAAATATAATCAGAGGCTGCATAAGATGCTATCTGTAGATTTCAAGCAAATCCGGTGATGGGAAAAATTCATTTGAGGCCAGTTTGGCAACTGAAAAACTGTATAGAAAGTTATTCTTGTCCTTGATGGTATTTTGAATGGAGGAAATATATACGT]

[+] EMBL AK068706             [ATGTGCTGAAAATGAGCTTCGCGAAAGCTCACGCGGTCTTCTTCAGAGAGAGGGGTCCCTACTCCGTGTCGAGCTGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCCGCGAGCCCAAAGATTTCCTCTTTCGTGGGGGAGACACGCCAAATCCAATCCGAGTTCTCCAACTCATCAATAATCTGCAAGATGTGAATAAGTCTCAAGTAGACTTTGCACCATTTGAGACACAATGAAGATAGGTCTGCTCATGTTGCTTGTTCTCTTCCTGGTCATGTCCCCTGATGGGATCCGCAGGAGCTTAGCCGCGAGGCCTTCTATTGTGAATATTGGGGCCATTCTTCGATTTAACTCCACCATTGGAGGTGTTTCGATGATTGCTATCCAGGCAGCCTTGGAGGATATTAATTCTGATTCAACAATTCTAAATGGAACAACTTTAAAAGTTGACATGAGGGATACAAATTGTGATGATGGTTTCCTTGGGATGGTTGAAGCTTTGCAGTTCATGGAGACTGATGTGATTGCAATTATTGGCCCACAGTGCTCAACAATTGCACATATCGTTTCATATGTAGCAAATGAGCTCCGAGTCCCTCTTATGTCCTTTGCATCTGATGCAACTTTGTCATCAATTCAGTTCCCATTCTTTGTTCGAACTGCTCCCAGTGATCTCTATCAAATGGATGCTGTACCTGCAATAGTTGACTACTACCGTTGGAAGATAGTGACTGCTATATATATTGATGATGATTATGGCCGAAATGGAATAGCCACATTGGATGATGCACTTACTCAAAGGCGCTGCAAAATCTCCTACAAGATTGCATTTCCTGCAAATGCTAGAAAGAGCGACCTCATAAATTTATTGGTCAGCGTTAGTTATATGGAGTCTCGTGTTATCATCCTCCATACTGGTGCTGGACCTGGACTCAAGATTTTCTCTCTGGCGAACCAACTAAGCATGATGGGCAATGGCTATGTATGGATTGCAACTGATTGGCTTTCTGCTTATCTCGATGCTAATTCATCGGTTCCTGATGAGACTATGTATGGCATGCAAGGAGTTCTCACTTTACGCCCACACATTCCTGAATCAAAGATGAAGAGTAATTTGATCTCCAAGTGGAGCAGGTTAAGCAAGAAGTACAGTTATAGTTATCTCCGCACAAGTTCATATGCTTTTTATGTTTATGATAGTGTATGGGCAGTAGCTCGGGCTTTGGATGCTTTCTTTGATGATGGTGGGAAGATTTCCTTTTCAAATGATTCAAGGCTGCGTGATGAAACTGGAGGTACTCTTCACCTTGAAGCAATGAGTATTTTTGATATGGGAAATAACTTGTTGGAGAAGATTAGAAAGGCAAACTTCACTGGGGTGTCTGGGCAAGTGCAATTTGATGCTACTGGTGACCTCATTCATCCTGCTTATGATGTCATAAATATAATTGGAAATGGCATGCGGACAGTTGGCTATTGGTCAAATTATTCTAGCTTGCTGTCGACTGTCCTTCCGGAGGTTCTCTATTCAGAGCCTCCTAACAATTCTCTAGCTAATCAACATCTATATGATGTTATTTGGCCTGGGCAGACTGCACAAACGCCTCGAGGCTGGGTTTTTCCTTCTAATGCTAAGGAGTTGAAAATTGGTGTCCCCAACAGATTTAGCTTCAGAGAATTTGTCACAAAAGATAATGTTACTGGATCAATGAAGGGCTATTGCATTGATGTCTTTACTCAGGCATTGGCTTTGCTTCCTTATCCTGTTACATACAAGTTTATACCATTTGGGGGTGGTAATGAAAATCCACATTATGACAAACTCGTACAAATGGTTGAGGATAACGAGTTTGACGCAGCAATAGGGGATATTGCAATTACAATGAGCAGGACTGTAACTACTGATTTCACCCAGCCCTTCATTGAATCTGGCTTGGTTATCTTGGCTCCAGTTAAAAAACATATTGTTAATTCCTGGGCATTCTTGCAGCCATTCACTCTTCAGATGTGGTGTGTTACTGGATTATTCTTTCTTGTTGTGGGTGCAGTTGTTTGGGTTCTTGGACATCGAATAAATGACGAATTCCGTGGCTCACCGCGAGAACAAATAATTACTATTTTCTGGTTCAGCTTTTCAACCTTGTTTTTTGCACACAGAGAAAATACCATGAGTACCTTAGGACGTGGTGTCTTGATCATATGGCTATTTGTTGTTTTAATCATTCAATCCAGCTATACTGCAAGTCTTACTTCCATCCTGACTGTTCAACAACTCGATACTTCTATAAGAGGAATTGATGACCTGAAAAATAGTGATGGTCCTATTGGTTTCCAAGTTGGTTCTTTTGCAGAAGAATACATGGTCAGGGAGCTGAACATCTCACGGTCGAGGCTGAGAGCTCTTGGTTCTCCAGAAGAATACGCTGAAGCGCTTAAGCATGGCCCTAAGAGAGGAGGTGTCATGGCCATTGTAGATGAGCGCCCCTACGTTGAACTGTTTTTGTCAACTTATTGCAAGATTGCAGTTGCTGGTTCGGATTTCACCAGCAGAGGATGGGGCTTTGCATTTCCAAGAGACTCCCCTTTGCAAATTGACCTATCGACTGCGATCCTGTCACTGTCGGAGAACGGGGAACTGCAGAGGATCCATGACAAATGGCTCAAGACTAGCGAGTGCTCAGCCGACAACACCGAGTTTGTCGACTCGGATCAGCTCCGCCTTGAGAGCTTCTGGGGCCTGTTCCTCATTTGTGGTATCGCATGTGTCATCGCGCTGCTCATCTACTTTTTCACCACCGTACGCAAATTCCTCAGGCATGAACCTCCAGAAGATCCAACACCTCGTCCAGGCGGATCAACAACTCTTCCAGACGAACGAACACCCCCAAAGAACGGACAAGAGAAATGCAACTGCAGAAATTTCATCTCATTTCTTGATCACAAGGAGCCACCAAAGAAGAAGCGGTCCTTGAGTTTGACGCCGACAACGCCATTGAGCAACTTTACTGCCCTTGAAATAGAAGGACCTGTGAGGACAGTCAGGAATGGTAGTGTCGTTGACATATAGAACTAGTGTGTGTAAAAAGCTGAGATGTTATATATTTTGGATCTGAGATATGCCATCTTTCGGTCAATCTCCTCAATTTTAGTTGAGAGAAAATATAATCAGAGGCTGCATAAGATGCTATCTGTAGATTTCAAGCAAATCCGGTGATGGGAAAAATTCATTTGAGGCCAGTTTGGCAACTGAAAAACTGTATAGAAAGTTATTCTTGTCCTTGATGGTATTTTGAATGGAGGAAATATATACGT]
[+] EMBL CA757331             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCGCCTTGAGAGCTTCTGGGGCCTGTTCCTCATTTGTGGTATCGCATGTGTCATCGCGCTGCTCATCTACTTTTTCACCACCGTACGCAAATTCCTCAGGCATGAACCTCCAGAAGATCCAACACCTCGTCCAGGCGGATCAACAACTCTTCCAGACGAACGAACACCCCCNAAGAACGGACAAGAGAAATGCAACTGCAGAAATTTCATCTCATTTCTTGATCACAAGGAGCCACCAAAGAAGAAGCAGCCCTTGAGTTTGACGCCNACNACGCCNTTGAGCAACTTTACTGCCCTTGAAATAGAAGGACCTGTGAGGACAGTCAGGAATGGTAGTGTCGTTGACATATAGAACTACTGTGTGTAAAAAGCTGAGATGTTATATATTTTGGATCTGAGATATGCCATCTTTCGGTCAATCTCCTCAATTTTAGTTGAGAGAAAATATAATCAGAGGCTGCATAAGATGCTATCTGTAGATTTCAAGCAAATCCGGTGATGGGAAAAATTCATTTGAGGCCAGTTTGGC ACTAANAAACTGTATAGAAAGCTATTCTTGTCaaaaaaaa                           ]


>consensus_1581#0 ATGTGCTGAAAATGAGCTTCGCGAAAGCTCACGCGGTCTTCTTCAGAGAGAGGGGTCCCT ACTCCGTGTCGAGCTGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCCGCGAGCCCAAAGATTTCCTCT TTCGTGGGGGAGACACGCCAAATCCAATCCGAGTTCTCCAACTCATCAATAATCTGCAAG ATGTGAATAAGTCTCAAGTAGACTTTGCACCATTTGAGACACAATGAAGATAGGTCTGCT CATGTTGCTTGTTCTCTTCCTGGTCATGTCCCCTGATGGGATCCGCAGGAGCTTAGCCGC GAGGCCTTCTATTGTGAATATTGGGGCCATTCTTCGATTTAACTCCACCATTGGAGGTGT TTCGATGATTGCTATCCAGGCAGCCTTGGAGGATATTAATTCTGATTCAACAATTCTAAA TGGAACAACTTTAAAAGTTGACATGAGGGATACAAATTGTGATGATGGTTTCCTTGGGAT GGTTGAAGCTTTGCAGTTCATGGAGACTGATGTGATTGCAATTATTGGCCCACAGTGCTC AACAATTGCACATATCGTTTCATATGTAGCAAATGAGCTCCGAGTCCCTCTTATGTCCTT TGCATCTGATGCAACTTTGTCATCAATTCAGTTCCCATTCTTTGTTCGAACTGCTCCCAG TGATCTCTATCAAATGGATGCTGTACCTGCAATAGTTGACTACTACCGTTGGAAGATAGT GACTGCTATATATATTGATGATGATTATGGCCGAAATGGAATAGCCACATTGGATGATGC ACTTACTCAAAGGCGCTGCAAAATCTCCTACAAGATTGCATTTCCTGCAAATGCTAGAAA GAGCGACCTCATAAATTTATTGGTCAGCGTTAGTTATATGGAGTCTCGTGTTATCATCCT CCATACTGGTGCTGGACCTGGACTCAAGATTTTCTCTCTGGCGAACCAACTAAGCATGAT GGGCAATGGCTATGTATGGATTGCAACTGATTGGCTTTCTGCTTATCTCGATGCTAATTC ATCGGTTCCTGATGAGACTATGTATGGCATGCAAGGAGTTCTCACTTTACGCCCACACAT TCCTGAATCAAAGATGAAGAGTAATTTGATCTCCAAGTGGAGCAGGTTAAGCAAGAAGTA CAGTTATAGTTATCTCCGCACAAGTTCATATGCTTTTTATGTTTATGATAGTGTATGGGC AGTAGCTCGGGCTTTGGATGCTTTCTTTGATGATGGTGGGAAGATTTCCTTTTCAAATGA TTCAAGGCTGCGTGATGAAACTGGAGGTACTCTTCACCTTGAAGCAATGAGTATTTTTGA TATGGGAAATAACTTGTTGGAGAAGATTAGAAAGGCAAACTTCACTGGGGTGTCTGGGCA AGTGCAATTTGATGCTACTGGTGACCTCATTCATCCTGCTTATGATGTCATAAATATAAT TGGAAATGGCATGCGGACAGTTGGCTATTGGTCAAATTATTCTAGCTTGCTGTCGACTGT CCTTCCGGAGGTTCTCTATTCAGAGCCTCCTAACAATTCTCTAGCTAATCAACATCTATA TGATGTTATTTGGCCTGGGCAGACTGCACAAACGCCTCGAGGCTGGGTTTTTCCTTCTAA TGCTAAGGAGTTGAAAATTGGTGTCCCCAACAGATTTAGCTTCAGAGAATTTGTCACAAA AGATAATGTTACTGGATCAATGAAGGGCTATTGCATTGATGTCTTTACTCAGGCATTGGC TTTGCTTCCTTATCCTGTTACATACAAGTTTATACCATTTGGGGGTGGTAATGAAAATCC ACATTATGACAAACTCGTACAAATGGTTGAGGATAACGAGTTTGACGCAGCAATAGGGGA TATTGCAATTACAATGAGCAGGACTGTAACTACTGATTTCACCCAGCCCTTCATTGAATC TGGCTTGGTTATCTTGGCTCCAGTTAAAAAACATATTGTTAATTCCTGGGCATTCTTGCA GCCATTCACTCTTCAGATGTGGTGTGTTACTGGATTATTCTTTCTTGTTGTGGGTGCAGT TGTTTGGGTTCTTGGACATCGAATAAATGACGAATTCCGTGGCTCACCGCGAGAACAAAT AATTACTATTTTCTGGTTCAGCTTTTCAACCTTGTTTTTTGCACACAGAGAAAATACCAT GAGTACCTTAGGACGTGGTGTCTTGATCATATGGCTATTTGTTGTTTTAATCATTCAATC CAGCTATACTGCAAGTCTTACTTCCATCCTGACTGTTCAACAACTCGATACTTCTATAAG AGGAATTGATGACCTGAAAAATAGTGATGGTCCTATTGGTTTCCAAGTTGGTTCTTTTGC AGAAGAATACATGGTCAGGGAGCTGAACATCTCACGGTCGAGGCTGAGAGCTCTTGGTTC TCCAGAAGAATACGCTGAAGCGCTTAAGCATGGCCCTAAGAGAGGAGGTGTCATGGCCAT TGTAGATGAGCGCCCCTACGTTGAACTGTTTTTGTCAACTTATTGCAAGATTGCAGTTGC TGGTTCGGATTTCACCAGCAGAGGATGGGGCTTTGCATTTCCAAGAGACTCCCCTTTGCA AATTGACCTATCGACTGCGATCCTGTCACTGTCGGAGAACGGGGAACTGCAGAGGATCCA TGACAAATGGCTCAAGACTAGCGAGTGCTCAGCCGACAACACCGAGTTTGTCGACTCGGA TCAGCTCCGCCTTGAGAGCTTCTGGGGCCTGTTCCTCATTTGTGGTATCGCATGTGTCAT CGCGCTGCTCATCTACTTTTTCACCACCGTACGCAAATTCCTCAGGCATGAACCTCCAGA AGATCCAACACCTCGTCCAGGCGGATCAACAACTCTTCCAGACGAACGAACACCCCCAAA GAACGGACAAGAGAAATGCAACTGCAGAAATTTCATCTCATTTCTTGATCACAAGGAGCC ACCAAAGAAGAAGCGGTCCTTGAGTTTGACGCCGACAACGCCATTGAGCAACTTTACTGC CCTTGAAATAGAAGGACCTGTGAGGACAGTCAGGAATGGTAGTGTCGTTGACATATAGAA CTAGTGTGTGTAAAAAGCTGAGATGTTATATATTTTGGATCTGAGATATGCCATCTTTCG GTCAATCTCCTCAATTTTAGTTGAGAGAAAATATAATCAGAGGCTGCATAAGATGCTATC TGTAGATTTCAAGCAAATCCGGTGATGGGAAAAATTCATTTGAGGCCAGTTTGGCAACTG AAAAACTGTATAGAAAGTTATTCTTGTCCTTGATGGTATTTTGAATGGAGGAAATATATA CGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)