cluster # 159

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Oryza sativa
cluster # 159 cluster # 159 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_159#0 length = 2076 sequences # 2
consensusID : consensus_159#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2076
fasta sequence
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[+] EMBL AK109851             [TCCATTGATCCTCCTCGTTGTAGGAAATCACCACCAATCCCACCGATTCCTCTCCACCGCTCTTTCCGCCCGTGCGATGAGTCCTCCGCGTGAATCCTGCCACCTCCTCGCTCCGCTCGAATCCCCGCTGCTGCCGCAGTGCACCACTGGACCAGCGCCAATCCCCGCCGCCTCCTCGCTCCTCCTCTCTCTACTTGAATCCTCGCTGCCGCCGCAGTCCACCGCTGGACCAGCGCCGCCGCTGCCGCGCCTCCATCGCCGGACCACCTCACTCGCTGCTGCACCTCCTCGAGACTCCCCGCCACACGCCACCGCATCGTGCCCCTCCGCTCCCAGGCCGGCGCTCACCTCGCTCCTCTGTTCACCATCGCAGGGGTCGGTGAGCTGGTGAAAGCCCCCGTAAGACCAAGGATTGTGGCTTCCGTGACGACCCCAACTCCATTGTGCCCCACGATTTTGACTCCCTCTGCCTGAACGGTGACCCTTACCCGTCTGATGTACGTCTTTCTGTTTCTGCCCAACCTCTCTGTCTTTCTATTGCTGAAGGATTTGCAGTGGTGGTTGGTTAATGGTTAGGCAGGGTGGTTTAATCTGGTATAGAATCCTAACTCAGCTTGTTTCCCTTTGTCGATCCATTGCTTTCACTATTAGATGATCATATTTGGATGCCAAATAGTGTGCTAAAGATGATGTCCATCATATGCTAATTTAAATGCCAAATTGCAACTTGTTACTCAAAGTATTGGCTGATTGTACAGCTCTGATTCAAGGAACTCTCTTATATTATTTGGATTATGGGAGCTTCCTGTTCATCTTTGCAAGCTGATTACTCTGACCACAATCAAGGTATGTAGCCGCTCTCCGCTCACATTGGCCTTAAGGTGTTATCGGAATTTACTAATATCATTTCTGGGATACCTTTTCTATACTGTATTTTTTGCATTTGCTTGTCCTCACGTAAGATTCGTTGTGTCCAATGTTTAGCATAACTTTGTAGAGTGGATATTAGTGACCATTTGTATGAGCATATGGGTCAATGGATCAATGTATGATCAGTCCTGCCTTTGGACATCAATATGTTATTTTGCAAACAGATTCCTTAGTTTGTTACACACTAATATGAGATAATTCTTGAAAATTCTAGAAGGCTGGCTAGGTTTCTAGATAATCCTTTTATTTGATGTAATCATCTCTTGCCTGGCAGCTACAGCGTCAATGGTTTGCTGGCCCCTCCTTATTTCAAATATTGGCTTATTCATGTCCTATACAGGAGGTTCCGGTTGTATTTATATAGGGGAATGTGTTCTCTGATTTAACAGTACCCTAAGTTTTCGTATCTGGACATCTGTGCTGAAACAAAATGTCGCTTGACAGTTAGCTTTACTGGTGGTCATATTTATCCAATTTTACATTGCTCTTTCATGTGTTTACAATTAAGGGTTCCTGGACCGAAGCAACGTTACTCCCTTTCACGTATGATGAAGGATCATTAATGTGTTCCTCTTTCCTTCCTTTCTATGCAGTCAGGGTGGATTGTCTGAACATGGAGTACTGCAATGGTCTGGTCAACCTATTGCATATTTGCGTTGCAGCTTCTAGCTATCCCAATTGATGTACCCCTTAAATTAATCGTGTATTTGATTGGGGGATATATGCGTGACTTCGATTGCCACATATAAAAAAAGGTATGCGATATCTAGAAAACATTCTTGATGTTACTGTGACTATGTCGAACTATTGTGAATATTTGATTTCCTTATATATTTACTAACCAGGGCGGAAATATATCCACACAAACAAGGTACACTATGCTTGCTCTCAAATAAAAAATGATTCCTTTATTTAGTGATTATGCTCTCCCTCTAGAAGTCATTATGTACAATTCCATTCGTTTGCAAGATATTCAATGGAATTTCTATGTGAATTAATTGTTGTGAGTATGAAGGTGCAGTTGACAAAGGTCAAGGAGAATTGGTGAACTAATCAGTACAACAACTATTTTTTTTCGACCGGAAATACTGCCAGGACTTTGTCCCGCAGTGTAATTTTATAAAATGAAAAGGTTATTTACAAATT]
[-] EMBL CA760927             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATCAATGTATGATCAGTCCTGCCTTTGGACATCAATATGTTATTTTGCAAGCAGATTCCTTAGTTTGTTACACACTAATATGAGATAATTCTTGAAAATTCTAGAAGGCTGGCTAGGTTTCTAGATAATCCTTTTATTTGATGTAATCATCTCTTGCCTGGCAGCTACAGCGTCAATGGTTTGCTGGCCCCTCCTTATTTCAAATATTGGCTTATTCATGTCCTATACAGGAGGTTCCGGTTGTATTTATATAGGGGAATGTGTTCTCTGATTTAACAGTACCCTAAGTTTTCGTATCTGGACATCTGTGCTGAAACAAAATGTCGCTTGACAGTTAACTTTACTGGTGGTCATATTTATCCAATTTTACATTGCTCCTTCATGTGTTTACAATTAAGGGTTCCTGGACCGAAGCAATGTTACTCCCTTTCACGTATGGTGAAGGATCAATAATGTGTTCCTCTTCCCTTCCTTTCTATGCAGTCAGGGTGGATTGTCTGAACATGGAGTACTGCAATGGTCTGGTCAACCTATTGCATATTTGCGTTGCAGCTTCTAGCTATCCCAATTGATGTACCCCTTAAATTAATCGTGTATTTGATTGGGGGATATATGCGTGACTTCGATTGCCTCATATAAAAAAAGTTATGCGATATCTAGAAAAaaaaaaa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]




>consensus_159#0
TCCATTGATCCTCCTCGTTGTAGGAAATCACCACCAATCCCACCGATTCCTCTCCACCGC
TCTTTCCGCCCGTGCGATGAGTCCTCCGCGTGAATCCTGCCACCTCCTCGCTCCGCTCGA
ATCCCCGCTGCTGCCGCAGTGCACCACTGGACCAGCGCCAATCCCCGCCGCCTCCTCGCT
CCTCCTCTCTCTACTTGAATCCTCGCTGCCGCCGCAGTCCACCGCTGGACCAGCGCCGCC
GCTGCCGCGCCTCCATCGCCGGACCACCTCACTCGCTGCTGCACCTCCTCGAGACTCCCC
GCCACACGCCACCGCATCGTGCCCCTCCGCTCCCAGGCCGGCGCTCACCTCGCTCCTCTG
TTCACCATCGCAGGGGTCGGTGAGCTGGTGAAAGCCCCCGTAAGACCAAGGATTGTGGCT
TCCGTGACGACCCCAACTCCATTGTGCCCCACGATTTTGACTCCCTCTGCCTGAACGGTG
ACCCTTACCCGTCTGATGTACGTCTTTCTGTTTCTGCCCAACCTCTCTGTCTTTCTATTG
CTGAAGGATTTGCAGTGGTGGTTGGTTAATGGTTAGGCAGGGTGGTTTAATCTGGTATAG
AATCCTAACTCAGCTTGTTTCCCTTTGTCGATCCATTGCTTTCACTATTAGATGATCATA
TTTGGATGCCAAATAGTGTGCTAAAGATGATGTCCATCATATGCTAATTTAAATGCCAAA
TTGCAACTTGTTACTCAAAGTATTGGCTGATTGTACAGCTCTGATTCAAGGAACTCTCTT
ATATTATTTGGATTATGGGAGCTTCCTGTTCATCTTTGCAAGCTGATTACTCTGACCACA
ATCAAGGTATGTAGCCGCTCTCCGCTCACATTGGCCTTAAGGTGTTATCGGAATTTACTA
ATATCATTTCTGGGATACCTTTTCTATACTGTATTTTTTGCATTTGCTTGTCCTCACGTA
AGATTCGTTGTGTCCAATGTTTAGCATAACTTTGTAGAGTGGATATTAGTGACCATTTGT
ATGAGCATATGGGTCAATGGATCAATGTATGATCAGTCCTGCCTTTGGACATCAATATGT
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CTAGAAGGCTGGCTAGGTTTCTAGATAATCCTTTTATTTGATGTAATCATCTCTTGCCTG
GCAGCTACAGCGTCAATGGTTTGCTGGCCCCTCCTTATTTCAAATATTGGCTTATTCATG
TCCTATACAGGAGGTTCCGGTTGTATTTATATAGGGGAATGTGTTCTCTGATTTAACAGT
ACCCTAAGTTTTCGTATCTGGACATCTGTGCTGAAACAAAATGTCGCTTGACAGTTAGCT
TTACTGGTGGTCATATTTATCCAATTTTACATTGCTCTTTCATGTGTTTACAATTAAGGG
TTCCTGGACCGAAGCAACGTTACTCCCTTTCACGTATGATGAAGGATCATTAATGTGTTC
CTCTTTCCTTCCTTTCTATGCAGTCAGGGTGGATTGTCTGAACATGGAGTACTGCAATGG
TCTGGTCAACCTATTGCATATTTGCGTTGCAGCTTCTAGCTATCCCAATTGATGTACCCC
TTAAATTAATCGTGTATTTGATTGGGGGATATATGCGTGACTTCGATTGCCACATATAAA
AAAAGGTATGCGATATCTAGAAAACATTCTTGATGTTACTGTGACTATGTCGAACTATTG
TGAATATTTGATTTCCTTATATATTTACTAACCAGGGCGGAAATATATCCACACAAACAA
GGTACACTATGCTTGCTCTCAAATAAAAAATGATTCCTTTATTTAGTGATTATGCTCTCC
CTCTAGAAGTCATTATGTACAATTCCATTCGTTTGCAAGATATTCAATGGAATTTCTATG
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TAATCAGTACAACAACTATTTTTTTTCGACCGGAAATACTGCCAGGACTTTGTCCCGCAG
TGTAATTTTATAAAATGAAAAGGTTATTTACAAATT
clustalw multiple alignements is not computed in this case