cluster # 1620

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Oryza sativa
cluster # 1620 cluster # 1620 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1620#0 length = 1427 sequences # 2
consensusID : consensus_1620#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1427
fasta sequence
                              [AGAGGAGATGAGATGGATGTGTAGTTTGTGTACATNGTTAGCTTAGCTCTAGTACTACTAGCTTTTGCCAACAACCCAGCTAAGCTGAGCTGATCTCTTCACGTTTGTGGCGTGA-NTAGCTGAGCTTATTAACTATCTCTNTACCAAATCAAGCTAAGTTAATNAGCTNGATAGCTAGCNCGGTGTGGTGGTGGTTGTCGTCGTCGTCGTCGTCTCCGGCGTCGGTGAGACGGCGGCCGGCGAAGAAGGGGGTGCGTATATATGGGGAATTCGCTTGGCTGCGTGGGGCTTGGGGAGAGGTTGGCGGCGGCGGCGAAGGACGGCGACGCGGCGGAGGCGCAGCGGCTGCTGGCGGCGAACCCCGGGCTGGCTCGGTGCACCACCTTCGGCAACCTCAACTCGCCGCTCCATGTCGCCGCCGCCAAAGGCCACCACGAGGTAAGCATACGTCCACAATGAACTGATCACCTCTAGTACAAAAACCATCTCCATTGATGGTGCAGCAAGCTAGCTAAGCTATGAGCTAGCTTCTCCTGTTTTTTTTTCTTTCAGATTGTTCATTGAATCATTGAAATGAATTAATTGCTTGCTGGCTGCTGGCAGTCCTGCTGCACTCATTTTTTTAGAAAAAAAAACTTTTCTTAAAAATATTCATTATATTGCATTGAAGAAACCACTTGTAGTACTTGTTTTAAGATATTAGTTAAGTTTATTTCTATAATAAAATAGATAATTTACTGTAATAATATGCTCAATGATCAAATCACAGACGAGGTAATAGCTAGATTGGTTTGCTATGTTTTTTACTATTAACCAGGCATATGAGTGATGTTGCCCTAGGAACAAGTTTTTTTAATCTTTTCGTTTTTAATTAATTTGCCAAAAGAATATATTCAACTGATTTTTTTTGGAAAAAGTTTATACACACACACACACATATGCATGTCATTAAAGAAAAAAAAGAATTCGAAAGAAAGAGAGAGTAAAAAAAAAAGAATTTACTGCTGTCCTGGTAGATCCCATATTAATTATTAATCTTTTAAGTGTTGCGCAAAAAATGGAAATCACAATCAGTCCTAGCTAGCTTTATCCCGCGATGGCTGAATGAGGTGACAGAAAACCTAACGGCAGGATGATTAATTCTTCAAATGACCAATTGATCACTCGTCTCTTAATCTGATTTGCGTGCCAAAAATGAAGAAGAAAACGTCATCATTAGTGAGATGTAACATTTACGCATGCAAGTTGCCTCTATTCATTTTGCGGGTTATTGTTATGCTGATGTGTGTGATTTGTAATTGTGTACCAACACTTATATACTTAAAATTCCTTTTCATGTTGATTGGGAATCGATGCAACTATAAAAGAAAGTGACACTATTAATGGAATTCGTCAATTATCATGCTTCTCCTTTGTAGAACGGTAAA]

[+] EMBL OSS0375A             [AGAGGAGATGAGATGGATGTGTAGTTTGTGTACATNGTTAGCTTAGCTCTAGTACTACTAGCTTTTGCCAACAACCCAGCTAAGCTGAGCTGATCTCTTCACGTTTGTGGCGTGA NTAGCTGAGCTTATTAACTATCTCTNTACCAAATCAAGCTAAGTTAATNAGCTNGATAGCTAGCNCGGTGTGGTGGTGGTTGTCGTCGTCGTCGTCGTCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AK119921             [                  GTGTAGTTTGTGTACATGGTTAGCTTAGCTCTAGTACTACTAGCTTTTGCCAACAACCCAGCTAAGCTGAGCTGATCTCTTCACGTTTGTGGCGTGAGCTAGCTGAGCTTATTAACTATCTCTCTACCAAATCAAGCTAAGTTAATTAGCTGGATAGCTAGCTCGGTGTGGTGGTGGTTGTCGTCGTCGTCGTCGTCTCCGGCGTCGGTGAGACGGCGGCCGGCGAAGAAGGGGGTGCGTATATATGGGGAATTCGCTTGGCTGCGTGGGGCTTGGGGAGAGGTTGGCGGCGGCGGCGAAGGACGGCGACGCGGCGGAGGCGCAGCGGCTGCTGGCGGCGAACCCCGGGCTGGCTCGGTGCACCACCTTCGGCAACCTCAACTCGCCGCTCCATGTCGCCGCCGCCAAAGGCCACCACGAGGTAAGCATACGTCCACAATGAACTGATCACCTCTAGTACAAAAACCATCTCCATTGATGGTGCAGCAAGCTAGCTAAGCTATGAGCTAGCTTCTCCTGTTTTTTTTTCTTTCAGATTGTTCATTGAATCATTGAAATGAATTAATTGCTTGCTGGCTGCTGGCAGTCCTGCTGCACTCATTTTTTTAGAAAAAAAAACTTTTCTTAAAAATATTCATTATATTGCATTGAAGAAACCACTTGTAGTACTTGTTTTAAGATATTAGTTAAGTTTATTTCTATAATAAAATAGATAATTTACTGTAATAATATGCTCAATGATCAAATCACAGACGAGGTAATAGCTAGATTGGTTTGCTATGTTTTTTACTATTAACCAGGCATATGAGTGATGTTGCCCTAGGAACAAGTTTTTTTAATCTTTTCGTTTTTAATTAATTTGCCAAAAGAATATATTCAACTGATTTTTTTTGGAAAAAGTTTATACACACACACACACATATGCATGTCATTAAAGAAAAAAAAGAATTCGAAAGAAAGAGAGAGTAAAAAAAAAAGAATTTACTGCTGTCCTGGTAGATCCCATATTAATTATTAATCTTTTAAGTGTTGCGCAAAAAATGGAAATCACAATCAGTCCTAGCTAGCTTTATCCCGCGATGGCTGAATGAGGTGACAGAAAACCTAACGGCAGGATGATTAATTCTTCAAATGACCAATTGATCACTCGTCTCTTAATCTGATTTGCGTGCCAAAAATGAAGAAGAAAACGTCATCATTAGTGAGATGTAACATTTACGCATGCAAGTTGCCTCTATTCATTTTGCGGGTTATTGTTATGCTGATGTGTGTGATTTGTAATTGTGTACCAACACTTATATACTTAAAATTCCTTTTCATGTTGATTGGGAATCGATGCAACTATAAAAGAAAGTGACACTATTAATGGAATTCGTCAATTATCATGCTTCTCCTTTGTAGAACGGTAAA]




>consensus_1620#0
AGAGGAGATGAGATGGATGTGTAGTTTGTGTACATNGTTAGCTTAGCTCTAGTACTACTA
GCTTTTGCCAACAACCCAGCTAAGCTGAGCTGATCTCTTCACGTTTGTGGCGTGANTAGC
TGAGCTTATTAACTATCTCTNTACCAAATCAAGCTAAGTTAATNAGCTNGATAGCTAGCN
CGGTGTGGTGGTGGTTGTCGTCGTCGTCGTCGTCTCCGGCGTCGGTGAGACGGCGGCCGG
CGAAGAAGGGGGTGCGTATATATGGGGAATTCGCTTGGCTGCGTGGGGCTTGGGGAGAGG
TTGGCGGCGGCGGCGAAGGACGGCGACGCGGCGGAGGCGCAGCGGCTGCTGGCGGCGAAC
CCCGGGCTGGCTCGGTGCACCACCTTCGGCAACCTCAACTCGCCGCTCCATGTCGCCGCC
GCCAAAGGCCACCACGAGGTAAGCATACGTCCACAATGAACTGATCACCTCTAGTACAAA
AACCATCTCCATTGATGGTGCAGCAAGCTAGCTAAGCTATGAGCTAGCTTCTCCTGTTTT
TTTTTCTTTCAGATTGTTCATTGAATCATTGAAATGAATTAATTGCTTGCTGGCTGCTGG
CAGTCCTGCTGCACTCATTTTTTTAGAAAAAAAAACTTTTCTTAAAAATATTCATTATAT
TGCATTGAAGAAACCACTTGTAGTACTTGTTTTAAGATATTAGTTAAGTTTATTTCTATA
ATAAAATAGATAATTTACTGTAATAATATGCTCAATGATCAAATCACAGACGAGGTAATA
GCTAGATTGGTTTGCTATGTTTTTTACTATTAACCAGGCATATGAGTGATGTTGCCCTAG
GAACAAGTTTTTTTAATCTTTTCGTTTTTAATTAATTTGCCAAAAGAATATATTCAACTG
ATTTTTTTTGGAAAAAGTTTATACACACACACACACATATGCATGTCATTAAAGAAAAAA
AAGAATTCGAAAGAAAGAGAGAGTAAAAAAAAAAGAATTTACTGCTGTCCTGGTAGATCC
CATATTAATTATTAATCTTTTAAGTGTTGCGCAAAAAATGGAAATCACAATCAGTCCTAG
CTAGCTTTATCCCGCGATGGCTGAATGAGGTGACAGAAAACCTAACGGCAGGATGATTAA
TTCTTCAAATGACCAATTGATCACTCGTCTCTTAATCTGATTTGCGTGCCAAAAATGAAG
AAGAAAACGTCATCATTAGTGAGATGTAACATTTACGCATGCAAGTTGCCTCTATTCATT
TTGCGGGTTATTGTTATGCTGATGTGTGTGATTTGTAATTGTGTACCAACACTTATATAC
TTAAAATTCCTTTTCATGTTGATTGGGAATCGATGCAACTATAAAAGAAAGTGACACTAT
TAATGGAATTCGTCAATTATCATGCTTCTCCTTTGTAGAACGGTAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case