Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 1628 cluster # 1628       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1628#0 length = 1207 sequences # 2  

consensusID : consensus_1628#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1207
fasta sequence
                              [TGGCCACGGATTTTCTTGATGTAAACAATCAAAATAAAGCAGTATTGCTAGATAGTTCATCTCATCGTGGTATCATGGACAATCATTGCAAATGTGGTGAGGAATTTTCTTCTGATAAGGAGGCTCCAGCTTACCATTTATTTGAAAATTATGATTTTGTTGACAAGCATGAAACAAAAGAGGTGGTACTTGGTGATACAGTAGTCTTGACCTTTGTAGATGATTTAGCCAATGATGACTCTGAATATAGGGAGGATATTTCAGAACAAAAGGATCCAAATAATTTATCAGGATTGCTTGATAACGTTGCAGATATTTTTTACCAGCAGCAAGAAATACATAAGGTGGTTGTTTCTGACGACAACAAGCCACCTGAAGTTTTGTTCCTCAGTGGAAAGCAAACTGTCAGCAGTTCAGGTGAATTTAGTTCTCCTAATGAGAATGGAACATCAGGATTTCCTTTTGATTCTGTTTGTGAAGATAAAAATGGAACAGTGGCCTATCCCAGCGTAGCATCCCATTATAATATCGGTATTGAAGATGACAAATGTGAGGATCATACTGACAACAACATAGAGGAGGCATCAAGTATCGCATCTACAAATTGTGGTTCTGCTGATAAGCATCAGACTATACAGGTGTTGCCTGTTTGTTTAGCAAATGGAGATAACATTGATGATGTTGCTTCATTGGGGAGTTCAATTTGTGAAGACGTTGAAGATAAAGACAACAAAAGTAATGCTAATTGTATTTCAGAGGGAGCTCCACATGGAAACGGAATGCCACTTGTTAGGTCCCCAGCATCATGGTGGAATTTATGTGGAGTTATTGATGTGTTTGCTGGATGTAAAGATTGAATTGAGATGTTGGCAGGTCATGGGTGGAACTTTGGGACAACAGAAAACTTTAGATGCTCATCCTAATCCTGTGTTGACAATGAAGAAGTATTTGACAGTTTGGATTGAGGTATTGAATTGTTTATAGTGAGGCTGTTTGTTTTGTTGGATGTATATATTTTTTTGTTAGATTGCCTGATTAGTTTTTGACATGTTGTGGTTCATTGGCTTTTTCTTTAAAAGCTGAGTGCTATTCTTTCTCAAGAAAGAAAGCTTCAACTTACTGTAATTGATTTTGAAAGGGAAATGGAACTGGAAATGCTTGTTGGCTTGTTGTATAGTGTATACTATATGCTTTGAGAAAAAAAAAG]

[+] EMBL AK066374             [TGGCCACGGATTTTCTTGATGTAAACAATCAAAATAAAGCAGTATTGCTAGATAGTTCATCTCATCGTGGTATCATGGACAATCATTGCAAATGTGGTGAGGAATTTTCTTCTGATAAGGAGGCTCCAGCTTACCATTTATTTGAAAATTATGATTTTGTTGACAAGCATGAAACAAAAGAGGTGGTACTTGGTGATACAGTAGTCTTGACCTTTGTAGATGATTTAGCCAATGATGACTCTGAATATAGGGAGGATATTTCAGAACAAAAGGATCCAAATAATTTATCAGGATTGCTTGATAACGTTGCAGATATTTTTTACCAGCAGCAAGAAATACATAAGGTGGTTGTTTCTGACGACAACAAGCCACCTGAAGTTTTGTTCCTCAGTGGAAAGCAAACTGTCAGCAGTTCAGGTGAATTTAGTTCTCCTAATGAGAATGGAACATCAGGATTTCCTTTTGATTCTGTTTGTGAAGATAAAAATGGAACAGTGGCCTATCCCAGCGTAGCATCCCATTATAATATCGGTATTGAAGATGACAAATGTGAGGATCATACTGACAACAACATAGAGGAGGCATCAAGTATCGCATCTACAAATTGTGGTTCTGCTGATAAGCATCAGACTATACAGGTGTTGCCTGTTTGTTTAGCAAATGGAGATAACATTGATGATGTTGCTTCATTGGGGAGTTCAATTTGTGAAGACGTTGAAGATAAAGACAACAAAAGTAATGCTAATTGTATTTCAGAGGGAGCTCCACATGGAAACGGAATGCCACTTGTTAGGTCCCCAGCATCATGGTGGAATTTATGTGGAGTTATTGATGTGTTTGCTGGATGTAAAGATTGAATTGAGATGTTGGCAGGTCATGGGTGGAACTTTGGGACAACAGAAAACTTTAGATGCTCATCCTAATCCTGTGTTGACAATGAAGAAGTATTTGACAGTTTGGATTGAGGTATTGAATTGTTTATAGTGAGGCTGTTTGTTTTGTTGGATGTATATATTTTTTTGTTAGATTGCCTGATTAGTTTTTGACATGTTGTGGTTCATTGGCTTTTTCTTTAAAAGCTGAGTGCTATTCTTTCTCAAGAAAGAAAGCTTCAACTTACTGTAATTGATTTTGAAAGGGAAATGGAACTGGAA                                                     ]
[-] EMBL CB642303             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATGGAACATCAGGATTTCCTTTTGATTCTGTTTGTGAAGATAAAAATGGAACAGTGGCCTATCCCAGCGTAGCATCCCATTATAATATCGGTATTGAAGATGACAAATGTGAGGATCATACTGACAACAACATAGAGGAGGCATCAAGTATCGCATCTACAAATTGTGGTTCTGCTGATAAGCATCAGACTATACAGGTGTTGCCTGTTTGTTTAGCAAATGGAGATAACATTGATGATGTTGCTTCATTGGGGAGTTCAATTTGTGAAGACGTTGAAGATAAAGACAACAAAAGTAATGCTAATTGTATTTCAGAGGGAGCTCCACATGGAAACGGAATGCCACTTGTTAGGTCCCCAGCATCATGGTGGAATTTATGTGGAGTTATTGATGTGTTTGCTGGATGTAAAGATTGAATTGAGATGTTGGCAGGTCATGGGTGGAACTTTGGGACAACAGAAAACTTTAGATGCTCATCCTAATCCTGTGTTGACAATGAAGAAGTATTTGACAGTTTGGATTGAGGTATTGAATTGTTTATAGTGAGGCTGTTTGTTTTGTTGGATGTATATATTTTTTTGTTAGATTGCCTGATTAGTTTTTGACATGTTGTGGTTCATTGGCTTTTTCTTTAAAAGCTGAGTGCTATTCTTTCTCAAGAAAGAAAGCTTCAACTTACTGTAATTGATTTTGAAAGGGAAATGGAACTGGAAATGCTTGTTGGCTTGTTGTATAGTGTATACTATATGCTTTGAGAAAAAAAAAG]


>consensus_1628#0 TGGCCACGGATTTTCTTGATGTAAACAATCAAAATAAAGCAGTATTGCTAGATAGTTCAT CTCATCGTGGTATCATGGACAATCATTGCAAATGTGGTGAGGAATTTTCTTCTGATAAGG AGGCTCCAGCTTACCATTTATTTGAAAATTATGATTTTGTTGACAAGCATGAAACAAAAG AGGTGGTACTTGGTGATACAGTAGTCTTGACCTTTGTAGATGATTTAGCCAATGATGACT CTGAATATAGGGAGGATATTTCAGAACAAAAGGATCCAAATAATTTATCAGGATTGCTTG ATAACGTTGCAGATATTTTTTACCAGCAGCAAGAAATACATAAGGTGGTTGTTTCTGACG ACAACAAGCCACCTGAAGTTTTGTTCCTCAGTGGAAAGCAAACTGTCAGCAGTTCAGGTG AATTTAGTTCTCCTAATGAGAATGGAACATCAGGATTTCCTTTTGATTCTGTTTGTGAAG ATAAAAATGGAACAGTGGCCTATCCCAGCGTAGCATCCCATTATAATATCGGTATTGAAG ATGACAAATGTGAGGATCATACTGACAACAACATAGAGGAGGCATCAAGTATCGCATCTA CAAATTGTGGTTCTGCTGATAAGCATCAGACTATACAGGTGTTGCCTGTTTGTTTAGCAA ATGGAGATAACATTGATGATGTTGCTTCATTGGGGAGTTCAATTTGTGAAGACGTTGAAG ATAAAGACAACAAAAGTAATGCTAATTGTATTTCAGAGGGAGCTCCACATGGAAACGGAA TGCCACTTGTTAGGTCCCCAGCATCATGGTGGAATTTATGTGGAGTTATTGATGTGTTTG CTGGATGTAAAGATTGAATTGAGATGTTGGCAGGTCATGGGTGGAACTTTGGGACAACAG AAAACTTTAGATGCTCATCCTAATCCTGTGTTGACAATGAAGAAGTATTTGACAGTTTGG ATTGAGGTATTGAATTGTTTATAGTGAGGCTGTTTGTTTTGTTGGATGTATATATTTTTT TGTTAGATTGCCTGATTAGTTTTTGACATGTTGTGGTTCATTGGCTTTTTCTTTAAAAGC TGAGTGCTATTCTTTCTCAAGAAAGAAAGCTTCAACTTACTGTAATTGATTTTGAAAGGG AAATGGAACTGGAAATGCTTGTTGGCTTGTTGTATAGTGTATACTATATGCTTTGAGAAA AAAAAAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)